1、医学文献检索医学文献检索v1.11.1信息、知识、情报、文献信息、知识、情报、文献信息(信息(information):是自然界、人类社会以及人类思维活动中普遍存在的,是泛指一切事物(包括物质的或精神的)运动的状态及运动的方式。简而言之,是指事事物存在和运动状态及其特征的反映。物存在和运动状态及其特征的反映。根据来源分类:信息分为自然信息、生物信息、电子信息和社会信息四大类。信息无时不在,无处不有,充斥着整个宇宙。现在,信息无时不在,无处不有,充斥着整个宇宙。现在,人们将信息视同与物质、能源一样重要的三大资源之一。人们将信息视同与物质、能源一样重要的三大资源之一。2医学文献检索知识(知识(kn
2、owledge):):知识是人类对客观事物的认识、实践经验的总结,它来源于信息它来源于信息。v 知识是一种特定的人类信息,它是对信息进行提炼和深化的结果。知识经过不断提高和深化,形成较为完整的科学知识体系。知识按其内容可分为自然科学知识和社会科学知识,医学知识属于自然科学的范畴。3医学文献检索v情报(情报(information、intelligence):情报来源于知情报来源于知识,必须在特定的时间内经过及时传递,并能为用识,必须在特定的时间内经过及时传递,并能为用户所接受和利用。户所接受和利用。v最初用于战争,“战时敌情之报告”。后来应用领域越来越广,如经济情报、科技情报等等。国内图书情报
3、界对情报的解释常不同,我们把情报定义为“解决一个特定问题所需要的知识,是激活了的知识“v医学情报,则指获取所需的医学知识v情报具有情报具有三个特性:知识性、传递性、效用性。知识性、传递性、效用性。4医学文献检索n文献文献(1iterature):文献是指记录有知识的一切载体,是用文字、图表、可视图像、符号、声频、视频等手段,记录知识和信息的物质形态,或者说以一定方式将人类知识和信息记录于一定载体之上所形成的物体n文献三个要素:知识、载体和记录 3个方面相辅相承,缺其一不能成为文献n医学文献就是记录着医学知识、信息的物质载体,如医学图书、期刊、会议录等5医学文献检索1.2 文献的类型1、按文献载
4、体类型划分、按文献载体类型划分v 纸张型文献纸张型文献 缩微型文献缩微型文献 v 声像型文献声像型文献 机读型文献(数字化文献)机读型文献(数字化文献)2、按文献出版形式划分、按文献出版形式划分v 图书图书 专利文献专利文献v 期刊期刊 学位论文学位论文v 科技报告科技报告 技术档案技术档案v 会议文献会议文献 政府出版物政府出版物3、按文献加工层次划分、按文献加工层次划分v 零次文献、一次文献、二次文献、三次文献零次文献、一次文献、二次文献、三次文献6医学文献检索v零次文献未经加工、出版发行的文献,手稿、实验记录、原始录音录象,会议记录等v一次文献(原始文献)著者以本人的研究成果为素材写成的
5、原始创作。专著、期刊论文、学位论文、科技报告等v二次文献将一次文献收集整理加工著录其特征(著者、篇名、分类、主题等)并按一定顺序加以编排而成的检索工具。目录、索引、文摘、相应数据库;Yahoo、Google等 二次文献是供读者检索所需一次文献线索的新的文献形式。v三次文献科技人员围绕某一专题,利用二次文献的检索,在吸取一次文献内容的基础上撰写的新文献。综述、指南、字典、教科书、百科全书、年鉴、手册等参考工具书。三次文献信息含量大、综合性强、参考价值大7医学文献检索数据库的结构v文档(文档(Files)是数据库的组成部分。按其编排结构与功能分为顺排文档和倒排文档。其中顺排文档是数据库中的主文档,
6、是大量记录的集合。v记录(记录(Records)是数据库中一个完整的信息单元,由一系列字段构成。一条记录代表一篇文献。v字段(字段(Fields)是著录文献各项目的名称及其内容,是描述文献内外特征的各项标识内容。各字段都有相应的字段标识符,如题名(TI)、著者(AU)、地址(AD)、出处(SO)、主题词(MeSH)、主要主题词(MMH,MJME)、关键词(KW)、特征词(TG)、出版年(PY)、语种(LA)、摘要(AB)等等。v数据库文档记录字段(由大到小)字段(由大到小)8医学文献检索 文献数据库的类型书目数据库事实数据库数值型数据库全文型数据库图像数据库9医学文献检索书目数据库(Bibli
7、ographic Database)v主要指二次文献数据库,包括各种机读版的题录、文摘、目录等形式的数据库,仅提供原始文献的线索或简要的内容,指引用户去查原始文献。v如MEDLINE CD-ROM,CBMdisc等。10医学文献检索事实数据库(Fact Database)v或称指南数据库(Directory Database),提供问题的答案,如人物、机构、事件、疾病的诊断和治疗、药物的用法和副作用等信息。v如:机构指南、产品目录11医学文献检索数值数据库(Numeric Database)v提供数值性的信息,包括各种统计数据,科学实验数据、人口数据、化学品理化参数等。v例如美国国立医学图书馆
8、编制的化学物质毒化学物质毒性数据库性数据库RTECS,包含了10万多种化学物质的急、慢性毒力试验数据。12医学文献检索全文数据库(Full Text Database)v存储的是原始文献的全文,有的是印刷版的电子版,有的则是纯电子出版物v中国学术期刊全文数据库(CNKI)13医学文献检索图像数据库图像数据库(Image Database,Atlas online)v是以图像信息为主,适当配以简短的文字说明v如人体解剖图谱、心脏病图谱、眼科图谱、手术图谱、CT图谱、血液学图谱、中草药图谱等等。这些图谱一般都可在因特网上免费查到。14医学文献检索文献检索途径和检索语言检索途径:检索途径:以文献记录
9、中某一特征作为检索切入点所进行的检索,检索途径通常体现为字段检索。检索语言:检索语言:检索语言就是为沟通文献标引与文献检索而编制的人工语言,也是连接信息存储和检索两个过程中标引人员与检索人员双方思路的渠道,是用于文献标引和检索提问的约定语言15医学文献检索题名(书名、篇名)著者,机构名称代码(专利号、报告号、标准号)引文(被引作者姓名和引用文献出处)外表特征分类语言主题语言标题词关键词叙词内容特征检索语言外表特征语言是以文献上标明的、显而易见的特征,如题名、著者姓名、文献序号等作为文献的标识和检索的依据,供人们进行标引和检索,它们具有客观性和内容上的唯一性 在揭示文献特征与表达信息提问方面,具
10、有更大的深度。在用来标引与检索时,更需要依赖标引与检索人员的智力判断,更带有主观性 16医学文献检索(一)分类语言检索v分类检索语言是将表达文献信息内容和检索课题的大量概念,按其所属的学科性质进行分类和排列,并用号码(分类号)来表示概念及其在系统中的位置,甚至还表示概念与概念之间关系的检索语言。常用分类法:中国图书馆分类法中国科学院图书馆图书分类法美国国会图书馆图书分类法杜威十进制分类法v中图法类目体系 五个基本部类,22个基本大类 标记符号采用拉丁字母与阿拉伯数字相结合的混合号码制 17医学文献检索类目简表vA马克思、列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论vB哲学、宗教vC社会科学总论vD政治、法
11、律vE军事vF经济vG文化、科学、教育、体育vH语言、文字vI文学vJ艺术vK历史、地理Z综合性图书vN自然科学总论vO数理科学和化学vP天文学、地球科学vQ生物科学vR医药、卫生vS农业科学vT工业技术vU交通运输vV航空、航天vX环境科学、安全科学vZ综合性图书18医学文献检索中图法医药卫生vR 医药、卫生vR0 一般理论 vR1 预防医学、卫生学vR2 中国医学 vR3 基础医学vR4 临床医学 vR5 内科学vR6 外科学vR8 特种医学vR9 药学19医学文献检索 R5 内科学 R56 呼吸系统疾病 R57 消化及胸部系统疾病 R571 食管疾病 R573 胃疾病 R573.1 溃疡
12、 R573.2 消化道出血 R573.3 胃炎胃疾病的上位类胃疾病的下位类20医学文献检索(二)自由词检索v是作者写文章时选用的自然词语v包括 标题词(Title word)关键词(Keyword)文摘词(Abstract word)全文词(Full Text word)不受主题词表约束,同一概念用词取决于著 者的偏爱21医学文献检索 特点:特点:在文献各字段中必须有与输入的相同的字、词,才能命中,只要有一个字母不同,检出的结果就完全不同;若在字段中作些限定,查准率较高;肺炎 in ti其缺点是查全率较低,一些同义词、近义词都会被漏检 AIDS 艾滋病 爱滋病 获得性免疫缺陷综合症 22医学文
13、献检索(三)主题词检索v主题词也叫叙词(descriptor)指从自然语言中优选出来并经过规范化处理的名词术语。规范化处理使得一个概念只用一个词表达或一个词只表达一个概念。避免了一词多义、一义多词现象,使得同一主题概念的文献相对集中在一个主题词下,较好的实现查全率和查准率。23医学文献检索肿瘤关键词表达:carcinoma,tumor,cancer,neoplasms主题词表达:neoplasms艾滋病关键词表达:艾滋病,爱滋病,AIDS,获得性免疫缺陷综合症主题词表达:获得性免疫缺陷综合症24医学文献检索主题词表:主题词语言所涉及的各种概念以规范的词或词组固定下来,构成叙词表。常用医学主题词
14、表:中医药主题词表医学主题词表25医学文献检索v医学主题词表(Medical Subject Headings,简称MeSh),是美国国立医学图书馆编制的权威性主题词表。它是一部规范化的可扩充的动态性叙词表。美国国立医学图书馆以它作为生物医学标引的依据,编制医学索引(Index Medicus)及建立计算机文献联机检索系统MEDLINE数据库。vMeSh汇集著名医学专家、医学编辑和医学图书馆专家推荐的,使用频繁而又是使用者认可的约19,000多个医学主题词。医学主题词表26医学文献检索v副主题词,又称限定词(Qualifiers),主要与主题词进行组配,对某一主题词的概念进行限定或复分,使主题
15、词具有更高的专指性 如:neoplasms neoplasms/therapy 检索v副主题词表,每年略有变化,目前使用的副主题词是92个。vMesh规定了每个副主题词的组配范围和原则。并非每个副主题词都可与所有的主题词组配,两者之间要有必然的逻辑联系。药物治疗可以与疾病类主题词如“肾疾病”组配,但不能与解剖类主题词如“肾”组配。27医学文献检索MeSH的参照系统同义词、近义词、异形词等非主题词(款目词)用参照系统联系起来,帮助用户准确的选择规范化的主题词用代参照,指引检索者将非正式主题词用正式主题词。用“See”表示,逆参照用“X”表示。款目词 see 主题词,主题词 X 款目词例如,Can
16、cer See Neoplasms;Neoplasms X Cancer。通过用代参照处理,从若干同义关系的词或词组中,选定一个科学而通用的名称作为主题词,供检索文献用,其他的同义词作为款目词。28医学文献检索相关参照:处理词间的相关关系,指引检索者从一个主题词去参考有关的其他主题词,以扩大选词范围。用“See related”表示,逆参照用“XR”表示。主题词 see related 主题词,主题词 XR主题词例如,Contraception(节育)see related population control,population control XR Contraception.再如检索
17、Alopecia(脱发)这一概念时,要把它的相关参照Alopecia Mucinosa(斑秃)、Baidness(脱发)、Hair Diseases(毛发疾病)Hypotrichosis(毛发稀少)等4个相关参照词下的内容看清楚,才能达到查全的目的。29医学文献检索主题词检索的优点主题词检索的优点:输入非主题词(款目词)能引见到规范化主题词;liver cancer see liver neoplasms;输入不甚确切的相近词,或仅输入词的前半部,就会显示相近的规范主题词输入正确的主题词,就出现该主题词为首的其他相近词.对所选词的含义是否确切可通过“所选词详解”以确定是否选用;对所选词的内容范
18、围,可采用单主题词检索,也可通过扩展树,进行扩大范围检索;通过副主题词表,选择副主题词,以确定检索范围大小和提高查准率。30医学文献检索 著者检索著者检索(Author Searching)就是用文献上署名就是用文献上署名的作者或编者姓名作为检索入口词的作者或编者姓名作为检索入口词v中文用全称中文用全称 郑树 v外文 按规则转换一般是姓在前,名在后,且名多用首字母如 如:William Henry Smithv Smith WH 中文姓名转换规则与外文一样(四)著者检索31医学文献检索著者检索有四种情况限定在著者字段状态下,以文献的著者姓名为检索词进行检索。在默认或缺省状态下,检索时在著者姓名
19、后加in AU,如郑树in AU。这就是凡作者字段出现郑树郑树的文献都为命中文献。但在所检的文献中可能包括郑树森、郑树清等不同著者的文献都会被检出。若在姓名后不加in AU,则指在各字段中凡有该人姓名的文献(如在题名或文摘等字段中提及郑树的文献)都为命中文献。这实际上“郑树”相当于一个自由词或一个索引词。若用AU=郑树,则检出的都是以郑树为著者的文献。32医学文献检索 引文检索引文检索(Citation Searching):引文检索有引用文献检索和被引文献检索被引文献检索 v引用文献-参考文献(被引用文献)v可以查一篇文献的参考文献,也能查一篇文献被哪些文献引用v也可以作为评价手段(五)引文
20、检索33医学文献检索1.4 计算机信息检索技术1.布尔逻辑检索逻辑或逻辑与逻辑非运算符or +and *not-检索式A or BA+B A and B A*B A not B A-B 命中A和B有一个出现或两个都出现的记录A和B都出现的记录只出现A而不出现B的记录 图示 优先级()not andor35医学文献检索2、位置算符位置算符(proximation operator),又称邻近符,表示其连接的两个检索词之间的位置关系。不同检索系统的位置算符不尽相同,winspirs系统中的位置算符有near,with等。仅用于自由词检索。36医学文献检索v同句检索:near 要求参加检索运算的两个
21、检索词必须在同一自然句中出现。有的数据库用same,sentence表示v语法 检索词 nearN 检索词 检索词 near 检索词v例1:tongue near3 base v舌根(tongue base,base of tongue,base of the tongue)v例2:information near2 retrievalv信息检索(information retrieval,retrieval of information)37医学文献检索v同字段检索:with要求左右两个检索词出现在同一字段,词序也可颠倒,比near的检索范围宽。有的数据库中用“filed”表示 如:wome
22、n with hepatoma(肝细胞瘤)38医学文献检索3.字段限定符 语法:检索词 in 字段标识符或字段标识符=检索词 例:肺癌 in TI AU=郑树 郑树 in TI v年份限定范围运算符:=、=例:PY2000,PY=2000-2005v期刊范围限定默认为全部,有些数据库分重要期刊和核心期刊39医学文献检索文献数据库中常见字段字段名英文全称缩写题目titleTI作者authorAU文摘abstractAB叙词descriptorDE关键词Key wordKW作者单位Corporate on sourceCS刊名journalJN出版年份Publication year PY语种la
23、nguageLA40医学文献检索v在检索中运用多个算符时,运算次序依次为:()and notand or 例:(心律失常 or 心肌梗塞)and 死亡率 心率失常 or 心肌梗塞 and 死亡率4.优先运算符 ()41医学文献检索5.精确检索和模糊检索主要是字段限定检索两种表达试精确检索语法:字段标识符=检索词 例:AU=郑树模糊检索语法:检索词 in 字段标识符 例:郑树 in AU42医学文献检索6、截词检索truncation截词符:截词符:也称通配符,用来对检索词进行扩展。常用截词符号有“?”、“*”或“$”等。加在检索词的前、后或中间,具有将同一词干的词全部查出的功能,减少检索词的输
24、入,同时也方便解决语言文字拼写方面的差异(如美式英语和英式英语),避免漏检,扩大检索范围。截词有:无限(非限定性)截词、限定性截词和中间截词等。v?代表一个或零个字符(汉字)v*用在词尾,代表任意个字符(汉字)v不同的检索系统也会不同的通配符例:endoscop*,可以检出endoscope(内窥镜)endoscopy(内镜检查术)endoscopists(内镜师)等v限定截词:?,n个?号表示其后可添加的字符数少于等于n个 smok?Smok?Smok?v中间截词:hyp?tension 可同时检索出 hypertension(高血压)hypotension(低血压)hyp*tension
25、可检索出hypertension hypotension hyperextension(伸展过度)43医学文献检索1.5 编写检索式与调整检索策略编写检索式编写检索式v检索式又称检索提问式(query),是用户向检索系统提交文献需求的句式。检索提问式分简单提问式和复合提问式两种。v简单提问式也称简单检索式,指只提供一个检索词,表达一个简单的检索概念。例:郑树 in au Sars 高血压44医学文献检索v复合提问式也称复合检索式,指检索式中含有多个检索词,并用布尔逻辑符或其他运算符把它们组配起来构成的检索式。v例:郑树 in au and 大肠癌 高血压 流行病学acute near3 pan
26、creatitis and(mice or mouse)45医学文献检索查全、查准的一般性规律1.有主题词的,主题词优先2.主题词检索时,副主题词优先3.借助系统提供的主题词表注释,帮助你选定合适的主题词和副主题词4.无主题词的,自由词检索,同义词(or连接,还用截词符的应用)5.跟踪某一著名学者的文献和重要研究单位的文献,以这些作为主题途径检索的补充,还可能获得新的研究线索46医学文献检索当检出文献数太少时可用以下方法扩大检索范围:当检出文献数太少时可用以下方法扩大检索范围:删除不重要的用and联接的词汇增加用or连接的检索词用位置符放宽范围检索可用截词符扩大范围用主题词检索,可包含同义词、
27、近义词,用下位词进行扩展检索用主题词检索,选用多个副主题词或全部副主题词检索主题词检索,同时又用自由词检索,用or连接。从某个分类类目中输词检索改为在全部类目中输词检索选用多个数据库检索。用自由词检索或简单检索时选用“任意字段”检索通过索引词表选用近义词检索47医学文献检索当检出文献数量太大时可用下列方法缩小当检出文献数量太大时可用下列方法缩小检索范围检索范围:v增加用and连接的检索词,或用“二次检索”v用特定的副主题词进行限定v用字段限定检索,如标题、主要主题词检索、加权检索等v进行文献类型、语种、重要期刊、临床核心期刊、年份等限定检索v进入更专指的分类范围输入检索48医学文献检索1.6
28、参考工具书参考工具书参考工具书的定义:汇集某一范围知识资料、按照特定的方法加以编排,专供解难释疑时查考之用的图书参考工具书的特点:参考性、概括性、易检性49医学文献检索参考工具书的排检方法参考工具书的排检方法v一、字顺排检法一、字顺排检法v主要有部首法、笔画法、号码法和标音字母排检法。v二、内容类序法二、内容类序法包括分类排检法、主题排检法、时序法和地序法等。v1.分类排检法:将所收载的知识材料按其内容性质,学科属性分门别类地加以归并和排列的一种主要排检方法。v2.主题排检法:按资料涉及的一定主题进行编排的方法。v3.时序法:以内容的时间顺序排检。年表v4.地序法:以内容的地域顺序排检。50医学文献检索参考工具书的类型及参考工具书的类型及举要举要v一、类型1.按学科范围分,有自然科学工具书和社会科学工具书2.按收录内容分,有综合性工具书和专科性工具书3.按功能用途分,有词典(辞)、字典、药典、百科全书、年鉴、手册、名录、图录表谱等参考性工具书,有目录、题录、文摘等检索性工具书。广义的参考工具书还包括经典著作或教科书 v二、举要v中医辞海、中国外科年鉴、新编医院药物大全、实用药物手册、人体解剖学彩色图谱51医学文献检索
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