HPV基因分型检测课件.ppt

1、华大基因华大基因 HPV HPV 基因分型检测基因分型检测深圳华大基因研究院内容提要内容提要华大基因华大基因l 华大基因是全球最大的基因研究中心，建立了大规模测华大基因是全球最大的基因研究中心，建立了大规模测序、序、生物信息、克隆、健康、能源、农业基因组等技术生物信息、克隆、健康、能源、农业基因组等技术平台。平台。l 华大基因已逐步将基因组领域的最新研究成果应用于临华大基因已逐步将基因组领域的最新研究成果应用于临床，同时将最新的基因检测技术应用于分子诊断中。床，同时将最新的基因检测技术应用于分子诊断中。深圳华大基因研究院深圳华大基因研究院临床检验中心临床检验中心l 深圳华大基因临床检验中心成立

2、于深圳华大基因临床检验中心成立于20072007年，隶属于深圳华年，隶属于深圳华大基因健康事业部，同年获得大基因健康事业部，同年获得医疗机构执业许可证医疗机构执业许可证。l 华大基因临床检验中心的临床基因扩增实验室于华大基因临床检验中心的临床基因扩增实验室于20082008年成年成功获得功获得卫生部临检中心的准入验收卫生部临检中心的准入验收。l 华大基因临床检验中心为独立的第三方医学检测实验室，华大基因临床检验中心为独立的第三方医学检测实验室，有出具有出具医学检验报告资质医学检验报告资质。l 华大基因临检中心于华大基因临检中心于20092009年正式开展年正式开展临床检测服务临床检测服务。人类

3、乳头瘤病毒人类乳头瘤病毒（Human Papillomaviruses,HPVHuman Papillomaviruses,HPV）双链双链DNADNA无包膜病毒无包膜病毒环状环状DNADNA，约，约8Kb8Kb；病毒颗粒直径为病毒颗粒直径为50-55nm50-55nm；依靠宿主细胞进行复制、依靠宿主细胞进行复制、转录和翻译；转录和翻译；L1L1区是既保守又特异的区域，可作为区是既保守又特异的区域，可作为HPVHPV基因分型的基因分型的目标区域目标区域。19951995年年IARCIARC专题讨论会：专题讨论会：高危高危型型HPVHPV持续感染是宫颈癌的主要持续感染是宫颈癌的主要病因。病因。2

4、0082008年：年：Harald zur Hausen Harald zur Hausen因因发现发现HPVHPV和宫颈癌的关系而获得和宫颈癌的关系而获得诺贝尔生理学或医学奖。诺贝尔生理学或医学奖。宫颈癌是目前唯一病因明确，可以早发现、早预防的癌症。哪些型别属于高危型哪些型别属于高危型HPV?HPV?低危型：低危型：6 6、1111、4242、4343、4444、5353、8181高危型：高危型：1616、1818、2626、3131、3333、3535、3939、4545、5151、5252、5353、5656、5858、5959、6666、6868、7373、8282（20052005年

5、年IARCIARC专题讨论会专题讨论会）来自世界各国的宫颈癌组织标本研究发现，高危来自世界各国的宫颈癌组织标本研究发现，高危型型HPV16HPV16、1818型在宫颈癌患者中的感染率最高，约占型在宫颈癌患者中的感染率最高，约占64%64%。但是做。但是做HPVHPV检测时，只检测检测时，只检测1616、1818型是远远不型是远远不够的，还有约够的，还有约36%36%的宫颈癌是由其他型别的的宫颈癌是由其他型别的HPVHPV病毒病毒引起的。引起的。基因检测早于细胞！高危型高危型HPVHPV的持续感染导致宫颈癌发生的持续感染导致宫颈癌发生（能精确到DNA水平）基因水平检测方法基因水平检测方法（只能精

6、确到细胞水平）HPV基因检测比传统的宫颈癌筛查方法更早发现宫颈癌前病变，可以起到预防的作用，这样有利于宫颈癌癌前病变的早发现、早诊断、早治疗。非分子水平检测方法非分子水平检测方法HPVHPV不同亚型感染与许多疾病具有相关性不同亚型感染与许多疾病具有相关性HPVHPV亚型（高危型）亚型（高危型）临床病变临床病变1616肛门生殖器疣、女阴上皮内瘤变、肛门生殖器疣、女阴上皮内瘤变、上皮内瘤变、上皮内瘤变、CINCIN、宫颈癌、宫颈癌1818生殖器疣、生殖器疣、CINCIN、宫颈癌、宫颈癌3131、3535、4545、5252、5656、5858、6666、6868肛门生殖器疣、肛门生殖器疣、CINC

7、IN、宫颈癌、宫颈癌3333CINCIN、女阴上皮内瘤变、宫颈癌、女阴上皮内瘤变、宫颈癌3939肛门生殖器疣、肛门生殖器疣、CINCIN、宫颈癌、宫颈癌、鲍鲍温样丘疹病温样丘疹病5151、5959肛门生殖器疣肛门生殖器疣HPVHPV亚型（低危型）亚型（低危型）临床病变临床病变6 6、1111尖锐湿疣尖锐湿疣我国宫颈癌的现状我国宫颈癌的现状 发病率世界第二发病率世界第二我国宫颈癌的现状我国宫颈癌的现状 发病率世界第二发病率世界第二 发病率逐年升高发病率逐年升高数据来源:2009中国卫生统计年鉴我国宫颈癌的现状我国宫颈癌的现状 发病率世界第二发病率世界第二 呈现年轻化趋势呈现年轻化趋势（资料来源：

8、中国预防医学杂志）发病率逐年升高发病率逐年升高目前常用的宫颈癌检测技术目前常用的宫颈癌检测技术非分子水平检测方法基因水平检测方法醋酸白试验醋酸白试验荧光荧光PCR检测法检测法阴道镜检测阴道镜检测第二代杂交第二代杂交捕获法捕获法宫颈刮片细胞学检查宫颈刮片细胞学检查分子导流分子导流杂交法杂交法宫颈和宫颈宫颈和宫颈管管活组织检查活组织检查飞行时间质谱法飞行时间质谱法 基因水平检测不但可以对基因水平检测不但可以对HPVHPV病毒进行分型检病毒进行分型检测，而且还可以起到预防和警示作用，这样有利于测，而且还可以起到预防和警示作用，这样有利于HPVHPV感染的早发现、早诊断、早处理。感染的早发现、早诊断、

9、早处理。HPV HPV 基因分型检测的临床意义基因分型检测的临床意义宫颈病变风险提示宫颈病变风险提示ASCUSASCUS和低度病变的分流和低度病变的分流术后随诊手段术后随诊手段疫苗接种前的有效性指导疫苗接种前的有效性指导降低筛查成本降低筛查成本The PCR-MS Base MethodPCRPCR技术技术:1993:1993年诺贝尔化学奖年诺贝尔化学奖飞行时间质谱技术飞行时间质谱技术:2002:2002年诺贝尔化学奖年诺贝尔化学奖华大基因华大基因HPVHPV基因分型技术基因分型技术该检测方法的最大特点是将两种先进的检测技术整合起来，从而形成巨大的技术优势。MALDI-TOF-MS原理原理简简

10、介介 MassARRAY平台的核心技术为平台的核心技术为MALDI-TOF-MS，即基质辅助，即基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术。激光解析电离飞行时间质谱技术。通过测定离子的质量电荷之比（通过测定离子的质量电荷之比（M/Z）与离子的飞行时间成正比进行检测）与离子的飞行时间成正比进行检测MALDI-TOF-MS准确准确特异性高于目前经典的检测方法特异性高于目前经典的检测方法灵敏灵敏能检测到的病原体最小拷贝数为能检测到的病原体最小拷贝数为1010精确分型精确分型对全部对全部1414种高危种高危HPVHPV型别，及两种生殖道疣的主要致病病毒（型别，及两种生殖道疣的主要致病病毒（6 6、1111）

11、的精确分型的精确分型高通量、集成检测高通量、集成检测日检测量可达日检测量可达1000010000份样本份样本科研服务科研服务可根据需求增加可根据需求增加HPVHPV检测型别，最多可以检测检测型别，最多可以检测200200多种亚型多种亚型华大基因华大基因HPV HPV 基因检测特点基因检测特点现行现行HPV HPV 基因检测技术比较基因检测技术比较（基于真实临床样本检测数据）（基于真实临床样本检测数据）N/A:N/A:不可用不可用成功案例l 参与了由深圳女医师协会发起，北大医院、美国克利夫兰临检中心联合开展的万人宫颈癌筛查项目。华大基因质谱技术获得了一致好评，被认为独具优势，值得大力推广。l 与

12、北京肿瘤研究所合作并开展河南安阳地区食管HPV检测项目，累计进行了万余人份的筛查。服务内容：服务内容：HPV DNAHPV DNA检测主要用于妇科宫颈检测主要用于妇科宫颈筛查，筛查，也可用于其他临床或者科也可用于其他临床或者科研目的的人体样本检测研目的的人体样本检测提供全部提供全部1414种高危型种高危型HPVHPV及两种及两种生殖道疣的主要致病病毒（生殖道疣的主要致病病毒（6 6、1111）的精确分型检测服务的精确分型检测服务亦可根据临床需求增减检测型别亦可根据临床需求增减检测型别提供临检中心出具的检测报告提供临检中心出具的检测报告接受样本类型：接受样本类型：TCTTCT液基细胞学保存液保存

13、的宫液基细胞学保存液保存的宫颈脱落细胞颈脱落细胞 宫颈脱落细胞样本（华大提供宫宫颈脱落细胞样本（华大提供宫颈刷和细胞保存管）颈刷和细胞保存管）活检组织样本活检组织样本皮肤拭子，生殖道拭子等皮肤拭子，生殖道拭子等 4647484550515249545753424344415556585960666768657071726974777362636461757678798086878885909192899497938283848195969899100 6 7 8 5101112 9141713 2 3 4 1151618192016 611Genital Warts455152565859666826272825303132293437332223242135363839403133353918华大基因华大基因HPV HPV 基因分型检测服务基因分型检测服务 服务流程服务流程：临床样本接收临床样本接收样本入库样本入库PCR-PEX-MSPCR-PEX-MS分型检测分型检测数据分数据分析析临床检测报告临床检测报告 服务时间：服务时间：珠三角地区从样本接受日到检测报告发出，仅需珠三角地区从样本接受日到检测报告发出，仅需3 3个个工作日（根据具体地域不同，服务时间稍有差异，详情请工作日（根据具体地域不同，服务时间稍有差异，详情请咨询客服。）咨询客服。）