PubMed及其EBM文献检索课件.ppt

1、PubMed及其及其EBM文献检索文献检索一、一、PubMedPubMed概述概述1.简介简介2.PubMed收录范围收录范围3.PubMed特点特点4.检索途径与使用方法检索途径与使用方法基本检索、高级检索、主题词检索基本检索、高级检索、主题词检索期刊检索、题录检索、定题检索期刊检索、题录检索、定题检索基本检索规则、注册基本检索规则、注册二、循证医学文献的查找二、循证医学文献的查找1.临床查询（临床查询（Clinical Queries）(1)Clinical Study Categories（临床研究类文献）（临床研究类文献）(2)Systematic Reviews（系统评价）（系统评价

2、）(3)Medical Genetics（医学遗传学）（医学遗传学）2.MeSH:MeSH Clinical Queries3.Limits限定选项限定选项 4.直接以直接以systematic review、Cochrane、meta-analysis、Randomized Controlled Trial等为关键词进行检索。等为关键词进行检索。5.Clinical Trials(http:/clinicaltrials.gov/)三、临床案例三、临床案例 PubMed是生物医学领域最重要和权威的数据库之一，是生物医学领域最重要和权威的数据库之一，由由美国国立医学图书馆美国国立医学图书馆(N

3、ational Library of Medicine,NLM)下属下属美国生物技术信息中心美国生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)研制开发，可通过网络研制开发，可通过网络免费访问免费访问(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez)。2.PubMed收录范围收录范围 PubMed收录全世界包括美国在内收录全世界包括美国在内80多个国家的多个国家的5000余余种生物医学期刊的文摘及题录数据，内容涉及基础医学以种生物医学期刊的文摘及题录数据，内容涉及基础医学以及护理学、牙科学、

4、兽医学、药理学、保健系统等医学各及护理学、牙科学、兽医学、药理学、保健系统等医学各个领域，现有文献个领域，现有文献2100万余条，时间起自万余条，时间起自20世纪世纪50年代。年代。一、一、PubMedPubMed概述概述1.简介简介 PubMed提供部分免费全文，包括提供部分免费全文，包括 NLM开发的免费开发的免费生物医学数字化期刊全文数据库生物医学数字化期刊全文数据库PubMed Central(PMC)；开放获取开放获取(Open Access,OA)期刊的文献；期刊的文献；部分出版部分出版商提供的免费期刊文献。商提供的免费期刊文献。PubMed每条记录均有惟一的识别号每条记录均有惟一

5、的识别号PMID(PubMed Unique Identifier)。MEDLINEMEDLINE:PubMedPubMed主体部分，记录均标有主体部分，记录均标有 PubMedPubMed-indexed for-indexed for MEDLINEMEDLINE In Process CitationIn Process Citation:又称又称Pre-Pre-MEDLINE,MEDLINE,记录均标有记录均标有 PubMedPubMed-in-in processprocessPublisher-Supplied CitationPublisher-Supplied Citation

6、:记录均标有记录均标有 PubMedPubMed-as supplied by-as supplied by publisherpublisher一、一、PubMedPubMed概述概述 2.PubMed收录范围收录范围 PubMedPubMed-indexed for MEDLINE-indexed for MEDLINE PubMedPubMed-as supplied by publisher-as supplied by publisher PubMedPubMed-in process-in process一、一、PubMedPubMed概述概述 3.PubMed 3.PubMed

7、特点特点(1)收录文献范围广、内容齐全、回溯年限长收录文献范围广、内容齐全、回溯年限长(2)免费提供题录、文摘及部分全文免费提供题录、文摘及部分全文(3)检索功能完善，使用简单方便检索功能完善，使用简单方便(4)提供提供、(5)提供相关文献链接提供相关文献链接:Related citations、Linkout(6)更新速度快更新速度快:数据实时更新数据实时更新(7)个性化服务个性化服务(My NCBI)(Automatic Term Mapping,ATM)PubMed对键入的检索词自动进行分析、匹配、转换并检索，对键入的检索词自动进行分析、匹配、转换并检索，是一种是一种智能化智能化的检索过

8、程。的检索过程。MeSH转换表转换表(MeSH Translation Table)protein c protein cMeSH Terms OR protein cAll Fields期刊转换表期刊转换表(Journals translation table)new england journal of medicine N Engl J MedJournal OR new england journal of medicineAll Fields作者索引及转换表作者索引及转换表(full author translation table)Smith JA Smith JAAuthor 一

9、、一、PubMedPubMed概述概述 4.检索途径与使用方法检索途径与使用方法 基本检索基本检索 高级检索高级检索 主题词检索主题词检索 题录检索题录检索 期刊检索期刊检索 定题检索定题检索 基本检索规则基本检索规则 注册注册 检索途径检索途径1.基本检索基本检索2.高级检索高级检索3.主题词检索主题词检索4.题录检索题录检索5.期刊检索期刊检索 evidence-based medicine,EBM文献文献例例1:检索检索2008年至今有关肾衰年至今有关肾衰(renal failure)诊断诊断方面的文献。要求：英文、综述方面的文献。要求：英文、综述基本检索基本检索(renal insuf

10、ficiencyMeSH Terms OR(renalAll Fields AND insufficiencyAll Fields)OR renal insufficiencyAll Fields OR(renalAll Fields AND failureAll Fields)OR renal failureAll Fields)AND(diagnosisSubheading OR diagnosisAll Fields OR diagnosisMeSH Terms)AND(Reviewptyp AND Englishlang AND(2008PDAT:2011PDAT)发送频率发送频率高级

11、检索高级检索例例2:检索天津医科大学孙保存教授检索天津医科大学孙保存教授2001年以来发表的文献年以来发表的文献例例3:通过主题词途径检索通过主题词途径检索2008年至今有关肾年至今有关肾衰衰(renal failure)方面的英文文献方面的英文文献主题词检索主题词检索急性肾损伤肾功能不全MeSH主题词倒置形式主题词倒置形式Kidney Failure,Chronic副主题词副主题词主题词加权检索、主题词加权检索、不扩展检索选项不扩展检索选项例例4:通过主题词途径检索通过主题词途径检索2008年至今有关肾衰诊断方面的英文文献年至今有关肾衰诊断方面的英文文献泌尿系疾病男性泌尿生殖系统疾病女性泌尿

12、生殖系统疾病和妊娠并发症 女性泌尿生殖系统疾病肾小管坏死，急性慢性肾功能不全主题词主题词下位主题词下位主题词下位主题词下位主题词主题词主题词例例5:通过主题词途径检索有关肾衰诊断方面的文献。要求通过主题词途径检索有关肾衰诊断方面的文献。要求:主题词加权检索主题词加权检索只对主题词进行加权检索只对主题词进行加权检索题录检索、期刊检索题录检索、期刊检索题录检索题录检索期刊检索期刊检索基本检索规则基本检索规则作者姓名作者姓名字段标识符字段标识符Justau刊名刊名字段标识符字段标识符scienceta截词截词检索检索注意：检索词自动转换匹配功能关闭注意：检索词自动转换匹配功能关闭词组检索词组检索注意

13、：检索词自动转换匹配功能关闭注意：检索词自动转换匹配功能关闭检索式检索式:common cold AND(vitamin c OR zinc)禁用词表禁用词表注册注册二、循证医学文献的查找二、循证医学文献的查找1.临床查询（临床查询（Clinical Queries）(1)Clinical Study Categories（临床研究类文献）（临床研究类文献）(2)Systematic Reviews（系统评价）（系统评价）(3)Medical Genetics（医学遗传学）（医学遗传学）2.MeSH:MeSH Clinical Queries3.Limits限定选项限定选项 4.直接以直接以s

14、ystematic review、Cochrane、meta-analysis、Randomized Controlled Trial等为关键词进行检索。等为关键词进行检索。5.Clinical Trials(http:/clinicaltrials.gov/)三、临床病例三、临床病例 二、循证医学文献的查找二、循证医学文献的查找 1.临床查询（临床查询（Clinical Queries）例例:临床医生想检索心肌炎临床医生想检索心肌炎(myocarditis)诊诊断方面的文献，要求检索结果比较准确断方面的文献，要求检索结果比较准确（1）Clinical Study Categories（临床研

15、究类文献）（临床研究类文献）（2）Systematic Reviews（系统评价）（系统评价）（3）Medical Genetics（医学遗传学）（医学遗传学）二、循证医学文献的查找二、循证医学文献的查找 2.MeSH:MeSH Clinical Queries二、循证医学文献的查找二、循证医学文献的查找 3.Limits限定选项限定选项 二、循证医学文献的查找二、循证医学文献的查找 4.直接以直接以systematic review、Cochrane、meta-analysis、Randomized Controlled Trial等为关键词进行检索。等为关键词进行检索。二、循证医学文献的查

16、找二、循证医学文献的查找 5.Clinical Trials(http:/clinicaltrials.gov/)美国国立医学图书馆研制开发的临床试验数美国国立医学图书馆研制开发的临床试验数据库。收录了美国及世界据库。收录了美国及世界170多个国家经注册多个国家经注册登记的登记的8万多条临床试验的详细信息，是十分万多条临床试验的详细信息，是十分重要的循证医学信息资源。重要的循证医学信息资源。二、循证医学文献的查找二、循证医学文献的查找 6.检索示例检索示例 检索阿司匹林检索阿司匹林(aspirin)治疗脑血管意外治疗脑血管意外(cerebrovascular accident)的随机对照试验的

17、随机对照试验(randomized controlled trial)文献文献主题词检索主题词检索检索式检索式:cerebrovascular accident AND aspirin AND randomized controlled trial自由词检索自由词检索Stroke/drug therapymh AND aspirin/tumh AND randomized controlled trialpt 81篇篇 cerebrovascular accident AND aspirin AND randomized controlled trial (strokeMeSH Terms O

18、R strokeAll Fields OR(cerebrovascularAll Fields AND accidentAll Fields)OR cerebrovascular accidentAll Fields)AND(aspirinMeSH Terms OR aspirinAll Fields)AND(randomized controlled trialPublication Type OR randomized controlled trials as topicMeSH Terms OR randomized controlled trialAll Fields OR randomised controlled trialAll Fields)1113篇篇Therapy/Narrowfilter AND(strokeMeSH Terms OR strokeAll Fields OR(cerebrovascularAll Fields AND accidentAll Fields)OR cerebrovascular accidentAll Fields)AND(aspirinMeSH Terms OR aspirinAll Fields)AND Randomized Controlled Trialptyp 643篇篇火狐浏览器火狐浏览器