1、绪论第一章第一章 蛋白质蛋白质 第二章第二章 核核 酸酸 第三章第三章 酶酶 第四章第四章 维生素维生素 第五章第五章 生物膜生物膜 第六章第六章 代谢总论代谢总论第七章第七章 生物氧化生物氧化 第八章第八章 糖代谢糖代谢第九章第九章 脂代谢脂代谢第十章第十章 蛋白质的酶促降解和氨基酸代谢蛋白质的酶促降解和氨基酸代谢 第十一章第十一章 核酸的酶促降解及核苷酸代谢核酸的酶促降解及核苷酸代谢第十二章第十二章 核酸的生物合成核酸的生物合成第十三章第十三章 蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成 1、氨基酸的侧链对多肽或蛋白质的结构和生物学功能非常重要。用三字母和单字母缩写形式列出其侧链为如下要求的氨基酸:
2、(答案)(a)含有一个羟基。(b)含有一个氨基。(c)含有一个具有芳香族性质的基团。(d)含有分支的脂肪族烃链。(e)含有硫。(f)含有一个在pH 710范围内可作为亲核体的基团或原子,指出该亲核基团或原子。第一章第一章 蛋白质化学蛋白质化学l2、一种氨基酸的可解离基团可以带电或中性状态存在,这取决于它的pK值和溶液的pH。(a)组氨酸有3种可解离基团,写出相应于每个pK 值的3种解离状态的平衡方程式。每种解离状态下的组氨酸分子的净电荷是多少?(b)在pH1、4、8和12时,组氨酸的净电荷分别是多少?将每一pH下的组氨酸置于电场中,它们将向阴极还是阳极迁移?(答案)l3、某种溶液中含有三种三肽
3、:Tyr-Arg-Ser,Glu-Met-Phe 和Asp-Pro-Lys,-COOH基团的pKa 为3.8;-NH3基团的pKa为8.5。在哪种pH(2.0,6.0或13.0)下,通过电泳分离这三种多肽的效果最好?(答案)l4、利用阳离子交换层析分离下列每一对氨基酸,哪一种氨基酸首先被pH7缓冲液从离子交换柱上洗脱出来。(答案)l(a)Asp和Lys(b)Arg和Met(c)Glu和Val(d)Gly和Leu(e)Ser和Ala5、氨基酸的定量分析表明牛血清白蛋白含有0.58的色氨酸(色氨酸的分子量为204)。(a)试计算牛血清白蛋白的最小分子量(假设每个蛋白分子只含有一个色氨酸残基)。(b
4、)凝胶过滤测得的牛血清白蛋白的分子量为70,000,试问血清白蛋白分子含有几个色氨酸残基?(答案)l6、胃液(pH1.5)的胃蛋白酶的等电点约为1,远比其它蛋白质低。试问等电点如此低的胃蛋白酶必须存在有大量的什么样的官能团?什么样的氨基酸才能提供这样的基团?l(答案)l7、已知某蛋白是由一定数量的链内二硫键连接的两个多肽链组成的。1.00g该蛋白样品可以与25.0mg还原型谷胱甘肽(GSH,MW307)反应。(答案)(a)该蛋白的最小分子量是多少?(b)如果该蛋白的真实分子量为98240,那么每分子中含有几个二硫键?(c)多少mg的巯基乙醇(MW78.0)可以与起始的1.00g该蛋白完全反应?
5、l8、一个含有13个氨基酸残基的十三肽的氨基酸组成为:Ala,Arg,2 Asp,2Glu,3Gly,Leu,3Val。部分酸水解后得到以下肽段,其序列由Edman降解确定,试推断原始寡肽的序列。(答案)(a)Asp-Glu-Val-Gly-Gly-Glu-Ala(b)Val-Asp-Val-Asp-Glu(c)Val-Asp-Val(d)Glu-Ala-Leu-Gly-Arg(e)Val-Gly-Gly-Glu-Ala-Leu(f)Leu-Gly-Argl9、下列试剂和酶常用于蛋白质化学的研究中:CNBr 异硫氰酸苯酯 丹黄酰氯 脲 6mol/LHCl-巯基乙醇 水合茚三酮 过甲酸 胰蛋白酶
6、 胰凝乳蛋白酶 其中哪一个最适合完成以下各项任务(答案)(a)测定小肽的氨基酸序列。(b)鉴定肽的氨基末端残基。(c)不含二硫键的蛋白质的可逆变性。若有二硫键存在时还需加什么试剂?(d)在芳香族氨基酸残基羧基侧水解肽键。(e)在蛋氨酸残基羧基侧水解肽键。(f)在赖氨酸和精氨酸残基侧水解肽键。l10、由下列信息求八肽的序列。(a)酸水解得 Ala,Arg,Leu,Met,Phe,Thr,2Val(b)Sanger试剂处理得DNP-Ala。(c)胰蛋白酶处理得Ala,Arg,Thr 和 Leu,Met,Phe,2Val。当以Sanger试剂处理时分别得到DNP-Ala和DNP-Val。(d)溴化氰
7、处理得 Ala,Arg,高丝氨酸内酯,Thr,2Val,和 Leu,Phe,当用Sanger试剂处理时,分别得DNP-Ala和DNP-Leu(答案)11、在结晶肽的1.49A)和C=N双键(1.27A)之间。他们也X-射线研究中,Linus Pauling和Robert corey发现肽链中的肽键(C-N)长度(1.32A)介于典型的C-N单键(发现肽键呈平面状(与肽键相连接的4个原子位于同一个平面)以及两个碳原子彼此呈反式(位于肽键的两侧)与肽键连接。(答案)(a)肽键的长度与它的键的强度和键级(是单键、双键或三键)有什么关系?(b)从Pauling等人的观察,就肽键旋转能得出什么看法?l1
8、2、羊毛衫等羊毛制品在热水中洗后在电干燥器内干燥,则收缩。但丝制品进行同样处理,却不收缩。如何解释这两种现象?(答案)l13、人的头发每年以15至20cm的速度生长,头发主要是角蛋白纤维,是在表皮细胞的里面合成和组装成“绳子”。角蛋白的基本结构单元是-螺旋。如果-螺旋的生物合成是头发生长的限速因素,计算-螺旋链的肽键以什么样的速度(每秒钟)合成才能解释头发每年的生长长度?(答案)l14、合成的多肽多聚谷氨酸(Glu)n),当处在pH3.0以下时,在水溶液中形成螺旋,而在pH5.0以上时却为伸展的形态。(答案)(a)试解释该现象。(b)在哪种PH条件下多聚赖氨酸(Lys)会形成-螺旋?l15、一
9、个-螺旋片段含有180个氨基酸残基,该片段中有多少圈螺旋?计算该-螺旋片段的轴长。(答案)l16、如何用二氧化碳与水的反应来解释Bohr效应?(答案)(a)写出由二氧化碳和水形成碳酸氢根的方程式,并解释H和CO2在血红蛋白氧合中的作用。(b)解释向休克病人静脉注射碳酸氢根的生理学依据。l17、一个寡聚蛋白(MW72000)是由相同亚基组成的,该蛋白可以完全解离并与2,4-二硝基氟苯反应。由100mg该蛋白可以获得5.56M的DNP-Gly,该蛋白含有几个亚基?(答案)l18、对怀孕的哺乳动物中氧的转运研究显示在同样条件下测量婴儿和母亲的血液氧饱和曲线明显不同。这是因为婴儿的红细胞中含有结构不同
10、的血红蛋白F(a2g2),而母亲的红细胞含有一般的血红蛋白A(a2g2)。(a)在生理状况下,哪一种血红蛋白对氧有更高的亲和性。请解释。(b)不同的氧亲和性有何生理意义?)当所有的2,3-二磷酸甘油酸(BPG)从血红蛋白A和F中移去后,测得的氧饱和曲线往左移。不过此时的血红蛋白A比血红蛋白F对氧有更高的亲和性。当加回 BPG时,氧饱和曲线又恢愎正常情形。BPG对血红蛋白的氧亲和性有何影响?用以上资料解释婴儿和母亲的血红蛋白的不同氧亲和性?(答案)l19、下列变化对肌红蛋白和血红蛋白的氧亲和性有什么影响?(答案)(a)血液中的pH由7.4下降到7.2。(b)肺部CO2分压由6kPa(屏息)减少到
11、2kPa(正常)。(c)BPG水平由5mM(平原)增加到8mM(高原)。l20、蛋白质A对配体X结合的解离常数为Kd106M,而蛋白质B对X结合的Kd109M。哪个蛋白对X有更高的亲和性?(答案)l 答:蛋白质B对X有更高的亲和性。蛋白质B对CX的半饱和浓度比蛋白质A的低得多。返回l 答案:(a)Ser(S),Thr(T),Tyr(Y)(b)Asn(N),Gln(Q),Arg(R),Lys(K)(c)Phe(F),Trp(W),Tyr(Y),(d)Ile(I),Leu(L),Val(V)(e)Cys(C),Met(M)(f)可以作为亲核试剂的侧链基团或原子有位于Ser(S),Thr(T)和Ty
12、r(Y)中的-OH;位于Cys(C)和Met(M)中的硫原子,位于Asp(D)和Glu(E)中的-COO-;以及位于His(H)和Lys(k)中的氮原子。l(a)、(b)l答:pH=6.0比pH=2.0或pH=13.0时电泳能提供更好的分辨率。因为在pH6.0的条件下每种肽都带有不同的净电荷(+1,-1,和0),而在pH2.0的条件下净电荷分别为+2,+1和+2,在pH13.0的条件下净电荷分别为-2,-2和-2。l 答:(a)Asp(b)Met(c)Glu(d)Gly(e)Serl 答:(a)32,100g/mol(b)2l答:COO;Asp,Glul 答:(a)MW24560;(b)4个二
13、硫键;(c)6.35mgl该肽链的序列可以通过将肽片段的相同序列重叠排列起来获得整个序列。l(a)Asp-Glu-Val-Gly-Gly-Alal(b)Val-Asp-Val-Glul(c)Val-Asp-Vall(d)Glu-Ala-Leu-Gly-Argl(e)Val-Gly-Gly-Glu-Ale-Leu-Gly-Argl(f)Leu-Gly-ArglVal-Asp-Val-Asp-Glu-Val-Gly-Gly-GluAla-Leu-Gly-Argl答:(a)异硫氰酸苯酯。(b)丹黄酰氯。(c)脲;-巯基乙醇还原二硫键。(d)胰凝乳蛋白酶。(e)CNBr。(f)胰蛋白酶ll答:Ala-
14、Thr-Arg-Val-Val-Met-Leu-Phel答:(a)键越短其强度越高,而且其键级越高(在单键以上)。肽键的强度比单键强,键的特性介于单键和双键之间。(b)在生理温度下,肽键旋转比较困难,因为它有部分双键特性。ll 答:羊毛纤维多肽链的主要结构单位是连续的-螺旋圈,其螺距为5.4A。当处于热水(或蒸汽)环境下,使纤维伸展为具有-折叠构象的多肽链。在-折叠构象中相邻R基团之间的距离是7.0A。当干燥后,多肽链重新由折叠转化为螺旋构象,所以羊毛收缩了。而丝制品中的主要成分是丝心蛋白,它主要是由呈现折叠构象的多肽链组成的,丝中的-折叠含有一些小的、包装紧密的氨基酸侧链,所以比羊毛中的-螺
15、旋更稳定,水洗和干燥其构象基本不变。ll答:每秒钟大约需合成43个肽键。(要考虑到-螺旋的每一圈含有3.6个氨基酸残基,螺距为0.54nm)。l答:(a)由可离子化侧链的氨基酸残基构成的-螺旋对pH值的变化非常敏感,因为溶液的pH值决定了侧链是否带有电荷,由单一一种氨基酸构成的聚合物只有当侧链不带电荷时才能形成-螺旋,相邻残基的侧链上带有同种电荷会产生静电排斥力从而阻止多肽链堆积成-螺旋构象。Glu侧链的pKa约为4.1,当pH值远远低于4.1(大约3左右)时,几乎所有的多聚谷氨酸侧链为不带电荷的状态,多肽链能够形成-螺旋。在pH值为5或更高时,几乎所有的侧链都带负电荷,邻近电荷之间的静电排斥
16、力阻止螺旋的形成,因此使同聚物呈现出一种伸展的构象。(b)Lys侧链的pK为10.5,当pH值远远高于10.5时,多聚赖氨酸大多数侧链为不带电荷的状态,该多肽可能形成一种-螺旋构象,在较低的pH值时带有许多正电荷的分子可能会呈现出一种伸展的构象。l答:该片段中含有50圈螺旋,其轴长为27nm。ll 答:二氧化碳与水的反应说明了为什么当CO2的浓度增加时,同时会引起pH值下降,迅速进行新陈代谢的组织所产生的CO2/SUB与水反应生成了碳酸根离子和H。(a)该反应生成的H降低了血液的pH值,从而稳定了血红蛋白的脱氧形式(T构象),净结果是P50的增加,即血红蛋白对氧的亲和力降低,于是更多的氧气被释
17、放到组织中。CO2也可以通过与四条链的N端形成氨甲酸加合物降低血红蛋白对氧气的亲和力、该加合物使脱氧构象(T)保持稳定,因而进一步增加了P50,并且促进了氧气向组织中的释放。(b)休克病人组织中严重缺乏氧气供应,碳酸盐静脉给药为组织提供了一种CO2的来源,通过降低血红蛋白对氧气的亲和力,CO2促使氧合血红蛋白向组织中释放氧气l 答:4个亚基。l:(a)当氧分压为4kPa时,HbA只有33的氧饱和度,而HbF为58,表明HbF比HbA对氧的亲和性更高。(b)HbF对氧的高亲和性可确保氧可以由母体血液流向胎盘中的胎儿血液。(c)当结合BPG时,与HbF相比,HbA氧饱和曲线发生了更大的漂移,表明H
18、bA结合BPG比HbF结合BPG更紧密,而结合BPG就减少了对氧亲和性。答:对肌红蛋白氧亲和性的影响:(a)没有影响(b)没有影响(c)没有影响对血红蛋白氧亲和性的影响:(a)降低(b)增加(c)降低1、比较蛋白质螺旋中的氢键和DNA双螺旋中的氢键,并指出氢键在稳定这两种结构中的作用。(答案)第二章第二章 核核 酸酸l2、一段双链DNA包含1000个碱基,其组成中G+C占58%,那么在DNA的该区域中胸腺嘧啶残基有多少?(答案)l第二章第二章 核酸核酸l3、双螺旋DNA一条链的碱基序列为(5)GCGCAATATTTCTCAAAATATTGCGC-3,写出它的互补链。该DNA片段中含有什么特殊类
19、型的序列?该双链DNA有能力形成另外一种结构吗?(答案)l4、用适当的碱基取代下面序列中的X,给出一个完整的反向重复结构。(答案)5GATCATXXXXXX 33XXXXXXXXXXXX 5l5、两个DNA分子,其长度相等,碱基组成不同,一个含有20%(A+T),另一个含有60%(A+T),哪个分子的Tm较高?(答案)l6、有二个DNA样品,分别来自两种未确认的细菌,两种DNA样品中的腺嘌呤碱基含量分别占它们DNA总碱基的32和17。这两个DNA样品的腺嘌呤,鸟嘌呤,胞嘧啶和胸腺嘧啶的相对比例是多少?其中哪一种DNA是取自温泉(64)环境下的细菌,哪一种DNA是取自嗜热菌?答案的依据是什么?(
20、答案)l7、溶液A中含有浓度为1M的20个碱基对的DNA分子,溶液B中含有0.05M的400个碱基对的DNA分子,所以每种溶液含有的总的核苷酸残基数相等。假设DNA分子都有相同的碱基组成。(答案)(a)当两种溶液的温度都缓慢上升时,哪个溶液首先得到完全变性的DNA?(b)哪个溶液复性的速度更快些?l8、一DNA样品,为线性的双螺旋。取部分样品涂布在栅板上,温度维持在20用电子显微镜观察;另取部分样品进行同样的操作,只是温度为60,30分钟后,用电子显微镜观察。发现线性的双螺旋中出现了一些眼形(也称之形)结构,请解释此现象?这种现象能提供什么有用的信息?(答案)l9、两条长度、浓度都相同的单链D
21、NA探针加入到从人细胞系中提取的DNA片段混合组分中。一个探针与核糖体RNA的某个区域互补,另一个与球蛋白mRNA的某个区域互补。加热混合物使DNA片段变性,然后再冷却。为什么核糖体RNA探针形成双链(答案)l10、如果人体有1014个细胞,每个体细胞的DNA含有6.4109对核苷酸,试计算人体DNA 的总长度为多少千米?这个长度相当于地球与太阳之间距离(2.2109千米)的多少倍?l(答案)l答:2.21011千米;100倍返回l 答:在-螺旋中,一个残基上的羧基氧与旋转一圈后的(该残基后面)第四个残基上的-氨基中的氮形成氢键,这些在肽链骨架内原子间形成的氢键大致平行于该螺旋的轴,氨基酸侧链
22、伸向骨架外,不参与螺旋内的氢键形成。在双链DNA中糖-磷酸骨架不形成氢键,相反在相对的两条链中互补的碱基之间形成2个或3个氢键,氢键大致垂直于螺旋轴。在-螺旋中,单独的氢键是很弱的,但是这些键的合力稳定了该螺旋结构。尤其是在一个蛋白质的疏水内部,这里水不与氢竞争成键。在DNA中形成氢键的主要作用是使每一条链能作为另一条链的模板,尽管互补碱基之间的氢键帮助稳定螺旋结构,但在疏水内部碱基对之间的堆积对螺旋结构的稳定性的供献更大。返回l答:如果58%的残基是G+C,42%的残基必定为A+T。因为每一个A与相对链上的一个T相配,A残基的数量与T残基的数量相等,因而21%或420个残基为T(20000.
23、21=420)。ll 答:(5)GCGCAATATTTTGAGAAATATTGCGC-3,含有回文序列;单链内可形成发卡结构;双链可形成十字结构。l答:5GATCATATGATC 33CTAGTATACTAG 5ll答:含有20%(A+T)的DNA分子具有更高的Tm。因为它含有80%(G+C)。因为G-C碱基对之间存在3个氢键,所以使富含G/C的DNA变性需要更多的能量。ll 答:一个DNA含量为32A、32T、18G和18C,另一个为17A、17T、33G和33C,均为双链DNA。前一种取自温泉的细菌,后一种取自嗜热菌,因为其GC含量高,变性温度高因而在高温下更稳定。l答:(a)溶液A中的D
24、NA将首先被完全变性,因为在20个碱基对螺旋中的堆积作用力比在400个碱基对螺旋中的力小很多,在DNA双链的末端的DNA的碱基对只是部分堆积。在片段短的分子中这种末端效应更大。(b)在溶液A中复性的速率更大。成核作用(第一个碱基对的形成)是一个限速步骤,单链分子的数目越大,重新形成碱基对的机率就越大,因而在溶液A中的DNA(含有2M单链DNA)将比溶液B中的DNA(含有0.1M单链DNA)更快地复性。l 答:眼形结构是由于双螺旋DNA局部片段解旋形成的。这些片段富含AT碱基对,AT比GC的热稳定性差。用这种方法可以检测DNA双螺旋链中碱基组成上的差别。ll答:因为核糖体RNA基因是多拷贝的。在
25、人体内的任一个细胞中,核糖体RNA基因在数目上远远高于球蛋白基因,因此一个rRNA探针遇到一个互补的人DNA序列的几率远远高于球蛋白探针。l1、称取25mg蛋白酶粉配制成25毫升酶溶液,从中取出0.1毫升酶液,以酪蛋白为底物,用Folin-酚比色法测定酶活力,得知每小时产生1500微克酪氨酸。另取2毫升酶液,用凯氏定氮法测得蛋白氮为0.2毫克(蛋白质中氮的含量比较固定:16)。若以每分钟产生l微克酪氨酸的酶量为1个活力单位计算。根据以上数据求:(a)1毫升酶液中所含蛋白质量及活力单位。(b)比活力。(c)1克酶制剂的总蛋白含量及总活力。(答案)第三章第三章 酶酶l2、从肝细胞中提取的一种蛋白水
26、解酶的粗提液300ml含有150mg蛋白质,总活力为360单位。经过一系列纯化步骤以后得到的4ml酶制品(含有0.08mg蛋白),总活力为288单位。整个纯化过程的收率是多少?纯化了多少倍?(答案)l3、1/v对1/S的双倒数作图得到的直线斜率为1.210-3min,在1/v轴上的截距为2.010-2nmol-1ml min。计算Vmax和Km。(答案)l4、一个二肽酶对二肽Ala-Gly和二肽Leu-Gly的Km分别为2.810-4和3.510-2,哪一个二肽是酶的最适底物?该酶的两个非竞争性抑制剂的Ki值分别为5.710-2和2.610-4。哪一个是最强的抑制剂?(答案)l5、根据米式方程
27、求(a)Kcat为30s-1,Km为0.005M的酶,在底物浓度为多少时,酶促反应的速度为1/4 Vmax?(b)底物浓度为1/2Km,2 Km和10 Km时,酶促反应的速率分别相当于多少Vmax?(答案)l6、延胡索酸酶催化延胡索酸水化生成L-苹果酸:该酶由四个相同的亚基组成,分子量为194,000。下面表格中的数据是延胡索酸作为底物,初始水化速率是在pH5.7,25下,酶浓度210-6M时得到的。用双倒数作图求出延胡索酸酶在这些条件下的Vmax,kcat和Km。(答案)l7、红细胞中的碳酸酐酶(Mr30000),具有很高的转换数。它催化CO2的可逆水合反应。H2O十CO2H2CO3 此反应
28、对CO2从组织运往肺部很重要。如果10mg的纯碳酸酐酶,37下一分钟内以最大速度可催化0.3g CO2的水合反应。碳酸酐酶的转换数(Kcat)是多少?。答案l8、许多酶会受到重金属离子,如Hg2+、Cu2+、Ag+等的不可逆抑制。这类重金属与酶中的活性巯基作用而使酶失活。E-SHAg+E-S-Ag+HAg+与巯基的亲和性如此之大,以至于Ag+可以用于-SH的定量滴定。欲使含有1.0mg/ml纯酶的10ml酶液完全失活,需加入0.342mmol的AgNO3。计算此酶的最小分子量。为什么能用此法计算酶的最小分子量?(答案)l9、酶溶液加热时,随着时间的推移,酶的催化活性逐渐丧失。这是由于加热导致天
29、然酶的构象去折叠。己糖激酶溶液维持在4512分钟后,活性丧失百分之五十。但是若己糖激酶与大量的底物葡萄糖共同维持在 4512分钟,则活性丧失仅为3。请解释,为什么在有底物存在下,己糖激酶的热变性会受到抑制?(答案)l10、新掰下的玉米的甜味是由于玉米粒中的糖浓度高。可是掰下的玉米贮存几天后就不那么甜了,因为50糖已经转化为淀粉了。如果将新鲜玉米去掉外皮后浸入沸水几分钟,然后于冷水中冷却,储存在冰箱中可保持其甜味。这是什么道理?(答案)l答:采下的玉米在沸水中浸泡数分钟,可以使其中将糖转化成淀粉的酶基本失活,而后将玉米存放在冰箱中,可以使残存的酶处于一种低活性状态,从而保持了玉米的甜度。l返回l
30、答:(a)0.625mg,250单位(b)400单位/mg(c)0.625g,2.5105单位l 答:80;1500倍。l答:Vmax50 nmol ml-1 min-1;Km6.0102 nmolml-1l答:Ala-Gly是最适底物;Ki值最小的那个是最强的抑制剂。l答:(a)1.710-3Ml (b)0.33;0.66;0.91l答:首先要分别计算出底物浓度和产物生成初始速度的倒数(注意在计算和绘图过程中选取合适的数值及单位),然后作图。1/Vmax0.20mmol-L min 所以Vmax5.0mmol L-1min-1 1/Km0.5mM-1 Km2.0mM或2.010-3M kca
31、t可以通过用Vmax除以Etotal而得到,Etotal为酶活性中心的浓度。因为延胡索酸酶由4个相同的亚基构成,即每一个四聚体的酶分子有四个活性部位,浓度为210-6M的延胡索酸酶可以表示为810-6M浓度的活性部位,或810-3mmol.L1。kcat的单位为S1。l 答:2.0107min-1或3.4105s-1l答:29,000;需要假定每一个酶分子只含有一个可滴定的巯基。l答:酶-底物复合物比单独的酶更稳定。1、确定下列各种辅酶,并指出它们是由哪种维生素衍生来的。(答案)(a)在使一个酮(例如丙酮酸)还原成次级醇(例如乳酸)反应中用的辅酶。(b)在使初级醇(例如乙醇)氧化为醛(例如乙醛
32、)反应中用的辅酶。(c)在依赖ATP的羧化(例如丙酮酸羧化生成草酰乙酸)反应中用的辅基。(d)在脱羧和转醛基(例如丙酮酸脱羧形成乙醛)反应中用的辅基。(e)在转甲酰基或甲叉基(羟甲基)反应中用的辅酶。(f)在转乙酰基或更长的脂酰基反应中用的辅酶。(g)在从氨基酸的碳上去除或取代基团的反应中用的辅基。第四章第四章 维生素和辅酶维生素和辅酶l2、某哺乳动物肝脏样品在三氯甲烷和水的混合物中匀浆,维生素A、B6、C、D各分布在哪一相中(答案)l3、人对烟酸(尼克酸)的需要量为每天 7.5毫克。当饮食中给予足量的色氨酸时,尼克酸的需要量可以降低。由此观察,尼克酸与色氨酸的代谢有何联系?当饮食是以玉米为主
33、食,而肉类很少时,人们易得癞皮病,为什么这种情况会导致尼克酸的缺乏,你能给予说明吗?(答案)l4、在一个典型的实验中,给予鸽子的一种实验饲料,浙渐地发现它们无法推持平衡及协调。而且它们的血液及脑中的丙酮酸比正常鸽子高出许多。若喂给鸽子肉汁,则此症状可以防止或改善。你能解释这个现象吗?(答案)l5、在冰箱内鸡蛋可保持4到6周仍不会变坏,但是去除蛋白的蛋黄,即使放在冰箱也很快地变坏。(答案)(a)什么因素因素使蛋黄变坏的呢?(b)你如何解释鸡蛋蛋白可以防止蛋黄变坏?(c)这种保护模式对鸟类有什么益处?l6、请写出维生素B1、B2的名称及它们的辅酶形式,它们是什么酶的辅?(答案)l7、怎样防止夜盲症
34、、佝偻病、脚气病和坏血症l(答案)l8、为什么维生素A及D可好几个星期吃一次,而维生素B复合物就必须经常补充?(答案)l9、角膜软化症是因维生素A缺乏,而使眼球乾燥及失去光泽,甚至造成失明。这种疾病危害很多小孩,但很少影响大人。在热带地区,每年约有10000个年纪18到36个月的小孩,因罹患此病而致瞎,相反大人即使食用维生素A缺乏的食物2年以上,结果只是患有夜盲症而已。当给予维生素A,则夜盲症很容易消失。请您解释为什么维生素A缺乏对小孩及大人的影响的差异会这么大?(答案)l10、肾性骨发育不全,或称肾性佝楼症,这种疾病主要是骨骼矿物质排除过多。肾病患者,即使给予均衡饮食,仍然会有肾性骨发育不全
35、发生。请问哪一种维生素与骨骼矿物质化有关?为什么肾脏受损会造成骨骼矿物质排除过多?(答案)l 答:维生素D3;受损的肾脏妨碍维生素D3完全羟化形成其生物活性形式。返回l答:(a)NADH(还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)或者NADPH(还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸),在上述两种情况下都是由烟酸衍生的。(b)NAD(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸),由烟酸衍生的。(c)生物胞素(一种生物素-Lys残基),由生物素衍生的。(d)TPP(硫胺素焦磷酸);由硫胺素(维生素B1)衍生的。(e)四氢叶酸,由叶酸衍生的。(f)CoA(辅酶A),由泛酸衍生的。(g)PLP(吡哆醛-5-磷酸),由吡哆醇(维生素B6)衍生的
36、。l答:在水相中将会发现维生素B6和维生素C,在有机相中将会发现脂溶性的维生素A和D。ll答:烟酸既是生物合成色氨酸所必需的,又可以由色氨酸合成。玉米中色氨酸的含量低。l 答:硫胺素缺乏。l:(a)细菌生长;l (b)抗生物素蛋白结合游离的生物素抑制细菌生长;l (c)在孵卵期,它保护了发育的胚胎免受破坏性细菌的生长。l答:B1称为硫胺素,辅酶名称为硫胺素焦磷酸,它是脱羧酶的辅酶。B2称为核黄素,辅酶为黄素单核苷酸(FMN)和黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD),为氧化还原酶的辅酶。ll答:分别服用维生素A、D、B1、C。l维生素A和D是脂溶性的维生素,可以贮存。但B族维生素是水溶性的,不能贮存,即维
37、生素B复合物的高溶解度导致了其快速排泄,所以必须经常补充。l 答:成熟的肝脏储存维生素A。第五章第五章 生物膜生物膜l1、一些药物必须在进入活细胞后才能发挥药效,但它们中大多是带电或有极性的,因此不能靠被动扩散跨膜。人们发现利用脂质体运输某些药物进入细胞是很有效的办法,试解释脂质体是如何发挥作用的。(答案)l2、一个红细胞的表面积大约为100m2,从4.7109个红细胞分离出的膜在水中形成面积为0.890m2的单层膜。从这个实验就细胞膜的构成能得出什么结论?(答案)l3、脂质体是一个连续的自我封闭的脂双层结构。(答案)l(a)脂双层形成的驱动力是什么?l(b)生物膜的结构对生物有什么重要作用?
38、l4、许多埋在膜内的蛋白(内在蛋白)与细胞中的蛋白质不同,它们几乎不可能从膜上转移至水溶液中。然而,此类蛋白的溶解和转移,常可用含有十二烷基硫酸钠或其它的去污剂,例如胆酸的钠盐等溶液来完成,这是什么道理?(答案)l5、将某细菌从37的生长温度转移至25后,利用什么手段可以恢复膜的流动性?(答案)l答:通过生产更多的不饱和脂肪酸链或较短的脂肪酸链可恢复膜的流动性。因为在较低的生长温度下,细菌必须合成具有更低Tm(高流动性)的不饱和脂肪酸或短的脂肪酸链,才能恢复膜流动性。l返回l 答:脂质体是脂双层膜组成的封闭的、内部有空间的囊泡。离子和极性水溶性分子(包括许多药物)被包裹在脂质体的水溶性的内部空
39、间,负载有药物的脂质体可以通过血液运输,然后与细胞的质膜相融合将药物释放入细胞内部。l 答:由一个红细胞的膜铺成的单层面积为0.8901012m2/(4.74109)188。由于红细胞表面积只有100m2,所以覆盖红细胞表面积的脂是双层的,即188/1002。换言之红细胞膜是由双层脂构成的。l 答:(a)形成双层的磷脂分子是两性分子(含有亲水和疏水部分)。脂双层的形成是由磷脂的疏水作用驱动的,这时磷脂疏水的脂酰链倾向于脱离与水的接触,水溶液中的磷脂分子的非极性尾部被水分子包围,磷脂分子之间为避开水疏水尾部彼此靠近,当磷脂双层结构形成时,脂酰链被限制在疏水的内部,而排挤出有序的水分子。该过程导致
40、这些水分子的熵大大增加,熵增加的量大大地超过由于更多有序的脂双层的形成导致熵减少的量。增加的熵以及脂双层中的相邻的非极性尾部之间的范德华接触对有利的(负的)自由能变化都有贡献,因此整个过程可以自发进行。(b)生物膜主要是由蛋白质、脂质、多糖类组成,形成一个流动的自封闭体系,它对生物的作用主要体现在以下方面:1、可以提供一个相对稳定的内环境。2、生物膜可以进行选择性的物质运输,保证生物体的正常生理功能。3、生物膜与信号传导、能量传递、细胞识别、细胞免疫等细胞中的重要过程相关。总之,生物膜使细胞和亚细胞结构既各自具有恒定、动态的内环境,又相互联系相互制约。l答:十二烷基磺酸钠和胆酸钠等去污剂,都具
41、有亲水和疏水两部分,它们可以破坏蛋白与膜之间的疏水相互作用,并用疏水部分结合蛋白的疏水部分,亲水部分向外,形成一个可溶性微团,将蛋白转移到水中。第六章 代谢总论1、在磷酸解中,一个键是受到无机磷酸的攻击(而不是象水解那样受水攻击)并被切断。某细菌含有蔗糖磷酸化酶,它能催化蔗糖的磷酸解:蔗糖+磷酸葡萄糖1-磷酸+果糖(a)从以下数据,计算蔗糖的磷酸解中的标准自由能变 化。H2O+蔗糖葡萄糖+果糖 G0=-29KJ/mol H2O+葡萄糖-1-磷酸葡萄糖+磷酸 G0=-21KJ/mol(b)计算蔗糖磷酸解的平衡常数。(答案)l2、辅酶Q的标准还原电势是+0.04V,黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)的标
42、准还原电势为-0.22V。说明FADH2被辅酶Q氧化时理论上释放的能量在标准条件下可以驱动由ADPPi合成ATP。(答案)l3、成年人每天利用ATP情况。(答案)(a)一个68kg的成年人每天(24h)需要此食物中摄取2000kcal(8360kJ)热量。食物代谢产生的能量主要用于身体日常的化学反应和机械功。假设食物能量转化为ATP的效率是50,计算成年人24h所利用的ATP的重量,它是人体重的百分之多少?(b)虽然成年人每天合成大量的ATP,但人本身的重量、构造和组成在此期间没有明显改变,试解释看似矛盾的现象。l4、任何氧化还原电对的标准还原电位都是由半电池反应确定的。NADNADH和丙酮酸
43、乳酸的标准还原电位分别为0.32V和0.19V。(答案)(a)哪一个共轭电对有较大失去电子的倾向?(b)哪一个共轭电对有较强的氧化能力?(c)如果在pH7时,每一反应物和生成物的浓度为1M,试问下列反应进行的方向。丙酮酸 NADHH=乳酸NAD(d)在25,此反应的标准自由能的变化G。(e)在25,此反应的平衡常数?l 答:(a)NAD+/NADH(b)丙酮酸/乳酸(c)乳酸形成方向(d)-25KJ/mol(e)2.5104返回l 答:(a)计算蔗糖磷酸解的标准自由能变化,只需要将两个反应原标准自由能变化加起来,而这两个反应组合就是总反应。G0(KJ/mol)H2O+蔗糖葡萄糖+果糖-29 葡
44、萄糖+磷酸H2O+葡萄糖-1-磷酸 21 蔗糖+磷酸葡萄糖-1-磷酸+果糖-8因此蔗糖磷酸解的标准自由能变化为-8KJ/mol。l(b)G0=-RTlnKeq,Keq=25ll答:首先计算耦合的氧化-还原反应的标准还原电势,然后计算标准自由能变化。因为将ATP水解为ADP+Pi的标准自由能变化为-30KJmol-1,因此ATP合成的标准自由能变化为+30KJ/mol。所以FADH2被辅酶Q氧化时理论上释放的能量要比由ADP+Pi合成ATP所需的自由能更多。l(a)46kg;68(b)ATP按照身体需要合成,然后降解为ADP和Pi,所以ATP的浓度维持在一个稳态水平,对身体没有明显影响。ll2、
45、在电子传递链中发现有6 种细胞色素都能通过可逆的氧化还原反应Fe3+Fe2+催化一个电子的传递。尽管铁在每种情况下都是电子载体,但是还原半反应的EO的值却从细胞色素b的0.05V变化到细胞色素a3的0.39V,试解释之。(答案)l3、细胞色素之间的电子传递涉及一个电子从一个铁原子上向另一个铁原子上转移。第二种电子转移方式则涉及氢原子和电子,在生物的氧化还原反应中,一个氢分子(H2或H:H)转移是普遍存在的。指出H2转移的两种机制,分别举例之。(答案)l4、超声处理产生的线粒体内膜碎片,内面朝外重新闭合形成的球状膜泡称为亚线粒体泡。这些小泡能够在NADH或QH2这样的电子源存在时,合成ATP。画
46、图显示在这些小泡中从NADH开始的电子传递以及随后的质子转运是如何发生的?(答案)l5、鱼藤酮是来自植物的一种天然毒素,强烈抑制昆虫和鱼类线粒体NADH脱氢酶;抗霉素A也是一种毒性很强的抗生素,强烈抑制电子传递链中泛醌的氧化。(a)为什么某些昆虫和鱼类摄入鱼藤酮会致死?(b)为什么抗霉素A是一种毒药?(c)假设鱼藤酮和抗霉素封闭它们各自的作用部位的作用是等同的,那么哪一个的毒性更利害?(答案)l6、线粒体的呼吸链的电子传递可用下列净反应方程式表示:NANHH+1/2O2H2ONAD+(a)计算此反应的E。(b)计算标准自由能变化G。(c)如果一分子ATP合成的标准自由能为7.3 Kcal mo
47、l,那么就理论上而言,上述总反应会生成多少分子的ATP?(答案)l 答:(a)NADH脱氢酶被鱼藤酮抑制降低了电子流经呼吸链的速度,因此也就减少了ATP的合成。如果在这种情况下生成的ATP不能满足生物体对ATP的需求,生物体将死掉。(b)因为抗霉素A强烈抑制泛醌的氧化,同样会发生(a)的情形。(c)由于抗霉素A封闭了所有电子流向氧的路径,而鱼藤酮只是封闭来自NADH,而不是来自FADH2的电子的流动,所以抗霉素A的毒性更强。返回l 答:半反应可以写作氧化态+ne 还原态两个半反应可以通过相加而获得一个耦合的氧化还原反应,书写时要将总反应中涉及到的还原态物质的半反应改变方向,同时也要改变它的还原
48、电势的符号。(a)23kJ/mol(b)-52 kJ/mol(c)-150 kJ/mol l 答:细胞色素是含有血红素基团的电子传递蛋白,在卟啉环中的每个铁原子的还原电势依赖于周围蛋白质的环境,因为每个细胞色素的蛋白质成分是不同的,因而每个细胞色素的铁原子具有不同的还原电势,还原电势的不同使一系列细胞色素可以沿着电势梯度传递电子ll 答:一个氢分子含有2个质子和2个电子,通过如下两种机制之一可以在生物体内由可氧化的底物进行传递。在NAD+还原过程中,一个氢离子(H:-)被转移到尼克酰胺环上同时H+被释放到溶液中,在FADH2的氧化过程中,通过等价的两个氢自由基(H)实现转移,组成自由基的H+和
49、电子通过分步进行的方式实现转移(H+e-H)。ll答:电子传递链的蛋白质镶嵌于线粒体的内膜,当膜的内侧被置于外侧时氧化还原酶的质子泵将H+运送到亚线粒体泡内(内部的pH值下降),同时电子传递给氧气,ATP合成酶现在将F1组分定位于小泡外侧,由于存在质子浓度梯度,H+通过F0通道转移到小泡的外侧,于是在该小泡的外侧可以合成ATP。l 答:会阻断丙酮酸经糖异生转化为葡萄糖的过程。因为生物素是催化丙酮酸羧化生成草酰乙酸反应的丙酮酸羧化酶的辅基,加入的抗生物素蛋白对生物素的亲和力高,使得反应缺乏生物素而中断。l第八章 糖及糖代谢1、已知一个只含有C、H和O的未知物质是从鸭肝中分离出的。当0.423g该
50、物质在过量氧气存在下完全燃烧后生成0.620gCO2和0.254gH2O。该物质的实验式与糖的是否一致?(答案)l2、在电子传递链中发现有6 种细胞色素都能通过可逆的氧化还原反应Fe3+Fe2+催化一个电子的传递。尽管铁在每种情况下都是电子载体,但是还原半反应的EO的值却从细胞色素b的0.05V变化到细胞色素a3的0.39V,试解释之。(答案)l3、细胞色素之间的电子传递涉及一个电子从一个铁原子上向另一个铁原子上转移。第二种电子转移方式则涉及氢原子和电子,在生物的氧化还原反应中,一个氢分子(H2或H:H)转移是普遍存在的。指出H2转移的两种机制,分别举例之。(答案)l4、超声处理产生的线粒体内
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