1、高通量测序 应用12高通量测序的用途高通量测序的用途将miRNA的标记与线性放大相结合,只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。高通量测序在microRNA中的应用高通量测序在mRNA表达谱的应用Illumina公司的Solexa测序仪,ABI公司的SOLiD 测序仪高通量测序在甲基化的应用高通量测序方法原理示意图高通量测序的三大平台:目前,科学家正为1000美元完成一个基因组测序而努力。罗氏公司(Roche)的454 测序仪,将miRNA的标记与线性放大相结合,只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。多家研究单位正在为此展开竞争,而且进
2、展比预期的更快。罗氏公司(Roche)的454 测序仪,ABI公司的SOLiD 测序仪高通量测序方法原理示意图对含有全基因组序列且转录本注释较好的物种开展转录组学研究,解析细胞转录产物的数量变化及其结构信息。高通量测序在基因组上应用3高通量测序的用途高通量测序的用途l基因组序列的物种进行重测序,鉴定SNP,indel及基因组结构变化;对含有全基因组序列且转录本注释较好的物种开展转录组学研究,解析细胞转录产物的数量变化及其结构信息。4高通量测序现状高通量测序现状l 第二代测序技术,又称超高通量测序。目前,科学家正为1000美元完成一个基因组测序而努力。多家研究单位正在为此展开竞争,而且进展比预期
3、的更快。5高通量测序原理高通量测序原理l高通量测序方法原理示意图6高通量测序平台高通量测序平台l高通量测序的三大平台:l Illumina公司的Solexa测序仪,l 罗氏公司(Roche)的454 测序仪,l ABI公司的SOLiD 测序仪7高通量测序特点高通量测序特点l速度快l通量高l结果一致性好l简便高效8高通量测序在基因组上应用高通量测序在基因组上应用l应用于人基因组重测序l动植物、细菌基因组测序9高通量测序在高通量测序在mRNA表达谱的应用表达谱的应用l将miRNA的标记与线性放大相结合,只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。10高通量测序在高通量测序在
4、microRNA中的应用中的应用l高通量、低成本l易于寻找新片段及作用位点11高通量测序在高通量测序在CHIP-CHIP的应用的应用l相对ref seq,染色质免疫沉淀以后的DNA直接进行测序,可以直接获得蛋白与DNA结合的位点信息l相对ChIP-chip,ChIP-seq可以检测更小的结合区段、未知的结合位点、结合位点。12高通量测序在甲基化的应用高通量测序在甲基化的应用l对于DNA甲基化的检测,目前采用:甲基化DNA富集并结合高通量测序,可以检测到全基因组范围内的甲基化现象。l特点:高效,准确13特异片段测序特异片段测序l血浆DNA测序l游离RNA测序罗氏公司(Roche)的454 测序仪
5、,相对ref seq,染色质免疫沉淀以后的DNA直接进行测序,可以直接获得蛋白与DNA结合的位点信息对含有全基因组序列且转录本注释较好的物种开展转录组学研究,解析细胞转录产物的数量变化及其结构信息。多家研究单位正在为此展开竞争,而且进展比预期的更快。高通量测序在基因组上应用将miRNA的标记与线性放大相结合,只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。对于DNA甲基化的检测,目前采用:甲基化DNA富集并结合高通量测序,可以检测到全基因组范围内的甲基化现象。将miRNA的标记与线性放大相结合,只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。将miRNA的标记与线性放大相结合,只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。高通量测序在microRNA中的应用高通量测序在甲基化的应用高通量测序在基因组上应用高通量测序在microRNA中的应用罗氏公司(Roche)的454 测序仪,高通量测序在mRNA表达谱的应用14未来未来-高通量测序会成为临床辅助工具高通量测序会成为临床辅助工具l致病基因l碱基突变15Thank you!