1、 第九章 蛋白质的降解和氨基酸代谢n蛋白质的消化降解:外源蛋白的消化 内源性蛋白的选择性降解n氨基酸的降解和转化n氨基酸的生物合成肽链外切酶肽链外切酶肽链内切酶肽链内切酶 第一节 蛋白质消化、降解消化道内几种蛋白酶的专一性消化道内几种蛋白酶的专一性(Phe.Tyr.Trp)(Arg.Lys)(脂肪族)(脂肪族)胰凝乳胰凝乳蛋白酶蛋白酶胃蛋白酶胃蛋白酶弹性蛋白酶弹性蛋白酶羧肽酶羧肽酶胰蛋白酶胰蛋白酶氨肽酶氨肽酶羧肽酶羧肽酶(Phe.Trp)哺乳动物的胃、小肠中含有胃蛋白酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、羧肽酶、氨肽酶、弹性蛋白酶。经上述酶的作用,蛋白质水解成游离氨基酸,在小肠被吸收。被吸收的氨基酸(与
2、糖、脂一样)一般不能直接排出体外,需经历各种代谢途径。二、外源蛋白质消化吸收(1)不依赖ATP的溶酶体途径,没有选择性,主要降解细胞通过胞吞作用摄取的外源蛋白、膜蛋白及长寿命的细胞内蛋白。(2)依赖ATP的泛素途径,在胞质中进行,主要降解异常蛋白和短寿命蛋白(调节蛋白),此途径在不含溶酶体的红细胞中尤为重要。(选择性降解)真核细胞中蛋白质的降解途径意义:(1)清除异常蛋白;(2)细胞对代谢进行调控的一种方式三、n泛素是一种8.5KD(76AA残基)的小分子蛋白质,普遍存在于真核细胞内。一级结构高度保守,酵母与人只相差3个AA残基,它能与被降解的蛋白质共价结合,使后者活化,然后被蛋白酶降解。n2
3、004年6日瑞典皇家科学院宣布,2004年诺贝尔化学奖授予以色列科学家阿龙切哈诺沃、阿夫拉姆赫什科和美国科学家欧文罗斯,以表彰他们发现了泛素调节的蛋白质降解。泛素的羧基末端的泛素的羧基末端的GlyGly与将被送去降解与将被送去降解的蛋白质的的蛋白质的LysLys的的-氨基共价连接,而氨基共价连接,而使将被降解的蛋白质携带了降解标记,使将被降解的蛋白质携带了降解标记,这个过程分三步进行:这个过程分三步进行:泛素的羧基末端以硫酯键与泛素活泛素的羧基末端以硫酯键与泛素活化酶(化酶(E1E1)相连。)相连。泛素然后被转移到被称为泛素结合泛素然后被转移到被称为泛素结合酶(酶(E2E2)的许多同源小蛋白质
4、的中某一)的许多同源小蛋白质的中某一小蛋白的巯基上。小蛋白的巯基上。泛素泛素-蛋白质连接酶(蛋白质连接酶(E3E3)将活化的)将活化的泛素从泛素从E2E2转移到已结合在转移到已结合在E3E3上的蛋白质上的蛋白质的赖氨酸的赖氨酸-氨基上,形成一个异肽键(氨基上,形成一个异肽键(isopetideisopetide bond bond)。)。情况下可被几个泛素分子连接。第二节 氨基酸的降解和转化氨基酸的去向:(1)重新合成蛋白质(蛋白质周转)(2)合成其它含氮化合物,如血红素、活性胺、GSH、核苷酸、辅酶等(3)彻底分解,提供能量v食物蛋白中,经消化而被吸收的氨基酸(外源性AA)与体内组织蛋白降解
5、产生的氨基酸(内源性AA)混在一起,分布于体内各处,参与代谢,称为氨基酸代谢库。氨基酸代谢概况食物蛋白质食物蛋白质氨基酸氨基酸特殊途径特殊途径-酮酸酮酸糖及其代谢糖及其代谢中间产物中间产物脂肪及其代谢脂肪及其代谢中间产物中间产物TCA鸟氨酸鸟氨酸循环循环NH4+NH4+NH3CO2H2O体蛋白体蛋白尿素尿素尿酸尿酸激素激素卟啉卟啉尼克酰氨尼克酰氨衍生物衍生物肌酸胺肌酸胺嘧啶嘧啶嘌呤嘌呤SO4 2-生物固氮生物固氮硝酸还原硝酸还原(次生物质代谢)(次生物质代谢)CO2胺胺n脱氨基作用氧化脱氨基非氧化脱氨基作用转氨基作用 联合脱氨基 n脱羧基作用氨基酸的分解代谢主要在肝脏中进行一、脱氨基作用(一)
6、氧化脱氨基AA AA 酮酸酮酸+NH+NH3 3L-谷氨酸脱氢酶谷氨酸脱氢酶H2O NH4+L-谷氨酸谷氨酸-亚氨基戊二酸亚氨基戊二酸-酮戊二酸酮戊二酸在体内,谷氨酸脱氢酶催化可逆反应。一般情况下偏向于谷氨酸的合成,因为高浓度氨对机体有害。但当谷氨酸浓度高而NH3浓度低时,则有利于脱氨和-酮戊二酸的生成。1、L-Glu脱氢酶反应不需氧。反应不需氧。L-谷氨酸脱氢谷氨酸脱氢酶在动、植、酶在动、植、微生物体内都微生物体内都有。有。氨基酸氧化酶 D-氨基酸氧化酶|-氨基酸氨基酸 氨基酸氧化酶(氨基酸氧化酶(FAD)-酮酸酮酸 R-CH-COOR-CH-COO-NHNH+3 3|R-C-COO R-C
7、-COO-+NH+NH3 3 O OFADFADFADHFADH2 2FADHFADH2 2+O+O2 2 FAD FAD+H+H2 2OO2 22、氨基酸氧化酶 脱酰胺基作用 脱水脱氨基作用 还原脱氨基作用(严格无氧条件下)氧化-还原脱氨基作用 两个氨基酸互相发生氧化还原反应 水解脱氨基作用(大多在微生物中进行)大多在微生物中进行)(二)非氧化脱氨基作用脱酰胺基作用 CH2-CONH2CH2-CH+NH3COO-+H2OCH2-COO-CH2-CH+NH3COO-+NH3谷氨酰胺酶CH2-CONH2CH+NH3COO-+H2O天冬酰胺酶CH2-COO-CH+NH3COO-+NH3上述两种酶广
8、泛存在于微生物、动物、植物中,有相当高的专一性。-氨基酸氨基酸1 R1-CH-COO-NH+3|-酮酸酮酸1 R1-C-COO-O|R2-C-COO-O|-酮酸酮酸2 R2-CH-COO-NH+3|-氨基酸氨基酸2(三)转氨基作用概念概念:指在转氨酶催化下将指在转氨酶催化下将-氨基酸的氨基转给另一个氨基酸的氨基转给另一个酮酸,酮酸,结果原来的结果原来的-氨基酸生成相应的氨基酸生成相应的-酮酸,而酮酸,而原来的原来的-酮酸则形成了相应的酮酸则形成了相应的-氨基酸氨基酸 。n参与蛋白质合成的20种-氨基酸中,除Gly、Lys、Thr和Pro不参加转氨基作用,其余均可由特异的转氨酶催化参加转氨基作用
9、。转氨基作用机制迄今发现的转氨酶都以磷酸吡哆醛为辅基,迄今发现的转氨酶都以磷酸吡哆醛为辅基,它与酶蛋白以牢固的共价键形式结合。它与酶蛋白以牢固的共价键形式结合。单靠转氨基作用不能最终脱掉氨基,单靠氧化脱氨基作用也不能满足机体脱氨基的需要,因为只有Glu脱氢酶活力最高,其余L-氨基酸氧化酶的活力都低。机体借助联合脱氨基作用可以迅速脱去氨基。(四)联合脱氨基a、转氨酶与L-谷氨酸脱氢酶作用相偶联b、转氨基作用与嘌呤核苷酸循环相偶联n大多数转氨酶,优先利用-酮戊二酸作为氨基的受体,生成Glu。n因为生成的谷氨酸可在谷氨酸脱氢酶的催化下氧化脱氨,使-酮戊二酸再生。转氨酶与L-谷氨酸脱氢酶作用相偶联转氨
10、基作用与嘌呤核苷酸循环相偶联-氨基酸氨基酸-酮酸酮酸-酮戊二酸酮戊二酸谷氨酸谷氨酸草酰乙酸草酰乙酸天冬氨酸天冬氨酸腺苷酰琥珀酸腺苷酰琥珀酸苹果酸苹果酸延胡索酸延胡索酸腺苷酸腺苷酸次黄苷酸次黄苷酸1、NH3去向氨对生物机体有毒,特别是高等动物的脑对氨极敏感,血中1%的氨会引起中枢神经中毒,因此,脱去的氨必须排出体外。氨中毒的机理:脑细胞的线粒体可将氨与-酮戊二酸作用生成Glu,大量消耗-酮戊二酸,影响TCA,同时大量消耗NADPH,产生肝昏迷。(五)产物去向AA AA 酮酸酮酸+NH+NH3 3R-CO-COOHR-CO-COOH(1)重新利用:合成AA、核酸。(2)贮存:高等植物将氨基氮以Gl
11、n,Asn的形式储存在体内。谷氨酰胺合成酶谷氨酰胺合成酶NH4+谷谷AA+ATP 谷氨酰胺谷氨酰胺+ADP+Pi+H+NH NH3 3去向去向(3)排出体外:通过尿素循环将NH3生成尿素尿 素 的 生 成a、概念b、总反应和过程氨基酸氨基酸谷氨酸谷氨酸谷氨酸谷氨酸氨甲酰磷酸氨甲酰磷酸鸟氨酸鸟氨酸瓜氨酸瓜氨酸瓜氨酸瓜氨酸精氨琥珀酸精氨琥珀酸鸟氨酸鸟氨酸精氨酸精氨酸延胡索酸延胡索酸草酰乙酸草酰乙酸氨基酸氨基酸谷氨酸谷氨酸-酮戊二酸酮戊二酸天冬氨酸天冬氨酸ATPAMP+PPiH2O2ATP+CO2+H2O2ADP+Pi基质基质线线粒粒体体胞液胞液尿素尿素1 12 23 34 45 5PiNH3-酮戊
12、二酸酮戊二酸尿素形成后由血液运到肾脏随尿排除。-酮戊二酸酮戊二酸(1)形成一分子尿素)形成一分子尿素消耗消耗4个高能磷酸键个高能磷酸键(2)两个氨基分别来)两个氨基分别来自游离氨和自游离氨和Asp,一,一个个CO2来自来自TCA循循环环.尿素循环2、酮酸(碳架)去向(1)重新氨基化生成氨基酸(2)氧化成CO2和水(TCA)(3)生糖、生酮AA AA 酮酸酮酸+NH+NH3 3R-CO-COOHR-CO-COOH 氨基酸碳骨架进入TCA20种AA的碳架可转化成7种物质:丙酮酸、乙酰CoA、乙酰乙酰CoA、-酮戊二酸、琥珀酰CoA、延胡索酸、草酰乙酸。生酮氨基酸:Phe、Tyr、Trp、Leu、L
13、ys在分解过程中转变为乙酰乙酰CoA,后者在动物肝脏中可生成乙酰乙酸和-羟丁酸。生糖氨基酸:凡能生成丙酮酸、-酮戊二酸、琥珀酸、延胡索酸、草酰乙酸的AA都称为生糖AA,它们都能生成Glc。Phe、Tyr是生酮兼生糖AA。二、脱 羧 基 作 用AA胺类化合物脱羧酶脱羧酶(辅酶为磷酸吡哆醛)(辅酶为磷酸吡哆醛)AA脱羧反应广泛存在于动、植物和微生物中,有些产物具有重要生理功能:L-Glu-氨基丁酸,是重要的抑制性神经介质,对中枢神经元有普遍性抑制作用。His 组胺,是一种强烈的血管舒张剂,有降低血压的作用。生物体内大部分生物体内大部分AA可进行脱羧作用,生成相应的一级胺。可进行脱羧作用,生成相应的
14、一级胺。AA脱羧酶专一性很强,每一种脱羧酶专一性很强,每一种AA都有一种脱羧酶,辅都有一种脱羧酶,辅酶都是磷酸吡哆醛。酶都是磷酸吡哆醛。AA脱羧反应广泛存在于动、植物和微生物中,有些产物脱羧反应广泛存在于动、植物和微生物中,有些产物具有重要生理功能:具有重要生理功能:如脑组织中L-Glu脱羧生成r-氨基丁酸,是重要的抑制性神经介质,对中枢神经元有普遍性抑制作用。His脱羧生成组胺(又称组织胺),组胺是一种强烈的血管舒张剂,有降低血压的作用。Arg 水解 鸟氨酸 脱羧 腐胺 亚精胺 精胺,亚精胺和精胺总称为多胺。多胺存在于精液及细胞核糖体中,是调节细胞生长的重要物质,Cys 的SH氧化成-SO3
15、-,并脱去-COO-就形成了牛磺酸,牛磺酸与胆汁酸结合,乳化食物。Tyr形成多巴、多巴胺、去甲肾上腺素、肾上腺素,形成多巴、多巴胺、去甲肾上腺素、肾上腺素,这四种统称儿茶酚胺类这四种统称儿茶酚胺类 Trp形成形成5-羟色胺,羟色胺,5-羟色胺是神经羟色胺是神经递质,促进血管收缩递质,促进血管收缩但大多数胺类对动物有毒,体内有胺氧化酶,但大多数胺类对动物有毒,体内有胺氧化酶,能将胺氧化为醛和氨,醛进一步氧化成脂肪酸。能将胺氧化为醛和氨,醛进一步氧化成脂肪酸。RCH2NH2+O2+H2O RCHO+H2O2+NH3RCHO+1/2O2 RCOOH CO2+H2OAA尿素 三、由氨基酸产生一碳单位一
16、碳单位(one carbon unit):在代谢过程中,某些化合物(如氨基酸)可以分解产生具有一个碳原子的基团(不包括CO2)亚氨甲基(-CH=NH),甲酰基(HC=O-),羟甲基(-CH2OH),亚甲基(又称甲叉基,-CH2),次甲基(又称甲川基,-CH=),甲基(-CH3)nGly、Ser、Thr、His、Met 等AA可以提供一碳单位。n一碳单位的转移靠四氢叶酸(5,6,7,8-四氢叶酸),携带甲基的部位是N 5、N 10n一碳基团的利用:参与合成反应,如磷脂、核苷酸等的合成。一碳基团的一碳基团的来源与转变来源与转变第三节 氨基酸的生物合成 氨基酸合成概述 氨基酸的合成 1、氮源 一、一
17、、氨基酸合成概述氨基酸合成概述氮流入氨基酸分子,起始于无机氮,如N2,NH3氨的同化-生物体将NH3转化为含氮 有机化合物的过程。N2固定(生物固氨)微生物 与豆科植物共生的根瘤菌、自养固氮菌-兰藻 在固氮酶系作用下,将空气中的N2固定,产生NH3硝酸还原植物、微生物 将硝酸盐(NO3-)还原为NH3 氨同化的途径(1)通过氨甲酰磷酸合成酶氨甲酰磷酸参与尿素循环中的精氨酸的合成及嘧啶合成 谷氨酰胺+-酮戊二酸2谷AA+H2O 谷氨酸合酶(2)通过谷氨酸脱氢酶(细菌)(3)通过谷氨酰胺合成酶-酮戊二酸+NH3 谷氨酸 NADH NAD+H2O谷谷AA脱氢酶脱氢酶谷AA+NH3 谷氨酰胺ATP A
18、DP+Pi+H2O谷氨酰胺合成酶谷氨酰胺合成酶谷氨酸作为氨基供体,通过转氨基作用参与其它氨基酸的合成直接碳架是相应的-酮酸:主要来源:糖酵解丙酮酸 TCA草酰乙酸、-酮戊二酸 磷酸戊糖途径磷酸核糖2、碳架二、氨基酸的合成必需氨基酸:许多氨基酸的合成途径只存在于植物和微生物,哺乳动物必须从食物中获得这些氨基酸,称为必需氨基酸 Ile、Leu、Lys、Met、Phe、Thr、Trp、Val、(Arg、His)谷氨酸族谷氨酸族天冬氨天冬氨酸族酸族丙氨丙氨酸族酸族丝氨丝氨酸族酸族His 和和芳香族芳香族必需必需非必需非必需二、氨基酸的合成1、丙氨酸族氨基酸的合成2、丝氨酸族氨基酸的合成3、天冬氨酸族氨
19、基酸的合成4、谷氨酸族氨基酸的合成5、组氨酸族和芳香族氨基酸的合成v包括:包括:Ala、Val、Leu 1、丙氨酸族氨基酸的合成 -丙酮酸衍生型 COOH CH3 C=O-CH2-COOHCH2-CHNH2COOH-COOH CH3 CHNH2-CH2-COOHCH2-C=OCOOH-转氨酶转氨酶+丙酮酸丙酮酸谷谷AA 丙丙AA -酮戊二酸酮戊二酸 (1)Ala的合成的合成(2)其它氨基酸的合成)其它氨基酸的合成2丙酮酸丙酮酸-酮异戊酸 缩合CO2转氨基缬氨酸缬氨酸丙氨酸丙氨酸 -酮异己酸酮异己酸 亮氨酸亮氨酸转氨基转氨基-CH3C=OCOO-CH2-CH3CH3-CH-C=OCOOH-CH3
20、-CH-酮异戊酸酮异戊酸 2、丝氨酸族氨基酸的合成-3-磷酸甘油酸衍生型 v包括:包括:Ser、Gly、Cys(1)Gly的合成的合成CH2-COOHCH2-CHNH2COOH-COOH CHO-+COOH CH2NH2-CH2-COOHCH2-C=OCOOH-+-酮戊二酸 甘AA 谷AA 乙醛酸 碳架碳架 COOH CH2NH2-COOH CH2OH CHNH2-+NH3+CO2+2H+2e-2H2O 丝AA 甘AA (2)Ser的合成的合成COOH HO-CHCH2O-P-COOH C=OCH2O-P-COOH CHNH2CH2O-P-COOH CH2OH CHNH2-COOH C=OCH
21、2O-P-COOH HO-CHCH2OH-COOH C=OCH2OH-H2O Pi磷酸酶磷酸酶转氨基转氨基氧化氧化H2O Pi转氨磷酸化途径磷酸化途径非磷酸化途径非磷酸化途径3-磷酸甘油酸磷酸甘油酸3-磷酸羟基丙酮酸3-磷酸羟基丙酮酸磷酸羟基丙酮酸3-磷酸丝氨酸磷酸丝氨酸甘油酸甘油酸3-羟基丙酮酸羟基丙酮酸丝氨酸丝氨酸碳架碳架(3)Cys的合成的合成丝丝AA+乙酰乙酰-COA O-乙酰丝乙酰丝AA+COA O-乙酰丝乙酰丝AA+硫化物硫化物 半胱氨酸半胱氨酸+乙酸乙酸 乙醛酸乙醛酸甘甘AA丝丝AA半胱半胱AA3-磷酸甘油酸磷酸甘油酸3、天冬氨酸族氨基酸的合成 -草酰乙酸衍生类型 v包括:包括:
22、AspAsp、AsnAsn、LysLys、ThrThr、MetMet、IleIleCH2-COO-C=OCOO-CH2-COO-CH2-CH+NH3COO-CH2-COO-CH+NH3COO-CH2-COO-CH2-C=OCOO-+转氨酶天冬AA(1)Asp(1)Asp的合成的合成(2 2)AsnAsn的合成的合成天冬酰胺天冬酰胺合成酶合成酶天冬天冬AA+NH3+ATPMg2+天冬酰胺天冬酰胺+H2O+AMP+PPi天冬天冬AA+谷氨酰胺谷氨酰胺+ATPMg2+天冬酰胺天冬酰胺+谷谷AA+AMP+PPi(植,细菌)(植,细菌)(动)(动)CH2-COOHCHNH2COOH-(3)其它氨基酸的合
23、成其它氨基酸的合成ATPADP天冬氨酸激酶天冬氨酸激酶CH2-C-O-P=OCHNH2COOH-O=OHOHNADPH+H+NADP+天冬氨酸激酶天冬氨酸激酶天冬氨酰磷酸天冬氨酰磷酸CH2-CHOCHNH2COOH-天冬氨酸半醛天冬氨酸半醛L-高丝氨酸高丝氨酸甲硫氨酸甲硫氨酸苏氨酸苏氨酸异亮氨酸异亮氨酸,-二氨基庚二酸二氨基庚二酸赖氨酸赖氨酸CO2天冬氨酸天冬氨酸草酰乙酸草酰乙酸v 几种氨基酸的关系几种氨基酸的关系赖氨酸赖氨酸苏氨酸苏氨酸甲硫氨酸甲硫氨酸异亮氨酸异亮氨酸天冬酰胺天冬酰胺天冬氨酸天冬氨酸4、谷氨酸族氨基酸的合成 -酮戊二酸衍生类型 v包括:包括:Glu、Gln、Pro、Arg (
24、1)Glu的合成的合成+NH3+NADH+NAD+H2O-酮戊二酸酮戊二酸谷谷AA 脱脱H酶酶 (真菌)(真菌)谷谷AA+NH3+ATP谷氨酰胺谷氨酰胺+ADP+Pi+H2O谷氨酰胺谷氨酰胺+-酮戊二酸酮戊二酸2谷谷AA+H2O 合成酶合成酶 (植物)(植物)(2)Pro的合成的合成CH2-COOHCH2-CHNH2COOH-CH2-COOHCH2-CHNH2CHO-NAD(P)H NAD(P)+ATPADPMg2+H2CCH2HCNCHCOOH NADHNAD+H2CCH2H2CNHCHCOOH1/2O2 CCH2H2CNHCHCOOHHHO(谷谷AA)(谷氨酰半醛谷氨酰半醛)(-二氢吡咯二
25、氢吡咯-5-羧酸羧酸)(脯脯AA)(羟脯羟脯AA)CH2-COOHCH2-CHNH2COOH-CH2-CH2NH2CH2-CHNH2COOH-CH2-COOHCH2-HC-NH-C-CH3COOH-O=CH2-CHOCH2-HC-NH-C-CH3COOH-O=-C=OCH2-CH2CH2-CHNH2COOH-NHNH2-CH2-CH2CH2-CHNH2COOH-NHNH2-CH2-CH2CH2-CHNH2COOH-NHNH-C=N-CH-C-NH2-COOHCH2COOH-=转乙酰酶转乙酰酶乙酰乙酰COACOANADPNADP+转氨作用转氨作用转甲酰酶转甲酰酶氨甲酰磷酸氨甲酰磷酸磷酸磷酸天冬氨
26、酸天冬氨酸延胡索酸延胡索酸裂解酶裂解酶精氨酸精氨酸精氨酰琥珀酸精氨酰琥珀酸瓜氨酸瓜氨酸鸟氨酸鸟氨酸N-乙酰谷氨酰半醛乙酰谷氨酰半醛(3)其它)其它AA的合成的合成v 几种氨基酸的关系几种氨基酸的关系-酮戊二酸酮戊二酸谷谷AA谷氨酰胺谷氨酰胺脯脯AA 羟脯羟脯AA鸟鸟AA瓜瓜AA精精AA5、组氨酸族和芳香族氨基酸的合成v包括:包括:His、Trp、Tyr、PhevHis族碳架:族碳架:PPP中的磷酸核糖中的磷酸核糖v芳香族芳香族AA碳架:碳架:4-磷酸磷酸-赤藓糖赤藓糖(PPP)和和PEP(EMP)CH2HCCCH-NH2COOH-NHCHN来自核糖来自核糖来自谷氨酰胺的酰胺基来自谷氨酰胺的酰胺基从谷氨酸经转氨作用而来从谷氨酸经转氨作用而来来自来自ATPv 几种氨基酸的关系几种氨基酸的关系 PEP4-磷酸赤藓糖磷酸赤藓糖莽草酸莽草酸分支酸分支酸色氨酸色氨酸预苯酸预苯酸酪氨酸酪氨酸苯丙氨酸苯丙氨酸