1、第九章第九章 微生物的生态微生物的生态第一节第一节 微生物在自然界中的分布微生物在自然界中的分布第二节第二节 微生物与生物环境间的关系微生物与生物环境间的关系第三节第三节 微生物与自然界物质循环微生物与自然界物质循环第四节第四节 微生物与环境保护微生物与环境保护前前 言言 生态学：研究生物系统与其所处环境条件之间的相互作用规律性的科学。研究内容：微生物群体微生物区系（microflora）或正常菌群（normal flora）对其周围生物和非生物环境条件的相互作用关系 生态学研究范围：生物圈（biosphere）、生态系统（ecosystem）、群落（community）、种群（populat
2、ion）。研究意义：理论：地球进化和生物进化原因实践：开发菌种资源、防治有害微生物、新的微生物农药、菌肥、医药、混菌发酵、生态农业，促进探矿、冶金、环保、提高土壤肥力以及开发生物能等几个概念几个概念 生物圈：地球上的所有生物。生态系统：生物群落与其无机环境相结合、相作用、相调控而成的动态系统。群落：同一环境中两个以上种群由于生活繁殖上的连锁而构成相依赖、相制约的生物集团。种群：生活在同一环境中的同种个体组成的能繁殖集团。与同种别地的种群有隔离、有界限。第一节第一节 微生物在自然界中的微生物在自然界中的分布与菌种资源分布与菌种资源本节内容：本节内容：一、微生物在自然界的分布一、微生物在自然界的分
3、布二、菌种资源的开发二、菌种资源的开发一、微生物在自然界中的分布一、微生物在自然界中的分布生物体内外正常的菌群生物体内外正常的菌群土壤中的微生物土壤中的微生物水中微生物水中微生物空气中微生物空气中微生物工农业产品中的微生物工农业产品中的微生物极端环境下的微生物极端环境下的微生物生物体内外的正常菌群生物体内外的正常菌群人体的正常微生物区系人体的正常微生物区系：生活在健康动物各部位，数量大、种类较稳定且一般是有益无害的微生物，称为正常菌群。正常菌群与人体的关系：一般能维持平衡，菌群内部的各种微生物之间，也是相互制约而维持相对稳定。变化情况：正常菌群是相对的、可变的、有条件的。机体防御机能减弱时，一
4、部分正常菌群会成为病原微生物；正常菌群在非正常部位时也可引起疾病；由于外界因素的影响，破坏了各种微生物之间的相互制约关系，正常菌群也会引起疾病（菌群失调症）。其它生物体其它生物体（germ-free animal）：体内外检查不到任何正常菌群的动物（gnotobiotics）：已经人为接种某已知纯种微生物的无菌动物（rhizosphere microorganism）：植物根系经常向周围土壤分泌各种外渗物质，故根际有大量微生物活动。种类组成受植物的种类和植物发育阶段影响。作用是改善植物营养、分泌生长刺激素及抗生素等；有时也有害，与植物争夺N、P等营养、分泌毒素等。（epibiotic micr
5、obe）：指生活在植物体表面，主要借其外渗物质或分泌物质为营养的微生物。叶面微生物是主要的附生微生物。土壤中的微生物土壤中的微生物土壤是微生物生长和栖息的良好基地土壤是微生物生长和栖息的良好基地土壤中微生物数量与分布土壤中微生物数量与分布土壤是微生物良好的生活场所土壤是微生物良好的生活场所 1 1、为微生物提供了良好的、为微生物提供了良好的 源、源、能源源、源、能源2、为微生物提供有机物为微生物提供有机物 无机盐无机盐 微量元素微量元素4、土壤值范围土壤值范围5.55.58.58.5之间之间5、温度温度 季节与昼夜温差不大季节与昼夜温差不大6、土壤颗粒空隙间充满着空气和水分土壤颗粒空隙间充满着
6、空气和水分7、适宜的渗透压适宜的渗透压3、满足了微生物对水分的要求满足了微生物对水分的要求 土壤中微生物的数量：按种类递减土壤中微生物的数量：按种类递减 细菌放线菌霉菌酵母菌藻类原生动物 108107 106 105 104103个/g按生物量计算：按生物量计算：霉菌细菌原生动物藻类酵母菌 150 75 15 7.5 7.5 kg/亩土壤微生物的代谢活动，可改变土壤的理化性土壤微生物的代谢活动，可改变土壤的理化性质，进行物质转化，因此，土壤微生物是构质，进行物质转化，因此，土壤微生物是构成土壤肥力的重要因素。成土壤肥力的重要因素。附中国不同土壤类型微生物数量典型果园土壤不同深度每克土壤的典型果
7、园土壤不同深度每克土壤的微生物菌落数微生物菌落数深度深度/cm细菌细菌放线菌放线菌*真菌真菌藻类藻类3-8975000020800001190002500020-25217900024500050000500035-40570000490001400050065-751100050006000100135-14514003000我国各主要土壤的含菌量我国各主要土壤的含菌量(万万/克干土克干土)土类地点细菌放线菌真菌暗棕壤黑龙江呼玛2,32761213棕壤辽宁沈阳1,2843936黄棕壤江苏南京1,4062716红壤浙江杭州1,1031234砖红壤广东徐闻5073911磷质石灰土西沙群岛2,22
8、91,10515黑土黑龙江哈尔滨2,1111,02419黑钙土黑龙江安达1,0743192棕钙土宁夏宁武140114草甸土黑龙江亚沟7,8632923嵝土陕西武功9511,0324白浆土吉林皎河1,598553滨海盐土江苏连云港466410.4水中的微生物水中的微生物 自然界江河湖海等各种淡水与咸水水域中都生存着相应的微生物。水域中微生物的种类和数量与水域的有机物、无机物的种类和含量，光照、酸碱度、渗透压、温度、含氧量和有毒物质的含量有密切关系。各种水系：水淡水海水地下水：无色杆菌、黄杆菌、革兰氏阳性杆菌、微球菌、诺卡氏菌溪水：营养少、主要是革兰氏阴性无芽孢杆菌、生丝微菌河水：出现假单孢菌、芽
9、孢、肠杆菌、弧菌、螺菌、硫细菌、微球菌、八叠球菌、诺卡氏菌、链球菌、螺旋体等生活污水：荧光、绿脓、变形、枯草、阴沟、大肠、粪链球菌、病毒和噬菌体生产污水：与所含污物有关 污水地表水海水：海水：特点：平均含盐量：特点：平均含盐量：3.5%，密度大、渗透压高、冰点低，密度大、渗透压高、冰点低微生物组成：多微生物组成：多G-、多嗜盐、河口处有耐盐菌、多嗜盐、河口处有耐盐菌嗜盐菌：低嗜盐菌，适于生活在盐浓度嗜盐菌：低嗜盐菌，适于生活在盐浓度25%；中等嗜盐菌，适于生活在盐浓度中等嗜盐菌，适于生活在盐浓度520%；高嗜盐菌：适于生活在盐浓度高嗜盐菌：适于生活在盐浓度2030%分分 布：不均匀，垂直分布明
10、显布：不均匀，垂直分布明显025米米透光区透光区25200米米无光区无光区200-6000米米深海区深海区6000米米超深渊海区超深渊海区常见菌种：假单孢菌、弧菌、螺菌、无色杆菌、黄杆菌常见菌种：假单孢菌、弧菌、螺菌、无色杆菌、黄杆菌清水型水生微生物清水型水生微生物洁净湖泊和水库：微生物数量少（洁净湖泊和水库：微生物数量少（10103/ml），），以化能自养型和光能自养型微生物为主，部分腐以化能自养型和光能自养型微生物为主，部分腐生细菌，如色杆菌、无色杆菌和微球菌等；霉菌生细菌，如色杆菌、无色杆菌和微球菌等；霉菌中如水霉、绵霉等的一些种；以及单细胞和丝状中如水霉、绵霉等的一些种；以及单细胞和丝
11、状的藻类和一些原生动物常在水面生长，数量较少。的藻类和一些原生动物常在水面生长，数量较少。以上微生物种类可以认为是水中的以上微生物种类可以认为是水中的“土著土著”菌群。菌群。类型：流经城市的河水、港口附近的海水、滞类型：流经城市的河水、港口附近的海水、滞留的池水、阴沟水留的池水、阴沟水环境情况：流入了大量的人畜排泄物、生活污环境情况：流入了大量的人畜排泄物、生活污物和工业废水等，有机物含量大增物和工业废水等，有机物含量大增微生物数量和类群：微生物数量和类群：繁殖及后果：通常因水体环境中的营养等条件繁殖及后果：通常因水体环境中的营养等条件不能满足其生长繁殖的要求，加上周围其它微不能满足其生长繁殖
12、的要求，加上周围其它微生物的竞争和拮抗关系，一般难以长期生存，生物的竞争和拮抗关系，一般难以长期生存，但由于水体的流动，也会造成病原菌的传播甚但由于水体的流动，也会造成病原菌的传播甚至疾病的流行。至疾病的流行。腐败型水生微生物腐败型水生微生物数量：大量外来的腐生细菌，使腐败型水生微生数量：大量外来的腐生细菌，使腐败型水生微生物尤其是细菌和原生动物大量繁殖，每毫升污水物尤其是细菌和原生动物大量繁殖，每毫升污水的微生物含量达到的微生物含量达到107108个。个。类群：类群：革兰氏阴性无芽孢杆菌，如革兰氏阴性无芽孢杆菌，如Proteus、E.coli、Enterobacter aerogenes和和
13、Alcaligenes等，等，各种各种Bacillus、Vibrio和和Spirillum等的一些种等的一些种纤毛虫类、鞭毛虫类和根足虫类等原生动物纤毛虫类、鞭毛虫类和根足虫类等原生动物还有一些随人畜排泄物和病体污物进入水体的还有一些随人畜排泄物和病体污物进入水体的动植物致病菌动植物致病菌水的自净作用水的自净作用污水中的微生物在污水环境中大量繁殖，逐渐把污水中的微生物在污水环境中大量繁殖，逐渐把水中的有机物分解成简单的无机物，同时它们的水中的有机物分解成简单的无机物，同时它们的数量随之减少，污水也就逐步净化变清。数量随之减少，污水也就逐步净化变清。在自然水体尤其是快速流动的水中，存在着对有在自
14、然水体尤其是快速流动的水中，存在着对有机或无机污染物的自净作用。原因：有稀释、沉机或无机污染物的自净作用。原因：有稀释、沉降、吸附等物理作用，更重要的是各种生物学和降、吸附等物理作用，更重要的是各种生物学和生物化学作用，如好氧菌对有机物的分解作用、生物化学作用，如好氧菌对有机物的分解作用、原生动物对细菌等的吞噬作用，噬菌体对宿主的原生动物对细菌等的吞噬作用，噬菌体对宿主的裂解作用，以及微生物产生的凝胶物质对污染物裂解作用，以及微生物产生的凝胶物质对污染物的吸附、沉降作用等使水中有机物含量降低，这的吸附、沉降作用等使水中有机物含量降低，这种作用称为水的自净作用。是流水不腐的原因。种作用称为水的自
15、净作用。是流水不腐的原因。水源的饮用价值：良好的饮用水细菌含量应在水源的饮用价值：良好的饮用水细菌含量应在100个个/ml以下，当超过以下，当超过500个个/ml时，即不适合时，即不适合作为饮用水。作为饮用水。更重要的是水中的致病微生物种类，一般用大更重要的是水中的致病微生物种类，一般用大肠菌群数作为是否含有病原菌的指标。肠菌群数作为是否含有病原菌的指标。饮用水的微生物标准：我国相关法规对饮用水微生物指标的规定我国相关法规对饮用水微生物指标的规定细菌总数不得超过 ：100个/毫升大肠菌群指数不得超过 ：3个/升附：饮用水消毒常用方法：加入液态氯或次氯酸盐附：饮用水消毒常用方法：加入液态氯或次氯
16、酸盐空气中的微生物空气中的微生物环境条件：无营养和水分、紫外线直射环境条件：无营养和水分、紫外线直射存在状态：漂浮，短暂停留，以吸附于尘埃微粒存在状态：漂浮，短暂停留，以吸附于尘埃微粒上的形式存在。与空气中的尘埃颗粒数微生物数上的形式存在。与空气中的尘埃颗粒数微生物数量有直接关系。量有直接关系。分布：越接近地面的空气含菌量越高，目前人类分布：越接近地面的空气含菌量越高，目前人类检测到微生物存在的最高处为检测到微生物存在的最高处为85km的高空。的高空。种类：球菌、芽孢杆菌、产色素细菌、真菌孢子种类：球菌、芽孢杆菌、产色素细菌、真菌孢子空气中微生物的杀灭与去除：紫外线照射、甲醛空气中微生物的杀灭
17、与去除：紫外线照射、甲醛熏蒸、药物喷雾、过滤除菌等熏蒸、药物喷雾、过滤除菌等工农业产品上的微生物工农业产品上的微生物工业品：工业品：食品：食品：农产品：农产品：微生物引起的工业产品的霉腐微生物引起的工业产品的霉腐材料劣化：工农业产品因受气候、物理、化学或材料劣化：工农业产品因受气候、物理、化学或生物因素的作用而被破坏的现象生物因素的作用而被破坏的现象微生物引起的劣化种类：微生物引起的劣化种类：霉变（mildew，mouldness）：由霉菌引起的劣化腐朽（decay）泛指在好氧条件下微生物酶解有机质使其劣化的现象，常见的如由担子菌引起的木材或木制品的腐朽现象腐烂（或腐败，Putrefectio
18、n，rot）主要指由细菌或酵母菌引起的使物体变软、发臭性的劣化腐蚀（corrosion）主要指由硫酸盐还原细菌、铁细菌或硫细菌引起的金属材料的侵蚀、破坏性劣化变质（deterioration）指由各种生物或非生物因素引起的工农业产品质量下降的现象霉腐微生物学霉腐微生物学 定义：研究危害各种工农业产品的微生物种类、分布、作用机理以及如何防治其危害的科学。霉腐微生物的作用机理：通过微生物酶系分解各种工农业产品中的相应组分产生危害。在矿物油中生长，不仅因大量菌体阻塞机件，代谢产物会腐蚀金属器件 硫细菌、铁细菌和硫酸盐还原菌会对金属制品、管道和船体外壳等产生腐蚀 菌体和代谢物属于电解质，对电讯、电机器
19、材等会危及其电学性能 有些霉菌分泌的有机酸能腐蚀玻璃以致严重降低光学仪器的性能 烟叶、中药材、化妆品建材、图书、文物、档案、艺术品、生物标本霉腐微生物的控制霉腐微生物的控制 控制其温度、湿度、氧气和养料 采用有效的化学抑菌剂、杀菌剂或物理杀菌剂 在工业产品加工、包装过程中，尽量保持环境卫生并严防杂菌污染工业防霉剂筛选的试验菌种及其特性 菌 名 破 坏 性 能Aspergillus niger（黑曲霉）在许多材料上广泛生长，抗铜盐Asp.terreus（土曲霉）侵蚀多种材料Aureobacidium pullulans（出芽短梗霉）侵蚀涂漆与喷漆Paecilomyces varioti（宛氏拟青
20、霉）侵蚀塑料和皮革Penicillium funiculosum（绳状青霉）侵蚀织物及多种材料P.ochro-chloron（赭绿青霉）侵蚀塑料与织物，抗铜盐Scopularriopsis brevicaulis（短柄帚霉）侵蚀橡胶Tricoderma viride（绿色木霉）侵蚀纤维织物与塑料食品上的微生物食品上的微生物 食品的基质条件：含有丰富的营养物质和适宜的环境 食品上微生物的来源：食品原料的采收、运输、加工和包装过程中被微生物污染，食品原料在土壤中生长所正常带有的微生物 污染食品的微生物种类：Aspergillus、Penicillium、Fusarium、Alternaria、Pa
21、ecilomyces、Rhizopus、Mucor、Trichoderma、Phoma、Escherichia coli、Staphylococcus aureus、Bacillus subtilis、B.megaterium、Salmonella、Proteus vulgaris、Pseudomonas aeroginosa、Lactobacillus、Streptococcus lactis、Clostridium、Sacchromyces cerevisiae等。微生物污染的危害：除引起食品变质外，还可能含有各种致病菌和毒素等有害代谢产物，会引起人类的各种严重疾病防止霉腐的方法：防止霉腐
22、的方法：在加工、制造、包装过程中必须特别注意清洁卫生 控制保藏条件采用低温、干燥、密封等措施 添加少量无毒的化学防腐剂如苯甲酸、山梨酸、脱氢醋酸、维生素K、丙酸、二甲基延胡索酸等主要食品中常见防腐剂的应用情况食品名 硝酸盐 SO2环六甲 甲酸乙酸丙酸山梨酸 苯甲酸 对羟基联苯烟熏 亚硝酸盐 基胺 苯甲酸酯干酪（+）（+）+（+）（+）+肉制品 +（+）+（+）+水产品 +蔬菜食品 +（+）果品 +（+）（+）软饮料 +（+）葡萄酒 +面包 +糖果糕点 +（+）+农产品上的微生物农产品上的微生物粮食和饲料上的微生物粮食和饲料上的微生物 主要菌种：以青霉属、曲霉属、镰孢霉属（Fusarium）等的
23、一些种为主。真菌毒素：目前已知的五万多种真菌中，至少有两百多个种能产生一百多种真菌毒素，其中有14种致癌，两种是剧毒致癌剂，其一为黄曲霉毒素（aflatoxin），另一种是由某些镰孢菌产生的单端孢烯族毒素T2。凡是被霉菌严重污染的粮食一般都含有多种真菌毒素。一份“黄变米”试样中70%米粒污染有产毒真菌，并都含有真菌毒素；北京空气中飘浮的真菌中11.5%是产毒真菌。主要真菌毒素：黄曲霉毒素、赭曲霉素、杂色曲霉素、岛青霉素、黄天精、环氯素、展青霉素、桔青霉素、皱褶青霉素、黄绿青霉素、青霉酸、圆弧青霉素、偶氮酸、单端孢烯族毒素、二氢雪腐镰刀菌烯酮和T2毒素等。极端环境下的微生物极端环境下的微生物嗜热
24、菌嗜冷菌嗜酸菌嗜碱菌嗜盐菌嗜压菌抗辐射的微生物以上内容自学以上内容自学二、菌种资源的开发菌种筛选的一般原则和基本步骤：菌种筛选的一般原则和基本步骤：采集菌样：了解目标菌分布情况、首选样品是土壤富集培养：利用选择性培养基的原理，向所采土样中加入某些特殊营养物，并创造一些有利于待分离对象生长的条件，使样品中少量的能分解利用该营养物的微生物大量繁殖，以提高其在群体中的比例，使之便于分离。纯种分离：见第八章第五节性能测定：见第八章第五节采取土壤样品要考虑的几个问题采取土壤样品要考虑的几个问题 土质肥，微生物含量高，特别肥沃的土壤中细菌多，放线菌少；在植物残体枯枝落叶下的土壤中较多含有拮抗性真菌。离地面
25、520cm处的土壤通气良好、不受阳光直射，含菌量最高。采土季节以春秋两季最好。采土方法：选择适当地点、铲除表土、取土样数十克，盛入事先准备的无菌防水纸袋中，其上记录采土时间、地点、植被情况等。多点采土、混合分离，可以代表每一地块上的微生物分布平均情况土样的富集培养土样的富集培养含有目的菌较多的土样不需要富集培养含有目的菌较多的土样不需要富集培养如果原有样品中目的菌含量低，可以人为地添加如果原有样品中目的菌含量低，可以人为地添加相应的基质，培养使之以较其它微生物更快的速相应的基质，培养使之以较其它微生物更快的速度生长繁殖，从而提高它们在样品中的比例，便度生长繁殖，从而提高它们在样品中的比例，便于
26、分离。于分离。富集培养的一般方法：采用有利于目的菌种而不富集培养的一般方法：采用有利于目的菌种而不利于无关微生物的营养和培养条件，以达到使目利于无关微生物的营养和培养条件，以达到使目的菌种在群体中比例上升的目的。的菌种在群体中比例上升的目的。一些有特定物质产生能力的菌种，不容易富集，一些有特定物质产生能力的菌种，不容易富集，只有通过大量艰苦的工作筛选取得。只有通过大量艰苦的工作筛选取得。某些细菌的富集条件某些细菌的富集条件 富集对象 接种菌样添加营养物(g)特殊培养条件好氧氨基酸氧化菌土壤好氧，pH7.0好氧性芽孢杆菌土壤，巴氏消毒 好氧，pH7.0氨基酸发酵性梭菌 土壤，巴氏消毒 厌氧，pH
27、7.0耐碱解尿素芽孢菌 土壤，巴氏消毒 尿素50 好氧，pH8.6 厌氧八叠球菌土壤 葡萄糖20厌氧，pH23 乳酸菌植物体或牛奶 葡萄糖20厌氧，pH6.5 肠道细菌土壤或污水葡萄糖20，CaCO320 好氧或厌氧，pH7.0 丙酸菌干酪 乳酸钠20厌氧，pH7.0 醋酸菌果实或生啤酒 乙醇40 好氧，pH6.0注：培养基成分为酵母膏10g，KH2PO4或K2HPO4 1.0g，MgSO47H2O 0.2g，加水1000ml。一般培养在30下。第二节第二节 微生物与生物环境微生物与生物环境之间的相互关系之间的相互关系微生物与任何一种生物之间的关系：微生物与任何一种生物之间的关系：双方获益：双
28、方获益：共生共生、互利共栖、协同共栖、互养共栖、互利共栖、协同共栖、互养共栖单方获益，对方受害：单方获益，对方受害：寄生寄生、捕食捕食、拮抗拮抗单方获益，对方无害：偏利共栖、卫星状共栖、单方获益，对方无害：偏利共栖、卫星状共栖、互生互生（代谢共栖）（代谢共栖）互不相扰：无关共栖互不相扰：无关共栖一方受害，对方无益无损：偏害共栖一方受害，对方无益无损：偏害共栖双方受损：竞争共栖双方受损：竞争共栖一、互生（一、互生（metabiosis）定义：两种可以单独生活的生物，当它们生定义：两种可以单独生活的生物，当它们生活在一起时，通过各自的代谢活动而有利活在一起时，通过各自的代谢活动而有利于对方，或偏利
29、于一方的生活方式。于对方，或偏利于一方的生活方式。又称代谢共栖又称代谢共栖特点：可分可和，合比分好，松散关系特点：可分可和，合比分好，松散关系：好氧性自生固氮菌与纤维分解菌好氧性自生固氮菌与纤维分解菌氧化乙酸脱硫单胞菌与一种绿硫细菌，卫氧化乙酸脱硫单胞菌与一种绿硫细菌，卫星状共栖，脱氢与光合星状共栖，脱氢与光合拉曼毛霉与一种红酵母，都是拉曼毛霉与一种红酵母，都是VB1需求者，需求者，都是只能合成硫胺素分子的一半结构；都是只能合成硫胺素分子的一半结构；二者共栖时，互相吸收对方分泌物而可二者共栖时，互相吸收对方分泌物而可以不需要以不需要VB1，此为代谢共栖。，此为代谢共栖。：排阻、抑制外来致病菌提
30、供若干种维生素：如VB1、B2、B6、B12、VK、烟酸、泛酸、生物素、叶酸等产生若干种酶类一定程度的固氮作用产气体和粪臭素动物肠道的正常菌群：动物肠道的正常菌群：微生物与植物间的互生关系微生物与植物间的互生关系根际微生物根际微生物附生微生物附生微生物二、共生二、共生定义：两种生物共居在一起，相互协作分定义：两种生物共居在一起，相互协作分工，相依为命，以至达到难分难解、合工，相依为命，以至达到难分难解、合二为一的一种关系。二为一的一种关系。微生物间的共生微生物与植物间的共生微生物与动物间的共生地地 衣：衣：组成：真菌（子囊菌，担子菌）单细胞藻类组成：真菌（子囊菌，担子菌）单细胞藻类（绿藻，蓝藻
31、）共生组成一种植物体，（绿藻，蓝藻）共生组成一种植物体，生理：地衣中的真菌和藻类已形成特殊形态的整体了，生理：地衣中的真菌和藻类已形成特殊形态的整体了，在生理上相互依存，真菌营异养生活，藻类制造养料，在生理上相互依存，真菌营异养生活，藻类制造养料，真菌提供水分、无机盐供藻类光合作用。真菌提供水分、无机盐供藻类光合作用。根瘤菌与豆科植物根瘤菌与豆科植物放线菌与一些非豆科植物之间的根瘤放线菌与一些非豆科植物之间的根瘤菌根菌根植物内生菌植物内生菌菌根菌根真菌与植物根的共生联合体真菌与植物根的共生联合体外生菌根与内生菌根外生菌根与内生菌根外生菌根多形成于木本植物，包括乔木和灌木，外生菌根多形成于木本植
32、物，包括乔木和灌木，其中松科植物最为显著。其中松科植物最为显著。形成外生菌根的真菌主要是担子菌，次为子囊菌，形成外生菌根的真菌主要是担子菌，次为子囊菌，个别为接合菌个别为接合菌外生菌根的形态和结构：菌套结构外生菌根的形态和结构：菌套结构外生菌根的作用：外生菌根的作用：1.对植物营养和生长的作用对植物营养和生长的作用 扩大寄主根的吸收面扩大寄主根的吸收面 菌根产生生长激素菌根产生生长激素 2.对防御林木根部病害的作用对防御林木根部病害的作用 根圈微生物群落数量多根圈微生物群落数量多 机械屏障作用机械屏障作用 根部受刺激，产生抑菌物质根部受刺激，产生抑菌物质 菌根菌产生抗生素菌根菌产生抗生素内生菌
33、根（丛枝菌根内生菌根（丛枝菌根Arbuscular Mycorrhiza，AM）内囊菌科真菌与植物形成的共生体系内囊菌科真菌与植物形成的共生体系分布普遍和广泛，陆生植物分布普遍和广泛，陆生植物80都有都有AM，不能形成或很少形成不能形成或很少形成AM的有十字花科、藜的有十字花科、藜科、石竹科、莎草科、蓼科、灯心草科等科、石竹科、莎草科、蓼科、灯心草科等10余科植物。最广泛的是豆科和禾本科植物。余科植物。最广泛的是豆科和禾本科植物。AM的结构：的结构：需染色处理，显微检查，确认皮层内有需染色处理，显微检查，确认皮层内有无丛枝和无隔菌丝无丛枝和无隔菌丝丛枝菌根与植物的关系丛枝菌根与植物的关系 植物
34、为菌根真菌的生长提供碳源和能量植物为菌根真菌的生长提供碳源和能量 真菌促进植物养料和水分的吸收，产生植真菌促进植物养料和水分的吸收，产生植物生长素，对防疫土传病害具有作用物生长素，对防疫土传病害具有作用丛枝菌根增加了根圈的范围丛枝菌根能扩大植物根系吸收范围和提高从土壤溶液中吸收养料的效率，特别是对P、Zn、Mo等扩散速度低的营养元素的吸收利用更有效。丛枝菌根对土传病害的减轻作用：结构上增强木质化；生理上，分泌植保素等物质植物内生菌植物内生菌内生菌：内生菌：微生物只生活在植物组织中，或生活周期大部分是在植物体内的称为内生菌，与植物构成共生关系，但不形成特殊结构，包括内生真菌和内生细菌。1993年
35、从红豆杉树皮中分离得到Taxomyces andreanae这是一株可以产生紫杉醇的内生真菌。产生具有医疗效果的化学物质的内生真菌是有待开发的巨大资源。内生细菌的研究是从固氮弧菌开始的。最具典型：反刍动物与其瘤胃微生物牛与瘤胃微生物共生关系示意图牛与瘤胃微生物共生关系示意图CO2，CH4，H2等大量菌体有机酸、乙醇从口中呕气排泄物牛肉、牛奶在皱胃中消化瘤胃吸收瘤胃微生物大量繁殖唾液纤维质饲料自然菌源牛羊等反刍动物，草是主要饲料，但它们本身牛羊等反刍动物，草是主要饲料，但它们本身没有分解纤维素的能力，而是靠瘤胃微生物帮助没有分解纤维素的能力，而是靠瘤胃微生物帮助分解，使纤维素变成能被牛羊吸收的糖
36、类分解，使纤维素变成能被牛羊吸收的糖类。三、寄生定义：一般指一种小型生物生活在另一种较大型生物的体内或体表，从中取得营养和进行生长繁殖，同时使后者蒙受损害甚至被杀死的现象。：噬菌体与其宿主之间的关系真菌对真菌的寄生细菌或真菌寄生于原生动物细菌寄生于细菌：蛭弧菌寄生于Pseudomonas phaseolicola（栖菜豆假单胞菌）：植物病原体：各种病原微生物昆虫病原菌生物农药冬虫夏草四、拮抗定义：由某种生物所产生的某种代谢产物可抑制他定义：由某种生物所产生的某种代谢产物可抑制他种生物的生长发育甚至杀死它们的关系。种生物的生长发育甚至杀死它们的关系。一般多用来指代微生物之间的一般多用来指代微生物
37、之间的“化学战术化学战术”有时也将因某微生物生长而引起的其它条件改有时也将因某微生物生长而引起的其它条件改变抑制他种生物的现象称为拮抗，如缺氧、变抑制他种生物的现象称为拮抗，如缺氧、pH值改变等值改变等拮抗关系的利用：为筛选抗生素、食品保藏、医疗拮抗关系的利用：为筛选抗生素、食品保藏、医疗保健、动植物病害防治等提供有效手段。保健、动植物病害防治等提供有效手段。五、捕食五、捕食定义：一种较大型的生物直接捕捉、吞食另一定义：一种较大型的生物直接捕捉、吞食另一种小型生物以满足其营养需要的相互关系。种小型生物以满足其营养需要的相互关系。微生物间的捕食关系微生物间的捕食关系原生动物吞食细菌和藻类的现象。
38、原生动物吞食细菌和藻类的现象。真菌捕食线虫和其它原生动物的现象真菌捕食线虫和其它原生动物的现象捕食现象的利用捕食现象的利用生物防治生物防治第三节第三节微生物在自然界物质微生物在自然界物质循环中的作用循环中的作用 生物圈的繁荣发展，能量来源主要依赖于太阳，而元素来源主要依赖于由微生物推动的物质循环。地球进化可分为：化学进化和生物学进化两个阶段。生物学进化分为：单极生态系统、双极生态系统、三极生态系统等三阶段。原始地球大气的组成氢化物气体：水、氨、甲烷、硫化氢等。原始海洋汇集了地壳表面大量可溶性化合物，成为诞生原始生命的摇篮地球的进化地球的进化化学进化：由无机小分子生成有机小分子物质 由有机小分子
39、物质形成生物大分子物质 由生物大分子组成团聚体或微球体形式的多分子体系，并进一步演变为原始生命生物进化 单极生态系统：只存在单一营养类型（异养分解者）的生态系统。原始汤中的生物为异养、厌氧、发酵代谢 双极生态系统：生态系统中具备了自养与异养（即合成和分解）两个环节。自养者是蓝细菌。三极生态系统：由于不同类型原核生物间发生内共生作用，出现了真核动物细胞和真核植物细胞，形成了三极生态系统。即出现了食物链。水体食物链（一个三极生态系统）水体食物链（一个三极生态系统）消费者分解者生产者大鱼小鱼虾类浮游动物真菌细菌真菌细菌一、碳素循环 大气中的CO2（0.032%）周转利用最快。大气中的CO2只够绿色植
40、物约20年使用。微生物在碳素循环中的作用：把有机物中的碳元素尽快矿化和释放，从而使生物解处于一种良好的碳平衡循环中。地球上约90%的CO2是由微生物分解作用形成的 微生物的分解作用：光合作用固定的CO2中大部分以聚糖形式积累于木本和草本植物躯干中，木材占60%，其中75%是纤维素、约20%是木质素和木聚糖、蛋白质仅占1%左右。在草本植物中多糖含量更高。分解纤维素的任务就是由土壤中的一些特殊微生物来完成的。醇+有机酸H2+CO2碳、氢、氧元素在自然界中的循环碳、氢、氧元素在自然界中的循环有氧条件下无氧条件下光合作用”发酵作用呼吸作用CO2+H2OO2+“CH2O”CH4甲烷产生作用 化石燃料分解
41、纤维素的微生物分解纤维素的微生物 分解纤维素的微生物主要是担子菌亚门非褶菌目的真菌、其它如一些放线菌、细菌和原生动物等也具有这种能力。真菌分解纤维素的能力最强，包括一些子囊菌、半知菌和担子菌。分解半纤维素的微生物：真菌在分解半纤维素的开始阶段较为活跃，后期主要靠放线菌。能分解半纤维素的真菌很多，大大超过能分解纤维素的真菌。半纤维素的分解产物有己糖、戊糖，糖醛酸等。二、氮素循环自然界的氮素循环是各种元素循环的中心，而微生物是整个氮素循环的中心。氮元素的自然形态：（1）铵盐、亚硝酸盐、硝酸盐、（2）有机含氮物、（3）氮气。据70年代中期的统计全球生物圈每年生物固氮达1.7108吨，其中草原3.5
42、107吨，林地4.0 108吨，海洋3.6 108吨，其它土壤0.6 108吨。根瘤菌属每年可为每公顷土地固氮达250Kg。生物固氮与化学固氮的比较生物固氮与化学固氮的比较生物固氮化学固氮生产条件 温和（中温、常压）高温（500）高压（200500atm）产量根瘤菌属250Kg/公顷非豆科植物共生固氮菌 22Kg/公顷自生固氮菌 0.52.5Kg/公顷共计：1.7 108吨/年5.0 107吨/年其中：草原3.5 107吨 林地4.0 108吨 海洋3.6 108吨 其它土壤0.6 108吨（二）硝化作用（二）硝化作用（nitrification）定义：土壤或水体中的氨态氮经化能自养菌的氧化而
43、成为硝酸态氮的过程。过程：两阶段（1）由亚硝化细菌参与，铵亚硝酸；（2）由硝化细菌参与，亚硝酸硝酸。意义：是自然界氮素循环中不可缺少的一环，对农业无益。（三）硝酸盐同化作用（三）硝酸盐同化作用（assimilatory nitrate reduction）定义：绿色植物和微生物在利用硝酸盐的过程中，硝酸盐被重新还原成NH4+后再被利用于合成各种含氮有机物，这就是硝酸盐的同化作用。（四）氨化作用（四）氨化作用（ammonnification）定义：含氮有机物竟微生物的分解产生氨的作用。含氮有机物的种类：蛋白质、尿素、尿酸、几丁质等分解蛋白质的微生物种类：Pseudomonas fluoresce
44、ns（荧光假单胞菌），Proteus vulgaris（普通变形杆菌），Bacillus megaterium（巨大芽孢杆菌），B.subtilis和B.mycoides（蕈状芽孢杆菌），Clostridium putrificum（腐败梭菌）。分解尿素的细菌如Sporosarcina ureae（脲芽孢八叠球菌）和Bacillus pasteurii（巴氏芽孢杆菌）。分解几丁质的细菌如Bacterium chitinophilum（嗜几丁杆菌）和Chromobacterium chitinochroma（几丁色色杆菌）等。意义：含氮有机物必须经过微生物降解才能被植物利用。（五）铵盐同化作用（
45、五）铵盐同化作用（assimilation of ammonium）所有绿色植物和微生物进行的以铵盐作为营养，合成氨基酸、蛋白质、核酸和其它含氮有机物的作用。（六）异化性硝酸盐还原作用（六）异化性硝酸盐还原作用（dissimilatory nitrate reduction）定义：硝酸粒子作为呼吸链的末端电子受体被还原为亚硝酸的反应。有时亚硝酸可进一步通过亚硝酸铵化作用（nitrite ammonification）而产生氨或进一步通过反硝化作用（denitrification）产生氮气、NO或N2O。菌种：兼性厌氧菌，行无氧呼吸的菌种。（七）反硝化作用（七）反硝化作用 定义：由硝酸盐还原成N
46、O2并进一步还原成N2的过程（广义）。狭义的反硝化作用仅指由亚硝酸还原成N2的过程。条件：厌氧（淹水的土壤或死水塘中）菌种：少数异养和化能自养菌。如：Bacillus lichenoformis（地衣芽孢杆菌）、Paracoccus denitrificans（脱氮副球菌）、Pseudomonas aeruginosa（铜绿假单胞菌）、Ps.stutzeri（施氏假单胞菌）、Thiobacillus denitrificans（脱氮硫杆菌）以及Spirillum（螺菌属）和Moraxella（莫拉氏菌属）等。意义：土壤中氮元素流失的重要原因之一。水稻田中施用化学氮肥，有效利用率只有25%左右。
47、另外可以利用水生性反硝化细菌去除污水中的硝酸盐。（八）亚硝酸氨化作用（八）亚硝酸氨化作用 定义：亚硝酸通过异化性还原可以经羟胺而转变成氨，叫做亚硝酸的氨化作用。菌种：Aeromonas（气单胞菌属）、Bacillus（芽孢杆菌属）、Enterobacter（肠杆菌属）、Flavobacterium（黄杆菌属）、Nocardia（诺卡氏菌属）、Vibrio（弧菌属）和 Staphylococcus（葡萄球菌属）等。三、硫素循环与细菌的金属滤沥三、硫素循环与细菌的金属滤沥 生物体对硫的需要量约为氮的1/10。硫循环与氮循环相似，各环节都有相应的微生物参与。菌种：1.植物和微生物2.腐败微生物3.好
48、氧：贝日阿托氏菌属、发硫菌属、硫杆菌属 厌氧：绿菌属、着色菌属4.脱硫弧菌属、脱硫肠状菌属5.脱硫单胞菌属生物体有机硫S5.异化性硫酸盐还原SO42 H2S1.同化性硫酸盐还原2.脱硫 作用4.硫氧化作用（2）3.硫氧化作用（1）6.异化性硫还原细菌滤沥也称细菌冶金，主要有三步：1.溶矿：硫酸铜溶出2.置换：用铁屑置换铜3.再生浸矿剂：Fe2+Fe3+四、磷的循环 能溶解土壤中的磷酸钙或磷灰石的微生物较多。靠产酸作用促进磷酸钙溶解。如硝化细菌和硫化细菌。植素、核酸和磷脂等，能分解这些物质的微生物更多蜡状、蕈状、多粘芽孢杆菌、解磷巨大芽孢杆菌等。水体中的可溶性磷酸盐浓度过大造成水体富营养化，进而
49、严重污染水源。生物体有机磷磷酸或可溶性磷酸盐不溶性磷酸盐产酸微生物的作用或磷肥生产与土壤中的盐基结合植被与微生物的吸收同化微生物的分解作用五、铁的循环 铁的循环主要在无机物或有机物中的Fe2+与Fe3+之间的氧化还原反应。菌种：化能自养铁细菌，如 纤发菌属、泉发菌属和嘉利翁氏菌属；化能自养硫细菌，如氧化亚铁硫杆菌。第四节污水处理的微生物学原理 环境污染：生态系统的结构、机能受到外来有害物质 的影响或破坏，无法进行正常的物质循环。水体污染的表现：无法进行水的自净作用 污水的种类：生活污水、工业有机污水（如屠宰、造纸、淀粉和发酵工业）、工业有毒污水（如农药、炸药、石油化工、电镀、印染、制革等行业）
50、和其它污水（如医院）。有害物质的种类：农药、炸药、多氯联苯（PCB）多环芳烃（致癌）酚、氰和丙烯腈等 污水处理方法中，最关键、最有效和最常用的是微生物处理法。一、污水处理中的特殊微生物 自然界中微生物的分解能力：分解氰诺卡氏菌属等14属49种分解多氯联苯少数红酵母、假单胞菌无色杆菌属等分解多环芳烃产碱杆菌、假单胞菌、棒杆菌、诺卡氏菌分解硝基炸药柠檬酸杆菌属、肠杆菌属克雷伯氏菌属、埃希氏菌属假单胞菌属等若干菌种降解高分子物质恶臭假单胞菌、芽孢杆菌二、微生物处理污水的原理污水处理装置是一个小型生态系统，在其中利用各种生理生化性能的微生物类群间的互相配合而进行的一种物质循环过程。高BOD5的污水进入
