基因-的结构和功能-ppt课件.ppt

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资源描述

1、基因的结构和功能基因的结构和功能1ppt课件1、基因的概念和特征、基因的概念和特征2、基因序列及链特征、基因序列及链特征3、真核生物的基因结构及其功能、真核生物的基因结构及其功能4、原核生物、病毒的基因结构及其功能、原核生物、病毒的基因结构及其功能提纲提纲2ppt课件精品资料 你怎么称呼老师? 如果老师最后没有总结一节课的重点的难点,你是否会认为老师的教学方法需要改进? 你所经历的课堂,是讲座式还是讨论式? 教师的教鞭 “不怕太阳晒,也不怕那风雨狂,只怕先生骂我笨,没有学问无颜见爹娘 ” “太阳当空照,花儿对我笑,小鸟说早早早”1、基因的概念和特征、基因的概念和特征5ppt课件6ppt课件基因

2、概念的发展基因概念的发展7ppt课件基因(基因(Gene Mendelian Factor),),也称为也称为遗传因子,是控制性状的基本遗传单位遗传因子,是控制性状的基本遗传单位(突变单位、重组单位和功能单位突变单位、重组单位和功能单位),是),是指线性排列在染色体上的,携带有一定遗指线性排列在染色体上的,携带有一定遗传信息,具有一定结构,并能进行自我信传信息,具有一定结构,并能进行自我信息复制与传递,控制息复制与传递,控制生物个体性状表现的生物个体性状表现的一段一段DNA或或RNA序列序列常常称为常常称为“染色体基因染色体基因”。1. 1 基因的定义基因的定义8ppt课件M Snyder,

3、M Gerstein (2003) Science 300: 258-609ppt课件A. 基因座基因座(Gene Locus):):基因在染色体上的特定位置。基因在染色体上的特定位置。B. 等位基因等位基因(Alleles):同源染色体上占据相同座位、具有不同形式的基因。同源染色体上占据相同座位、具有不同形式的基因。C. 纯合子纯合子/体体(Homozygous/Homozygotes) :同一基因座位上,具同一基因座位上,具有两个相同等位基因的基因型,称为纯合子,其对应细胞或个体称为纯合体。有两个相同等位基因的基因型,称为纯合子,其对应细胞或个体称为纯合体。D. 杂合子杂合子/体体(Het

4、erozygous/Heterozygote) :同一基因座位上,同一基因座位上,具有两个不同等位基因的基因型,称为杂合子,其对应细胞或个体称为杂合体。具有两个不同等位基因的基因型,称为杂合子,其对应细胞或个体称为杂合体。E. 显性基因显性基因(Dominant Genes): 杂合体中,表现为显性性状的基因。杂合体中,表现为显性性状的基因。F. 隐性基因隐性基因(Recessive Genes):杂合体中,表现为隐形性状的基因。杂合体中,表现为隐形性状的基因。基因相关遗传术语基因相关遗传术语了解知识了解知识10ppt课件E.复等位基因复等位基因(Multiple Alleles): 在群体中

5、,同一基因座上具有三个或三个以上的等在群体中,同一基因座上具有三个或三个以上的等位基因。位基因。F.拟等位基因拟等位基因 (Pseudo Alleles):在功能上密切相关、在位置上又邻接的几个基因。:在功能上密切相关、在位置上又邻接的几个基因。F. 突变型基因突变型基因 ( Mutant Genes):同一基因座位,等位基因直接或间接地由野生型:同一基因座位,等位基因直接或间接地由野生型基因突变产生的基因。基因突变产生的基因。G. 野生型基因野生型基因(Wild-type Genes): 在自然群体中占有多数的(视为在自然群体中占有多数的(视为正常的)等位基因。正常的)等位基因。H. 复合基

6、因复合基因 (Complex Genes): 在作用上有关的几个基因排列在一起,构成一个基因在作用上有关的几个基因排列在一起,构成一个基因复合体或基因簇。复合体或基因簇。了解知识了解知识11ppt课件了解知识了解知识12ppt课件三大特点:三大特点:l 自我复制(半保留复制):自我复制(半保留复制):是生物得以繁衍,保证物是生物得以繁衍,保证物种稳定,保持生物的基本特征。种稳定,保持生物的基本特征。l 基因决定性状:基因决定性状:l 能够突变能够突变1.2. 基因的特点基因的特点13ppt课件蛋白蛋白/酶酶14ppt课件l 能够突变能够突变http:/www.shigen.nig.ac.jp

7、致死突变致死突变非致死突变非致死突变物种进化物种进化致病突变致病突变新物种新物种遗传病遗传病15ppt课件16ppt课件此外,此外,l不同物种,其基因大小不同。不同物种,其基因大小不同。总的来说,低等生物的基总的来说,低等生物的基因小,高等生物的基因(通常含大量的内含子或重复序列)大。即使在同一生物内,因小,高等生物的基因(通常含大量的内含子或重复序列)大。即使在同一生物内,不同基因大小不同。不同基因大小不同。l原核生物:原核生物:基因数目少,结构简单、紧凑,常具有操纵子结构,序列基因数目少,结构简单、紧凑,常具有操纵子结构,序列利用效率高,易突变,大多为多顺反子。利用效率高,易突变,大多为多

8、顺反子。l真核生物:真核生物:基因数目很多,结构复杂,常含重复序列和非编码序列,基因数目很多,结构复杂,常含重复序列和非编码序列,机制复杂,相对稳定,大多为单顺反子。机制复杂,相对稳定,大多为单顺反子。17ppt课件l结构基因结构基因-编码蛋白和酶分子结构(蛋白基因);编码蛋白和酶分子结构(蛋白基因);l调控基因调控基因(Regulatory Gene)-调节结构基因表达,包含调调节结构基因表达,包含调节基因、操纵基因和启动基因;节基因、操纵基因和启动基因;l转录而不翻译的基因(转录而不翻译的基因(RNA基因):基因): rRNA基因基因rRNA核仁形成区,核糖体组成。核仁形成区,核糖体组成。

9、 tRNA基因基因tRNA转运氨基酸。转运氨基酸。1.3 基因分类基因分类按功能按功能18ppt课件l看家基因看家基因(House-keeping Gene) : 维持细胞最低限度功能所不可少的基因, 如编码组蛋白基因、编码核糖体蛋白基因、线粒体蛋白基因、糖酵解酶的基因等。这类基因在所有类型的细胞中都进行表达。l必需基因必需基因(Essential Gene ): 突变时会引起致死表型的基因.按重要程度按重要程度按物种按物种l原核基因;原核基因;l病毒基因;病毒基因;l真核基因真核基因按拷贝数按拷贝数l单拷贝基因单拷贝基因(多出现在原核和病毒多出现在原核和病毒);l多拷贝基因多拷贝基因;19p

10、pt课件2、基因序列及链特征、基因序列及链特征20ppt课件基因核酸链的化学组成:核苷基因核酸链的化学组成:核苷+磷酸磷酸OCOHH12345脱氧核苷脱氧核苷-H2HO-OHO碱基碱基AGCTAGCUPOO-OO 磷酸核苷(磷酸核苷(NMP)-D-2-核糖(戊糖)核糖(戊糖)核苷核苷POO-O53了解知识了解知识核苷核苷21ppt课件腺嘌呤腺嘌呤A鸟嘌呤鸟嘌呤G了解知识了解知识16932458716932458722ppt课件了解知识了解知识胸腺嘧啶胸腺嘧啶T胞嘧啶胞嘧啶C164532尿嘧啶尿嘧啶U16453216453223ppt课件12345了解知识了解知识24ppt课件双链双链DNA (

11、Double-stranded Genomic DNA)5-ATGGTTTCCCAATTATTCGAAGAAAAAGCTAAAGCC-3+ or sense strand(正义链)(正义链) 3-TACCAAAGGGTTAATAAGCTTCTTTTTCGATTTCGG-5- or antisense strand(反义链)(反义链)基基因因核核酸酸链链的的极极性性了解知识了解知识25ppt课件了解知识了解知识两类核酸的基本化学组成比较两类核酸的基本化学组成比较脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸(DNA)-核糖核酸核糖核酸(RNA)26ppt课件核苷酸及相应的核苷、碱基名称中英文对照表核苷酸及相应的核苷、

12、碱基名称中英文对照表了解知识了解知识27ppt课件单链单链DNA/RNA (Single Stranded DNA, ssDNA/RNA)单链线性单链线性DNA/RNA (Single Stranded Linear DNA/RNA)单链环状单链环状DNA/RNA (Single Stranded Circular DNA/RNA)双链双链DNA/RNA (Double Stranded DNA,dsDNA/RNA)双链线性双链线性DNA/RNA (Double Stranded Linear DNA/RNA)双链环状双链环状DNA/RNA (Single Stranded Circular

13、DNA/RNA)共价闭合环状共价闭合环状DNA (Covalently Closed Circular DNA,cccDNA)共价闭合环状双链共价闭合环状双链DNA质粒(质粒(Plasmid)DNA/RNA链的形式链的形式28ppt课件DNA分子由分子由两条反向平行两条反向平行多核苷酸多核苷酸链围绕同一中心轴构成的链围绕同一中心轴构成的双螺旋双螺旋结结构。双螺旋表面形成大沟和小沟构。双螺旋表面形成大沟和小沟 双螺旋直径双螺旋直径2nm,碱基平面垂直于,碱基平面垂直于螺旋纵轴螺旋纵轴 两条链都由磷酸和脱氧核糖以两条链都由磷酸和脱氧核糖以3,5-磷酸二酯键磷酸二酯键相连而成,它们位于相连而成,它们

14、位于螺旋的外侧。嘌呤碱基与嘧啶碱基螺旋的外侧。嘌呤碱基与嘧啶碱基位于螺旋的内侧,糖基平面与碱基位于螺旋的内侧,糖基平面与碱基平面相垂直平面相垂直 两条多核苷酸链依照两条多核苷酸链依照碱基互补配对碱基互补配对的原则形成的氢键相连接:的原则形成的氢键相连接:A-T间间形成两个氢键;形成两个氢键;G-C间形成三个氢间形成三个氢键键3.4nm右手双螺旋模型要点右手双螺旋模型要点2nm5335了解知识了解知识29ppt课件A-DNA:右手螺旋,右手螺旋,DNA与与RNA混合配对时混合配对时B-DNA:Watson-Crick模型,右手螺旋,生理条件下最稳定的结构模型,右手螺旋,生理条件下最稳定的结构Z-

15、DNA:左手螺旋左手螺旋Triple Helix DNA:两股碱基按两股碱基按Watson-Crick方式配对,第三股多聚方式配对,第三股多聚嘧啶(镜像重复)通过嘧啶(镜像重复)通过TAT和和CGC+配对配对DNA链结构多样性链结构多样性A-DNAB-DNAZ-DNA三股螺旋三股螺旋了解知识了解知识30ppt课件31ppt课件DNA序列中以某一中心区序列中以某一中心区域为对称轴,其两侧的碱域为对称轴,其两侧的碱基对顺序正读和反读都相基对顺序正读和反读都相同的双螺旋结构同的双螺旋结构。即对称。即对称轴一侧的片段旋转轴一侧的片段旋转180后,后,与另一侧片段对称重复。与另一侧片段对称重复。回文结构

16、能形成回文结构能形成十字结构十字结构和发夹结构。和发夹结构。回文结构回文结构32ppt课件存在于同一股上的某些存在于同一股上的某些DNA区段的反向重复序列。区段的反向重复序列。此序列各单股中没有互补序列,不能形成十字型或此序列各单股中没有互补序列,不能形成十字型或发夹结构。发夹结构。镜像重复镜像重复AATTCAAGGGAGAAGTAATGAAGAGGGAAGGATTTAAGTT CCC T CT T CATTAC T T CT CC C T TC CTA33ppt课件DNA双螺旋结构进一步盘曲形成的复杂的超螺旋双螺旋结构进一步盘曲形成的复杂的超螺旋结构:结构:l线状线状DNA形成的纽结;形成的

17、纽结;l超螺旋和多重螺旋;超螺旋和多重螺旋;l环状环状DNA形成的结;形成的结;l超螺旋超螺旋l连环连环l.DNA三级结构三级结构34ppt课件线状线状DNA形成的超螺旋形成的超螺旋35ppt课件环状环状DNA形成的超螺旋形成的超螺旋36ppt课件约约200个碱基对的个碱基对的DNA和包括和包括H1, H2A,H2B,H3,H4在内的在内的5种组蛋白结合在一起所构成种组蛋白结合在一起所构成 。DNA四级结构四级结构37ppt课件 长约长约140bp的的DNA分子绕核心部位分子绕核心部位1圈圈 38ppt课件核小体核小体39ppt课件核小体和染色质核小体和染色质40ppt课件核小体构成核小体构成

18、染色质丝染色质丝41ppt课件RNA链结构多样性链结构多样性IGCGCG53mRNA42ppt课件rRNA43ppt课件3、真核生物的基因结构及其功能、真核生物的基因结构及其功能所有含细胞的所有含细胞的(单细胞或多细胞单细胞或多细胞)生物的总称,包括动物、植物、生物的总称,包括动物、植物、真菌和原生动物。真菌和原生动物。特点:特点:均含有细胞核(核遗传)和其他细胞器均含有细胞核(核遗传)和其他细胞器(核外物质遗传(核外物质遗传/胞质遗传胞质遗传/母系遗传),如线粒体或叶绿体,有细胞骨架母系遗传),如线粒体或叶绿体,有细胞骨架l基因编码区不连续基因编码区不连续l单顺反子(一个基因序列编码一种产物

19、)单顺反子(一个基因序列编码一种产物)l基因内部存在大量重复序列基因内部存在大量重复序列l多拷贝基因多拷贝基因l基因间大小差异大基因间大小差异大l表达调控较复杂表达调控较复杂44ppt课件3.1 真核生物基因结构真核生物基因结构(Eukaryotic Gene Structure)启动子启动子Promoter外显子外显子Exons内含子内含子Introns增强子增强子Enhancer(Optional)开放阅读框开放阅读框ORF基因基因间隔区间隔区基因基因间隔区间隔区终止子终止子Terminator3-UTR加尾信号加尾信号PolyA结构基因结构基因5上游区上游区侧翼序列侧翼序列/调节序列调节

20、序列/顺式调控元件顺式调控元件3下游区下游区侧翼序列侧翼序列/调节序列调节序列/顺式调控元件顺式调控元件转录起始点转录起始点5-UTR45ppt课件断裂基因断裂基因(Richard J.Roberts &Phillip A.Sharp, 1993)指基因编码区域的不连续性,是真核基因的结构特指基因编码区域的不连续性,是真核基因的结构特点,即基因的外显子被内含子间隔成不连续、按顺点,即基因的外显子被内含子间隔成不连续、按顺序镶嵌排列在基因的序镶嵌排列在基因的ORF区域(外显子和内含子交区域(外显子和内含子交替出现,每个内含子具有替出现,每个内含子具有5-GT-AG-3边界序边界序列)列).内含子

21、内含子外显子外显子内含子内含子外显子外显子Open Reading FrameGTGTGTAGAGAG外显子外显子46ppt课件A. 并非所有基因都是断裂基因:并非所有基因都是断裂基因:如组蛋白基因和干扰素基因等。如组蛋白基因和干扰素基因等。在单细胞真核生物中,其多数基因编码区是连续的,非断裂。在单细胞真核生物中,其多数基因编码区是连续的,非断裂。B. 断裂基因是基因选择性剪接的结构基础:断裂基因是基因选择性剪接的结构基础:一个简单基一个简单基因编码不同蛋白。人类基因因编码不同蛋白。人类基因35%的基因存在选择性剪接。的基因存在选择性剪接。C. 断裂基因具有生物演化意义断裂基因具有生物演化意义

22、: 1)不同外显子)不同外显子不同不同功能域蛋白功能域蛋白 2)外显子的不同组合)外显子的不同组合新蛋白新蛋白 3)同一基因外显子的不同剪接)同一基因外显子的不同剪接功能有别的蛋白功能有别的蛋白 4)外显子间隔有利于基因重组和演化,防止或减少突变)外显子间隔有利于基因重组和演化,防止或减少突变47ppt课件启动子启动子启动子启动子(Promoter)位于结构基因位于结构基因5端转录起始点上游的大约端转录起始点上游的大约100-200bp 范围内,范围内,并有若干具有独立功能的并有若干具有独立功能的DNA序列元件,每个元件约长序列元件,每个元件约长730bp,序列本身不被转录,是,序列本身不被转

23、录,是RNA聚合酶聚合酶特异性识别和结合的一段DNA序列,能控制基因表达(转录)的起始时间,能控制基因表达(转录)的起始时间和转录程度。和转录程度。注意:启动子包含转录起始点,内部还有精细的序列结构,注意:启动子包含转录起始点,内部还有精细的序列结构,其本身不能影响和控制转录起始时间和转录程度,而是通过其本身不能影响和控制转录起始时间和转录程度,而是通过与转录因子与转录因子(Transcription factor) 蛋白质结合互作发生作用。蛋白质结合互作发生作用。转录起始点转录起始点(5-9bp),常见序列为常见序列为CAT(原核),第一个转录通常为(原核),第一个转录通常为G/A5-UTR

24、48ppt课件-10 -35转录起始位点上游大约转录起始位点上游大约10/25bp和和35/70bp处有两个共有序列处有两个共有序列(Consensus Sequence),称为),称为-10和和-35序列序列(分别控制转录起点分别控制转录起点和频率和频率)。共有序列只有少数几个核苷酸有差异,能影响。共有序列只有少数几个核苷酸有差异,能影响RNA聚聚合酶与启动子的相互识别。合酶与启动子的相互识别。TTGACATATATTAATGTGTGGAATPribnow box(原核)(原核)Hogness box/TATA box(真核)(真核)-80, -70CCAAT(真核)真核)-30, -25T

25、ATAAAAG(真核真核)GCCACACCC/GGGCGGG -110, -80GC box(真核真核)TTGACA(原核原核)TATAA(原核原核)-10与与-35之间核苷酸变动数应在之间核苷酸变动数应在15, 20, 强启动子强启动子(原核原核) : 171 TFIICTFSP10转录起点转录起点 核心启动子元件核心启动子元件(起始转录所必需的最小的(起始转录所必需的最小的DNA序列)序列)转录起始点及其上游转录起始点及其上游25/30bp处的处的TATA盒盒上游启动子元件上游启动子元件(70bp附近的附近的CAAT盒和盒和GC盒及更远)盒及更远)49ppt课件TATA框(框(TATA B

26、ox):):一段高度保守序列一段高度保守序列(7bp),TATAA/TAA/T,位,位于转录起始点上游于转录起始点上游2530 bp(-3050)。)。TATA框与转录因子框与转录因子TFII结结合,再与合,再与RNA 聚合酶聚合酶II形成复合物,从而准确地识别转录起始位置,形成复合物,从而准确地识别转录起始位置,对转录水平有定量效应。对转录水平有定量效应。CAAT框(框(CAAT Box):一段保守序列:一段保守序列GGGC/TCAATAC(9bp),), 位于转录起始点上游位于转录起始点上游-70-80bp,转录因子,转录因子CTF识别位点并与之结合,识别位点并与之结合,激活转录。激活转录

27、。GC框(框(GC Box):):碱基序列为碱基序列为GGCGGG,有两个拷贝,位于,有两个拷贝,位于CAAT Box两侧,与转录因子两侧,与转录因子SP1结合。(结合。(SP1有锌指区可以与有锌指区可以与DNA结合,在结合,在N端有激活转录的作用)端有激活转录的作用)GC框有激活转录的功能。框有激活转录的功能。50ppt课件不同的启动子序列不同的启动子序列51ppt课件52ppt课件应答元件应答元件(Responsive Elements)人金属硫蛋白基因调控区域人金属硫蛋白基因调控区域GRE-260 -240 -220 -200 -180 -160 140 -120 -100 -80 -6

28、0 -40 -20BLEMREBLE TRE MRE GC MRE TATAAP2AP1PICAP2蛋白连接蛋白连接http:/ 热激应答元件热激应答元件 (Heat Shock Response Element,HSE)、l 金属应答元件金属应答元件(Metal Response Element,MRE)、l 糖皮质激素应答元件糖皮质激素应答元件(Glucor-ticoid Response Element,GRE)l 血清应答元件血清应答元件(Serum Response Element,SRE)53ppt课件元件名称元件名称共同序列共同序列结合蛋白结合蛋白因子名称因子名称结合蛋白结合蛋白

29、因子分子量因子分子量结合结合DNA长度长度(蛋白因子蛋白因子)TATAboxTATAAAATBP30,00010bpGC boxGGGCGGSP-1105,00020bpCAAT boxGGCCAATCTCTF/NF160,00022bpOctamerATTTGCAT1-Oct76,00010bp2-Oct53,00020bpKBGGGACTTTCC NFkB44,00010bpATFGTGACGTAFT?20bpTATA框、框、CAAT框、框、GC框框八核苷酸序列(八核苷酸序列(Octamer)顺式调控元件顺式调控元件对基因表达有调控活性的对基因表达有调控活性的DNA序列,其活性只影响与其自

30、身同处于一序列,其活性只影响与其自身同处于一个个DNA分子上的基因分子上的基因。通常把顺式调控元件中的核心序列称为共有序。通常把顺式调控元件中的核心序列称为共有序列或一致序列(列或一致序列(Consensus Sequence),包含启动子、增强子、负调),包含启动子、增强子、负调控元件、应答元件和加尾信号等。控元件、应答元件和加尾信号等。54ppt课件元件名称元件名称共同序列共同序列结合蛋白结合蛋白因子名称因子名称结合蛋白结合蛋白因子分子量因子分子量结合结合DNA长度长度(蛋白因子蛋白因子)TATAboxTATAAAATBP30,00010bpGC boxGGGCGGSP-1105,0002

31、0bpCAAT boxGGCCAATCTCTF/NF160,00022bpOctamerATTTGCAT1-Oct76,00010bp2-Oct53,00020bpKBGGGACTTTCCNFkB44,00010bpATFGTGACGTAFT?20bpTBP: TATA-binding proteinCTF: CAAT box transcription factor 反式作用因子:反式作用因子:TBP、CTF、SP-l反式作用因子反式作用因子一组识别与结合顺式调控元件核心序列,进而调控靶基因转录效率的蛋白质。一组识别与结合顺式调控元件核心序列,进而调控靶基因转录效率的蛋白质。它由反式它由反式

32、作用因子基因编码,通常具有锌指结构、碱性亮氨酸拉链、螺旋作用因子基因编码,通常具有锌指结构、碱性亮氨酸拉链、螺旋-环环-螺旋基元等特征,螺旋基元等特征,具有具有DNA结合结构域和转录活化结构域两个重要的结构域。结合结构域和转录活化结构域两个重要的结构域。55ppt课件l广谱表达型启动子;广谱表达型启动子;l组织特异性启动子;组织特异性启动子;l肿瘤特异性启动子;肿瘤特异性启动子;l物种特异性启动子;物种特异性启动子;l 恶性肿瘤恶性肿瘤转录因子调控障碍转录因子调控障碍启动子启动子56ppt课件增强子增强子Enhancer启动子上游或下游的一段启动子上游或下游的一段DNA序列(核心序列常为序列(

33、核心序列常为8-12bp),可以增强启动子发动转录,提高转录效),可以增强启动子发动转录,提高转录效率。率。 特点:特点:l在在任意任意位置都有效位置都有效l无方向性无方向性l有有组织特或细胞特异性组织特或细胞特异性57ppt课件绝缘子绝缘子http:/jcs.biologists.org/content/122/9/1275/F4.expansion.html嗅觉受嗅觉受体基因体基因 珠蛋白基因珠蛋白基因浓缩染色质浓缩染色质 核仁磷酸化蛋白核仁磷酸化蛋白 CTCF: CCCTC-binding factor Beta珠蛋白基因增强子珠蛋白基因增强子2个串联重复个串联重复,72bp, 效率提高

34、效率提高200倍倍58ppt课件外显子外显子结构基因中,编码序列称为结构基因中,编码序列称为外显子外显子(Exon),表达,表达多肽链部分。非编码序列称为多肽链部分。非编码序列称为内含子内含子(Intron)。内含子内含子外显子、内含子外显子、内含子l真核基因内含子和外显子并非完全固定不变真核基因内含子和外显子并非完全固定不变:如编如编码某一多肽链时,为外显子,而编码另一多肽链时,则是内含子。这样,同一基因却可以转录两种或码某一多肽链时,为外显子,而编码另一多肽链时,则是内含子。这样,同一基因却可以转录两种或两种以上的两种以上的mRNA。l某些真核基因无内含子某些真核基因无内含子:如组蛋白基因

35、,干扰素基因等,它们多以基因如组蛋白基因,干扰素基因等,它们多以基因簇形式存在。此外,大多数酵母结构基因也无内含子。簇形式存在。此外,大多数酵母结构基因也无内含子。GTGT59ppt课件DMD基因基因 (2300kb):79个外显子个外显子+ 78 个内含子个内含子Duchenne Muscular Dystrophy (杜氏肌营养不良症杜氏肌营养不良症 )60ppt课件信使信使RNA蛋白质蛋白质信使信使RNA信使信使RNA前体前体RNA断裂断裂蛋白质蛋白质GeneA腺病毒腺病毒 GeneB高等动物高等动物 非编码区非编码区(Non-coding Rregion)不能编码蛋白质的区段叫做非编码

36、区非编码区 61ppt课件终止子终止子Terminator使使RNA聚合酶转录终止的聚合酶转录终止的DNA序列序列。包含一段。包含一段回文回文序列、序列、5-AATAAA-3 (PolyA)序列及富含序列及富含GT/T序列序列。终止子终止子加尾信号加尾信号62ppt课件5-C C CAGC CCGCCTAATGAGCGGGCTTTTTTT-33-GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCGAAAAAAA-5DNA回文序列回文序列:转录终止信号转录终止信号7-20bp阻碍阻碍RNA聚合酶的移动。一串聚合酶的移动。一串U与与DNA模板中的模板中的A的结合不稳定,从的结合不稳定,从模板上脱落下来,

37、终止转录。模板上脱落下来,终止转录。5-CCCA GCCCGC CUAAUGA GCGGGC UUUUUUU-3mRNA5-CCCAGCCCGCCGGGCGUUUUUUU-3CUAAUGA发夹环发夹环PolyA:附加信号附加信号因子非依赖性终止子,因子非依赖性终止子,GC含量高含量高63ppt课件lRho-dependent Terminator 64ppt课件UTR:Untranslated Region终止密码终止密码mRNA前导区前导区(leader)尾区尾区65ppt课件l5- UTR: 翻译起始密码子上游翻译起始密码子上游, mRNA翻译起点翻译起点的鸟嘌呤核苷酸的鸟嘌呤核苷酸G(甲

38、基化帽(甲基化帽CAP)延伸至)延伸至ATG起始密码子起始密码子,能被核糖体识别结合,充当滑道的序能被核糖体识别结合,充当滑道的序列(列(SD序列序列原核原核););l3- UTR: 编码区末端终止密码子到多聚编码区末端终止密码子到多聚A末端。末端。AAUAAA多聚腺苷酸信号多聚腺苷酸信号保护性蛋白保护性蛋白连接位点连接位点miRNAs连接位点连接位点 注:注: 3- UTR可脱离可脱离mRNA单独存在,称为游离单独存在,称为游离3- UTR66ppt课件侧翼序列侧翼序列Flanking sequence5上游区上游区侧翼序列侧翼序列/调节序列调节序列3下游区下游区侧翼序列侧翼序列/调节序列调

39、节序列结构基因的第一个和最后一个外显子的外侧,不被结构基因的第一个和最后一个外显子的外侧,不被转录的非编码区,称为转录的非编码区,称为侧翼序列侧翼序列。基因的调控序列,对基因的有效表达起调控作用,包括:启动子、增强子、终止子等。基因的调控序列,对基因的有效表达起调控作用,包括:启动子、增强子、终止子等。67ppt课件基因家族基因家族(Gene Family )基因家族:基因家族:指由某一祖先基因经过重复复制和变指由某一祖先基因经过重复复制和变异所产生的一组基因,其核苷酸序列或编码产物异所产生的一组基因,其核苷酸序列或编码产物的结构具有一定程度的同源性。的结构具有一定程度的同源性。(每个基因都有

40、自己的启动(每个基因都有自己的启动子,与操纵子不同;功能相近,利于功能发挥。)子,与操纵子不同;功能相近,利于功能发挥。)68ppt课件低密度脂蛋白受体基因家族低密度脂蛋白受体基因家族分拣蛋白分拣蛋白http:/www.mdc-berlin.de清除血液中的脂蛋白(介导内吞作用,传递信号到靶细胞)清除血液中的脂蛋白(介导内吞作用,传递信号到靶细胞)69ppt课件B. 簇集在不同染色体上簇集在不同染色体上,编码功能紧密相关的一组蛋白。,编码功能紧密相关的一组蛋白。 胎儿期基因胎儿期基因胚胎期基因胚胎期基因成人期基因成人期基因假基因假基因2 1 2 1 2 1 G A 珠蛋白基因珠蛋白基因11染色

41、体染色体珠蛋白基因珠蛋白基因16染色体染色体基因家族簇集方式基因家族簇集方式A. 簇集在同一条染色体上簇集在同一条染色体上,可同时发挥作用,合成某些蛋白质。如组蛋,可同时发挥作用,合成某些蛋白质。如组蛋白基因家族:第白基因家族:第7号染色体长臂号染色体长臂3区区2带到带到3区区6带区域内。带区域内。70ppt课件基因家族类型:基因家族类型:A. 多拷贝基因家族多拷贝基因家族(彼此核酸序列相同):(彼此核酸序列相同):rRNA家族、家族、tRNA家族、组蛋白家族。家族、组蛋白家族。B. 序列高度同源基因家族序列高度同源基因家族(同源性(同源性80%):人类生长激素基因家族。):人类生长激素基因家

42、族。C. 同源功能基因家族同源功能基因家族(编码产物具有同源功能区):(编码产物具有同源功能区):src癌基因家族。癌基因家族。D. 保守基序基因家族保守基序基因家族(编码产物具有小段保守基序):(编码产物具有小段保守基序):DEAD盒。盒。E. 基因超家族:基因超家族:指一组由多基因家族及单基因组成的更大的基因家族。指一组由多基因家族及单基因组成的更大的基因家族。F. 假基因(假基因(Pseudo gene,):):多基因家族中,具有功能基因相似的多基因家族中,具有功能基因相似的基因序列,但不能产生功能性产物的基因。基因序列,但不能产生功能性产物的基因。71ppt课件来源:来源:l 复制插入

43、突变复制插入突变:功能基因复制插入序列中,后经过突变形成功能基因复制插入序列中,后经过突变形成非功能性基因。非功能性基因。l 反转录插入反转录插入:自主的反转录转座元件,来源于自主的反转录转座元件,来源于RNA聚合酶聚合酶的转录产物(由的转录产物(由mRNA反转录为反转录为cDNA,后整合在基因组中)。它通常,后整合在基因组中)。它通常具有具有mRNA的特征(的特征(5端有端有mRNA分子特有的多聚腺苷分子特有的多聚腺苷Poly(A)序列)序列)特点:特点: 不含内含子序列,末端有很短一段不含内含子序列,末端有很短一段AT碱基对,两端各有一个短的正向重碱基对,两端各有一个短的正向重复序列。复序

44、列。假基因假基因( Pseudo gene)72ppt课件假基因中可以积累许多突变,并常常同时存在三种终止密码子序列假基因中可以积累许多突变,并常常同时存在三种终止密码子序列复制插入突变复制插入突变反转录插入反转录插入复制复制突变突变反转录反转录插入插入73ppt课件4、原核、病毒的基因结构和功能特征、原核、病毒的基因结构和功能特征真核生物与原核生物的最大区别在于出现了胞质和核质的真核生物与原核生物的最大区别在于出现了胞质和核质的区域区域化化,使遗传信息的复制、转录与翻译在时空上完全分开。,使遗传信息的复制、转录与翻译在时空上完全分开。单倍体单倍体一条染色体一条染色体+质粒质粒+转转座因子座因

45、子.74ppt课件原核生物基因结构原核生物基因结构Prokaryotic Gene Structure 操纵子(操纵子(Operon):):原核基因功能单位,含原核基因功能单位,含有有一个启动子序列一个启动子序列和和多个结构基因多个结构基因。指数个功能上相关的基因串联在一起,连同指数个功能上相关的基因串联在一起,连同上游的调控区和下游的转录终止信号构成基上游的调控区和下游的转录终止信号构成基因的表达单位。因的表达单位。75ppt课件原核生物基因结构原核生物基因结构乳糖操纵子乳糖操纵子( Lactose Operon)调节序列调节序列结构基因(结构基因(3个)个)Plac结构基因结构基因启动子启

46、动子调节基因启动子调节基因启动子Pio操作子:操作子:阻遏蛋白阻遏蛋白结合位点结合位点i调调节节基基因因编编码码区区y渗透酶渗透酶z半乳糖苷酶半乳糖苷酶 a转乙酰酶转乙酰酶 调节基因调节基因乳糖操纵子乳糖操纵子阻遏蛋白阻遏蛋白76ppt课件l调节基因:调节基因:可转录翻译出调节蛋白/阻遏蛋白, 调节操纵基因的活动(本身能转录出mRNA)l操纵基因:操纵基因:位于基因启动子后或与启动子重叠,可控制邻近基因或基因群的表达及表达速度(本身不能转录成mRNA)l启动基因:启动基因:位于操纵基因附近,其作用是发出信号,mRNA合成开始(不能转录成mRNA )77ppt课件一段一段DNA序列从原位上单独复

47、制或断裂下来,序列从原位上单独复制或断裂下来,插入另插入另DNA序列位点,并调控其后基因的转录序列位点,并调控其后基因的转录,此过程称转座(,此过程称转座(Transposition)。这段序列称)。这段序列称跳跃基因、转座子或转座元件(跳跃基因、转座子或转座元件(Tranposable Element)。)。转座子(转座子(Tansposon)78ppt课件TranposableElement79ppt课件l相关基因丛集相关基因丛集: 功能上相关的基因排列在一起功能上相关的基因排列在一起l含有不规则基因结构序列含有不规则基因结构序列l有重叠基因有重叠基因病毒基因特点病毒基因特点80ppt课件

48、重叠基因(重叠基因(Overlapping Gene)1977年年Sanger在研究在研究X174噬菌体时发现,有两噬菌体时发现,有两个或两个以上的基因共用一段个或两个以上的基因共用一段DNA序列,或一序列,或一段段DNA序列成为两个或两个以上基因的组成部序列成为两个或两个以上基因的组成部分。分。l重叠基因有编码序列,也有调控序列:重叠基因有编码序列,也有调控序列:节约碱基,参与对基因的节约碱基,参与对基因的调控。调控。 l仅见于线粒体和质粒仅见于线粒体和质粒DNA(其它的生物细胞)其它的生物细胞)81ppt课件l两基因首尾重叠:两基因首尾重叠:A-Kl几个基因重叠一段核苷酸几个基因重叠一段核

49、苷酸序列:序列:A-A-B-KEAACDKB重叠基因重叠类型重叠基因重叠类型82ppt课件正向重复(正向重复(DR):5-TTCACCTCTGC-3特点特点HBV (Hepatitis B Virus)83ppt课件1、基因的概念和特征、基因的概念和特征2、基因序列及链特征、基因序列及链特征(知识回顾与了解知识回顾与了解)3、真核生物的基因结构及其功能、真核生物的基因结构及其功能增强子、启动子、内含子增强子、启动子、内含子/外显子、终止子、外显子、终止子、UTR、侧翼序列、基因家族、假基、侧翼序列、基因家族、假基因、断裂基因因、断裂基因4、原核生物、病毒的基因结构及其功能、原核生物、病毒的基因结构及其功能操纵子、转坐子、重叠基因操纵子、转坐子、重叠基因总结总结84ppt课件

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