1、二代测序助力二代测序助力 遗传性肿瘤精准遗传性肿瘤精准医学医学胡胡 元元 华大基因肿瘤华大基因肿瘤产品部产品部Cancer is a genetic disease that is,cancer is caused by certain changes to genes that control the way our cells function,especially how they grow and divide.NCI-The Genetics of Cancer癌症是一种基因病癌症是一种基因病 除遗传性肿瘤，所有恶性肿瘤（癌症）的发生都是体细胞基因突变导致的。在人的一生中，肿瘤细胞是
2、通过一系列进行性的改变而逐渐变成恶性的。整理整理pptState of the art and future directions in the era of personalized medicine人类基因研究史人类基因研究史肿瘤也会遗传吗？肿瘤也会遗传吗？各类肿瘤中遗传性肿瘤的占比各类肿瘤中遗传性肿瘤的占比AACR cancer progress report 2015肿瘤的治疗效果与发现时期有关肿瘤的治疗效果与发现时期有关癌症防控：早发现癌症防控：早发现 早诊断早诊断 早治疗早治疗Ref：WHO world cancer report世界卫生组织（世界卫生组织（WHO）-“抗击癌症抗击
3、癌症 重在预防！重在预防！”1/3的的癌症可以癌症可以预防预防1/3的的癌症可以癌症可以根治根治1/3的的经过治疗可以长期经过治疗可以长期生存生存疫苗（宫颈癌疫苗，乙肝疫苗）生物制剂（胸腺肽、卡介菌多糖）自检血清学（CEA、CA199）影像学（X片、B超、CT）内窥镜（胃肠镜）病理诊断手术放疗化疗靶向治疗血清学（CEA、CA199）影像学（X片、B超、CT）内窥镜（胃肠镜）传统方法传统方法遗传性肿瘤遗传性肿瘤基因检测基因检测基因科技基因科技根据肿瘤基因变异及免疫组库情况，进行病情监测并及时调整治疗方案无创肿瘤早早筛基于基因突变的精准检测及个体化用药方案1预防预防4监测监测2早诊早诊3诊疗诊疗基
4、因基因科技助力肿瘤精科技助力肿瘤精准预防准预防1预防预防4监测监测2早诊早诊3诊疗诊疗临床基因检测的方法临床基因检测的方法l 聚合酶链式反应聚合酶链式反应(PCR(PCR：qPCRqPCR，dPCRdPCR，ARMS,)ARMS,)l 荧光原位杂交技术荧光原位杂交技术(FISH)(FISH)l 一代测序（一代测序（Sanger sequencingSanger sequencing）l 二代测序（二代测序（Next-generation sequencingNext-generation sequencing）整理ppt临床基因检测方法的差别临床基因检测方法的差别肿瘤有肿瘤有遗传性遗传性和和散
5、发性散发性之分之分美国癌症学会（www.cancer.org）Brozek I et al.J Appl Genet 2009;50(4):379384 第一次打击第一次打击 是胚系突变是胚系突变所有体细胞均成为杂合所有体细胞均成为杂合BRCA 第二次打击第二次打击 是肿瘤细胞的突变导致细胞是肿瘤细胞的突变导致细胞失去杂合性失去杂合性所有体细胞均为野生型所有体细胞均为野生型仅病灶处肿瘤细胞突变仅病灶处肿瘤细胞突变遗传性肿瘤遗传性肿瘤5-10%散发性肿瘤散发性肿瘤90-95%家族性肿瘤与生俱来（胚系突变）与生俱来（胚系突变）VS 与时俱进（体细胞突变）与时俱进（体细胞突变）由于遗传性原因导致的染
6、色体和基因异常，特别是常染色体及其上的基因，而使患某些肿瘤的机会大大增加，病理学上称之为遗传性肿瘤遗传性肿瘤综合征综合征整理ppt家族性家族性/遗传性肿瘤人群特征遗传性肿瘤人群特征 仅用于初步判断人群是否具有家族性/遗传性肿瘤的特征。各种遗传性肿瘤高危筛查人群的判断需综合临床表现和权威指南的标准进行。遗传性乳腺癌卵巢癌综合遗传性乳腺癌卵巢癌综合征征遗传性乳腺癌遗传性乳腺癌/卵巢癌相关基因在卵巢癌相关基因在乳腺癌乳腺癌人群中的检出人群中的检出情况情况 由于遗传性原因导致的染色体和基因异常，特别是常染色体及其上的基因，而使患某些肿瘤的机会大大增加，病理学上称之为遗传性肿瘤综合征遗传性肿瘤综合征。N
7、ils et al.Dtsch Arztebl 2008;105(41):70614 http:/ J,et al.Ann Oncol 2011;22(suppl.6);v131-vi34乳腺癌(31%-56%)卵巢癌(2%-19%)BRCA1 突变突变 BRCA2 突变突变BRCA1BRCA 2BRCA1BRCA1定位于定位于17q2117q21，约，约100 kb100 kb，含有，含有2424个外显子，其中第个外显子，其中第1 1、4 4号外显子不编码氨基酸，另外号外显子不编码氨基酸，另外2222个转录出个转录出7.6 kb mRNA7.6 kb mRNA，最终可编码含，最终可编码含18
8、631863个氨基酸的蛋白质。而第个氨基酸的蛋白质。而第1111号外显子较大，长号外显子较大，长3.4 kb3.4 kb。已报道其突变位点多于已报道其突变位点多于17851785个个BRCA2BRCA2定位在定位在13q12-1313q12-13，有，有2727个外显子个外显子,仅编码区就有仅编码区就有11.4K11.4K。其中。其中1111号外显子几乎含编码序列号外显子几乎含编码序列的一半，完整的的一半，完整的BRCA2BRCA2编码编码34183418个氨基酸的蛋白质个氨基酸的蛋白质 。已报道其突变位点多于已报道其突变位点多于20112011个个参考数据库：http:/research.n
9、hgri.nih.gov/bic/BRCA1/2基因没基因没有热点突变有热点突变遗传性乳腺癌遗传性乳腺癌/卵巢癌卵巢癌CA Cancer J Clin 2014;64:52-62.遗传性乳腺癌发病年龄较散发性乳腺癌发病年龄低 随着时间的发展，乳腺癌的死亡率逐渐下降 50岁以上的人群，因为乳腺癌筛查技术的完善有效降低浸润性乳腺癌发病率 50岁以下人群发病率无明显变化，死亡率下降缓慢乳腺癌筛查有效降低浸润性乳腺癌发病率，乳腺癌筛查有效降低浸润性乳腺癌发病率，基基因检因检测是否可以降低遗传性乳腺癌发病率测是否可以降低遗传性乳腺癌发病率？测位点还是测基因外显子？测位点还是测基因外显子？BRCA1基因共
10、基因共5592bp，外显子，外显子+内含子共内含子共81189 bp，其中，其中2600+位点的变异位点的变异可导致乳腺癌可导致乳腺癌/卵巢癌风险上升卵巢癌风险上升。Research Themes of HKU Department of Surgery http:/www.surgery.hku.hk/research_div_br.php遗传性乳腺癌遗传性乳腺癌/卵巢癌基因检测卵巢癌基因检测检测基因检测基因检测周期检测周期遗传性乳腺癌/卵巢癌（21个基因）BRCA1、BRCA2、CHEK2、PALB2、BRIP1、TP53、PTEN、STK11、CDH1、ATM、BARD1、MLH1、MR
11、E11A、MSH2、MSH6、MUTYH、NBN、PMS1、PMS2、RAD50、RAD51C20天遗传性乳腺癌/卵巢癌（2个基因）BRCA1、BRCA220天检测优势科学 可检测遗传性结直肠癌的14个易感基因，结合亚洲人群遗传数据库及华大本地12000例样本数据库，综合评估肿瘤风险精准 标准化的实验操作工序和数据分析流程，直击突变基因，准确率达99.9%全面 目标基因外显子区域捕获测序，全面覆盖，查找突变基因便捷 仅需提供5mL外周血或2mL唾液即可完成检测遗传性乳腺癌遗传性乳腺癌/卵巢癌基因检测卵巢癌基因检测检测基因检测基因检测周期检测周期遗传性乳腺癌/卵巢癌（21个基因）BRCA1、BR
12、CA2、CHEK2、PALB2、BRIP1、TP53、PTEN、STK11、CDH1、ATM、BARD1、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MUTYH、NBN、PMS1、PMS2、RAD50、RAD51C20天遗传性乳腺癌/卵巢癌（2个基因）BRCA1、BRCA220天检测优势科学 可检测遗传性结直肠癌的14个易感基因，结合亚洲人群遗传数据库及华大本地12000例样本数据库，综合评估肿瘤风险精准 标准化的实验操作工序和数据分析流程，直击突变基因，准确率达99.9%全面 目标基因外显子区域捕获测序，全面覆盖，查找突变基因便捷 仅需提供5mL外周血或2mL唾液即可完成检测遗传性遗传性结直
13、肠癌结直肠癌 Kenneth W Kinzler1,et al,Cell,1996.遗传性结直肠癌相关综合征遗传性结直肠癌相关综合征遗传症遗传症致病基因致病基因遗传特点遗传特点一生的一生的患患癌几率癌几率%遗传性非息肉病性结直肠癌(Lynch Syndrome/HNPCC)mismatch repair(MMR)相关基因生殖系突变：MSH2,MLH1,MSH6,PMS2MSH2,MLH1,MSH6,PMS2常染色体显性遗传结肠癌50-8050-80家族性腺瘤性息肉病(FAP)APCAPC 基因生殖系突变 常染色体显性遗传结肠癌100100MUTYH相关性息肉病(MAP)MUTYHMUTYH 生
14、殖系双等位基因突变常染色体隐性遗传结肠癌8080错构瘤息肉综合征(Hamartomatous polyposis syndromes)幼年性息肉病综合征(Juvenile polyposis syndrome)SMAD4SMAD4 or BMPR1ABMPR1A 基因生殖系突变常染色体显性遗传 结肠癌3939Peutz-Jeghers 综合征STK11STK11 基因生殖系突变常染色体显性遗传结肠癌3939遗遗传性结直肠癌基因检测传性结直肠癌基因检测检测基因检测基因检测周期检测周期遗传性结直肠癌APC,AXIN2,EPCAM,MLH1,MLH3,MSH2,MSH6,MUTYH,PMS1,PMS
15、2,STK11,PTEN,SMAD4,BMPR1A20天检测优势科学 可检测遗传性结直肠癌的14个易感基因，结合亚洲人群遗传数据库及华大本地12000例样本数据库，综合评估肿瘤风险精准 标准化的实验操作工序和数据分析流程，直击突变基因，准确率达99.9%全面 目标基因外显子区域捕获测序，全面覆盖，查找突变基因便捷 仅需提供5mL外周血或2mL唾液即可完成检测APC基因突变的致病风险基因突变的致病风险癌症类型癌症类型年龄（岁）年龄（岁）患癌风险患癌风险普通人群风险普通人群风险小肠癌小肠癌到80岁4%-12%0.2%结直肠癌结直肠癌AFAP:到80岁70%3.4%FAP:到21岁 7%99%3.4
16、%其他硬纤维瘤其他硬纤维瘤到80岁10%-30%0.04%胃癌胃癌到80岁风险升高0.6%甲状腺癌甲状腺癌到80岁1%-2%1%胰腺癌胰腺癌到80岁风险升高1%肝母细胞瘤肝母细胞瘤到5岁1.6%0.001%中枢神经系统癌中枢神经系统癌到80岁1%0.5%APC基因突变的风险管理基因突变的风险管理癌症类型癌症类型风险管理措施风险管理措施起始年龄起始年龄频率频率小肠癌小肠癌上消化道内镜检查，考虑MRI或者CT25-30岁或根据个体情况每4年一次结直肠癌结直肠癌乙状结肠镜或结肠镜检查10-15岁每年一次考虑药物预防（如非甾体类消炎药）根据个体情况-考虑结直肠预防性手术根据腺瘤的分布和密度情况-其他硬
17、纤维瘤其他硬纤维瘤MRI或者CT结肠手术后1-3年每5-10年一次胃癌胃癌上消化道内镜检查根据个体情况每3-5年一次甲状腺癌甲状腺癌甲状腺检查或超声18-19岁每年一次胰腺癌胰腺癌胰腺癌筛查MRCP（磁共振胰胆管造影）和EUS（超声内镜）根据个体情况-肝母细胞瘤肝母细胞瘤肝脏触诊婴儿期每3-6个月一次中枢神经系统癌中枢神经系统癌考虑CT、MRI等检查中枢神经系统根据个体情况不定 遗传性肾癌遗传性肾癌整理ppt遗传综合症遗传综合症致病基因致病基因遗传特点遗传特点遗传性乳头状肾癌（HPRC）Met proto-oncogene(MET)常染色体显性BirtHoggDube综合征（BHD）Folli
18、culin(FLCN)常染色体显性遗传性平滑肌瘤/肾细胞癌（HLRCC）Fumarate dehydratase(FH)常染色体显性Von HippelLindau综合征（VHL）VHL gene(VHL)常染色体显性 遗传性前列腺癌遗传性前列腺癌整理pptJohns LE et al.BJU Int 2003;91:78994.先证者为一级亲属患癌风险先证者为兄弟患癌风险先证者为父亲患癌风险家族性家族性遗传性遗传性BRCA1/BRCA2表达对不同肿瘤发病风险的影响整理ppt为您的健康保驾护航为您的健康保驾护航-华大基因遗传性肿瘤基因检测产品华大基因遗传性肿瘤基因检测产品肿瘤风险早检测，未病先
19、防保健康！一一次次检测，指导一生检测，指导一生预防预防！检测项目检测项目检测基因检测基因检测周期检测周期遗传性胃癌遗传性胃癌CDH1,MLH1,MSH2,MSH6,PMS2,EPCAM20天遗传性肾癌遗传性肾癌VHL,MET,FH,FLCN20天遗传性前列腺癌遗传性前列腺癌BRCA1，BRCA2,CHEK220天遗传性多发性内分泌腺瘤遗传性多发性内分泌腺瘤MEN1,RET,CDKN1B20天遗传性甲状腺癌遗传性甲状腺癌RET,NTRK120天遗传性甲状旁腺癌遗传性甲状旁腺癌CDC73,MEN 120天遗传性多发性神经纤维瘤遗传性多发性神经纤维瘤NF1,NF220天遗传性嗜铬细胞瘤遗传性嗜铬细胞
20、瘤SDHAF2,SDHB,SDHC,SDHD,RET,VHL,MAX,NF1，TMEM12720天遗传性家族性副神经节瘤遗传性家族性副神经节瘤SDHB,SDHC，SDHD，SDHAF2，VHL20天遗传性视网膜细胞瘤遗传性视网膜细胞瘤RB120天遗传性黑色素瘤遗传性黑色素瘤CDKN2A,CDK420天遗传性多发性软骨肉瘤遗传性多发性软骨肉瘤EXT1,EXT220天遗传性胰腺癌遗传性胰腺癌BRCA2，PALB220天遗传性子宫内膜癌遗传性子宫内膜癌MLH1,MSH2,MSH6,PMS2,EPCAM20天整理ppt华大基因遗传性肿瘤检测覆盖范围及送样比例华大基因遗传性肿瘤检测覆盖范围及送样比例整理
21、ppt乳腺癌乳腺癌58%结直肠癌结直肠癌26%副神经节瘤副神经节瘤1%胃癌胃癌1%多发性神经纤维瘤多发性神经纤维瘤1%嗜铬细胞瘤嗜铬细胞瘤8%视网膜母细胞瘤视网膜母细胞瘤2%甲状腺癌甲状腺癌1%前列腺癌前列腺癌1%肾癌肾癌1%华大基因遗传性肿瘤基因检测阳性率华大基因遗传性肿瘤基因检测阳性率整理ppt00.050.10.150.20.250.3乳腺癌结直肠癌软骨肉瘤副神经节瘤胃癌多发性神经纤维瘤嗜铬细胞瘤视网膜母细胞瘤甲状腺癌多发性内分泌瘤肾癌子宫内膜癌总计为您的健康保驾护航为您的健康保驾护航-华大基因遗传性肿瘤基因检测产品华大基因遗传性肿瘤基因检测产品APC、ATM、AXIN2、BARD1、B
22、MPR1A、BRAC1、BRAC2、BRIP1、CDC73、CDH1、CDK4、CDKN1B、CDKN2A、CHEK2、EPCAM、EXT1、EXT2、FH、FLCN、MAX、MEN1、MET、MLH1、MLH3、MRE11A、MSH2、MSH6、MUTYH、NBN、NF1、NF2、NTRK1、PALB2、PMS1、PMS2、PTEN、RAD50、RAD51C、RB1、RET、SDHAF2、SDHB、SDHC、SDHD、SMAD4、STK11、TMEM127、TP53、VHL775个外显子个外显子36万个位点全覆盖万个位点全覆盖49基因基因775360,000准确率：准确率：99.99%，引领
23、行业引领行业标准！标准！服务内容：服务内容：女性常见16种遗传性肿瘤/男性常见15种遗传性肿瘤适宜适宜人群：人群：患者、近亲中有多个人患癌、患癌近亲的发病年龄小于50岁、近亲中有同一人罹患多种癌症。检测检测样本样本类型：类型：外周血、唾液。服务周期：服务周期：30个自然日配套服务：配套服务：遗传性肿瘤风险管理和健康指导、专业遗传咨询服务*高风险人群进行遗传性肿瘤相关基因的检测十分必要，早检测早预防！整理ppt专业遗传咨询团队专业遗传咨询团队-国内领先国内领先祁鸣教授美国罗彻斯特大学临床分子遗传学中心实验室主任，浙江大学医学院特聘教国际临床国际临床遗传咨询师遗传咨询师王一鸣教授华大医学首席遗传咨
24、询师，高年资医学遗传学顾问，中山大学分子医学研究院疾病基因研究所中心主任黄辉博士香港中文大学医学遗传学，遗传性疾病的诊断、预防、治疗及健康指导国内临床国内临床遗传咨询师遗传咨询师遗传咨询报告的审核、解读及咨询复杂案例研究及检测方案的设计疾病发生及再发风险评估预测遗传咨询师遗传咨询师12人人检测内容、流程、方法、周期、目的和意义接受适用人群评估检测方案：提供简单的已明确的方案样本类型、运输及保存条件咨询遗传咨询遗传咨询客服中心客服中心14人人整理ppt检测流程检测流程唾液唾液与医生一起制定与医生一起制定健康管理方案健康管理方案疫苗（宫颈癌疫苗，乙肝疫苗）生物制剂（胸腺肽、卡介菌多糖）自检血清学（
25、CEA、CA199）影像学（X片、B超、CT）内窥镜（胃肠镜）病理诊断手术放疗化疗靶向治疗血清学（CEA、CA199）影像学（X片、B超、CT）内窥镜（胃肠镜）传统方法传统方法遗传性肿瘤基因检测基因科技基因科技根据肿瘤基因变异及免疫组库情况，进行病情监测并及时调整治疗方案无创无创肿瘤早早肿瘤早早筛筛基于基因突变的精准检测及个体化用药方案1预防预防4监测监测2早诊早诊3诊疗诊疗基因基因科技助力肿瘤精科技助力肿瘤精准预防准预防1预防预防4监测监测2早诊早诊3诊疗诊疗整理ppt无创肿瘤早早筛无创肿瘤早早筛-ctDNA检测检测整理ppt无创肿瘤早早筛无创肿瘤早早筛-ctDNA检测检测整理ppt华大基因发展历程华大基因发展历程整理ppt华大基因科研实力华大基因科研实力整理ppt华大基因资质华大基因资质华大基因资质华大基因资质整理ppt123基因科技造福人类基因科技造福人类谢谢 谢谢
