1、1/29/2023 Department of Biochemistry(2)第一节第一节 基因表达调控的基本概念基因表达调控的基本概念一、基因表达的基本概念一、基因表达的基本概念l基因(gene)：遗传的基本单位，是负载特定遗传信息的DNA片断。l基因组(genome)：指含有一个生物体生存、发育、活动和繁殖所需要的全部遗传信息的整套核酸。l基因表达(gene expression)：基因转录与翻译的过程。1/29/2023 Department of Biochemistry(9)四、基因表达调控的生物学意义四、基因表达调控的生物学意义（一）适应环境、维持生长和增殖（一）适应环境、维持生长
2、和增殖环境是在不断变化的。通过调控，可使生物体表达出合适的蛋白质分子。（二）维持细胞分化和个体发育（二）维持细胞分化和个体发育生长、发育的不同阶段，不同组织器官内蛋白质分子分布、种类和含量存在很大差异，这是调节细胞表型的关键。1/29/2023 Department of Biochemistry(10)一、基因表达的多级调控一、基因表达的多级调控 基因激活基因激活 转录起始调控转录起始调控 转录后加工转录后加工 翻译调控翻译调控 翻译后加工翻译后加工转录起始水平的调控最为重要转录起始水平的调控最为重要第二节第二节 基因表达调控的基本原理基因表达调控的基本原理1/29/2023 Departm
3、ent of Biochemistry(11)二、基因转录激活受二、基因转录激活受转录调节蛋白和启动转录调节蛋白和启动子相互作用子相互作用的调节的调节（一）特异（一）特异DNA序列序列 特异DNA序列主要指具有调节功能的DNA序列。它们决定基因的转录活性。原核生物大多数基因表达调控是通过操纵子机制实现的。真核基因调控机制普遍涉及编码基因两侧的DNA序列顺式作用元件。1/29/2023 Department of Biochemistry(12)1.1.原核生物：操纵子机制原核生物：操纵子机制 蛋白质因子蛋白质因子特异特异DNA序列序列编码序列编码序列 启动序列启动序列 操纵序列操纵序列 其他调
4、节序列其他调节序列(promoter)(operator)1/29/2023 Department of Biochemistry(13)操纵子（操纵子（operon）：通常由2个以上的编码序列与启动序列（promotor）、操纵序列（operator）以及其它调节序列在基因组中成簇串联组成。启动序列（启动序列（promotor）：RNA聚合酶结合并启动转录的特异DNA序列。又称启动子。各种原核启动序列特定区域内（通常在转录起始点上游-10及-35区域）存在共有序列（consensus sequence）-35盒盒-10，TATA 盒盒1/29/2023 Department of Bioch
5、emistry(15)共有序列(consensus sequence)决定启动序列的转录活性大小。某些特异因子（蛋白质）决定RNA聚合酶对一个或一套启动序列的特异性识别和结合能力。启动子：指RNA聚合酶识别、结合并开始转录的一段 DNA序列。原核生物启动子序列按功能的不同可分为三个部位，即起始部位、结合部位、识别部位。1/29/2023 Department of Biochemistry(16)操纵序列（操纵序列（operator）：与启动序列毗邻或接近的DNA序列，是原核阻遏蛋白的结合位点。其DNA序列常与启动序列交错、重叠。当操纵序列结合有阻遏蛋白时，会阻碍RNA聚合酶与启动序列的结合，
6、或是RNA聚合酶不能沿DNA向前移动，阻碍转录。启动序列启动序列编码序列编码序列操纵序列操纵序列pol阻遏蛋白阻遏蛋白1/29/2023 Department of Biochemistry(17)其他调节序列、调节蛋白其他调节序列、调节蛋白例如：激活蛋白(activator)可结合启动序列邻近的DNA序列，促进RNA聚合酶与启动序列的结合，增强RNA聚合酶活性。有些基因在没有激活蛋白存在时，RNA聚合酶很少或完全不能结合启动序列。1/29/2023 Department of Biochemistry(18)2.2.真核生物真核生物不同真核生物的顺式作用元件中也会发现一些共有序列，如TATA
7、盒、CAAT盒等，这些共有序列是RNA聚合酶或特异转录因子的结合位点。顺式作用元件顺式作用元件(cis-acting element)可影响自身基因表达活性的可影响自身基因表达活性的DNA序列序列BADNA编码序列编码序列转录起始点转录起始点1/29/2023 Department of Biochemistry(19)（二）转录调节蛋白（二）转录调节蛋白增强或抑制转录活性增强或抑制转录活性原核生物原核生物基因调节蛋白（基因调节蛋白（DNA结合蛋白）分为三类：结合蛋白）分为三类：特异因子：决定RNA聚合酶对一个或一套启动序列的特异性识别和结合能力。阻遏蛋白（repressor）：可结合特异DN
8、A序列操纵序列，阻遏基因转录。激活蛋白（activator）：可结合启动序列邻近的DNA序列，促进RNA聚合酶与启动序列的结合，增强RNA聚合酶活性。分解（代谢）物基因激活蛋白（catabolite gene activaton protein,CAP）就是一种激活蛋白。有些基因在没有激活蛋白存在时，RNA聚合酶很少或完全不能结合启动序列。1/29/2023 Department of Biochemistry(20)真核生物真核生物基因转录调节蛋白又称基因转录调节蛋白又称转录因子转录因子（transcription factor）。绝大多数真核转录调节因子由某一基因表达后，通过与特异的顺式作
9、用元件结合（DNA-蛋白质相互作用）反式激活另一基因的转录，称为反式作用因子（trans-acting factor）。这种调节作用称为反式作用。这种调节作用称为反式作用。1/29/2023 Department of Biochemistry(21)顺式作用蛋白顺式作用蛋白还有蛋白质因子可特异识别、结合自身基因的调节序列，调节自身基因的表达，称顺式作用。cDNAaDNAC顺式调节顺式调节 mRNA C蛋白质蛋白质CBA mRNA蛋白质蛋白质AA反式调节反式调节1/29/2023 Department of Biochemistry(23)（三）（三）DNA-蛋白质、蛋白质蛋白质、蛋白质-蛋白
10、质相互作用蛋白质相互作用转录调节蛋白对转录起始调节的方式转录调节蛋白对转录起始调节的方式 DNA-蛋白质相互作用（DNA-protein interaction）主要 指反式作用因子和顺式作用元件之间的特异识别。通常是非共价结合，被识别的DNA结合位点通常呈对称、或不完全对称结构。蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction）某些调节蛋白在结合DNA前，需通过蛋白质-蛋白质相互作用，形成二聚体(dimer)或多聚体(polymer)。二聚化二聚化 同二聚体同二聚体异二聚体异二聚体1/29/2023 Department of Biochemistry(24)（
11、四）（四）RNA聚合酶聚合酶与启动序列与启动序列/启动子相结合启动子相结合1、启动序列、启动序列/启动子与启动子与RNA聚合酶活性聚合酶活性RNA聚合酶与其的亲和力，影响转录。2、调节蛋白与、调节蛋白与RNA聚合酶活性聚合酶活性一些特异调节蛋白在适当环境信号刺激下表达，然后通过DNA-蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用影响RNA聚合酶活性。1/29/2023 Department of Biochemistry(25)一、原核基因转录调节特点一、原核基因转录调节特点（一）因子决定RNA聚合酶识别特异性（二）操纵子模型的普遍性（三）阻遏蛋白的负性调节是重要因素第三节第三节 原核基因表达调节原核基因表
12、达调节1/29/2023 Department of Biochemistry(26)E.coli乳糖操纵子（乳糖操纵子（lac operon）包含：）包含：三个结构基因：三个结构基因：Z 编码-半乳糖苷酶、Y 编码通透酶、A 乙酰基转移酶 一个操纵序列一个操纵序列O 一个启动序列一个启动序列 P 一个调节基因一个调节基因 I一个分解代谢物基因激活蛋白结合位点一个分解代谢物基因激活蛋白结合位点（catabolite gene activation protein,CAP）（一）乳糖操纵子的结构（一）乳糖操纵子的结构二、原核生物转录起始调节操纵子调控模式二、原核生物转录起始调节操纵子调控模式1/
13、29/2023 Department of Biochemistry(27)乳糖操纵子结构模式 调控区调控区CAP结合位点结合位点启动序列启动序列操纵序列操纵序列 结构基因结构基因Z：-半乳糖苷酶半乳糖苷酶Y：透酶透酶A：乙酰基转移酶：乙酰基转移酶ZYAOPDNA1/29/2023 Department of Biochemistry(28)没有乳糖没有乳糖存在时，lac操纵子处于阻遏状态。I序列表达的lac阻遏蛋白与O序列结合，阻碍RNA聚合酶与P序列结合，抑制转录启动。有乳糖有乳糖存在时，lac操纵子可被诱导。乳糖在通透酶催化、转运进入细胞，再经-半乳糖苷酶催化，转变成半乳糖。半乳糖作为诱
14、导剂分子结合阻遏蛋白，使蛋白构象变化，导致阻遏蛋白与O序列解离，发生转录。（二）阻遏蛋白的负性调节（二）阻遏蛋白的负性调节1/29/2023 Department of Biochemistry(29)当没有葡萄糖及cAMP浓度较高时，cAMP与CAP结合，这时CAP结合在lac启动序列附近的CAP位点，可刺激RNA转录活性。当有葡萄糖存在时，cAMP浓度较低，cAMP与CAP结合受阻，lac操纵子表达下降。（三）（三）CAP的正性调节的正性调节1/29/2023 Department of Biochemistry(30)Lac阻遏蛋白负性调节与阻遏蛋白负性调节与cAMP正性调节两种正性调节
15、两种机制协调合作机制协调合作单独存在乳糖时，细菌利用乳糖作为能源。当葡萄糖和乳糖共同存在时，细菌首先利用葡萄糖作为能源物质。这时，葡萄糖通过降低 cAMP浓度，阻碍cAMP与CAP结合而抑制lac操纵子转录，使细菌只能利用葡萄糖。葡萄糖对 lac 操纵子的阻遏作用称分解代谢阻遏(catabolic repression)。（四）协调调节（四）协调调节1/29/2023 Department of Biochemistry(31)三、原核生物转录终止调节三、原核生物转录终止调节大肠杆菌中存在两种主要的转录终止机制：依赖Rho因子的转录终止不依赖Rho因子的转录终止大肠杆菌中存在两种终止调节方式：
16、衰减抗终止1/29/2023 Department of Biochemistry(32)四、原核生物翻译水平调节四、原核生物翻译水平调节（一）蛋白质（一）蛋白质分子结合于启动序列或启动分子结合于启动序列或启动序列周围进行自我调节序列周围进行自我调节调节蛋白结合mRNA靶位点，阻止核蛋白体识别翻译起始区，阻断翻译调节蛋白一般作用于自身mRNA，抑制自身的合成，称自我控制(autogenous control)。1/29/2023 Department of Biochemistry(33)（二）反义（二）反义RNA对翻译的调节作用对翻译的调节作用调节RNA调节基因表达的RNA分子反义RNA含有
17、与特定mRNA翻译起始部位互补的序列，通过与mRNA杂交，阻断30S小亚基对起始密码的识别以及与SD序列的结合，抑制翻译起始。称为反义控制(antisense control)。1/29/2023 Department of Biochemistry(34)附：其它转录调节机制附：其它转录调节机制转录衰减（attenuation）色氨酸操纵子是一种阻遏型操纵子当有色氨酸结合阻遏蛋白时，阻遏蛋白构象改变可结合O序列，阻断基因转录基因重组SOS反应1/29/2023 Department of Biochemistry(35)一、真核基因组结构特点一、真核基因组结构特点（一）（一）真核基因组结构庞
18、大真核基因组结构庞大第四节第四节 真核基因表达调节真核基因表达调节 哺乳类动物基因组DNA 约 3 10 9 碱基对 人基因组编码基因约有34个（22.5万），其中60存在可变剪接。编码序列仅占总长的1%rDNA等重复基因约 占 5%10%1/29/2023 Department of Biochemistry(36)（二）单顺反子二）单顺反子(monocistron)即一个编码基因转录生成一个mRNA分子，经翻译生成一条多肽链。（三）重复序列三）重复序列单拷贝序列（一次或数次）高度重复序列（106 次）中度重复序列（103 104次）多拷贝序列（四）基因不连续性四）基因不连续性1/29/20
19、23 Department of Biochemistry(37)二、真核基因表达调控特点二、真核基因表达调控特点（一）一）RNA聚合酶聚合酶有三种，分别负责三种RNA转录。（二）转录激活状态的染色质结构明显变化二）转录激活状态的染色质结构明显变化1.对核酸酶敏感对核酸酶敏感活化基因常有超敏位点，位于调节蛋白结合位点附近。1/29/2023 Department of Biochemistry(38)2.DNA拓扑结构变化拓扑结构变化天然双链DNA均以负性超螺旋构象存在；基因活化后基因活化后RNA-pol正超螺旋正超螺旋负超螺旋负超螺旋转录方向转录方向3.DNA碱基修饰变化碱基修饰变化真核DN
20、A约有5%的胞嘧啶被甲基化，甲基化范围与基因表达程度呈反比。1/29/2023 Department of Biochemistry(39)4.组蛋白变化组蛋白变化 富含Lys组蛋白水平降低 H2A,H2B二聚体不稳定性增加 组蛋白H3、H4发生乙酰化、甲基化或磷酸化修饰 H3组蛋白巯基暴露组蛋白修饰对于基因表达影响的机制也包括两种相互包容的理论。即：组蛋白的修饰直接影响染色质或核小体的结构，以及化学修饰征集了其他调控基因转录的蛋白质，为其他功能分子与组蛋白结合搭建了一个平台。这些理论构成了“组蛋白密码”的假说。1/29/2023 Department of Biochemistry(40)组
21、蛋白修饰对染色质结构与功能的影响组蛋白修饰对染色质结构与功能的影响组蛋白组蛋白氨基酸残基位点氨基酸残基位点修饰类型修饰类型功功 能能H3Lys-4甲基化甲基化激活激活H3Lys-9甲基化甲基化染色质浓缩染色质浓缩H3Lys-9甲基化甲基化DNA甲基化所必需甲基化所必需H3Lys-9乙酰化乙酰化激活激活H3Ser-10磷酸化磷酸化激活激活H3Lys-14乙酰化乙酰化防止防止Lys-9的甲基化的甲基化H3Lys-79甲基化甲基化端粒沉默端粒沉默H4Arg-3甲基化甲基化H4Lys-5乙酰化乙酰化装配装配H4Lys-12乙酰化乙酰化装配装配H4Lys-16乙酰化乙酰化核小体装配核小体装配H4Lys-
22、16乙酰化乙酰化Fly X激活激活1/29/2023 Department of Biochemistry(41)（三三）正性调节占主导正性调节占主导（四四）转录与翻译分隔进行转录与翻译分隔进行（五）转录后修饰、加工更为复杂五）转录后修饰、加工更为复杂 采用正性调节机制更精确：采用多种正性调节元件、正性调节蛋白可提高基因表达调节的特异性和精确性。采用负性调节不经济：在正性调节中，大多数基因不结合调节蛋白，所以是没有活性的；只要细胞表达一组激活蛋白时，相关靶基因即可被激活。转录在细胞核，翻译在细胞浆。因此，转录与翻译产物的分布、定位等环节均可以被调控。1/29/2023 Department o
23、f Biochemistry(42)三、三、RNA pol和和 pol 的转录调节的转录调节（一）（一）RNA pol转录体系的控制转录体系的控制RNA Pol I的转录产物只有rRNA前体，经剪接修饰生成除5S rRNA外的各种rRNA。启动子元件包括：启动子元件包括：核心元件(core element)或核心启动子(core promoter)和上游控制元件(upstream control element,UCE)。转录因子包括：转录因子包括：上游结合因子（UBF1）、选择性因子1（SL1）1/29/2023 Department of Biochemistry(43)（二）（二）RNA
24、 pol 转录体系的控制转录体系的控制RNA Pol III的转录产物：多种小分子RNA，包括tRNA、5S rRNA和一部分小核RNA。启动子位于转录起始点下游（即转录区内），称内部控制区(internal control regions,ICR)。转录起始需多种转录因子1/29/2023 Department of Biochemistry(44)四、四、RNA pol 的转录起始的调节的转录起始的调节RNA pol 转录生成所有mRNA前体及大部分snRNA参与的DNA调控序列和转录因子复杂的多按功能特性，真核基因顺式作用元件分为三种：启动子启动子、增强子增强子、沉默子沉默子（一）（一）
25、顺式作用元件影响基因转录活性顺式作用元件影响基因转录活性1/29/2023 Department of Biochemistry(45)1.启动子启动子真核基因启动子是真核基因启动子是RNA聚合酶结合位点周围的聚合酶结合位点周围的一组转录控制组件，至少包括一个一组转录控制组件，至少包括一个转录起始点转录起始点以及一个以上的以及一个以上的功能组件功能组件。TATA盒盒GC盒盒CAAT盒盒1/29/2023 Department of Biochemistry(46)2.增强子增强子(enhancer)指远离转录起始点、决定基因的时间、空间特指远离转录起始点、决定基因的时间、空间特异性、增强启动子
26、转录活性的异性、增强启动子转录活性的DNA序列。序列。其发挥作用的方式通常与方向、距离无关。其发挥作用的方式通常与方向、距离无关。增强子也由若干功能元件组成。增强子也由若干功能元件组成。酵母中的酵母中的上游激活序列上游激活序列（UASs）。）。某些基因的负性调节元件，当其结合特异蛋白某些基因的负性调节元件，当其结合特异蛋白因子时，对基因转录起阻遏作用。因子时，对基因转录起阻遏作用。3.沉默子沉默子(silencer)1/29/2023 Department of Biochemistry(47)（二）（二）反式作用因子重要的转录调控蛋白反式作用因子重要的转录调控蛋白1.转录调节因子分类转录调节
27、因子分类 按功能特性分为：按功能特性分为：基本转录因子基本转录因子（general transcription factors）是RNA聚合酶结合启动子所必需的一组蛋白因子决定三种RNA(mRNA、tRNA及rRNA)转录的类别主要参与RNA聚合酶与转录起始点附近的DNA特异序列形成稳定的转录起始复合物。特异转录因子特异转录因子（special transcription factors）为个别基因转录所需，决定该基因的时间、空间特异性表达。有转录激活因子和转录抑制因子两种。1/29/2023 Department of Biochemistry(48)2.转录调节因子结构转录调节因子结构包括
28、三个结构区域：包括三个结构区域：DNA结合域结合域转录激活域转录激活域TF蛋白质蛋白质-蛋白质结合域蛋白质结合域（二聚化结构域）（二聚化结构域）谷氨酰胺富含域谷氨酰胺富含域酸性激活域酸性激活域脯氨酸富含域脯氨酸富含域1/29/2023 Department of Biochemistry(49)最常见的最常见的DNA结合域结合域1.锌指锌指(zinc finger)C CysH His常结合常结合GC盒盒1/29/2023 Department of Biochemistry(50)2.碱性碱性-螺旋螺旋常结合常结合CAAT盒盒1/29/2023 Department of Biochemis
29、try(51)3.碱性亮氨酸拉链碱性亮氨酸拉链 （bZIP）碱性螺旋碱性螺旋-环环-螺旋螺旋 （bHLH）等）等1/29/2023 Department of Biochemistry(52)（三）（三）mRNA转录激活起始复合物形成转录激活起始复合物形成polTFHTAFTFFTAFTAFTFATFBTBP真核真核RNA聚合酶聚合酶在转录因子帮助下，形成在转录因子帮助下，形成的转录起始复合物的转录起始复合物TATA DNATBP相相关因子关因子EBP增强子增强子结合蛋白结合蛋白1/29/2023 Department of Biochemistry(53)真核基因转录调节是真核基因转录调节是
30、复杂的、多样的复杂的、多样的*不同的DNA元件组合可产生多种类型的转录调节方式；*多种转录因子又可结合相同或不同的DNA元件。*转录因子与DNA元件结合后，对转录激活过程所产生的效果各异，有正性调节或负性调节之分。1/29/2023 Department of Biochemistry(54)五、五、RNA pol 的转录终止的调节的转录终止的调节（一）（一）HIV基因组转录终止调节基因组转录终止调节HIV基因的有效表达需要病毒蛋白Tat，它是一种抗终止蛋白。Tat与转录产物5特异RNA序列结合，并与宿主蛋白质、RNA pol 相互作用，在延长中的RNA形成特定的二级结构，阻止HIV基因组转录
31、提早终止。1/29/2023 Department of Biochemistry(55)（二）热休克蛋白基因的转录终止调节（二）热休克蛋白基因的转录终止调节在应激条件下，细胞作出一系列反应，包括暂时性停止大多数基因的转录和翻译，启动一套能够提高细胞生存能力的蛋白质即热休克蛋白（heat shock protein，HSP）的基因转录等。热休克时，热休克转录因子（HSTF）转变为活性状态基因快速诱导表达。1/29/2023 Department of Biochemistry(56)六、转录后水平的调节六、转录后水平的调节（一）（一）hnRNA加工成熟的调节加工成熟的调节加工过程包括加帽、加尾
32、、剪接、碱基修饰和编辑等。（二）（二）mRNA运输、胞浆内稳定性的调节运输、胞浆内稳定性的调节通过与蛋白质结合形成核蛋白体复合物(ribonucleoprotein,RNP)进行。高等真核细胞mRNA半寿期较原核长，一般为几小时；半寿期可影响蛋白质合成量稳定性可调节的mRNA，可能含有与特异蛋白质相互作用的反应元件，影响降解速度1/29/2023 Department of Biochemistry(57)七、翻译水平以及翻译后阶段的调节七、翻译水平以及翻译后阶段的调节调节点主要在蛋白质合成的起始和延长阶段；以起始阶段为主（一）翻译起始因子（一）翻译起始因子（eIF）活性的调节）活性的调节磷酸
33、化调节（二）（二）RNA结合蛋白（结合蛋白（RBP）的调节）的调节RBP是指那些能与RNA特异序列结合的蛋白质RBP参与基因表达的许多调节环节，如：转录终止、RNA剪切、RNA转运、RNA胞浆稳定性的控制、翻译起始等等1/29/2023 Department of Biochemistry(58)（三）对翻译产物水平及活性的调节（三）对翻译产物水平及活性的调节新合成蛋白质的半衰期长短是决定蛋白质生物学功能的重要影响因素。通过对新生肽链的水解和运输，可以控制蛋白质的浓度在特定的部位或亚细胞器保持在合适的水平。许多蛋白质需要在合成后经过特定的修饰才具有功能活性。如磷酸化、甲基化、酰基化修饰、等等，
34、可以达到调节蛋白质功能的作用。1/29/2023 Department of Biochemistry(59)（四）小分子（四）小分子RNA对基因表达的调节对基因表达的调节非编码RNA（non-coding RNA,ncRNA）：微小RNA（microRNA,miRNA）小干扰RNA（small interfering RNA,siRNA）细胞核小分子RNA（snRNA）核仁小分子RNA（snoRNA）核酶（ribosome），等等RNA组学（RNomics）：研究细胞内所有小分子RNA的种类、结构和功能1/29/2023 Department of Biochemistry(60)1微小微小
35、RNA(microRNA,miRNA)是一大家族小分子非编码单链RNA，长度约2025个碱基，由一段具有发夹环结构、长度为7090个碱基的单链RNA 前体(pre-miRNA)经Dicer酶剪切后形成。成熟的miRNA与其他蛋白质一起组成RNA诱导的沉默复合体（RNA-induced silencing complex，RISC），通过与其靶mRNA分子的3非编码区域（3-UTR）互补配对，抑制该mRNA翻译。1/29/2023 Department of Biochemistry(61)miRNA的特点：的特点：其长度一般为2025个碱基；在不同生物体中普遍存在；其序列在不同生物中具有一定的
36、保守性；具有明显的表达阶段特异性和组织特异性；miRNA 基因以单拷贝、多拷贝或基因簇等多种形式存在于基因组中，大多位于基因间隔区。1/29/2023 Department of Biochemistry(62)2小干扰小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)是细胞内一类双链RNA(double-stranded RNA，dsRNA)在特定情况下通过一定酶切机制，转变为具有特定长度(2123个碱基)和特定序列的小片段RNA。双链siRNA参与RISC组成，与特异的靶mRNA完全互补结合，导致靶mRNA降解，阻断翻译过程。由siRNA介导的基因表达抑制作用被称为RN
37、A干涉(RNA interference，RNAi)。1/29/2023 Department of Biochemistry(63)30bp 双链双链RNA（dsRNA）水解生成水解生成21-23nt siRNA 5335 RISC形成形成 识别特异序列识别特异序列并使其降解并使其降解RNA干扰作用机制干扰作用机制1/29/2023 Department of Biochemistry(64)siRNAmiRNA前体前体内源或外源长双链内源或外源长双链RNA诱导产生诱导产生内源发夹环结构的转内源发夹环结构的转录产物录产物结构结构双链分子双链分子单链分子单链分子功能功能降解降解mRNA阻遏其翻
38、译阻遏其翻译靶靶mRNA 结合结合需完全互补需完全互补不需完全互补不需完全互补生物学效生物学效应应抑制转座子活性和抑制转座子活性和病毒感染病毒感染发育过程的调节发育过程的调节siRNA 和和miRNA的差异比较的差异比较1/29/2023 Department of Biochemistry(65)操纵子模式图I I调节基因调节基因P P启动序列启动序列O O操纵序列操纵序列（操纵基因）（操纵基因）Z Z、Y Y、A A三三种结构基因种结构基因（cis-acting element）真核生物编码基因两侧的DNA序列可影响自身基因的表达活性通常是非编码序列包括启动子、增强子、沉默子顺式作用元件（
39、顺式作用元件（cis-acting element）基因产物特异识别、基因产物特异识别、结合自身基因的调结合自身基因的调节序列，调节自身节序列，调节自身基因的开启或关闭基因的开启或关闭称为顺式调节称为顺式调节基因产物特异识别、结基因产物特异识别、结合其它基因的调节序列，合其它基因的调节序列，调节其它基因的开启或调节其它基因的开启或关闭称为反式调节关闭称为反式调节反式与顺式1/29/2023 Department of Biochemistry(68)乳糖水解1/29/2023 Department of Biochemistry(69)阻遏蛋白的负性调节图解阻遏蛋白的负性调节图解mRNA阻遏蛋
40、白阻遏蛋白IDNAZYAOPpol没有乳糖存在时没有乳糖存在时阻遏基因阻遏基因1/29/2023 Department of Biochemistry(70)有乳糖存在时有乳糖存在时mRNA阻遏蛋白阻遏蛋白IDNAZYAOPpol启动转录启动转录mRNA乳糖乳糖半乳糖半乳糖-半乳糖苷酶半乳糖苷酶1/29/2023 Department of Biochemistry(71)CAP的正性调节图解的正性调节图解+转录转录无葡萄糖，无葡萄糖，cAMP浓度高时浓度高时有葡萄糖，有葡萄糖，cAMP浓度低时浓度低时ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAP协调调节图解mRNA低半乳糖时低半乳糖时
41、高半乳糖时高半乳糖时 葡萄糖低葡萄糖低 cAMP浓度高浓度高 葡萄糖高葡萄糖高cAMP浓度低浓度低RNA-polOOOO1/29/2023 Department of Biochemistry(73)1.色氨酸操纵子的结构色氨酸操纵子的结构E.coli色氨酸操纵子（lac operon）包含：五个结构基因五个结构基因一个操纵序列一个操纵序列O一个启动序列一个启动序列 P一个调节基因一个调节基因 I 一个前导序列一个前导序列附：转录衰减（附：转录衰减（attenuation）1/29/2023 Department of Biochemistry(74)1/29/2023 Department
42、of Biochemistry(75)色氨酸操纵子是一种阻遏型操纵子，参与该操纵子机制的阻遏蛋白有两种分子构象。当有色氨酸结合阻遏蛋白时，阻遏蛋白构象改变可结合O序列，阻断基因转录。当没有色氨酸结合阻遏蛋白时，阻遏蛋白不能结合O序列，基因开始转录。1/29/2023 Department of Biochemistry(76)2、转录衰减机制、转录衰减机制 当色氨酸丰富时，色氨酸操纵子使用衰减作用来终止和减弱转录。转录衰减的DNA作用部位称为衰减子衰减子（attenuator）它是位于结构基因上游前导序列中具有终止子结构的短序列。前导序列转录的RNA 5 端162个核苷酸顺序，这段mRNA包含
43、4个彼此互补的区域，可形成独特的二级结构。区域 1还是一个开放阅读框，可编码一个含14个氨基酸的短肽，称为前导肽。前导肽的第10、11位是两个连续的Trp。1/29/2023 Department of Biochemistry(77)当Trp缺乏时，没有色氨酸-tRNA供给，前导肽的翻译至Trp密码子（UGG）时停止，核糖体不再移动，占据1区位置，区域2，3配对，区域4空出，不形成转录终止信号。当有足够的Trp供给时，前导14肽继续合成，核糖体占据1区和2 区，3、4区配对形成发夹结构。其后又紧跟一串U残基，转录终止。基因重组图解基因重组图解沙沙门门菌菌鞭鞭毛毛素素基基因因的的调调节节 H2
44、鞭毛素鞭毛素 阻遏蛋白阻遏蛋白 Hin重组酶重组酶转位片段转位片段hinH2IH1 H1鞭毛素鞭毛素hinH2IDNA启动序列启动序列H1启动序列启动序列1/29/2023 Department of Biochemistry(81)SOS反应反应 SOS基因基因紫外线紫外线激活激活Rec ALex A阻遏蛋白阻遏蛋白 与与DNA 损伤修复有损伤修复有关的酶和蛋白质关的酶和蛋白质基因基因表达表达Lex A阻遏蛋白阻遏蛋白操纵序列操纵序列DNA1/29/2023 Department of Biochemistry(82)锌指结构锌指结构与与DNA结合结合HLH 形成二聚体形成二聚体1/29/2023 Department of Biochemistry(84)1/29/2023 Department of Biochemistry(85)再见！86 结束语结束语
