1、生物医学文献数据库生物医学文献数据库PubMedPubMed数据库简介数据库简介 PubMedPubMed是美国国立医学图书馆是美国国立医学图书馆(NLM) (NLM) 的国家生物技的国家生物技术信息中心术信息中心(NCBI)(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索开发的因特网生物医学信息检索系统。系统。 收录收录19661966年以来的包含医学、护理、牙科、兽医、年以来的包含医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统及前临床科学的文献。这些数据来源健康保健系统及前临床科学的文献。这些数据来源于于7070多个国家和地区的多个国家和地区的40004000多种生物医学期刊。多种生物医学期刊。 数据类型:
2、期刊论文、综述、以及会议论文等。数据类型:期刊论文、综述、以及会议论文等。PUBMEDPUBMED检索途径检索途径一、基本检索区一、基本检索区二、辅助检索区二、辅助检索区三、个性化检索区三、个性化检索区基本检索区基本检索区辅助检索区提供辅助检索区提供辅助检索功能辅助检索功能个性化检索区个性化检索区PubMedPubMed主页主页一、基本检索一、基本检索可对任何具有实质意义的词都可以进行检索,如可对任何具有实质意义的词都可以进行检索,如: 1.词语检索词语检索 自动匹配功能自动匹配功能 2.精确检索精确检索 用用“ ”进行强制短语检索进行强制短语检索 3.截词检索截词检索 用通配符用通配符 ?,
3、?,*检索检索 4.逻辑组配检索逻辑组配检索 AND OR NOT 5.作者检索作者检索 6.期刊检索期刊检索一、基本检索一、基本检索1.词语检索词语检索自动匹配转换自动匹配转换.自动匹配转换功能 主题词索引主题词索引 作者索引作者索引 期刊索引期刊索引自动匹配转换过程自动匹配转换过程.2.精确检索精确检索一、基本检索一、基本检索强制将其作为强制将其作为一个词组检索一个词组检索3.截词检索截词检索一、基本检索一、基本检索无限截词检索无限截词检索3.截词检索截词检索一、基本检索一、基本检索有限截词检索有限截词检索4.逻辑组配检索逻辑组配检索一、基本检索一、基本检索逻辑组配检索逻辑组配检索(1)通
4、过)通过“limit”的的”search by author”5.作者检索作者检索一、基本检索一、基本检索一、基本检索一、基本检索(2)用字段限定)用字段限定au检索检索5.作者检索作者检索一、基本检索一、基本检索5.作者检索作者检索(3)通过系统自动)通过系统自动匹配功能自动检索匹配功能自动检索一、基本检索一、基本检索6.期刊检索期刊检索(1)用字段限定)用字段限定ta检索检索一、基本检索一、基本检索(2)通过系统自动)通过系统自动匹配功能自动检索匹配功能自动检索6.期刊检索期刊检索一、基本检索一、基本检索(3)通过)通过“limit”的的“search by journal”6.期刊检索期
5、刊检索一、基本检索一、基本检索6.期刊检索期刊检索(4)通过)通过“期刊期刊数据库数据库”检索检索一、基本检索一、基本检索6.期刊检索期刊检索一、基本检索一、基本检索点击选中点击选中发送至检索恇发送至检索恇6.期刊检索期刊检索一、基本检索一、基本检索点击执行检点击执行检索索6.期刊检索期刊检索一、基本检索一、基本检索6.期刊检索期刊检索检索结果检索结果二、辅助检索区二、辅助检索区1.Limit 1.Limit (限定检索)(限定检索)2.Preview/index2.Preview/index(预览(预览/ /索引)索引)3.History3.History(检索史)(检索史)4.Clipbo
6、rard4.Clipborard(剪贴板)(剪贴板)5.Detail5.Detail(检索式详览)(检索式详览)作者限定作者限定添加作者姓名输入框添加作者姓名输入框清除限定清除限定期刊限定期刊限定作者姓名索引选词作者姓名索引选词多作者逻辑多作者逻辑匹配选项匹配选项全文、免费全文、摘要限全文、免费全文、摘要限定定日期限定日期限定1.Limit 对检索结果进行多重对检索结果进行多重限定限定出版日期限定出版日期限定入库日期限定入库日期限定研究对象研究对象人人/动物限定动物限定研究对象性别限定研究对象性别限定语种限定语种限定子文档限定子文档限定文献类型限定文献类型限定研究对象年龄限定研究对象年龄限定检
7、索字段限定检索字段限定执行检索执行检索清除所有限定清除所有限定2.Previw/index(检索策略预览) 浏览检索式 改变检索式 (可用检索式编号#1 OR #2) 浏览索引(index)检索预览检索预览检索历史检索历史索引加词检索索引加词检索步骤步骤3 索引选词索引选词步骤步骤4 确定与检索栏中确定与检索栏中检索提问的逻辑关系检索提问的逻辑关系步骤步骤2 输入待选词输入待选词步骤步骤1 点击预览和索引点击预览和索引 检索式回顾 编辑检索式 如#3 AND child3.History(检索史)检索历史回顾检索历史回顾检索式检索式检索时间检索时间检出篇数检出篇数检索式编号可替代检索式进行输入
8、检索检索式编号可替代检索式进行输入检索如:如:#5 AND #6用于暂时存放选中的文献,以备集中显示、打印或存盘。4.Clipboard(剪贴板)检索时间检索时间4.Clipboard(剪贴板)点击剪贴板显示点击剪贴板显示被剪贴的内容被剪贴的内容5.Details (匹配过程) 显示检索词转换匹配运算详细过程显示检索词转换匹配运算详细过程 用途:转换、确定规范词用途:转换、确定规范词 如:如:liver cancer liver neoplasms 修改检索策略修改检索策略显示数据库自动显示数据库自动匹配转换过程匹配转换过程检索词转换检索词转换显示用户输入的检索式显示用户输入的检索式检索明细检
9、索明细5.Details (匹配过程)三、个性化检索三、个性化检索1.Mesh Database1.Mesh Database2.2.引文匹配器引文匹配器3.3.临床问题临床问题三、个性化检索三、个性化检索1.Mesh DatabaseMesh Database 确定规范检索词确定规范检索词 查看词义注释、树状结构表查看词义注释、树状结构表 副主题词、扩展、主要主题词副主题词、扩展、主要主题词 例:欲查肾衰竭的饮食疗法相关文献?例:欲查肾衰竭的饮食疗法相关文献?MeSH Database 规范主题词数据库检索规范主题词数据库检索肾衰竭饮食疗法课题肾衰竭饮食疗法课题1.输入检索词输入检索词3.点
10、按规范词可获详细注解点按规范词可获详细注解2.执行浏览执行浏览主题词注释主题词注释可选副主题词可选副主题词限定作为限定作为主要主题主要主题词匹配词匹配不进行下位词扩检不进行下位词扩检该主题词所替代的该主题词所替代的非规范词形式非规范词形式主题词树形结构主题词树形结构表:显示该词的表:显示该词的学科隶属关系学科隶属关系可选副主题词可选副主题词选择检索选择检索点击执行检索点击执行检索检出结果更为专指检出结果更为专指通过通过MeSH Database检索的结果,其中检索的结果,其中4篇篇综述文献综述文献2.2.引文匹配器引文匹配器(Citation MatcherCitation Matcher):
11、 : Single citation matcher(单篇引文匹配器) 查找特定文献进行补缺,以查文献的准确信息。如查找:由Chang PY(taiwan yi xue hui za zhi ) 撰写、 1975 发表文献的其他著者 Batch citation matcher(批量引文匹配器)输入待检刊名输入待检刊名输入待检第一著者输入待检第一著者特定文献查找(已知文献第一著特定文献查找(已知文献第一著者,欲查其他信息如其他著者等)者,欲查其他信息如其他著者等)得出其他著者得出其他著者用于核对批量文献信息用于核对批量文献信息插入文件插入文件输入输入EMAIL地址地址输入已知文献信息输入已知文
12、献信息3.临床问题(Clinical Queries)专门为临床医生设计的一种检索服务,专门为临床医生设计的一种检索服务, Search by clinical study categorySearch by clinical study category Find systematic reviewsFind systematic reviews Special queriesSpecial queries3.3.临床问题(临床问题(Clinical Queries)Clinical Queries)用于临床问题的检索用于临床问题的检索3.3.临床问题(临床问题(Clinical Queri
13、es)Clinical Queries)输入检索词输入检索词检索设置检索设置3.3.临床问题(临床问题(Clinical Queries)Clinical Queries)检索结果检索结果检索结果输出 显示检索结果显示检索结果 保存检索结果保存检索结果 保存检索策略保存检索策略 打印检索结果打印检索结果显示字段选择(显示字段选择(Display)Display) Abstract :Abstract :来源期刊、标题、著者、著者地来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PMIDPMID或或UIUI、摘要。、摘要。 SummerySum
14、mery:作者:作者 Citation : Citation : 显示除上述内容外,加显示除上述内容外,加MeSHMeSH叙叙词、化学物质名称、资助项目号等字段。词、化学物质名称、资助项目号等字段。 MEDLINE : (MEDLINE : (最完整,有标识符)最完整,有标识符)显示格式选择显示格式选择显示字段选择(Display)记录选择 单一记录:著者姓名 所有记录: 选定记录: 方框内打钩输出格式选择(send to)选中题录(或文摘)后选中题录(或文摘)后 TextText: 文本格式文本格式,用浏览器文件保存用浏览器文件保存 File File : 文件格式保存文件格式保存 Clip
15、boadClipboad :暂存需下载记录,暂存需下载记录,多项检索后一起多项检索后一起保存。保存。 最多最多允许存储允许存储500500条,保留条,保留8 8小时。小时。 EmailEmail: 通过邮件发送通过邮件发送 OtherOther: 全文传递服务等申请,需帐号、收费全文传递服务等申请,需帐号、收费获取原文及相关资源 1.联机获取原文(联机获取原文( free full text articlefree full text article) 2. link out2. link out 3.3.向有关图书馆索要向有关图书馆索要 4.4.其他数据库资源(生物信息学等)其他数据库资源(
16、生物信息学等)文摘中的期刊图标链接文摘中的期刊图标链接Linkout链接点击获取原文点击获取原文检索实例1. 1.哮喘的药物治疗(哮喘的药物治疗(asthma, drug therapyasthma, drug therapy) asthma/drug therapyasthma/drug therapy2.2.阿司匹林治疗心肌梗死(阿司匹林治疗心肌梗死(aspirin, aspirin, therapeutic use, myocardial infarction, drug therapeutic use, myocardial infarction, drug therapytherap
17、y)aspirin/therapeutic use ANDaspirin/therapeutic use ANDmyocardial infarction/drug therapymyocardial infarction/drug therapy1.哮喘的药物治疗选择选择MeSH Database输入检索词(单词、词组)输入检索词(单词、词组)(不能输有运算符的语句如:(不能输有运算符的语句如:asthma AND therapy)点击相关规范词点击相关规范词选择副主题词选择副主题词选择检索选择检索执行检索执行检索检索结果检索结果题录:著者、篇名、刊名题录:著者、篇名、刊名2.阿司匹林治疗心
18、肌梗死首先,将概念切分成首先,将概念切分成2个面:个面:Aspirin/治疗应用治疗应用心肌梗死心肌梗死/药物治疗药物治疗然后,分别进行规范词选择检索然后,分别进行规范词选择检索这里是第一个这里是第一个概念面检出的概念面检出的文献,文献,18885条条记录记录第二个概念第二个概念面进行规范面进行规范词选择检索词选择检索这是第二个概念这是第二个概念面检出的结果面检出的结果10112条记录条记录在检索历史中进行在检索历史中进行2个概念面的编辑个概念面的编辑检索(注意逻辑符检索(注意逻辑符AND大写)大写)这是这是2个概念面逻个概念面逻辑辑AND的检索结果的检索结果1003条记录条记录再进行限定再进行限定检索检索限定文献发限定文献发表的时间表的时间可以输入具可以输入具体时间年、体时间年、月、日月、日这是两个概念这是两个概念2005年年-2006年逻辑年逻辑AND检索检索结果结果77条记录条记录