1、会议暨研讨会会议暨研讨会2008年4月8日10日 中国成都DICOM中的病理学中的病理学 第第26工作组工作组和和 IHE的进展的进展Bruce BECKWITH(1),Christel Daniel LE BOZEC(2),Marcial GARCIA-ROJO(3),John GILBERTSON(4),Harry SOLOMON(5)1)北岸医疗中心病理部,马萨诸塞州塞勒姆市。2)勒内笛卡尔大学INSERM UMRS 872,法国巴黎。3)Ciudad Real综合医院病理部,西班牙。4)马萨诸塞州总医院(Massachusetts General Hospital)病理部,马萨诸塞州波
2、士顿市。5)GE医疗集团综合IT解决方案(GE Healthcare Integrated IT Solutions),美国伊利诺伊州Barrington演示人:Marcial Garca Rojo医学数字成像与通信标准病理学 病理学病理学(了解疾病的依据)是一门视觉现(了解疾病的依据)是一门视觉现象丰富的医疗专业。象丰富的医疗专业。在放射学的引导下,它非常迅速地朝广泛应用数字图像的方向发展。两个专业的成像过程中存在明显区别。调整当前的DICOM标准以适应病理学中独特的成像方式。现在现在以前以前医学数字成像与通信标准病理学图像 大体图像大体图像:活组织检查、外科标本、尸体解剖。视频。显微镜图像
3、:显微镜图像:组织切片(活组织检查活组织检查、细胞块、尸体解剖)。染色和特殊技术。细胞学、分散。分子病理学:分子病理学:FISH、CISH、SISH(显微镜检查)琼脂糖凝胶。测序。挂号患者信息/安排订单计划程序存储大体图像存储显微镜图像(多模态)存储报告诊断站多模态工作表完成获取处理标本光学显微镜报告填写订单医学数字成像与通信标准DICOM 服务的一致性表示获取显示打印医学数字成像与通信标准Medical images web serviceTools in image viewer图像的一致表示保存病理医师保存病理医师的转换的转换原始图像原始图像&表示状态表示状态病理医师病理医师的转换已丢失
4、的转换已丢失原始图像原始图像Annotate原始图像原始图像窗口层窗口层翻转翻转放大放大处理过的图像处理过的图像原始图像原始图像关注关注区域区域批注批注关注关注区域区域医学数字成像与通信标准DICOM 和病理学 为病理学规定特殊的为病理学规定特殊的 DICOM 对象(对象(“信信息对象定义息对象定义”)需要修改和需要修改和/或扩展,有两个主要原因:或扩展,有两个主要原因:DICOM模型没有为成像样本的描述或特定标本与特定图像的结合提供强大的机制。一些病理学相关图像格式(整张切片图像、多谱段图像、流式细胞测量等)没有可应用的DICOM信息对象定义。医学数字成像与通信标准第26工作组建立于建立于2
5、005年年9月,有两个直接的目标:月,有两个直接的目标:1.升级和扩展用于描述病理学标本(成像过程的主题)的数据模型。2.创建一个在DICOM框架内存储、检索和查看整张切片显微镜图像的机制。医学数字成像与通信标准WG26.参与者 来自欧洲、日本和美国病理学学会的代表。来自欧洲、日本和美国病理学学会的代表。联系联系HL7 解剖病理学、解剖病理学、IHE-病理学和实验病理学和实验室特别兴趣小组(如:欧洲对话科技合作室特别兴趣小组(如:欧洲对话科技合作计划(计划(European COST)IC0604)。)。医学数字成像与通信标准DICOM 增补版122 定义了一个标本数据模型,使其适合解释定义了
6、一个标本数据模型,使其适合解释病理图学像所需的大量相关信息病理图学像所需的大量相关信息:标本类型,获取标本的程序,物理和化学处理,采样和二次采样的方法,等等。医学数字成像与通信标准统一概念 该增补版的一个重要部分是为主要概念确立统一的定该增补版的一个重要部分是为主要概念确立统一的定义。义。标本标本被定义为一个物理对象,实验室把它看作一个单离散被定义为一个物理对象,实验室把它看作一个单离散的、可唯一识别的的、可唯一识别的单元单元,是诊断工作流中一个或多个步骤,是诊断工作流中一个或多个步骤的主体。的主体。处理过程各个层面上的对象(从新鲜的组织到由包埋组织制成的切片,或分散体)。容器:容器:标本(标
7、本(1个或多个)物理放置的地方个或多个)物理放置的地方。桶、暗盒、玻璃小瓶和载玻片。医学数字成像与通信标准标本的DICOM 模型 标本标本物理对象容器容器盒子、区、载玻片等子段从属于n准备准备步骤步骤收集、采样、染色、处理 图像图像获取于1系列系列1n1创建设备设备模态1n检查检查包括患者患者1接受n1n来源1包括包括1nn有1n1有1成分成分盐基、盖玻片n医学数字成像与通信标准兼容性 该增补版还论述了新标本模块和标准该增补版还论述了新标本模块和标准中当前定义的标本坚定模块之间的兼容性。中当前定义的标本坚定模块之间的兼容性。决定:取消旧版的决定:取消旧版的DICOM标本鉴定模块。标本鉴定模块。
8、医学数字成像与通信标准整张切片成像 独特的挑战:独特的挑战:根据尺寸(它们可能包括数十亿甚至数万亿像素)超过 1 GB 的压缩文件/幻灯片。访问功能 模拟观察物理显微镜载玻片的经历。医学数字成像与通信标准查看大型图像 响应用户交互式命令,发送图像数据的小响应用户交互式命令,发送图像数据的小型子集型子集。推荐的解决方案推荐的解决方案:将这些整张切片图像并入将这些整张切片图像并入到到DICOM标准中,以便实现标准中,以便实现互操作性互操作性和支和支持快速、动态的持快速、动态的查看查看。医学数字成像与通信标准Universidades de Tampere y HelsinkiUniversidad
9、es de Tampere y Helsinki修订的标本模块 增补版增补版122 规定了规定了“标本模块和修订的病理学标本模块和修订的病理学SOP类类”。DICOM增补版增补版15添加了标本的概念,但未明确指添加了标本的概念,但未明确指出标本在出标本在DICOM信息模型中的信息模型中的位置位置,当前的标本,当前的标本鉴定处于鉴定处于患者患者层。层。处于处于图像层图像层的新的新标本标本模块模块。鉴定构成鉴定构成图像直接主体图像直接主体的标本(连同关键的的标本(连同关键的标本标本信息信息,如:说明、标本血统及处理)是解释图像,如:说明、标本血统及处理)是解释图像所必需的。所必需的。医学数字成像与
10、通信标准DICOM中的必要变化 标本模块已经符合标本模块已经符合HL7 v2 SPM分段和分段和HL7 v3草案的标本草案的标本域信息模型。域信息模型。检查层的现有登陆号可以重新使用。检查层的现有登陆号可以重新使用。不要求改变不要求改变DICOM中的信息或真实世界模型。中的信息或真实世界模型。提供标本相关信息的提供标本相关信息的DICOM信息模型扩展版。信息模型扩展版。从所有从所有IOD中取消旧的标本鉴定模块。影响现有设备吗?中取消旧的标本鉴定模块。影响现有设备吗?多半没影响,即便有影响的话,使用旧标本鉴定模块的实多半没影响,即便有影响的话,使用旧标本鉴定模块的实际设备也非常少。预期出现的问题
11、极少。际设备也非常少。预期出现的问题极少。医学数字成像与通信标准模态 模态工作表模态工作表 模态必须获得标本鉴定并将纳入获取的图像中。病理信息系统为每个成像标本提供标本模块的属性(IHE概要)。在放射学中,图像主体是患者;在病理学中,图像主体是来自患者的标本。模态执行过程步骤模态执行过程步骤 实验室信息系统可以得到每个标本产生的图像列表(IHE概要)。医学数字成像与通信标准DICOM中的虚拟切片“作为作为PACS卖方,我们将卖方,我们将WSI看作是下一看作是下一年的主要冒险活动。年的主要冒险活动。”“从扫描器发送出的图像已经格式化,以便从扫描器发送出的图像已经格式化,以便在在PACS外有效分配
12、,这对于病理学来说是外有效分配,这对于病理学来说是非常重要的。非常重要的。”“病理学病理学PACS将对连接到查看用户处的扫将对连接到查看用户处的扫描装置的描装置的 直通流(直通流(through-streaming)进行管理。进行管理。”(摘自摘自Ralf Zwnitzer 2006年年8月与月与WG26邮件发送清单成员的邮件通信邮件发送清单成员的邮件通信)医学数字成像与通信标准DICOM在病理学中的优势 组织:所有医疗专业医疗图像的中央储存组织:所有医疗专业医疗图像的中央储存库:库:PACS。集成电子健康记录。集成电子健康记录。适用于所有医疗图像的查看程序。适用于所有医疗图像的查看程序。以下
13、项目的独立性以下项目的独立性 装置制造商。专有的文件格式。医学数字成像与通信标准标准:IHE参与者(Actors)及事项处理(Transaction)订单放置物订单装填物订单结果追踪者证据创建者图像显示获取模态图像档案图像管理者存储模态图像(RAD-8)存储约定(RAD-10)订单结果管理(RAD-3)提供模态工作表(PAT-5)查询图像(RAD-14)找回图像(RAD-16)证据文件存储(RAD-43)存储约定放置物订单管理(RAT-1)装填物订单管理(RAT-2)过程预定和更新(PAT-4)IHE-病理学工作流医学数字成像与通信标准病理学中DICOM执行示例造型造型/组织处理室组织处理室会
14、议室会议室医院本地医院本地 IT基础结构基础结构医院局域网医院局域网病理办公室病理办公室解剖室解剖室挂号挂号医院局域网医院局域网诊断室诊断室试验室试验室SECAM网网SECAM中心服务设施中心服务设施Web服务(现行)医学数字成像与通信标准结论 数字图像和虚拟切片已经普遍应用于病理学,主数字图像和虚拟切片已经普遍应用于病理学,主要适用于第二意见(要适用于第二意见(second opinion)和继续教和继续教育。育。对于现有标准来说,虚拟切片技术是一项重大挑对于现有标准来说,虚拟切片技术是一项重大挑战。战。互操作性和长期解决方案需要病理学中的互操作性和长期解决方案需要病理学中的DICOM标准标准。PACS每年应能够管理每年应能够管理50个以上的个以上的TB。一些团体已经将一些团体已经将JPEG 2000(JPIP)视为备选方视为备选方案。案。医学数字成像与通信标准
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