斑马鱼相关实验操作.docx

上传人(卖家):最好的沉淀 文档编号:5369029 上传时间:2023-03-31 格式:DOCX 页数:19 大小:1.11MB
下载 相关 举报
斑马鱼相关实验操作.docx_第1页
第1页 / 共19页
斑马鱼相关实验操作.docx_第2页
第2页 / 共19页
斑马鱼相关实验操作.docx_第3页
第3页 / 共19页
斑马鱼相关实验操作.docx_第4页
第4页 / 共19页
斑马鱼相关实验操作.docx_第5页
第5页 / 共19页
点击查看更多>>
资源描述

1、斑马鱼人工繁殖、受精和胚胎发育一、实验目的了解斑马鱼的生活和繁殖习性,掌握斑马鱼人工繁殖技术,了解斑马鱼受精、胚胎发育过程和形态模式形成的特点。二、斑马鱼的生活和繁殖习性斑马鱼(Danio reri)o 为热带鱼类,可在一年内多次产卵。在合适的养殖条件下,4 月龄的斑马鱼即性成熟;性成熟后每 1-2 周可以产卵一次,一条雌鱼一次可以产出数百颗卵子。斑马鱼产卵受温度和光照长度的调节。最适产卵水温为28.5,产卵的光调节周期为光照 14 小时,黑暗 10 小时。为防止自然产卵,性成熟的雌、雄斑马鱼必须分开养殖。斑马鱼具有下列特点:1、繁殖周期短,不受季节限制,容易获得所需要的精子、卵子和胚胎材料。

2、2、小型鱼类,可在实验室高密度养殖,饲养成本低。3、是脊椎动物,具有和人类相似的器官和组织。4、体外受精、体外发育,胚胎培养条件简单。5、胚胎透明,可以在活体上直接观察器官的发育。6、发育周期短,在 28.5温度下培养,受精后 24 小时即可以形成个体的基本结构。因此,斑马鱼现在选择作为发育生物学研究的模式动物。三、实验器材和材料斑马鱼养殖系统,大塑料盆(直径约 58cm)两个,塑料筛框(直径约 36cm) 一个,中号塑料盆(直径约 36cm)1 个,加热棒,加气泵,12cm 培养皿若干, 9cm 培养皿若干,数个胶头滴管。曝气水 10L。性成熟雌、雄性斑马鱼。四、实验内容和程序实验前一天的准

3、备:1、在实验前一天的早上向 2 个大塑料盆中放大半盆干净的自来水,放入气泵和加热棒,将加热棒温度调整至 28(每个加热棒都有差异,需要放入温度计, 根据温度计指示的实际温度调节和校准温度计),以供斑马鱼催产繁殖时使用。2、曝气水将干净的自来水烧开后冷却,将气泵放入其中进行曝气,以为培养胚胎之用。3、斑马鱼的选取和催产雌雄鱼的鉴别:性成熟的雄鱼体型修长,腹部较小,而雌鱼腹部较大。选鱼的时间在实验前一天的晚上,在选取斑马鱼之前需要喂食红虫,喂食后 1 小时才开始选鱼。一般按 2 : 1 的比例选择健康的性成熟雄鱼和雌鱼用于交配。选择好的雌、雄鱼放到同一个水槽箱或水盆中,用隔板或者筛网栏隔离。在养

4、鱼房之外,可用黑布将整个塑料盆或者水槽箱盖住,使光线不能透过而进行黑暗处理。黑暗处理开始的时间根据第二天准备开始进行试验的时间和产卵的光周期而定,保证黑暗处理时间为 10 小时即可。例如 22:00 开始,第二天早上约 8:00 揭开黑布。4、交配产卵黑暗处理 10 小时后进行光照,撤去隔离筛使雌雄鱼混合,并加入金鱼藻作为产卵的鱼巢。雌、雄鱼在光照后很快出现交配追逐并开始产卵,发现产卵后, 用胶头滴管将胚胎吸出放入有曝气水的培养皿中进行快速漂洗后,在曝气水中于28进行胚胎培养。随后立即观察和记录受精卵的变化和胚胎发育的变化过程和时序。五、斑马鱼胚胎发育的观察的基本内容和作业鱼类的卵是端黄卵,进

5、行盘状卵裂,通过观察斑马鱼从受精卵发育成具有自主生活能力的个体的过程了解端黄卵受精后的变化过程和盘状卵裂类型胚胎卵裂和形态模式形成的特点和过程。具体内容包括观察、作图并记录下述发育过程和时序:1、受精卵的变化和胚盘形成的过程;2、卵裂的方式和多细胞胚胎囊胚的形成;3、原肠形态发生运动囊胚细胞经过广泛的、全局性的定向细胞运动形成原肠胚和胚胎的基本形体模式的方式、特点和过程;4、器官发生脑、眼睛,循环系统,消化系统,骨骼,肌肉等主要器官和系统形成的过程和时序。附录:斑马鱼胚胎发育图谱和时序(引自 Kimmel 等,1995)J, l、一. ?y/;- 二了、., .、. .,.;妇二三心尘._/;

6、,;、.、 、z 夕“产-:、,刁)oblong3.7 hsphe re4h?,/。、会、2、 ,立多夕,,J 才,今r.,-一、 ,dome4.3 h30%-epiboly4.7 h为,r、心7., 4飞:f , :);-:- -:-、;./,. 义,生匡冬了会七 ./, .- 、厂衫 才、 逌 .I,-,.,._三二,:?,1.,.“.忨.y.:-., .夕 巳 ,口 .; 、, .、伶/ 了 了./;t.,i 一-/ 50%-epiboly5.3 h ,,心-hs 6j入germ ring5.7 h75%-epiboly 8 h90%-eplboly 9hbud10 h3-somite1

7、1 h6-somlte12 h/勹了、 入,芘,,芩, .,笋.卒. :竺枭,?_.J、,夕i?:. .,/飞 、.,扫夕J/oblong.f i二乞, / 丈,,r.J , L,”也3.7 h囡, :,”,1i, ,L少50%-epiboly5.3 hsphere4hgerm ring丈三一产5.7 hdome,1y;r 、.、人、g. .尸、.f5. 二,.5L;夕令,.,A,f 5及勺乙,;J4.3 h、一J从女i .-.?六.r夕 J.,j,;f, .I rshield 6h30%-epiboly4.7 h75%-epibo ly8 h“月夕7,乡三90沈 eplb oly 9 hbu

8、d 10 h3-somlte 11 h6-somit.,12 h,. .,岛/.;/ 了了.心-.,、, ,. ., .) 女心玉心必心;、,勺 ,.,飞占 心竺.,.,P、为,?.-. 气,.jJ., :t /. 、 -/oblong37 hsphere4h/ :.,-.- -.、,dome4.3 h,,,.一,J 己、w上、30%-eplboly4.7 hf ;f、/,才., . 于 令,5!/ :.,., , 、!/,. :、心古伐 ,心,了:,.:勺、 ,,/f 、心 ,.,. -“-, 一-、If . . ;)i. . ;,、.、_ f、.;、 入上少”/柲;. . ? 迳. J J

9、rr.I/ - 了一. ,,“ 尸 令 / ,,f. 1). , 、,;;)50%-ep i bol y5. 3 h :.:-germ ringJ 夕”, .5.7 h丸心九一”:., “产shield6 h75%-epibol y8 h丿Z 心心、戈、.g .L90讼 eplboly9hbud 10 h3-somite 11 h6心 omite12 h参考文献:Kimmel CB, Ballard WW, Kimmel SR, Ullmann B, Schilling TF. Stages of embryonic development of the zebrafish. Dev Dyn

10、1995; 203:253-310.基因表达研究的显微操作技术一、实验目的通过显微操作将目标基因的 DNA 或者 RNA 分子注射到受精卵中,以观察其对胚胎发育的影响。这种显微操作技术是研究基因在胚胎发育中功能的重要手段。本实验的目的是了解和掌握显微操作的基本技术。二、实验器材和材料显微注射仪,体视镜,200ul 移液器,100ul 移液器,2.5ul 移液器,注射试剂,封口膜,注射专用器皿,注射针,拉针仪。三、实验内容和程序1、体视镜操作:体视镜操作主要是通过调整焦距以及两个目镜之间的距离来保证视野内出现清晰且立体的景象。2、注射仪的操作:注射仪是由定量控制器,显微注射器,手动操作仪以及固定

11、支架等部分组成的精密仪器(图 3-1)。控制器参数设置界面如图 3-2。定量控制器与电源、显微注射器等的接口如图 3-3。图 3-1:显微操作系统图 3-2:定量控制器面板Output 1-4 对应的信号输出端口,绿灯亮表示相应端口有信号输出; I/W 注射/吸样;VOLUME SET 预设的注射或者吸入注射针的样品体积;VOLUME COUNTER 实际注射进胚胎或者吸入注射针的样品体积;RATE 设置的吸入或者注射速率;DEVICE TYPE 连接的仪器类型(本实验中设置为”K”); G/N/D 端口同时输出信号/不同时输出信号/禁用端口; RUN/STOP 开始或者暂停工作。图 3-3

12、定量控制器背面接口POWER ON/OFF 开关;RS232/FOOT SWITCH 外接控制器端口;OUTPUT 信号输出端口,对应图 2 的 OUTPUT 1-4。手动操作仪主要用于控制注射针的移动和角度,操作方式如图 3-4 所示。图 3-4 手动操作仪操作示意图注射针通过垫圈和电极保护套连接和固定到注射器上。图 3-5 电极保护套及将注射针固定到注射器上的垫圈3、实验步骤(1) 通过斑马鱼人工催产准备胚胎(可以直接用受精卵,也可以用脱膜的受精卵)。(2) 注射针的准备:在斑马鱼产卵的同时组装注射针。注射针是用特制的电极毛细管用电热拉针器拉制而成,其尖细的前端是封闭的,在使用前需要截掉针

13、尖前端的封闭部分;然后在显微镜下观察截断后针头的大小,选择有斜面(参考普通医用针头),大小合适实验需要的注射针。针头粗对受精卵的损害相对较大,但过细则容易造成堵塞。然后使用特制的移液器枪头向注射针内灌满石蜡。(3) 注射针的安装:卸下操作仪的电极保护套及三个垫圈后,将保护套及较大的黑色垫圈套按大头在上,小头在下的方向依次套在注射针上。其他两个垫圈按照黑在上,白在下的顺序套在注射器的推杆上。将注射针套入到注射器的推杆上(此步要小心操作,电极很脆弱,不能用力过度),然后将固定的电极保护套旋紧即完成注射针的安装。组装完成后,调整控制仪参数,先排出一定体积的石蜡(一般排 2500nl)确保注射针的前端

14、没有气泡。(4) 注射样品的吸取:用干净的滤纸除去针头的石蜡,剪取合适大小的封口膜, 将注射用的试剂吸取数微升至封口膜上,在体视镜下开始吸样(吸取样品体积, 速率要先设置好)。吸样结束后,先排除 50-100nl 的样品,再设置需要注射的参数。(5) 注射操作:将胚胎放置在注射专用器皿,并将待注射胚胎移动到视野内。调节手动操作仪的旋钮,将注射针头插入到胚胎的胚胎中后(插入角度以 45-60 未佳),按定量控制器的注射按钮或者脚踏板将样品注入到胚胎中;约以秒钟后, 调节手动操作仪的旋钮将注射针头从胚胎中拉出完成注射。然后移动注射器皿将第二个胚胎移植到注射针头下,进行下一次注射。(注射在没有脚踏板

15、的情况下需要两个,一个人注射,另一个负责按定量控制仪以完成注射,期间可以交换操作,保证每个人都熟悉基本操作技术)。完成注射后,调整参数将电极收回,卸下注射针,关闭仪器并用玻璃保护罩罩住。四、注意事项:1、实验前需要先熟悉仪器,在老师指导下进行操作练习。只有经过长期练习才能熟练使用显微注射仪。刚开始做尽力做到能将样品送到胚胎内部,可以通过共注射有颜色的试剂(如酚红之类)来第一时间观察样品是否进入胚胎。之后再尽量尝试把样品注入胚盘,再然后就是同时提高注射的速度和精度。2、针头的大小应根据实验需要进行选择。3、尽量能在 1-2 细胞期将样品注入到胚盘。由于鱼类的胚胎在 16 细胞以前,细胞与细胞之间

16、的细胞质是连通的,只要将样品送入胚盘都是有效果。但是实际注射时,时期越早越好,最晚在分裂到 8 细胞就停止注射。基因表达与形体模式形成一、实验目的:基因表达的严格时空控制是发育机制的核心。本次实验人工通过显微注射使斑马鱼 -catenin-2基因在胚胎发育早期过表达,干扰该基因表达的时空模式,然后观察和比较 -catenin-2 基因过表达胚胎与野生型胚胎发育的差异,了解基因表达的时空控制在斑马鱼形体模式形成中的重要性。二、实验器材和材料: 1、实验器材:体视镜,显微注射仪,28.5恒温水浴设备,37恒温水浴锅,PH 值测定仪, 水平拉针仪,斑马鱼养殖设备(加热棒,曝气设备)等。培养皿(中号,

17、大号),胶头滴管若干,移液枪。2、溶液及配制:(1)1PBS: 将 20PBS 用双蒸水稀释 20 倍,高温高压灭菌,室温放置备用。使用前调节至 28.5。(2)0.25%胰蛋白酶:准确称取 0.5g 胰蛋白酶,0.02g EDTA 溶于 200ml 的 1 PBS,37水浴充分溶解 1h,4放置备用。使用前加热至 28.5。(3)1Hanks 液: 称取 0.4gKCl, 8.0gNaCl, 0.67g Na HPO 7H O, 0.6g KH PO4,24221.44gCaCl 1.23g MgSO 7H O, 溶于 800ml 蒸馏水中,充分溶解。使用前加入2,420.35g NaHCO

18、 ,加水定容至 1L,用 HCl 调至 pH 7.2,4保存。用于斑马鱼胚胎3培养时加热至 28.5,并加入抗生素(10 万单位/升的氨苄青霉素,5 万单位/ 升的氯霉素)。3、注射样品准备:以 BstXI 单酶切后的 pcs107+zf-catenin-2 ORF 线性质粒为模板,用 Ambion 的体外转录试剂盒mMESSAGE mMACHINE SP6 Kit转录全长的-catenin-2 capped mRNA。随后使用 Roche 公司的 Mini Quick RNA Columns 纯化 capped mRNA。检测合成的RNA 的质量和浓度后, -80保存,备用。使用DEPC 水

19、前将-catenin-2 capped mRNA 稀释至所需浓度(400-600ng/l),冰上放置。三、实验步骤:1、斑马鱼胚胎的获得斑马鱼在实验室条件下至于 28.5恒温水浴养殖,以高蛋白冰血赤虫和固体饲料作饵食,设置光照周期为 10h 黑暗/14h 光照,性成熟后按雌雄分开养殖。催产前一天晚上,挑选 2:1 比例的雄鱼和预产卵雌鱼分开养殖,按照光照周期次日开始光照后雌雄混合,光照刺激 15 分钟左右即可开始收集受精卵。2、斑马鱼胚胎受精膜的去除斑马鱼卵子受精后几分钟,受精卵外围会举起一层受精膜保护胚胎,受精膜的存在不影响观察胚胎发育和模式形成,但不利于显微注射及其它后续实验,所以部分胚胎

20、可以先利用胰蛋白酶脱膜。在开始光照刺激产卵前 1 小时前,将 4中的 0.1x Hanks 液,0.25%的胰蛋白酶以及 1xPBS 溶液取出,将其加热至 28.5。将收集的斑马鱼受精卵立即放入 1PBS 溶液中漂洗一次后,吸尽 PBS 溶液后加入 0.25%胰蛋白酶溶液,于28.5消化处理并在显微镜下实时观察脱膜情况。一般处理大约 10 min 后,大部分受精卵的卵膜被消化,立即将脱膜后的胚胎小心转移到新鲜的曝气水中漂洗4 次以去除残留酶液。最后将胚胎放入盛有 0.1Hanks 液的培养皿中,28.5 培养,用于注射或观察。3、显微注射使用日本 Narishige 公司的 PN30 水平拉针

21、器将毛细管拉成显微注射用针(拉针参数为 heater:80,sub:50,main:56)。注射前将针尖在滤纸上轻轻划一下,形成一个断面以适合注射。用移液器将针内注满液体石蜡并将针安装显微注射仪上,排出一定体积的石蜡后将配制好的样品吸入到毛细管里,准备注射。胚胎脱膜后在 1-2 细胞期进行注射,注射体积设定为 1.15nl/每胚胎。野生型对照组中每个胚胎注入同样体积的无菌水。4、 胚胎培养注射完成后将胚胎转入已加抗生素的 0.1Hanks 液中于 28.5培养,去除未受精的胚胎,每隔 2-3h 换液一次。四、胚胎发育观察和作业1、从原肠期至器官发生期,在体视镜下进行观察野生型对照组和-cate

22、nin-2 capped mRNA 注射组胚胎发育和形体模式形成的差异。2、在受精 24h 后统计二者中畸形胚胎和正常胚胎的比例,并在体视镜下拍照。3、根据野生型对照组和实验组中胚胎形体的差异分析catenin2 过表达对胚胎形体模式形成的影响。五、注意事项:1、体外合成的capped mRNA 容易降解,相关的离心管、吸头等需DPEC 处理去除RNA 酶后方可使用。吸样前后均需将 RNA 置于冰盒上。2、脱膜处理不当及容造成卵损伤。因卵膜内的压力比膜外大,脱膜不充分时移动卵子会导致细胞质从破损处强行挤出而使卵子损坏。时间过长则胰蛋白酶会对胚胎的细胞膜造成损伤。因此必须在显微镜下实时监控脱膜的

23、过程。待大部分胚胎的卵膜基本上被溶解的时候才开始进行漂洗。漂洗时操作要轻而快,脱膜后的胚胎必需保持在水中,一旦离开水或者在水的表面都会使受精卵立即崩解。基因表达的整胚原位杂交分析一、实验目的:在胚胎发育过程中基因都是按严格的时空模式进行表达。本次实验以斑马鱼脊索中胚层标记基因 ntl 为例,进行整胚原位杂交分析其在斑马鱼胚胎原肠期的空间表达模式。二、mRNA 原位杂交的原理:RNA 原位杂交是运用 cDNA 或寡核苷酸等探针检测细胞、组织和胚胎内目标基因 mRNA 表达的一种原位杂交技术,它能够将目标基因在胚胎上表达的部位直观而明确的展现出来。其基本原理是:在胚胎细胞和组织 结构保持不变的条件

24、下,用与目标基因 mRNA 互补并连接了地高辛等标记物的反义序列作为探针,在胚胎上与待测目标基因的 mRNA 结合而形成杂交体(Hybrids);然后再用标记物的识别抗体,通过组织化学或免疫组织化学方法在形成杂交体的 位置形成可在显微镜下观察到的杂交信号,从而确定目标基因的空间表达模式。三、实验器材和材料:1、实验器材:体视显微镜,28.5恒温水浴设备,恒温水浴锅,PH 值测定仪, 斑马鱼养殖设备(加热棒,曝气设备),分子杂交炉,真空泵,水平摇床等。培养皿(中号,大号各 5 组),胶头滴管若干,移液枪,2ml 离心管(无 DNase/RNase),锡箔纸等。2、溶液配制:(1)1PBS;(2)

25、0.25%胰蛋白酶:准确称取0.5g 胰蛋白酶,0.02g EDTA 溶于200ml 的1PBS, 37水浴充分溶解 1h,4放置备用。使用前加热至 28.5。(3)1Hanks 液:称取 0.4gKCl, 8.0gNaCl, 0.67g Na HPO 7H O, 0.6g KH PO4,24221.44gCaCl 1.23g MgSO 7H O, 溶于 800ml 蒸馏水中,充分溶解。使用前加入2,420.35g NaHCO ,加水定容至 1L,用 HCl 调至 pH 7.2,4保存。用于斑马鱼胚胎3培养时加热至 28.5,并加入抗生素(10 万单位/升的氨苄青霉素,5 万单位/ 升的氯霉素

26、)。(4)4%PFA(wt/vol):称取 20g 多聚甲醛(paraformaldehyde PFA)溶于经 DEPC 处理的 500ml 1PBS 溶液,65水浴加热,持续搅拌至溶液澄清,冷却至室温, 冰上过滤、分装,-20放置。(5)PTW: 1PBS,0.1%Tween-20(vol/vol)。(6)20SSC:购自上海生工,4放置备用(7)10%CHAPS: 5g CHAPS 粉末(上海生工)溶于 50ml RNase-free 双蒸水中, 分装,-20放置。(8)100mg/ml Heparin: 称取 100mg Heparin(上海生工)溶解于 1ml RNase-free双蒸

27、水中。(9)10mg/ml Yeast tRNA : 称取 2 mg Yeast tRNA(Roche)溶于 2 ml RNase-free 双蒸水,分装,-20放置。(10) 10% Tween-20(vol/vol):5ml Tween-20 中加入 45ml RNase-free 双蒸水。(11) 5M NaCl:称取 146.1gNaCl(上海生工),加水定容至 1L,充分溶解,灭菌后室温保存。(12) 1M Tris-HCl:称取 121.1gTris 置于 1L 烧杯,加入 800ml 双蒸水搅拌溶解,用 HCl 调至 pH9.5,定容至 1L,灭菌后室温保存。(13) 1M Mg

28、Cl :95g MgCl 粉末溶于 1L 双蒸水中,灭菌后室温保存。22(14) 杂交液(Hybridization mix, HYM):50%去离子甲酰胺,1.3SSC,5 mM EDTA, 0.2% Tween-20,100g/ml Heparin, 50g/ml Yeast tRNA。(15) Blocking Buffer:1PBS,2% Sheep Serum,2 mg/ml BSA,0.8% GoatSerum, 0.1% Tween-20(vol/vol)。(16) Staining Buffer:100 mM Tris-HCl(pH 9.5),50 mM MgCl Tween-

29、20(vol/vol)。3、杂交用 RNA 探针的制备:100 mM NaCl,0.1%2,用位于插入片段 5端的限制性内切酶对已构建好的重组载体pB-zf ntl ORF 进行单酶切,轻轻混匀后置于 37水浴酶切 4h 后,取 1l 点样,检测是否酶切完全,然后使用 PCR 纯化试剂盒(Axygen)回收线性质粒。以线性化的重组载体为模板,采用 Roche 公司的体外转录试剂盒转录得到地高辛(DIG)标记的反义 RNA 探针。37水浴反应 2h,加入 DNase I 消化质粒模板,37孵育 15-20 分钟。将上述反应体系用 Roche 公司的 Mini Quick Spin RNA Col

30、umns 进行纯化。最后将得到的ntl 探针进行电泳检测,加入等体积的去离子甲酰胺,测定浓度,-80保存。四、实验步骤:1. 斑马鱼胚胎的获得: 参照实验六2. 斑马鱼胚胎受精膜的去除 :斑马鱼卵子受精后几分钟,受精卵外围会举起一层受精膜保护胚胎,受精膜的存在不影响观察胚胎发育和模式形成,但不利于显微注射及其它后续实验,所以部分胚胎可以先利用胰蛋白酶脱膜。在开始光照刺激产卵前 1 小时前,将 4中的 0.1x Hanks 液,0.25%的胰蛋白酶以及 1xPBS 溶液取出,将其加热至 28.5。将收集的斑马鱼受精卵立即放入 1PBS 溶液中漂洗一次后,吸尽 PBS 溶液后加入 0.25%胰蛋白

31、酶溶液,于28.5消化处理并在显微镜下实时观察脱膜情况。一般处理大约 10 min 后,大部分受精卵的卵膜被消化,立即将脱膜后的胚胎小心转移到新鲜的曝气水中漂洗4 次以去除残留酶液。最后将胚胎放入盛有 0.1Hanks 液的培养皿中,28.5培养,用于注射或观察。3. 胚胎材料的收集:体视镜下观察斑马鱼胚胎发育情况,发育时期的确定参照 Kimmel1的划分标准,取原肠中晚期(70-90%下包)胚胎进行实验。用大口径吸管选取 30 颗左右的胚胎置于装有 4%PFA 的 EP 管中,4固定过夜。4. 斑马鱼胚胎整胚原位杂交整胚原位杂交按照 Thiss 的方法2进行。具体步骤包括胚胎固定和预处理、复

32、水和杂交、洗脱和孵育抗体以及显色等。(1)胚胎的预处理(a) PFA 固定后的胚胎,用 PTW 溶液漂洗 2 次,5min/次。(b) 脱水。使胚胎依次经过 25%,50%,75%,100%的甲醇/PTW 溶液,5min/次。然后 100%甲醇洗 3 次,10min/次。(c) 将胚胎置于新鲜的 100%甲醇,-20保存。可放置数个月。(2) 复水和杂交(以下溶液若无确切说明,每次用量为 1ml)(a) 复水,即将 100%甲醇依次置换成 75%,50%,25%的甲醇/PTW 溶液,5min/次, 然后用 PTW 溶液洗 2 次,5min/次,室温进行。(b)用 10g/ml 的蛋白酶 K/P

33、TW 对胚胎进行消化。处理的时间依胚胎发育时期而异,但体节期之前的胚胎一般不进行消化处理。(c) 4%PFA 再固定,室温 30min 以上。(d) 用 PTW 洗 3 次,5min/次,然后将胚胎转移至一个装有新鲜的 PTW 溶液的 2ml 离心管中。(e) 用 400l PTW/HYM(1:1)混合液洗涤胚胎,使之沉在管底。然后再用400 l 100%杂交液洗一次。(f) 将胚胎转移至含有 400l 新鲜杂交液的 EP 管中,65-70预杂交 1-4 h。(g) 吸出预杂交的 HYM(可回收),加入已经预热并含有终浓度为 0.1-1 g/mlRNA 探针的杂交液,分子杂交炉中 65杂交过夜

34、。(3) 洗脱并孵育抗体准备 70水浴、干浴,将杂交炉设置为 70。(以下溶液每次用量为 1ml)(a) 吸出含有探针的杂交液后,用新鲜的杂交液快速洗涤胚胎一次。(b) 依次将溶液置换成 66% HYM/33% 2SSC,33% HYM/66% 2SSC, 2SSC 溶液,70,放置 15 分钟(c) 置换成 0.2SSC 溶液,70,放置 30 分钟(d) 置换成 0.1SSC 溶液,70,放置 30 分钟(e) 置换成 66% 0.05SSC/33%PTW,室温,放置 10 min。(f) 置换成 33% 0.05SSC/66%PTW,室温,放置 10 min。(g) 室温用 PTW 润洗

35、胚胎 2 次,每次 5 分钟(h) 将胚胎置于 Blocking Buffer 中,于室温孵育胚胎 3 小时以上。(i) 按 1:5000 的比例在 blocking buffer 中加入地高辛抗体,4冰箱过夜。(4) 洗脱、显色 (以下溶液每次用量为 1ml)(a) 室温,用 PTW 洗脱 6 次,15 min/次。(b) 将胚胎转移至新的 2 ml EP 管中,用 Staining Buffer 漂洗 2 次,5 min/ 次。(c) 按 1 ml Staining Buffer 加入 20l NBT/BCIP(Roche)的比例配制染色液。将胚胎转移至染色液中。(e) 锡箔纸包住 EP

36、管,每隔 10 分钟在体式显微镜下观察胚胎显色情况。(f) 待显色完成,吸去染色液,用 PTW 漂洗 2 次。(g) 4% PFA 室温固定 30 min。(h) 吸去 PFA,用 PTW 漂洗 2 次。(i) 将胚胎依次转移至 50%,100%甲醇/PTW 混合液,脱去背景颜色。(j) 置换成 PTW 润洗两次,4保存或立即拍照。五、作业:根据原位杂交结果,分析在胚胎发育过程中 ntl 表达的时空模式和预定中胚层细胞在鱼类胚胎上的位置。六、注意事项:1、PFA 具有强烈刺激味,最好在通风橱操作。2、RNA 探针合成、胚胎的固定和预处理、复水和杂交等过程中所有的实验耗材、试剂均需用 DEPC

37、处理。3、用蛋白酶 K 处理可以增加细胞的通透性,探针及抗体分子更容易进入细胞。但是消化时间需严格控制,时间过长会引起胚胎形态的损伤。在本实验中,由于ntl 基因的表达丰度较高,蛋白酶 K 消化与否不影响实验结果。4、杂交液中的 RNA 探针的浓度范围为 0.1-1 g/ml,并根据所检测基因表达丰度的差异进行调节,探针浓度过高将导致背景色加深。5、75洗脱过程需谨慎操作,避免对胚胎形态的损伤。6、由于 ntl 的表达丰度相对较高,注意控制显色时间,显色过久过造成背景加深。参考文献:1. Kimmel CB, Ballard WW, Kimmel SR, Ullmann B, Schilling TF. Stages of embryonic development of the zebrafish. Dev Dyn 1995; 203:253-310.2. Thisse C, Thisse B. High-resolution in situ hybridization to whole-mount zebrafish embryos. Nat Protoc 2008; 3:59-69.

展开阅读全文
相关资源
猜你喜欢
相关搜索

当前位置:首页 > 办公、行业 > 待归类文档
版权提示 | 免责声明

1,本文(斑马鱼相关实验操作.docx)为本站会员(最好的沉淀)主动上传,163文库仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对上载内容本身不做任何修改或编辑。
2,用户下载本文档,所消耗的文币(积分)将全额增加到上传者的账号。
3, 若此文所含内容侵犯了您的版权或隐私,请立即通知163文库(发送邮件至3464097650@qq.com或直接QQ联系客服),我们立即给予删除!


侵权处理QQ:3464097650--上传资料QQ:3464097650

【声明】本站为“文档C2C交易模式”,即用户上传的文档直接卖给(下载)用户,本站只是网络空间服务平台,本站所有原创文档下载所得归上传人所有,如您发现上传作品侵犯了您的版权,请立刻联系我们并提供证据,我们将在3个工作日内予以改正。


163文库-Www.163Wenku.Com |网站地图|