1、融合基因融合基因基因突变基因突变基因表达异常基因表达异常21. 融合基因:融合基因: 所谓融合基因,是指将两个或多个基因的编码区首尾所谓融合基因,是指将两个或多个基因的编码区首尾相连置于同一套调控序列(包括启动子、增相连置于同一套调控序列(包括启动子、增 强子、核强子、核糖体结合序列、终止子等)控制之下,构成的嵌合基因。糖体结合序列、终止子等)控制之下,构成的嵌合基因。 Chr 9Chr 22ABLBCRBCR-ABL融合基因融合基因32. 基因突变:基因突变: 错义突变(点突变)错义突变(点突变) 插入突变插入突变 缺失突变缺失突变 移码突变移码突变4错义突变(点突变):错义突变(点突变):
2、 DNA分子中一个碱基对被另一个不同的碱基对取代所引起分子中一个碱基对被另一个不同的碱基对取代所引起的突变。的突变。 如:如: JAK2V617F JAK2基因基因 mRNA水平(水平(cDNA水平):第水平):第1849位点位点G突变为突变为T 蛋白水平:第蛋白水平:第617位氨基酸位点由缬氨酸(位氨基酸位点由缬氨酸(V)突变)突变 为笨丙氨酸(为笨丙氨酸(F)5插入突变:插入突变: 较长片段的较长片段的DNA的插入而发生突变,但不改变的插入而发生突变,但不改变阅读框阅读框 如:如: NOTCH1 H1590-L1592insFGP NOTCH1基因基因 mRNA水平(水平(cDNA水平):
3、水平):c.47754776ins(TGGGCC) 蛋白水平:蛋白水平: H1590-L1592insFGP6缺失突变:缺失突变: 较长片段的较长片段的DNA的缺失而发生突变的缺失而发生突变 ,但不改变,但不改变阅读框阅读框 如:如: JAK2 N542-E543del JAK2基因基因 mRNA水平(水平(cDNA水平):水平): c.1624-1629 del 6bp 蛋白水平:蛋白水平:N542-E543 缺失缺失N、E氨基酸氨基酸 7移码突变:移码突变:DNA片段中某一位点插入或丢失一个或几个(非片段中某一位点插入或丢失一个或几个(非3或或3的倍数的倍数碱基对时,造成插入或丢失位点以后
4、的一系列编码顺序发生碱基对时,造成插入或丢失位点以后的一系列编码顺序发生错位的一种突变。错位的一种突变。 如:如:CALR L367fs(46) 突变突变 CALR基因基因 mRNA水平(水平(cDNA水平):水平): c.1179_1230del 52bp 蛋白水平:第蛋白水平:第367位氨基酸(亮氨酸)位点发生移码,在位氨基酸(亮氨酸)位点发生移码,在 367位点起后的位点起后的46位氨基酸终止。位氨基酸终止。8 癌基因或抑癌基因表达异常 如: WT1定量3、基因表达异常、基因表达异常9二、白血病基因检测的临床意义二、白血病基因检测的临床意义1、 辅助诊断2、 指导治疗3、 评估预后4、
5、微小病变残留检测10三、白血病相关基因分类三、白血病相关基因分类BCR-ABLFLT3-ITDJAK2V617FC-KITPML-RARaNPM1RUNX1AML1-ETODNMT3ATET2ASXL1/ASXL2IDH1/IDH2SF3B1SRSF2U2AF1 Class 1 增增 殖殖Class 2 分分 化化Class 3 表观遗传表观遗传Class 4 剪切因子剪切因子11四、白血病相关常见基因四、白血病相关常见基因AML CMLMPNALLCLLMDS12AML 相相 关关 基基 因因 异异 常常融合基因:融合基因:1、 PML-RARa: 95% AML-M3 分为三型分为三型 L
6、型、型、S型、型、V 型型 PLZF-RARa NPM1 -RARa2、 AML1-ETO: 40% AML-M2 (主要为主要为M2b)3、 CBF-MYH11:90% AML-M4Eo4、 MLL-AF17 MLL-AF6 AML-M4 /M5 MLL-AF913AML 相相 关关 基基 因因 异异 常常基因突变:基因突变:FLT3-ITDNPM1(A/B/D型)型)c-KitIDH1IDH2 ASXL2NRAS KRAS P53DNMT3A基因定量分析:基因定量分析:WT1 定量定量FLT3-ITD:AML-M3中发生频率较高中发生频率较高c-Kit: 50%AML1-ETO阳性阳性AM
7、L CBF-MYH11阳性阳性AMLASXL2:AML1-ETO阳性阳性AML14CML 相相 关关 基基 因因 异异 常常BCR-ABL : 95%CML CML特异 marker 亚型: cDNA Protein b3a2、b2a2型 P210 e19a2型 P230 e1a2型 P19015MPN 相相 关关 基基 因因 异异 常常PV、ET、PMF的诊断的诊断BCR-ABL 排除早期慢粒排除早期慢粒PV: JAK2V617F JKA2exon12ET:JAK2V617F MPL CALRPMF: JAK2V617F MPL CALRBCR-ABL JAK2V617F MPL CALR
8、JAK2exon1216MDS 相相 关关 基基 因因 异异 常常WT1 定量定量DNMT3ATET2ASXL1SF3B1SRSF2 RUNX1SF3B1:主要见于:主要见于50-70% 环形铁粒幼增多性贫血环形铁粒幼增多性贫血SRSF2 :主要见于:主要见于CMML17ALL 相相 关关 基基 因因 异异 常常BCR-ABL: 35%成人成人ALLTEL-AML1: 儿童儿童ALL 预后好预后好E2A-PBX1:预后不好:预后不好MLL-AF4 : 婴幼儿多见婴幼儿多见NOTCH1 : 预后好预后好FBXW7: 预后不好预后不好PTEN NRAS KRAS B-ALLT-ALL18CLL 相相 关关 基基 因因 异异 常常P53NOTCH1NOTCH1:见于见于B系或系或T系系CLL在在CLL中为预后不好指标中为预后不好指标19五、检测方法介绍:五、检测方法介绍:1、 RT-PCR2、 PCR3、 PCR-测序测序4、 RQ-PCR20六、结果报告单分析:六、结果报告单分析:21222324Thank you !25