新冠病毒超级突变一图读懂奥密克戎.pptx

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1、一 图 读 懂 “ 奥 密 克 戎 ”奥密克戎(OMICRON)编号B.1.1.529奥密克戎,为2019新型冠状病毒变种,2021年11月9日,南非首次从病例样本中检测到一种新冠病毒B.1.1.529变异株。短短2周时间,该变异株即成为南非豪登省新冠感染病例的绝对优势变异株,增长迅猛。11月26日,WHO将其定义为第五种“关切变异株”(variant of concern, VOC),取名希腊字母Omicron(奥密克戎)变异株。目前,南非、以色列、比利时、意大利、英国、奥地利和中国香港等,均已监测到该变异株的输入。世卫组织称,新冠病毒奥密克戎变异毒株在全球总体风险评估为“非常高”,可能在世

2、界广泛传播。奥密克戎(Omicron),编号B.1.1.529,是一种新型的新冠病毒变异毒株。发现时间线在南非首次采集确认。南非政府首次向世卫组织报告。南非新增确诊病例2465例,奥密克戎毒株占新增病例数的75%以上。世卫组织将其列为“需要关注”的变异毒株,并命名为“奥密克戎”。全球至少有9个国家和地区相继报告明确发现了该变异毒株。长相图注:图为德尔塔(左)与奥密克戎(右)毒株的刺突蛋白(S蛋白)对比图。(图片来自罗马儿童医院)变化最大的区域用红色标记。在德尔塔变异毒株的刺突蛋白上,突变的氨基酸残基数量为18个,而在新毒株奥密克戎中则有43个。奥密克戎变异多样化,且大部分位于与人体细胞相互作用

3、的区域。当地时间11月27日,意大利罗马儿童医院科研团队发布新冠病毒新型变异毒株奥密克戎的全球首张图片。注:以上有关奥密克戎变异毒株特性由初步证据得出,更进一步风险评估仍需更多实验数据。特点德尔塔变异毒株奥密克戎变异毒株刺突蛋白上的变异15处32处突变基因(可能性)新冠病毒属于mRNA病毒,它本身就容易发生基因突变携带着一系列不寻常的突变,且大部分位于与人体细胞相互作用的区域毒性/传播力(可能性)与过去老的毒株相比,传播速度快;病毒载量高;发病进程快;重症比例高与德尔塔毒株相比,可能会增加人体二次感染新冠的风险;可能增强了人际传播能力;毒性可能大于德尔塔免疫逃逸可能存在免疫逃逸,但疫苗仍有保护

4、作用部分刺突蛋白突变有助于病毒逃避免疫,多处变异或将弱化现有疫苗的效力2021年11月29日,世卫组织称,新冠病毒奥密克戎变异毒株在全球总体风险评估为“非常高”,可能在世界广泛传播。由此可见,与此前发现的“德尔塔”毒株相比,奥密克戎有可能产生如下影响更多的刺突蛋白突变变异多样化大部分位于与人体细胞相互作用的区域更大的传播风险更强的疫苗抗药性增加二次感染新冠风险根据新冠病毒数据库GISAID目前共享的信息显示,新冠病毒奥密克戎变异株的突变位点数量明显多于近2年流行的所有新冠病毒变异株,尤其在病毒刺突(Spike)蛋白突变较多。推测其出现的原因可能有以下三种情况:01 01 免疫缺陷患者感染新冠病

5、毒后免疫缺陷患者感染新冠病毒后在体内经历了较长时间的进化累积大量突变,通过偶然机会传播。01020302 02 某种动物群体感染新冠病毒后某种动物群体感染新冠病毒后在动物群体传播过程中发生适应性变化后突变,溢出感染人类。03 03 某些国家或地区监测能力不足某些国家或地区监测能力不足此变异株在新冠病毒基因组变异监测落后的国家或地区持续流行了很长时间,由于监测能力不足,其进化的中间代次病毒未能及时发现。南非医学协会主席安吉丽克南非医学协会主席安吉丽克库切介绍:库切介绍:这是一种轻度疾病,症状包括肌肉酸疼、疲倦,并伴有轻微咳嗽。到目前(当地时间11月26日)为止,我们发现感染者并没有失去味觉和嗅觉

6、,也没有明显的症状。目前,全球尚无奥密克戎变异株传播力、致病力和免疫逃逸能力等方面的系目前,全球尚无奥密克戎变异株传播力、致病力和免疫逃逸能力等方面的系统研究数据。统研究数据。但奥密克戎变异株同时具有前4个VOC变异株Alpha(阿尔法)、Beta(贝塔)、Gamma(伽玛)和Delta(德尔塔)刺突蛋白的重要氨基酸突变位点,包括增强细胞受体亲和力和病毒复制能力的突变位点。流行病学和实验室监测数据显示,南非感染奥密克戎变异株病例数明显增加,并部分取代了Delta(德尔塔)变异株,传播力有待进一步监测研究。研究表明,新冠病毒S蛋白若出现K417N、E484A或N501Y突变,提示免疫逃逸能力增强

7、;而奥密克戎变异株同时存在“K417N+E484A+N501Y”三重突变此外,奥密克戎变异株还存在其他多个可能降低部分单克隆抗体中和活性的突变。突变的叠加可能降低部分抗体药物对奥密克戎变异株的保护效力,对现有疫苗免疫逃逸的能力,有待进一步监测研究。123对奥密克戎变异株的基因组分析显示,其突变位点不影响我国主流核酸检测试剂的敏感性和特异性。奥密克戎变异株突变的位点主要集中在S蛋白基因的高变异区,并不位于我国第八版新型冠状病毒肺炎防控方案公布的核酸检测试剂引物和探针靶标区域(中国疾控中心病毒病所向全球公布的ORF1ab基因和N基因)。但南非多个实验室的数据提示,对于检测靶标为S基因的核酸检测试剂

8、可能无法有效检出奥密克戎变异株的S基因。鉴于奥密克戎变异株在南非的快速流行趋势,包括美国、英国、欧盟、俄罗斯、以色列、我国台湾和香港等在内的多个国家和地区纷纷限制来自非洲南部的旅客入境。我国的我国的“外防输入,内防反弹外防输入,内防反弹”防控策略对奥密克戎变异株仍然有效。防控策略对奥密克戎变异株仍然有效。中国疾控中心病毒病所已针对奥密克戎变异株建立了特异性核酸检测方法,并持续针对可能的输入病例开展病毒基因组监测。上述措施将有利于及时发现可能输入我国的奥密克戎变异株。WHO建议各国加强新冠病毒的监测、报告与研究工作,采取有效的公共卫生措施阻断病毒传播建议个人采取的有效预防感染措施包括公共场所至少

9、保持1米距离、佩戴口罩、开窗通风、保持手清洁、对着肘部或纸巾咳嗽或打喷嚏、接种疫苗等,同时避免去通风不良或拥挤的地方。与其他VOC变异株相比,目前尚不确定奥密克戎变异株传播力、致病性和免疫逃逸能力是否更强,相关研究在未来的几周内将得到初步结果。但目前已知的是,所有变异株都可能导致重症或死亡,因此预防病毒传播始终是关键,新冠疫苗对减少重症和死亡仍然有效。建 议即使已经完成全程疫苗接种和接种加强针的情况下,也同样需要在室内公共场所、公共交通工具等场所佩戴口罩。此外,还要勤洗手和做好室内通风。(1 1)戴口罩仍然是阻断病毒传播的有效方式,对于奥密克戎变异株同样适用。)戴口罩仍然是阻断病毒传播的有效方式,对于奥密克戎变异株同样适用。在有疑似新冠肺炎症状,例如发热、咳嗽、呼吸短促等症状出现时,及时监测体温,主动就诊。(2 2)做好个人健康监测。)做好个人健康监测。短短数天时间,多个国家和地区陆续报告奥密克戎变异株输入,我国也面临该变异株输入的风险,并且目前全球对该变异株的认识仍有限。因此,应尽量减少前往高风险地区,并加强旅行途中的个人防护,降低感染奥密克戎变异株的机会。(3 3)减少非必要出入境。)减少非必要出入境。一 图 读 懂 “ 奥 密 克 戎 ”奥密克戎(OMICRON)编号B.1.1.529

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