蛋白质组学广州中医药大学课程课件.ppt

1、厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第一章第一章 绪论绪论分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划Proteome&Proteomics分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划Proteome&Proteomics 定义定义nProteome：n1994年，由澳大利亚年，由澳大利亚Macguarie大学的大学的Wilkins等等首先提出：首先提出：“蛋白质组指的是一个基因组所表达蛋白质组指的是一个基因组所表达的全部蛋白质的全部蛋白质”(proteome in

2、dicates the proteins expressed by a genome)n“proteome”是由蛋白质一词的前几个字母是由蛋白质一词的前几个字母“prote”和基因组一词的后几个字母和基因组一词的后几个字母“ome”拼接拼接而成而成n蛋白质组蛋白质组(Proteome):细胞内的全部蛋白质细胞内的全部蛋白质分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划Proteomics定义定义n蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象，研究蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象，研究细胞内所有蛋白质及其动态

3、变化规律的科学细胞内所有蛋白质及其动态变化规律的科学n最早是在最早是在1995年提出的，它在年提出的，它在本质本质上指的是上指的是在在大规模水平上大规模水平上研究蛋白质特征：研究蛋白质特征：n表达水平表达水平（量）（量）n翻译后的修饰（成熟与调控）翻译后的修饰（成熟与调控）n蛋白与蛋白相互作用（信号通路）等蛋白与蛋白相互作用（信号通路）等n由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识谢等过程的整体而全面的认识 分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人

4、类基因组计划人类基因组计划Proteome 与与 Genome关系关系n互补互补的角度的角度/空间来空间来研究细胞的分子架构研究细胞的分子架构n相辅相成相辅相成nGenome-导演导演RNome-编剧编剧Proteome-演员演员分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划Proteome 与与 Genome区别区别n稳定性稳定性nProteome-静态静态 nGenome-动态动态n修饰化程度修饰化程度nProteome-高高 nGenome-底底n复杂程度复杂程度nProteome-高高（

5、20aa +高度多样性修饰）高度多样性修饰）nGenome-底底（4nt）n特异性特异性nProteome-组织和细胞特异性组织和细胞特异性 nGenome-无组织和细胞特异性无组织和细胞特异性 分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划功能蛋白质组功能蛋白质组(functional proteome)n1997年，由年，由Cordwell和和Humphery-Smith提出提出的，它指的是在的，它指的是在特定时间、特定环境和实验特定时间、特定环境和实验条件下基因组活跃表达的蛋白质条件下基因

6、组活跃表达的蛋白质。n功能蛋白质组只是总蛋白质组的一部分功能蛋白质组只是总蛋白质组的一部分，通，通过对功能蛋白质组的研究，既能阐明某一群过对功能蛋白质组的研究，既能阐明某一群体蛋白质的功能，亦能丰富总蛋白质数据库，体蛋白质的功能，亦能丰富总蛋白质数据库，是从生物大分子是从生物大分子(蛋白质、基因蛋白质、基因)水平到细胞水平到细胞水平研究的重要桥梁环节。水平研究的重要桥梁环节。分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划功能蛋白质组功能蛋白质组厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第一章第

7、一章 绪论绪论分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组学研究思路与方法蛋白质组学研究思路与方法策略、技术、工具策略、技术、工具分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组研究相关网站蛋白质组研究相关网站n蛋白质组学研究依赖生物信息学和网络技术蛋白质组学研究依赖生物信息学和网络技术nhttp:/www.proteomeworks.bio- 蛋白质组研究技术、信息等蛋白质组研究技术、信息等nhttp:/ 发现新蛋白及新作用发现新蛋白及新作用(新药开发新药开发

8、)nhttp:/www.proteome.med.umich.edu 蛋白质组研究相关企业、各蛋白质组研究相关企业、各 种种仪器来源、新闻等仪器来源、新闻等nhttp:/www.proteome.co.uk 各种蛋白质组研究相关信息各种蛋白质组研究相关信息nhttp:/www.micromass.co.uk 介绍蛋白质鉴定的先进仪器介绍蛋白质鉴定的先进仪器nhttp:/www.expasy.ch 蛋白质鉴定专家系统蛋白质鉴定专家系统，Swiss Institute of Bioinformatics nhttp:/expasy.proteome.org.au 蛋白质鉴定专家系统蛋白质鉴定专家系

9、统，Australian Proteome Analysis Facilitynhttp:/expasy.cbr.nrc.ca 蛋白质鉴定专家系统蛋白质鉴定专家系统，Canadian Bioinformatics Resours 分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划主要专业术语及其英文对照和缩写主要专业术语及其英文对照和缩写nIPG-IEF：固相固相pH梯度等电聚焦（梯度等电聚焦（immobilized pH gradients isoelectric focusing）nSDS-PA

10、GE：十二烷基磺酸钠十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电聚丙烯酰胺凝胶电泳（泳（Sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis）n2-DE：双向电泳双向电泳(Two Dimensional Electrophoresis)nHPLC：高效液相色谱（高效液相色谱（High performance Liquid Chromatography）nMALDI-TOF MS：基质辅助激光解吸电离基质辅助激光解吸电离飞行时飞行时间间质谱（质谱（Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time-o

11、f-Flight Mass Spectrometry)分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划研究策略与技术研究策略与技术n两条互补的实验流程两条互补的实验流程n基于凝胶的工作流程基于凝胶的工作流程（Gel-based workflow）n基于液相色谱的工作流程基于液相色谱的工作流程（LC-based workflow）分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组学实验室所需的条件

12、蛋白质组学实验室所需的条件分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划双向凝胶电泳（双向凝胶电泳（2DE）n是是等电聚焦电泳等电聚焦电泳和和SDS-PAGE的组合的组合n即先进行等电聚焦电泳（按照即先进行等电聚焦电泳（按照pI分离）分离）n然后再进行然后再进行SDS-PAGE（按照分子大小）（按照分子大小）n凝胶经染色得到二维分布的蛋白质图凝胶经染色得到二维分布的蛋白质图 分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类

13、基因组计划人类基因组计划蛋白质组研究的基本技术蛋白质组研究的基本技术n2D-SDS-PAGE：n样品制备样品制备n第一向第一向IPG-IEF电泳电泳nIPG平衡平衡n第二向第二向SDS-PAGE电泳电泳n染色（银染）及染色（银染）及 图谱分析图谱分析n目标蛋白获取及其鉴定（目标蛋白获取及其鉴定（MC分析）分析）分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2DE结果图谱结果图谱分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人

14、类基因组计划人类基因组计划蛋白质组研究的基本技术蛋白质组研究的基本技术-样品预分离样品预分离n样品的制备（预处理）样品的制备（预处理）：n组织组织n细胞细胞n细胞器（线粒体、叶绿体、细胞核）细胞器（线粒体、叶绿体、细胞核）分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组研究的基本技术蛋白质组研究的基本技术-蛋白提取蛋白提取n重要性：重要性：n在制备时丢失的蛋白永远不能在后面实验中弥补在制备时丢失的蛋白永远不能在后面实验中弥补n把蛋白质看作具有独特而奇妙性质的把蛋白质看作具有独特而奇妙性质的

15、实体实体n原则：原则：n使所有待分析的蛋白样品全部处于溶解状态使所有待分析的蛋白样品全部处于溶解状态 n防止样品在聚焦时发生蛋白的聚集和沉淀防止样品在聚焦时发生蛋白的聚集和沉淀 n防止在样品制备过程中发生样品的抽提后化学修防止在样品制备过程中发生样品的抽提后化学修饰（如酶性或化学性降解等）饰（如酶性或化学性降解等）n完全去除样品中的核酸和某些干扰蛋白完全去除样品中的核酸和某些干扰蛋白 分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组研究的基本技术蛋白质组研究的基本技术-蛋白提取蛋白提取n步

16、骤：步骤：n破碎破碎n沉淀蛋白沉淀蛋白n去除杂质去除杂质分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组研究的基本技术蛋白质组研究的基本技术-蛋白提取蛋白提取n样品制备流程样品制备流程-破碎破碎尽可能减少蛋白水解尽可能减少蛋白水解/其它形式蛋白降解原则其它形式蛋白降解原则n机械法（超声波法、高压法机械法（超声波法、高压法、机械匀浆法、机械匀浆法）n化学法（去污剂法、酶裂解法化学法（去污剂法、酶裂解法）n物理法（液氮研磨法、循环冻融法、渗透物理法（液氮研磨法、循环冻融法、渗透法法、玻璃珠破碎

17、法、玻璃珠破碎法）分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组研究的基本技术蛋白质组研究的基本技术-蛋白提取蛋白提取n样品制备流程样品制备流程-沉淀蛋白沉淀蛋白 去杂浓缩后蛋白可溶性是关键去杂浓缩后蛋白可溶性是关键 nTCA-丙酮沉淀法丙酮沉淀法 n三氯醋酸（三氯醋酸（TCA）沉淀法）沉淀法 引起降解引起降解/修饰修饰 n丙酮沉淀法丙酮沉淀法 n硫酸铵沉淀法硫酸铵沉淀法 影响影响IEFn醋酸铵沉淀法醋酸铵沉淀法 步骤繁琐步骤繁琐 分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与

18、基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2D电泳结果影响因素分析电泳结果影响因素分析分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组研究的基本技术蛋白质组研究的基本技术-蛋白提取蛋白提取n样品制备流程样品制备流程-去除杂质去除杂质 关键是尽量不丢失蛋白和减少蛋白修饰关键是尽量不丢失蛋白和减少蛋白修饰 n核酸的清除核酸的清除（DNase/Rnase）n多糖的清除多糖的清除（超离心（超离心、TCA沉淀等）沉淀等）n去污剂的清除去污剂的清除（丙酮

19、沉淀法等）（丙酮沉淀法等）n盐离子和外源带电小分子的清除（透析、盐离子和外源带电小分子的清除（透析、TCA-丙酮沉淀法）丙酮沉淀法）分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2D电泳结果影响因素分析电泳结果影响因素分析可能原因：样品含高丰度可能原因：样品含高丰度Pr可能原因：可能原因：TCA残留致使残留致使Pr丢失丢失分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2D电泳结果影响因素分析电泳结

20、果影响因素分析可能原因：可能原因：Tris质量不好质量不好可能原因：可能原因：Urea 不纯不纯分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组研究的基本技术蛋白质组研究的基本技术-蛋白提取蛋白提取n样品制备注意事项：样品制备注意事项：n蛋白质水解蛋白质水解-蛋白酶抑制剂蛋白酶抑制剂(PMSF等等)n特殊样品的制备特殊样品的制备(低丰度低丰度、强碱性蛋白质、强碱性蛋白质（核糖体）、极端分子量（核糖体）、极端分子量)n样品定量样品定量 n重复性重复性分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体

21、与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2D-SDS-PAGE重复性重复性The same protocol and sample,however not the same resultsRec:similar;cir:different 分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2-DEn第一向第一向IPG-IEF电泳nIEF是一种根据样品的是一种根据样品的等电点不同等电点不同而使它而使它们在们在pH梯度中相互分离的一种电泳技

22、术梯度中相互分离的一种电泳技术n将等电点不同的蛋白质混合物加入有将等电点不同的蛋白质混合物加入有pH梯梯度的凝胶介质中，在电场内经过一定时间度的凝胶介质中，在电场内经过一定时间后，各组分将分别聚焦在各自等电点相应后，各组分将分别聚焦在各自等电点相应的的pH位置上，形成分离的蛋白质区带位置上，形成分离的蛋白质区带n从而得知其等电点信息从而得知其等电点信息分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划IEF的基本条件的基本条件step 1step 2step 3totalvoltageTimeVol

23、t-HoursRamp25020minLinear400040002hr10,000V-hrLinearRapid5 hr14,000V-hr7 cmstep 1step 2step 3totaltotalstep 1step 2step 311 cm17 cm25025080001000010000800020min20min2.5hr2.5hr20,000V-hr40,000V-hr30,000V-hr50,000V-hr5.3 hr7 hrLinearLinearLinearLinearRapidRapid分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世

24、分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划IPG-IEF电泳电泳分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2-DEn第二向垂直第二向垂直SDS-PAGE电泳电泳n聚丙烯酰胺凝胶形成网状结构，具有浓缩聚丙烯酰胺凝胶形成网状结构，具有浓缩效应、电荷效应、分子筛效应效应、电荷效应、分子筛效应。SDS与蛋与蛋白质形成雪茄状带负电荷复合物，从而消白质形成雪茄状带负电荷复合物，从而消除了蛋白间的电荷及形状差异，除了蛋白间的电荷及形状差异，电泳速度电泳速度仅与分子量有关仅与分子量有关

25、 n从而得知其分子量信息从而得知其分子量信息分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划第二向垂直第二向垂直SDS-PAGE电泳电泳n凝胶浓度与其对应的分离范围凝胶浓度与其对应的分离范围胶浓度胶浓度 分离范围分离范围(KD)5%36-200 7.5%24-200 10%14-200 12.5%14-100 15%14-60分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划第二向垂直第二向垂直SDS-

26、PAGE电泳电泳n步骤：步骤：n溶液配置溶液配置(Buffer、Bis-Acr、AP、TEMED)n灌胶灌胶n电泳电泳Ettan Dalt twelve电泳系统电泳系统分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划第二向垂直第二向垂直SDS-PAGE电泳电泳Ettan Dalt six电泳系统电泳系统分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2-DE 凝胶蛋白质斑点的检测凝胶蛋白质斑点的检测n

27、染色：染色：1）考马斯亮兰染色法；）考马斯亮兰染色法；2）银染法；）银染法；3）负染法；）负染法；4）荧光染色法；）荧光染色法；5）放射性同位素标记法等）放射性同位素标记法等分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2-DE 凝胶蛋白质斑点的检测凝胶蛋白质斑点的检测n图像扫描和分析图像扫描和分析Image Scanner II分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2-DE 凝胶蛋白质斑

28、点的检测凝胶蛋白质斑点的检测n全自动斑点切取系统（全自动斑点切取系统（Ettan Spot Picker）分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2-DE 凝胶蛋白质斑点的检测凝胶蛋白质斑点的检测n质谱或质谱或MALDI-TOF MSn质谱分析基本原理是使试样中各组分电离生成不质谱分析基本原理是使试样中各组分电离生成不同同荷质比荷质比的离子，经加速电场的作用，形成离子的离子，经加速电场的作用，形成离子束，进入质量分析器，利用电场和磁场使发生相束，进入质量分析器，利用电场和磁场使发生相反的速

29、度色散反的速度色散离子束中速度较慢的离子通过离子束中速度较慢的离子通过电场后偏转大，速度快的偏转小；在磁场中离子电场后偏转大，速度快的偏转小；在磁场中离子发生角速度矢量相反的偏转，即速度慢的离子依发生角速度矢量相反的偏转，即速度慢的离子依然偏转大，速度快的偏转小；当两个场的偏转作然偏转大，速度快的偏转小；当两个场的偏转作用彼此补偿时，它们的轨道便相交于一点用彼此补偿时，它们的轨道便相交于一点。与此与此同时，在磁场中还能发生质量的分离，这样就使同时，在磁场中还能发生质量的分离，这样就使具有同一质荷比而速度不同的离子聚焦在同一点具有同一质荷比而速度不同的离子聚焦在同一点上，不同质荷比的离子聚焦在不

30、同的点上上，不同质荷比的离子聚焦在不同的点上，将它，将它们分别聚焦而得到质谱图，从而确定其质量们分别聚焦而得到质谱图，从而确定其质量。分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2-DE 凝胶蛋白质斑点的检测凝胶蛋白质斑点的检测nMALDI-TOF MSn样品溶于固定的底物中形成晶体，用样品溶于固定的底物中形成晶体，用激光激光脉冲使其离子化脉冲使其离子化，离子被加速后通过飞行，离子被加速后通过飞行管时分离，所有离子均可被检测，常用来管时分离，所有离子均可被检测，常用来测测蛋白质蛋白质、多肽、核

31、酸和多糖等生物大分子多肽、核酸和多糖等生物大分子分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划2-DE 凝胶蛋白质斑点的检测凝胶蛋白质斑点的检测n通过质谱分析，可以获得分析样品的通过质谱分析，可以获得分析样品的分子量、分子量、分子式、分子中同位素构成和分子结构分子式、分子中同位素构成和分子结构等多等多方面的信息方面的信息SARS病毒病毒N蛋白整体分子量蛋白整体分子量 厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第一章第一章 绪论绪论分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划

32、蛋白质功能研究技术蛋白质功能研究技术分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质功能研究技术蛋白质功能研究技术n酵母双杂交酵母双杂交分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质功能研究技术蛋白质功能研究技术nCo-IP技术技术分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质功能研

33、究技术蛋白质功能研究技术nCo-IP&Pull down厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第一章第一章 绪论绪论分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划 蛋白质组在医学研究中蛋白质组在医学研究中的现状和前景的现状和前景 分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组在医学研究中的现状和前景蛋白质组在医学研究中的现状和前景n人类疾病的蛋白质组研究人类疾病的蛋白质组研究n直肠癌：直肠癌：Sanchez等对等对15例结肠癌和例结肠癌和13例正常例正常人的结肠上

34、皮进行人的结肠上皮进行2-DE。建立了包括。建立了包括882和和861个斑点的结肠癌及正常人结肠粘膜的个斑点的结肠癌及正常人结肠粘膜的标准胶图。结果发现在分子量为标准胶图。结果发现在分子量为13kD和和pI值为值为5.6处的蛋白质仅出现在结肠癌的组织处的蛋白质仅出现在结肠癌的组织中。经鉴定为：中。经鉴定为：钙粒蛋白钙粒蛋白B（calgranulin B）及钙卫蛋白（及钙卫蛋白（calprotectin）分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组在医学研究中的现状和前景蛋白质组在医学研

35、究中的现状和前景n人类疾病的蛋白质组研究人类疾病的蛋白质组研究n肝癌肝癌-醛糖还原酶醛糖还原酶 n膀胱癌膀胱癌-醛糖还原酶醛糖还原酶、Trp-tRNA合成酶、合成酶、IFN-诱导的诱导的r3，SOD及及35.8kD和和11.2kD两两未知蛋白未知蛋白 n扩张型心肌病扩张型心肌病-8种蛋白质种蛋白质分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组在医学研究中的现状和前景蛋白质组在医学研究中的现状和前景n 致病微生物的蛋白质组研究致病微生物的蛋白质组研究 n检测博氏疏螺旋体与免疫有关的蛋白质检

36、测博氏疏螺旋体与免疫有关的蛋白质 n弓形体抗原的检测弓形体抗原的检测n白色念珠菌白色念珠菌-对真菌细胞壁蛋白分析筛对真菌细胞壁蛋白分析筛选抗药真菌药物选抗药真菌药物厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第一章第一章 绪论绪论分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组学研究趋势蛋白质组学研究趋势 分子生物学分子生物学 第二章第二章 染色体与基因染色体与基因厚德 博学 精诚 济世分子生物学分子生物学 第三章第三章 人类基因组计划人类基因组计划蛋白质组学研究趋势蛋白质组学研究趋势n在应用研究方面在应用研究方面n蛋白质组学将成为寻找蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药疾病分子标记和药物靶标物靶标最有效的方法之一最有效的方法之一 n在技术发展方面在技术发展方面n研究方法将更强调各种方法间的研究方法将更强调各种方法间的整合和互整合和互补补，以适应不同蛋白质的不同特征，以适应不同蛋白质的不同特征n蛋白质组学与其它学科的交叉互动蛋白质组学与其它学科的交叉互动