1、第第6章章 细菌的分类和命名细菌的分类和命名微生物的分类微生物的分类l分类是认识客观事物的一种基本方法。分类是认识客观事物的一种基本方法。l因此，我们要认识、研究和利用各种微生物资源因此，我们要认识、研究和利用各种微生物资源也必须对它们进行分类。也必须对它们进行分类。l分类学涉及三个相互依存又有区别的组成部分：分类学涉及三个相互依存又有区别的组成部分：分类、鉴定、命名分类、鉴定、命名分类分类:根据一定的原则根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关性表型特征相似性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对
2、各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定。类的微生物进行鉴定。(根据现有数据建立系统的过程根据现有数据建立系统的过程)鉴定：鉴定：借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。分类群的过程。(根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程)命名：命名：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称。是根据命名法规，给每一个分类群
3、一个专有的名称。(分类系统建立过程中的步骤之一分类系统建立过程中的步骤之一)第一节第一节 细菌的分类地位细菌的分类地位古细菌古细菌I.是一个独特的系统进化类别，其成员产甲烷、极是一个独特的系统进化类别，其成员产甲烷、极端耐盐、高度嗜热，其细胞壁组成与细菌不同。端耐盐、高度嗜热，其细胞壁组成与细菌不同。II.这些极端微生物被认为是生物进化过程中的早期这些极端微生物被认为是生物进化过程中的早期产物，因此称之为古细菌。产物，因此称之为古细菌。III.在兽医微生物学中，不占重要地位。在兽医微生物学中，不占重要地位。细菌的分类等级细菌的分类等级属属 具有共性的若干种的组合，应与其它属有明具有共性的若干种
4、的组合，应与其它属有明显的差异。不同的属之间的显的差异。不同的属之间的16S rRNA序列有较大序列有较大差异，差异应大于差异，差异应大于57。种种 是微生物学分类的最基本单元，是微生物学分类的最基本单元，可以认为是可以认为是一群性质相似的菌株，与其它菌株群体有明显差异一群性质相似的菌株，与其它菌株群体有明显差异。凡是凡是16S rRNA序列同源性大于序列同源性大于97的两株细菌，的两株细菌，即可确定为同一种。即可确定为同一种。亚种亚种 是指同一菌种的各个细菌，虽然基本性是指同一菌种的各个细菌，虽然基本性状基本相同，但是在某些方面仍有一定差异，差状基本相同，但是在某些方面仍有一定差异，差异较明
5、显的称为异较明显的称为亚种亚种，差异不明显的称为，差异不明显的称为型型。新种新种 是指权威性的分类、鉴定手册种从未记是指权威性的分类、鉴定手册种从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物。载过的一种新分离并鉴定过的微生物。菌株菌株 是不同来源的某一种细菌的纯培养物。是不同来源的某一种细菌的纯培养物。同一种细菌可有许多菌株，其主要性状应完全相同，同一种细菌可有许多菌株，其主要性状应完全相同，次要性状可稍有差异。次要性状可稍有差异。标准菌株标准菌株 又叫模式菌株，具有某种细菌典型特征又叫模式菌株，具有某种细菌典型特征的菌株。的菌株。种和亚种指定模式菌株（种和亚种指定模式菌株（type strain）；
6、）；亚属和属指定模式种（亚属和属指定模式种（type species）；）；属以上至目级分类单元指定模式属（属以上至目级分类单元指定模式属（type genus）；）；模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。考和索取。属名属名 种名种名 种名种名 属名属名亚种亚种 在学名后加上在学名后加上ssp.或或subsp.（正体）。（正体）。新种新种 在学名后加上在学名后加上sp.nov.（正体）。（正体）。属名属名 通常是一个描述生物形态的名词或发现该通常是一个描述生物形态的名词或发现该生物的人名，词首必须大写。生物的人名，词首必须大写。种名种名 表示
7、该生物的某种特征、寄居部位或所致表示该生物的某种特征、寄居部位或所致疾病等，字母须小写。疾病等，字母须小写。Escherichia coli 大肠埃希氏菌大肠埃希氏菌拉丁文学名应该按拉丁文字母的发音规则读念，用拉丁文学名应该按拉丁文字母的发音规则读念，用英语读念是错误的。英语读念是错误的。第三节第三节 细菌分类鉴定的标准细菌分类鉴定的标准v 形态特征形态特征v 培养特征培养特征v 生理特征生理特征v 生态特征生态特征v 化学组成化学组成v 血清学反应血清学反应v 遗传学特性遗传学特性细菌分类依据细菌分类依据第四节第四节 细菌分类的方法细菌分类的方法人为影响因素多，但实际临床检验很实用。人为影响
8、因素多，但实际临床检验很实用。各种性状同等重要，应用多菌株比较。各种性状同等重要，应用多菌株比较。所选性状越多，正确性越高，至少要达到所选性状越多，正确性越高，至少要达到100个，个，否则易误判。否则易误判。优点：科学、规范优点：科学、规范 缺点：需要电子计算机缺点：需要电子计算机第五节第五节 细菌的分类体系细菌的分类体系3、Balows等编著的等编著的“原核生物原核生物”(The Prokaryyotes):第二版，第二版，1992，可弥补伯吉氏手册，可弥补伯吉氏手册的不足。的不足。4、国际系统与进化微生物学杂志（、国际系统与进化微生物学杂志（International Journal of
9、 Systematic and Evolutionary Microbiology,IJSEM）：是细菌分类命名的世界公认的权威期刊，）：是细菌分类命名的世界公认的权威期刊，由国际微生物学会联合会（由国际微生物学会联合会（International Union of Microbiological Societies）于）于1901年创刊出版。年创刊出版。第六节第六节 细菌的鉴定细菌的鉴定用商品化的细菌鉴定试剂盒，取代自行选择若用商品化的细菌鉴定试剂盒，取代自行选择若干检测项目。干检测项目。细菌学诊断细菌学诊断标本的采集和运送标本的采集和运送避免杂菌污染运送注意保存不同期不同标本用抗菌素以前采集病变明显部位标本必须新鲜病原菌的检查程序病原菌的检查程序药物敏感试验直接涂片镜检分离培养生化试验血清学试验动物试验明明确确诊诊断断初步诊断初步诊断分子生物学技术其他检测技术
