1、网络药理虚拟筛选方法简介什么是网络药理学？ 从系统生物学和生物网络平衡的角度阐释从系统生物学和生物网络平衡的角度阐释疾病的发生发展过程；疾病的发生发展过程； 从改善或恢复生物网络平衡的整体观角度从改善或恢复生物网络平衡的整体观角度认识药物与机体的相互作用并指导新药发认识药物与机体的相互作用并指导新药发现。现。 在高通量组学数据分析、计算机模拟计算及网在高通量组学数据分析、计算机模拟计算及网络数据库检索的基础上，进行生物网络的构建络数据库检索的基础上，进行生物网络的构建及分析，进而进行药物作用机制的研究及创新及分析，进而进行药物作用机制的研究及创新药物的发现药物的发现2网络药理学的研究思路 思路
2、一：根据公共数据库和公开发表根据公共数据库和公开发表的已有数据，建立特定药物作用机制网的已有数据，建立特定药物作用机制网络预测模型，预测药物作用靶点络预测模型，预测药物作用靶点/ /机制，机制，从生物网络平衡的角度解析药物作用的从生物网络平衡的角度解析药物作用的药理学机制；药理学机制； 思路二：利用各种组学技术以及高内利用各种组学技术以及高内涵涵/ /高通量技术，观察药物对模型高通量技术，观察药物对模型( ( 分子、分子、细胞、组织或细胞、组织或/ /和动物和动物) ) 的作用或模型对的作用或模型对药物的作用，针对所产生的大量数据，药物的作用，针对所产生的大量数据，采用生物信息学的手段分析和构
3、建药物采用生物信息学的手段分析和构建药物- -靶点靶点- -疾病网络，建立预测模型，进而解疾病网络，建立预测模型，进而解析所研究药物的网络药理学机制。析所研究药物的网络药理学机制。3肆准备待筛选分子壹叁贰靶点筛选通路筛选网络药理图第一章准备待筛选分子一一 、准备待筛选分子、准备待筛选分子6Chembiooffice2008Chembiooffice2008以上版本作图，文件格式须为以上版本作图，文件格式须为sdfsdf第二章靶点筛选二、 靶点筛选8http:/59.78.96.61/pharmmapper/点击此处上传分子结构，每次只能投入1个分子结构Jod ID是下载结果的“密码”10下载结
4、果11FitFit为分子和靶点的匹配为分子和靶点的匹配度，越高代表越匹配。度，越高代表越匹配。靶点名称靶点名称与人类相关的靶点代码与人类相关的靶点代码第三章通路筛选三 、通路的筛选 将前面工作中得到的与人类相关的靶点代码全部换成类似于P00517 P00517 的形式，以投入博奥数据库得到与靶点相关的通路。以靶点PDPK1_HUMAN PDPK1_HUMAN 为例：http:/www.uniprot.org/此为蛋白编号靶点蛋白名称注册并登陆上传project建议自己申请！建议自己申请！选择与人类相关的选择与人类相关的靶点填于此处17靶点-通路一般选择一般选择p p值小值小于于0.010.01
5、的通路的通路将选择的靶点在将选择的靶点在uniprotuniprot上查的蛋白名称上查的蛋白名称第四章网络药理图四、网络药理图21将化合物对应靶点，靶点对应通路于同一将化合物对应靶点，靶点对应通路于同一EXCELLEXCELL中。中。注意：要做成两列即：注意：要做成两列即：化合物化合物靶点靶点靶点通路然后将表格导入然后将表格导入CytoscapeCytoscape软件（官方下载地址：软件（官方下载地址： http:/cytoscapeweb.cytoscape.org/ http:/cytoscapeweb.cytoscape.org/ ），也可使用其他作图软件。），也可使用其他作图软件。点击
6、对形状和背景进行更改节点连线背景为了方便对图进行编辑和更改，我们可以导入attributes。令通路等于2，化合物名称等于3。可在此处专一的对化合物、靶点。通路进行更改颜色也可以专一性的进行形状的更改网络药理学与实验相关的环节 基于实验结果构建网络所需基本数基于实验结果构建网络所需基本数据的获取据的获取 对所建立的网络预测模型进行实验对所建立的网络预测模型进行实验验证验证 目前网络药理学研究在实验研究水目前网络药理学研究在实验研究水平所涉及的相关技术除了组学平所涉及的相关技术除了组学( ( 基基因组、蛋白质组、代谢组和糖组等因组、蛋白质组、代谢组和糖组等) ) 技术外，主要包括技术外，主要包括3 3 个方面个方面: :高通量高通量/ /高内涵技术、双高通量基因表达检高内涵技术、双高通量基因表达检测技术和分子相互作用技术。测技术和分子相互作用技术。网络药理虚拟筛选方法简介讲课人：冰点学习就像一个蓄电池，你学过的每一种知识，都会在将来的某一天，给你惊喜。温 馨 提 示心身投入全恳请大家批评指正
