1、 界（界（kingdom）动物界动物界(Animalia)门（门（phylum）脊索动物门脊索动物门(Chordata)脊椎动物亚门脊椎动物亚门(Vertebtata)纲（纲（class）哺乳动物纲哺乳动物纲(Mammalia)真兽亚纲真兽亚纲(Eutheria)目（目（order）灵长目灵长目(Primates)类人猿亚目类人猿亚目(Anthropoidea)科（科（family）人科人科(Hominidae)属（属（genus）人属人属(Homo)种（种（species）人种人种(sapiens)超超-（super-）；亚）；亚-（sub-）三界说、四界说、五界说、六界说三界说、四界说、五
2、界说、六界说 六界说：六界说：真细菌真细菌 古细菌古细菌 原生生物原生生物 真菌真菌 植物植物 动物动物原核生物原核生物真核生物真核生物 原核生物原核生物(prokaryote)：由原核细胞构成的单细胞生物：由原核细胞构成的单细胞生物 DNA分子无核膜包裹，遗传信息量小；分子无核膜包裹，遗传信息量小；细胞小，直径为细胞小，直径为0.210 m，有细胞壁；，有细胞壁；细胞内无细胞器。细胞内无细胞器。真核生物真核生物(eukaryote)：由真核细胞构成的单细胞、多细胞：由真核细胞构成的单细胞、多细胞生物生物 有核膜包裹的完整细胞核，核内有核膜包裹的完整细胞核，核内DNA借助组蛋白形成多个借助组蛋
3、白形成多个染色体；染色体；细胞体积较大，直径为细胞体积较大，直径为10100 m；细胞内有功能专一的细胞器。细胞内有功能专一的细胞器。细胞的结构（真核和原核）（1707-1778）瑞典博物学家瑞典博物学家 Linnaeus在在Systema Naturae中创立生物分类体系中创立生物分类体系 每个物种的科学名称由两部分组成：每个物种的科学名称由两部分组成：属名加种名，属名在前，第一个字母属名加种名，属名在前，第一个字母大写；种名在后，小写；其后还可标大写；种名在后，小写；其后还可标注发现的地名或发现者的名字；采用注发现的地名或发现者的名字；采用拉丁文拉丁文 模式生物基因组计划是人类基因组计划的
4、一个重要组成部分模式生物基因组计划是人类基因组计划的一个重要组成部分为人类基因组研究做方法学和组织工作的准备为人类基因组研究做方法学和组织工作的准备（1）将从模式生物中得到的数据和资料与人类基因组比较，通过不同生物基）将从模式生物中得到的数据和资料与人类基因组比较，通过不同生物基因序列的同源性来阐明人类相应基因的功能；因序列的同源性来阐明人类相应基因的功能；（2）通过研究小而简单的模式生物的基因组，积累经验，发展技术；）通过研究小而简单的模式生物的基因组，积累经验，发展技术；（3）对模式生物的研究亦具有重要的经济价值。）对模式生物的研究亦具有重要的经济价值。模式生物的基因组结构相对于人类基因组
5、来说，比较简单，在模式生物的基因组结构相对于人类基因组来说，比较简单，在基因组测序时可以为人类基因组计划提供借鉴，更重要的是对这基因组测序时可以为人类基因组计划提供借鉴，更重要的是对这些模式生物体的功能基因的认识可以为认识人类基因组的功能提些模式生物体的功能基因的认识可以为认识人类基因组的功能提供更多的帮助。供更多的帮助。四大四大“模式生物模式生物”：酵母、线虫、果蝇、小鼠：酵母、线虫、果蝇、小鼠 感染细菌、真菌、放线菌或螺旋体等微生物的病毒感染细菌、真菌、放线菌或螺旋体等微生物的病毒 如：大肠杆菌噬菌体如：大肠杆菌噬菌体(coliphages)遗传物质：单链遗传物质：单链/双链、环状双链、环
6、状/线状、线状、DNA/RNA电镜下的蝌蚪形噬菌体电镜下的蝌蚪形噬菌体 不具有细胞形态结构，仅由核酸和蛋白质构成；不具有细胞形态结构，仅由核酸和蛋白质构成；如：人艾滋病毒如：人艾滋病毒HIV、SARS冠状病毒冠状病毒 体积小，体积小，10300nm；严格的专性细胞内寄生；严格的专性细胞内寄生；对抗生素不敏感。对抗生素不敏感。电子显微镜下的电子显微镜下的SARS冠状病毒冠状病毒100nm放大了放大了15万倍的万倍的H5N1型禽流感病毒型禽流感病毒 人类研究得最为详尽的模式生物：人类研究得最为详尽的模式生物：结构简单，基因组小，无内含结构简单，基因组小，无内含子，无性繁殖，可人工培养。因此，作为分
7、子生物学及相关基础生物学研究子，无性繁殖，可人工培养。因此，作为分子生物学及相关基础生物学研究的材料，是一种良好的模式生物的材料，是一种良好的模式生物 K12菌株，全基因组于菌株，全基因组于1997年测定，长年测定，长460万万bp 长度长度1.6 m，单细胞原核生物，繁殖快。，单细胞原核生物，繁殖快。大肠杆菌及其大肠杆菌及其全基因组全基因组 属于真菌界的单细胞真核生物；属于真菌界的单细胞真核生物；有有16条染色体，全基因组于条染色体，全基因组于1996年测定：遗传学上的里程年测定：遗传学上的里程碑碑 细胞数目一定：成虫细胞数目只有细胞数目一定：成虫细胞数目只有959个，其中包括个，其中包括3
8、02个个神经元；神经元；有有6条染色体，全基因组于条染色体，全基因组于1998年测定，长年测定，长9.7Mb荧光显微镜下的秀丽线虫荧光显微镜下的秀丽线虫 生活周期短、容易饲养、繁殖力强、染色体数目少、易于生活周期短、容易饲养、繁殖力强、染色体数目少、易于观察、容易诱发变异等特点观察、容易诱发变异等特点；全基因组长约全基因组长约1.8亿亿bp。果蝇：遗传学和分子发育生果蝇：遗传学和分子发育生物学的国王物学的国王果蝇的果蝇的4 4对染色体照片对染色体照片 十字花科草本，生活周期为十字花科草本，生活周期为6周，是理想的模式植物；周，是理想的模式植物；5条染色体，全基因组长约条染色体，全基因组长约1.
9、0108 bp。植物中的植物中的“果蝇果蝇”拟南芥拟南芥 基因组大小与人类相近，约基因组大小与人类相近，约30亿个核苷酸对，有亿个核苷酸对，有19条染色条染色体；体；1999年小鼠基因年小鼠基因组测序项目启动组测序项目启动2002年年8月完成小鼠月完成小鼠基因组物理图谱基因组物理图谱2002年年12月完成小月完成小鼠基因组序列草图鼠基因组序列草图 基因组比较紧致，为小麦的基因组比较紧致，为小麦的1/37，是禾本科植物的首选测序，是禾本科植物的首选测序对象；对象；12条染色体；约为人类基因组的七分之一，大约条染色体；约为人类基因组的七分之一，大约4.3亿亿bp。1 1个受精卵在个受精卵在2424
10、小时内分裂到各种器官初具雏形的程度小时内分裂到各种器官初具雏形的程度 身体透明的小鱼，生活周期约身体透明的小鱼，生活周期约3 3个月，是研究脊椎动物发育个月，是研究脊椎动物发育过程的良好对象。过程的良好对象。从化学成分看，生物体内除了水、无机盐类、离子，主要从化学成分看，生物体内除了水、无机盐类、离子，主要有有4类分子，其中类分子，其中3类可以形成大分子。类可以形成大分子。小分子小分子大分子大分子单糖、双糖单糖、双糖多糖、淀粉、糖原、纤维素多糖、淀粉、糖原、纤维素脂肪酸脂肪酸核苷酸核苷酸核糖核酸核糖核酸RNA、脱氧核糖核酸、脱氧核糖核酸DNA氨基酸氨基酸蛋白质蛋白质 作为燃料（是生命活动所需的
11、能源）作为燃料（是生命活动所需的能源）重要的中间代谢物重要的中间代谢物 参与生物大分子组成参与生物大分子组成 作为信号分子作为信号分子 碳水化合物，含碳水化合物，含C、H、O三种元素，比例一般为三种元素，比例一般为1:2:1。小分子：单糖、双糖、三糖小分子：单糖、双糖、三糖大分子（由单糖构成的多糖）：淀粉、糖原、纤维素大分子（由单糖构成的多糖）：淀粉、糖原、纤维素 构成生物膜的骨架构成生物膜的骨架 储存能量（效率是糖的储存能量（效率是糖的2倍左右）倍左右）构成生物表面的保护层、保温层构成生物表面的保护层、保温层 重要的生物学活性物质重要的生物学活性物质碳水化合物，含碳水化合物，含C、H、O三种
12、元素，三种元素，H:O远大于远大于2，某些脂，某些脂类含有类含有P、N；不溶于水，但溶于非极性溶剂；不溶于水，但溶于非极性溶剂；中性脂肪、磷脂、类固醇、萜类中性脂肪、磷脂、类固醇、萜类 是遗传信息转化成生物结构和功能的表达者；是遗传信息转化成生物结构和功能的表达者；参与基因表达的调节，以及细胞中氧化还原反应、电子传参与基因表达的调节，以及细胞中氧化还原反应、电子传递、神经传递、学习记忆等重要生命过程；递、神经传递、学习记忆等重要生命过程；酶（一类重要的蛋白质）在细胞和生物体内各种生化反应酶（一类重要的蛋白质）在细胞和生物体内各种生化反应中起催化作用；中起催化作用；某些蛋白质为生物生长提供营养；
13、某些蛋白质为生物生长提供营养；某些蛋白质是动物的攻防武器（蛇毒、蜂毒）。某些蛋白质是动物的攻防武器（蛇毒、蜂毒）。蛋白质是细胞的重要组成成分。除含有蛋白质是细胞的重要组成成分。除含有C、H、O、N外，还有外，还有S。蛋白质的基本结构单位为氨基酸（。蛋白质的基本结构单位为氨基酸（amino acid）。蛋白质）。蛋白质种类繁多，估计有种类繁多，估计有10101012种。种。符号符号意义意义符号符号意义意义A(Ala)丙氨酸丙氨酸N(Asn)天冬酰胺天冬酰胺B天冬氨酸天冬氨酸/天冬酰胺天冬酰胺P(Pro)脯氨酸脯氨酸C(Cys)半胱氨酸半胱氨酸Q(Gln)谷氨酰胺谷氨酰胺D(Asp)天冬氨酸天冬氨
14、酸R(Arg)精氨酸精氨酸E(Glu)谷氨酸谷氨酸S(Ser)丝氨酸丝氨酸F(Phe)本丙氨酸本丙氨酸T(Thr)苏氨酸苏氨酸G(Gly)甘氨酸甘氨酸U硒代半胱氨酸硒代半胱氨酸H(His)组氨酸组氨酸V(Val)缬氨酸缬氨酸I(Ile)异亮氨酸异亮氨酸W(Trp)色氨酸色氨酸K(Lys)赖氨酸赖氨酸Y(Tyr)酪氨酸酪氨酸L(Leu)亮氨酸亮氨酸Z谷氨酸谷氨酸/谷氨酰胺谷氨酰胺M(Met)甲硫氨酸甲硫氨酸一级结构一级结构(primary structure)多肽链中氨基酸数目、种类和线性多肽链中氨基酸数目、种类和线性排列顺序排列顺序二级结构二级结构(secondary structure)氢键
15、形成氢键形成-螺旋螺旋(-helix)链间形成链间形成-折叠折叠(-sheet)三级结构三级结构(tertiary structure)肽链进一步沿多方向盘绕成紧密的肽链进一步沿多方向盘绕成紧密的近似球状结构近似球状结构四级结构四级结构(quaternary structure)具有特定构象的肽链进一步结合，具有特定构象的肽链进一步结合，并在空间相互作用并在空间相互作用 存在于细胞核内的染色质中，以及线粒体存在于细胞核内的染色质中，以及线粒体和叶绿体中和叶绿体中 DNA是遗传信息的携带者是遗传信息的携带者核酸是最重要的一类生物大分子。核酸是最重要的一类生物大分子。1870年，年，F.Miesc
16、her从脓细胞的核中分离，由于呈酸性，故从脓细胞的核中分离，由于呈酸性，故命名为核酸。命名为核酸。在细胞核内产生，再进入细胞质中在细胞核内产生，再进入细胞质中 RNA在蛋白质合成中起重要作用在蛋白质合成中起重要作用核苷酸核苷酸代码代码核苷酸核苷酸代码代码A（腺嘌呤）（腺嘌呤）AU（尿嘧啶）（尿嘧啶）UC（胞嘧啶）（胞嘧啶）CC或或T（U）YG（鸟嘌呤）（鸟嘌呤）GG或或T（U）KT（胸腺嘧啶）（胸腺嘧啶）TA或或T（U）W非非ABA或或GR非非CDA或或CM非非GHG或或CS非非TVA或或C或或G或或T（U）N1、普遍性：对大多数病毒、原核生物、真菌、植物、动物都适用；普遍性：对大多数病毒、原
17、核生物、真菌、植物、动物都适用；2、特殊性：、特殊性：支原体：支原体：UGA 色氨酸色氨酸(Trp)嗜热四膜虫：嗜热四膜虫：UAA 谷氨酰胺谷氨酰胺(Gln)线粒体：与核线粒体：与核DNA编码的氨基酸有部分差异编码的氨基酸有部分差异线粒体线粒体DNA与核与核DNA密码差异密码差异物种物种密码密码线粒体线粒体DNA编码的氨基酸编码的氨基酸核核DNA编码的氨基酸编码的氨基酸所有所有UGATrp(色氨酸）色氨酸）STOP酵母酵母CUAThrLeu（亮氨酸）（亮氨酸）果蝇果蝇AGASer（苏氨酸）（苏氨酸）Arg（精氨酸）（精氨酸）哺乳类哺乳类AGA/AGGSTOPArg（精氨酸）（精氨酸）AUAMet（蛋氨酸）（蛋氨酸）Ile（异亮氨酸异亮氨酸）思考：思考：生物信息学的研究对象从哪里得到？生物信息学的研究对象从哪里得到？比如：比如：1.人类全基因组人类全基因组DNA序列；序列；2.有哪些存在于细胞核的蛋白质已经有哪些存在于细胞核的蛋白质已经被确定？被确定？3.血红蛋白的结构是什么样？血红蛋白的结构是什么样？下节课提问下节课提问
