1、2011-5-7WB实验技术及常见问题分析Western blot 定义 Western Blot中文一般称为蛋白质印迹l通过聚丙烯酰胺电泳根据分子量大小分离蛋白后转移到杂交膜上l分离的蛋白可以通过一抗/二抗复合物进行检测l是蛋白质分析的最流行的技术之一Western Blot操作流程l蛋白样品的制备（蛋白抽提、定量）lSDS-聚丙烯酰胺 凝胶电泳（SDS-PAGE凝胶制备、上样）l转膜l封闭l一抗杂交l二抗杂交l底物显色水溶液提取法 针对水、稀盐、稀酸或碱溶液中的蛋白质。稀盐和缓冲系统的水溶液 对蛋白质稳定性好、溶解度大、是提取蛋白质最常用的溶剂。细胞裂解液：50 mmol/L Tris-H
2、Cl,150 mmol/L Nacl,5 mmol/L EDTA,1%NP40，0.05%PMSF，2g/mL Aprotinin,0.5g/mL Leupeptin，pH8.0 有机溶剂提取法 对于分子中非极性侧链较多的蛋白质可用有机溶剂提取，包括乙醇、丙酮和丁醇等。一、蛋白样品的制备二、蛋白样品的定量(Bradford法)原理考马斯亮蓝G-250有红、蓝两种不同颜色的形式，在一定浓度的乙醇和酸性条件下，可配成淡红色的溶液，与蛋白结合后形成蓝色化合物，该化合物在595nm处有最大吸收值，化合物颜色深浅与蛋白的浓度高低成正比。l制作标准曲线（插入表格）l检测样品蛋白含量：取一管考马斯亮蓝+95
3、 l 0.15mol/L NaCl NaCl溶液+5l待测蛋白样品，混匀后静置2min，倒入比色杯中测试。l 20-30 ug 细胞/组织裂解物 100 ng 纯化蛋白l根据蛋白表达丰度调整适当的蛋白上样量l上样量一致：每孔上样量保持一致l上样前用loading buffer加热变性样本三、三、SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳Anode-内槽缓冲液带有负电荷，与凝胶顶部接触外槽中缓冲液带有正电荷，与凝胶底部接触Cathode+带有负电荷的蛋白质从上到下运动（负极到正极），分开电泳进程可以根据前沿指示剂来确定，等其跑到底部上面1cm左右即可停止电泳小分子量蛋白跑的比较快小分子量蛋白跑
4、的比较快.蛋白根据分子量大小分开蛋白根据分子量大小分开蛋白质带有负电荷，因此电泳时可以从负极向正极移动蛋白质带有负电荷，因此电泳时可以从负极向正极移动标本加入到上样孔中四、Western Blot 转膜 分离的蛋白通过电转膜方式从凝胶中转移到杂交膜上分离的蛋白通过电转膜方式从凝胶中转移到杂交膜上（PVDF或或NC膜）膜）nPVDF膜：价格较贵，可重复使用，特别适合蛋白印迹，结合能力较强，但价格比较昂贵。nNC膜（硝酸纤维素膜）：价格比较便宜，应用较广，结合牢固性差一些，韧性也不如PVDF，不能重复使用，但蛋白吸附容量高，亲水性较好。六、一抗、二抗孵育六、一抗、二抗孵育l把NC膜放在密闭塑料袋或
5、者培养皿中，加入一抗溶液与滤膜温育，室温小时或4过夜。l倒掉一抗溶液，用PBS漂洗滤膜3次，每次10min。l加入配制的二抗，摇床上缓慢摇动，室温一小时或4过夜。l倒掉二抗溶液，用PBS漂洗滤膜3次，每次10min。uECL化学发光显色 比较常用，结果容易控制，但是被催化是 灵敏度差一点uDAB显色 比较灵敏，是HRP最敏感的底物Western Blot 需要的主要试剂WB需要试剂膜常用的有PVDF膜，硝酸纤维素膜或者尼龙膜WB需要试剂封闭试剂lBSA或者脱脂奶粉(光明脱脂奶粉)l商业化的封闭试剂 主要目的是确定靶蛋白的分子量大小；使用预染的Marker还可以实时检测电泳分离情况，并可以转移到
6、膜上。WB需要试剂蛋白质MarkerPrestained protein laddersUnstained protein laddersFermentasWB需要试剂一抗选择适合检测标本种属的一抗（说明书有验证）选择适用于WB实验方法的一抗（说明书有验证）选择单克隆抗体或者经过亲和纯化的多克隆抗体 根据说明书推荐的浓度优化最佳稀释比例 Santa cruz,Cell signaling,Invitrogen,Sigma,Abcam,R&D,Abnova,Chemicon,Calbiochem,Millipore,BD,Cayman,Roche,eBioscience,et al.选择合适的一
7、抗：选择合适的一抗：杂交需要试剂二抗二抗选择二抗选择：根据一抗来源种属以及抗体Ig亚型选择合适的二抗。二抗的使用二抗的使用：l根据说明书推荐浓度使用TBST稀释二抗。l如果说明书没有推荐浓度，可进行多个稀释比例进行摸索最佳稀释度（1:1000-1:20000）。l孵育条件一般为室温1-2小时。Santa cruz,Cell signaling,Invitrogen,Sigma,Abcam,R&D,Abnova,Chemicon,Calbiochem,Millipore,BD,Cayman,Roche,eBioscience,et al.杂交需要试剂底物显色底物：操作简单，灵敏度低，如TMB、D
8、AB、BCIP/NBT化学发光底物：灵敏度高，需要曝光检测设备（暗室、曝光设备和胶片）或者凝胶成像设备。WB常见问题l没有信号l高背景l非特异性条带l条带大小不对标本问题 l标本中不含检测蛋白：设置阳性对照l上样量不够，或者蛋白表达丰度比较低：增加上样量转膜问题l转膜不完全：转膜后使用丽春红染色，确定目的大小蛋白条带是否存在于膜上，使用蛋白质Marker.l洗涤过度：减少洗涤时间和次数.封闭l封闭过度：减少封闭试剂浓度，封闭时间，更换封闭试剂抗体孵育和检测l抗体浓度和时间孵育不够：增加抗体浓度，延长孵育时间l一抗不工作：设置阳性对照l二抗不工作：和其他一抗配合检测二抗是否工作l一抗/二抗不匹配
9、：检查抗体的来源和亚型。正确选择二抗l底物失活：重新配制有效的底物没有信号没有信号/弱信号弱信号背景高背景高封闭l封闭时间不够：延长封闭时间l优化封闭试剂的类型和浓度l封闭试剂和抗体有交叉反应：更换封闭试剂.l磷酸化抗体不能使用含有酪蛋白的封闭试剂：推荐BSA封闭抗体孵育和检测l一抗/二抗浓度太高：降低抗体浓度l孵育温度太高：建议4度孵育过夜其他l洗膜不充分：5*3mins，多次短时间的洗膜l曝光时间过长：缩短曝光时间l出现干膜现象：保证膜充分浸透，避免出现干膜l二抗非特异性：设置只加二抗对照非特异性条带非特异性条带标本制备l二聚体或者多聚体：增加上样前煮沸变性时间l蛋白不同剪切体或者 isoforms 存在.l蛋白降解：使用新鲜制备的标本，标本中加入新鲜配制的蛋白酶抑制剂l上样量过大：减少上样量封闭Blockingl封闭不充分：优化封闭时间和封闭试剂浓度抗体孵育和检测l一抗/二抗浓度过高：降低抗体浓度l抗体没有经过纯化l二抗非特异性结合：使用二抗对照其他l洗膜保证充分条带大小不对条带大小不对标本制备l二聚体/多聚体存在：使用还原变性电泳，除非说明书上有特殊说明l多个亚型存在？（Isoforms）l蛋白降解？l蛋白修饰
