战创伤样本库课件.pptx

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资源描述

1、战创伤临床标本资源库建设战创伤临床标本资源库建设战创伤样本资源库建设是战创伤样本资源库建设是“十二五十二五”国家重大专项国家重大专项,目标是整合军队战创伤优势临床医学资源,建立军,目标是整合军队战创伤优势临床医学资源,建立军队队 的战创伤样本资源和临床信息数据库;建立军队战的战创伤样本资源和临床信息数据库;建立军队战创伤创伤 网络协同研究环境和资源共享机制。为军队特需网络协同研究环境和资源共享机制。为军队特需药物的药物的 各期临床研究和新药开发提供资源和技术支持,各期临床研究和新药开发提供资源和技术支持,为建立为建立 军队转化医学平台创造条件。军队转化医学平台创造条件。一、基本情况一、基本情况

2、二、硬件建设二、硬件建设完成建设完成建设800平方平方米米战创战创伤伤标本库标本库 样本存储区:样本存储区:低温冰箱和液氮存储低温冰箱和液氮存储 实验区:实验区:体液样本和组体液样本和组织织样本样本的的处理处理与与分析分析完成了可管理50万份标本数据的战创伤标本资源库信息系统专用机房建 设,最大支持300TB数据存储。安全性能方面:系统与互联网物理隔离。内部控制方面:建立了完整的数据调用日志记录。内网数据存储区内网数据存储区外网数据存储区外网数据存储区机房:建设能管理机房:建设能管理50万万份标份标本本的数的数据据库存库存储储系统系统样本库共享信息网站样本库共享信息网站访问共享平台:访问共享平

3、台:1在线资源信息检索,包括库存样本信息,如 疾病种类、样本种类、临床数据等。2通过互动中心进行 样本在线申请、服务咨 询、资料下载及留言反 馈。温度监控与报警系统温度监控与报警系统环境管理监控室环境管理监控室 通过了伦理审批通过了伦理审批(批准号:批准号:S2013-013-01)。任务一任务一制定样本库建设标准和规制定样本库建设标准和规范范标本本库的的规范化管理制度范化管理制度标本本库的的标准化操作流程准化操作流程(5个方面,37个条)建设规范 组织架构 运行管理 安全管理 质量控制(共16个章节)样本采集前程序 样本的采集流程 样本的处理流程 样本的质量检测 样本保存与使用二、软件建设二

4、、软件建设样本库管理和质量体系文样本库管理和质量体系文件件急诊科急诊科入选病例 采集样本生化科生化科离心4度暂存标本资源库标本资源库分离分装入库、存储 监管 标本质量检查病案管理科病案管理科病例资料采集 多科室协作标本采集流多科室协作标本采集流程程图图信息库信息库手术及诊断信息手术及诊断信息治疗信息治疗信息实验室检查实验室检查体格检查体格检查患者基本信息患者基本信息入院基本信息入院基本信息 建立战创伤人体信息数建立战创伤人体信息数据据库库 完成信息库建设标准的制定,包括规范化建设、安全 管理等13个条目。完成信息库操作规范的制定,涵盖信息库设计、样本 信息化管理、样本相关临床信息规范化采集和处

5、理等 5个条目。制定信息库建设标准和制定信息库建设标准和规规范范开发了开发了44个专用服务个专用服务接接口,口,扩扩展了展了样样本本信信 息处理功能。息处理功能。检验医嘱病历护理手术心电超声放射自然 信息样本 临床信息共享数据录入至资源库信息管理平台质 控 校 对上传并备份入库人工提取 添加字段筛 选 病 例利用保存采集整理战 创 伤 人 体 信 息 数 据 采集表半结构 化数据结构化 数据条形码身份标 识疾病诊 断编码信息库信息库工作流程图工作流程图创伤病例信息采集表基本信息门诊号住院号姓 名性 别婚 否军兵种民 族身份/军官/士兵证号工作单位电 话联系人姓名关 系入院科室入院时间转科科室转

6、科时间出院科室出院时间主 诉现病史受伤时间创伤原因刺伤 烧伤 割伤 辐射 雷击 电击 溺水 撞击伤 坠落伤 交通伤 火器伤 挤压伤 爆 震伤 腐蚀伤 电击伤 动物咬伤 高、低气压 高、低水压 热射/日射 其他()伤型(单选)闭合性伤 开放性伤 切割伤 贯通伤 盲管伤 切线伤 撕脱伤 脱套伤 挫伤 其他()受伤部位颅脑 颈部 头面 胸部 腹部 骨盆 会阴 脊柱 四肢 其他()伤后症状(单选)昏迷 休克 头痛 呕吐 胸痛 腹痛 活动受限 外出血 便失禁其他()院外诊治包扎 TAT 骨折整复 固定 手术 止血带 镇痛 液体复苏 抗生素其他()创伤病例信息采集表创伤病例信息采集表依据依据ICD-10分

7、类标准,对各种战创伤疾病进行了系统编码(分类标准,对各种战创伤疾病进行了系统编码(2963条)。条)。损 伤、中 毒 和 外 因 的 某 些 其 他 后 果 S00-T98疾病分类代码疾病诊断名称疾病分类代码疾病诊断名称S00.001 头 皮 表 浅 损 伤 S01.506 软 腭 穿 通 伤 S00.002 头 皮 挫 伤 S01.507 唇 开 放 性 外 伤 伴 异 物 S00.003 头 皮 血 肿 S01.508 腮 腺 开 放 性 外 伤 S00.101 睑 挫 伤 S01.701 头 部 多 处 开 放 性 外 伤 S00.102 眼 周 软 组 织 挫 伤 S01.801 颜

8、面 部 开 放 性 外 伤 S00.103 眼 睑 血 肿 S01.803 颏 部 开 放 性 外 伤 S00.201 眼 睑 和 眼 周 区 其 他 浅 表 损 伤 S01.804 创 伤 性 面 部 皮 肤 缺 失 S00.301 鼻 挫 伤 S01.805 颜 面 部 开 放 性 伤 口 伴 异 物 S00.302 鼻 血 肿 S01.806 面 部 开 放 性 外 伤 S00.401 耳 廓 挫 伤 S01.807 面 部 裂 伤 S00.402 耳 廓 血 肿 S01.808 颌 面 部 开 放 性 伤 口 伴 异 物 S00.501 口 腔 粘 膜 损 伤 S01.809 颏 部

9、开 放 性 外 伤 伴 异 物 S00.701 头 部 多 处 浅 表 损 伤 S01.901 头 部 开 放 性 外 伤 S00.801 颞 部 表 浅 损 伤 S02.001 额 骨 骨 折 S00.802 面 部 表 浅 异 物 S02.002 顶 骨 骨 折 S00.803 面 部 挫 伤 S02.011 顶 骨 开 放 性 骨 折 S00.804 嚼 肌 下 血 肿 S02.012 额 骨 开 放 性 骨 折 S00.805 面 部 擦 伤 S02.101 颅 底 骨 折 S01.001 头 皮 裂 伤 S02.102 颞 骨 骨 折 S01.101 眼 周 围 区 皮 肤 开 放

10、性 外 伤 S02.103 枕 骨 骨 折 S01.102 眼 睑 开 放 性 外 伤 S02.104 乳 突 骨 折 建立战创伤疾病诊断字建立战创伤疾病诊断字典典库库对144家军队医院调研后,制定包括战创伤的规范手术代码8229条、诊 断代码16759条。2015年年4月月1日开始日开始在全军卫生部门和医疗在全军卫生部门和医疗机机构实构实施施应用应用 制定了两套国家军用标准制定了两套国家军用标准实现了与实现了与HIS系统对接获取临床信息。系统对接获取临床信息。实现了与数字病理信息对接。实现了与数字病理信息对接。实现了与知情同意书关联。实现了与知情同意书关联。采取分账号管理保障数据安全。采取分

11、账号管理保障数据安全。自主开发的样本信息管理系自主开发的样本信息管理系统统 战战创伤人创伤人体体信息数信息数据据库包括库包括:样本信样本信息息、随访、随访信信 息息、患者、患者临临床信息床信息、科研反科研反馈馈信息。信息。样本总数:样本总数:截至截至2016.2.29,共采集样本,共采集样本7571例,例,203070份份 样本种类:样本种类:血清、血浆、血清、血浆、WBC、尿液、唾液、组织样本、尿液、唾液、组织样本、血凝块、血凝块、DNA、数字病理切片。、数字病理切片。成果成果任务三任务三创伤类型创伤类型与与304、263医院、海军总医院、航天中心医院建立医院、海军总医院、航天中心医院建立战

12、战 创伤样本的互通共享。创伤样本的互通共享。院际共享院际共享专科样本库共建专科样本库共建建立了建立了“烧伤样本分库烧伤样本分库”(1504例)例)建立了建立了“肝脾破裂数字肝脾破裂数字病病理库理库”(426例)例)国际生物与环境样本库协会会员单位国际生物与环境样本库协会会员单位2013年承担了国际年承担了国际PT项目的国内组织工作项目的国内组织工作通过了国际生物样本库协会(通过了国际生物样本库协会(ISBER)的实验室)的实验室 能力检测评定能力检测评定中国医药生物技术协会组织生物样本库分会的中国医药生物技术协会组织生物样本库分会的生生 物样本库质量达标检查物样本库质量达标检查是首家通过了是首

13、家通过了 Iso9001-2015版认证的单位版认证的单位质量保证质量保证2013年接授国际生物样本库协会年接授国际生物样本库协会(ISBER)的委任,的委任,组织了国内组织了国内13家样本库进行了实验室能力检测评定。本家样本库进行了实验室能力检测评定。本样样 本库通过并获得了较好的评价。本库通过并获得了较好的评价。撰写专著临床生物样本库撰写专著临床生物样本库获得实用新型专利一项:获得实用新型专利一项:“便携式低温操作箱便携式低温操作箱”。1.生物样本库的现状及研究进展。刘克新,郑琳,王莹,赵秀梅,吉栩,江婧婧,郭渝成。中国病案,2014,15(9):32-34。2.生物样本库临床信息数据采集

14、系统的需求与设计。刘克新,郑琳,刘晶,郭渝成。中国病案,2015,16(8):31-33。3.犬猫伤人次数与气象要素关系初步研究。马盼;张志薇;褚金花;王娟怀;尹岭;黎檀实;何史林;李旭;尚可政;王式功。环境与健康杂志,2014,31(1):37-40。4.23岁以下创伤性硬膜外血肿临床特点研究。田万管,张文涛,朱志宏,黎檀实。中国全科医学,2013,16(6):686-688。5.超声引导微创治疗腹部实质性脏器创伤性出血的护理体会。张丽萍,王永坤,潘菲,吕发勤,黎檀实。临床急诊杂志,2014,15(1):7-9。6.血浆和红细胞不同输注比率在重型颅脑损伤合并严重多发伤救治中的疗效观察。田万管

15、,张文涛,朱志宏,黎檀实。创伤外科杂志,2013,15(1):15-18。7.强风暴中的灾害医学问题。冯聪,杨蕾娟,陈力,滕怀金,孙荣距,黎檀实。中国急救复苏与灾害医学杂志,2012,7(4):296-300。8.北京市犬咬伤就诊人数与气象因素关系研究。冀翠华,康延臻,尹岭,王式功,黎檀实。环境与健康杂志,2015,32(4):337-341。9.北京市创伤发病特征及其与气象条件的关系分析。冀翠华;王丽萍;王式功;尹岭;李蓓;黎檀实。兰州大学学报(自然科学版),2015,9(1):98-102。10.四种气象与环境因子影响循环系统急诊量模型对比分析。崔泳琳,周忠玉,尹岭,黎檀实,王式功,藤怀金

16、,王敏珍,郑山,吴效明。数理医学杂志,2013,26(2):127-129。11.Ji X,Zhao XM,Jiang JJ,Yin L,Guo YC*.Clinical biobanks,from the world to China.Biomed Environ Sci.2014 Jun;27(6):481-3.12.Zhao X,Jiang X,Zhu J,Li G,He X,Ma F,Meng Q,Cao Q,Meng Y,Howson C,Zhong N*,Tian Y*.Factors influencing the quality of preconception healthc

17、are in China:applying a preconceptional instrument to assess healthcare needs.BMC Pregnancy Childbirth.2014 Nov 3;14:360.13.Jinhua Luo,Qing Zhao,Wei Zhang,Zhuhong Zhang,Jing Gao,Chunyan Zhang,Yali Li,Yaping Tian*;A novel panel of microRNAs provides a senstive and specific tool for the diagnosis of b

18、reastcancer.2014;10(2):785-9114.Zhang PJ,Zou M,Wen XY,Gu F,Li J,Liu GX,Dong JX,Deng XX,Gao J,Li XL,Jia XW,Dong ZhN,Chen LN,Wang Y,Tian,YP*,Development of serum parameters panels for the early detection of pancreatic cancer,International Journal of Cancer 2014;134(11):26462655 论文:论文:SCI 4篇,核心篇,核心10篇篇

19、支持了战创伤相关研究支持了战创伤相关研究课课题题3项项课题编号课题编号类别类别名称名称2011ZX09307-001国家重大科技专项创新药物研究开发技术创新药物研究开发技术平平台建设台建设BWS14J048军队十二五重点大面积烧伤创面修复及大面积烧伤创面修复及治治疗关疗关键键技术技术研研究究2013BA108B03国家科技支撑计划灾后心理干预技术与设灾后心理干预技术与设备备研发研发及及其网其网络络平台平台的的建立建立支持了和临床疾病相关的研究共支持了和临床疾病相关的研究共42项,其中重点课题项,其中重点课题20项。项。课题编号课题编号类别类别名称名称2014CB541706国家重点基础研究发展

20、计划基因遗传性聋病的分子基因遗传性聋病的分子机机制研制研究究单基单基因因聋病聋病早早期诊期诊 断与预警策略断与预警策略2014CB943000国家科技部重大基础研究项目听觉微环障碍形成的遗听觉微环障碍形成的遗传传和分和分子子机制机制2013BA108B03国家科技支撑计划灾后心理干预技术与设灾后心理干预技术与设备备研发研发及及其网其网络络平台平台的的建立建立2011ZX09307-001国家重大科技专项创新药物研究开发技术创新药物研究开发技术平平台建设台建设2011ZX09307-001-05国家重大科技专项全国多中心恶性肿瘤临全国多中心恶性肿瘤临床床标本标本资资源库源库的的建立建立与与共享共

21、享2013AA020105863计划干细胞治疗糖尿病的临干细胞治疗糖尿病的临床床前方前方案案优化优化及及临床临床应应用研究用研究SS2015AA020701863计划肠道微生态关键技术研究肠道微生态关键技术研究2012BAI08B06国家科技支撑计划视神经炎的临床研究视神经炎的临床研究BWS14J048军队十二五重点大面积烧伤创面修复及大面积烧伤创面修复及治治疗关疗关键键技术技术研研究究部分重点课题部分重点课题课题编号课题编号类别类别名称名称Z14110000211405北京市科委重大专项高龄老年心房纤颤抗栓高龄老年心房纤颤抗栓临临床注床注册册研究研究2014BAI04B02国家科技支撑计划基

22、于分子病理学的脑胶基于分子病理学的脑胶质质瘤个瘤个性性化及化及综综合治合治疗疗研究研究2012AA02A508863项目中国人群脑胶质瘤分子中国人群脑胶质瘤分子分分型与型与生生物标物标志志物研究物研究91229121自然科学基金重大研究计划基于转录组学的复杂炎基于转录组学的复杂炎症症网络网络与与脑胶脑胶质质瘤恶瘤恶性性转化转化的的研究研究Z131100006113018北京市科委“绿色通道”项目基于临床分子病例的神基于临床分子病例的神经经胶质胶质瘤瘤个体个体化化治疗治疗评评估体估体系系的建的建立立2014CBA02005973计划人体泌尿系统蛋白质组人体泌尿系统蛋白质组表表达谱达谱2012AA

23、02A512863计划IgA肾脏疾病分子分型肾脏疾病分子分型和和个体个体化化诊疗诊疗技技术术2011AA02A111863计划心脑血管慢性损伤及急心脑血管慢性损伤及急救救指标指标等等体外体外诊诊断试断试剂剂的研制的研制2015AA020511863计划视神经炎诊断、视神经视神经炎诊断、视神经功功能评能评价价设备设备的的开发开发近近3年各项课题利用年各项课题利用样样本资本资源源发表发表文文章章108篇篇培养博士研究生15名,硕士研究生20名。向外单位输送技术人员6名。先后接待外单位参观学习和进修人员268人次。建立了9个军队基层多兵种创伤应激防护示范基地。人才培养人才培养积极参与中国样本库标积极

24、参与中国样本库标准准化建化建设设,为,为全全国样国样本本库标库标准准化建化建设设示示范范 中心之一中心之一为全国生物样本标准化为全国生物样本标准化技技术委术委员员会副会副主主任委任委员员单位单位为国际生物与环境样本为国际生物与环境样本库库协会协会(ISBER)的的VIP会员会员学术界影响力学术界影响力依托样本库的设备资源和样本资源,推动产学研结合和成依托样本库的设备资源和样本资源,推动产学研结合和成果果 转化,获得北京市国际科技合作基地资格两项。转化,获得北京市国际科技合作基地资格两项。成果转化成果转化 经验和体会经验和体会从院领导层面重视、支持样本库的工作。管理要严,统一标准,统一规范,保障

25、样本质量,才能保 障后续科研数据的质量。重视多科室的协作和权益,调动临床科室的积极性。加大样本库的宣传,促进样本相关工作的标准化。鼓励样本产出,提高样本的使用率。经验和体会经验和体会样本的用途样本的用途血清血清/血浆血浆/尿液尿液/唾液等体液唾液等体液提取蛋白质提取蛋白质质谱、二维质谱、二维电电泳分析泳分析提取代谢物提取代谢物代谢组分析代谢组分析游离核游离核酸酸(DNA,miRNA,lncRNA)测序、芯片、测序、芯片、PCR等分析等分析提取蛋白质提取蛋白质蛋白质组分析蛋白质组分析白细胞白细胞/组织组织/细胞沉渣等细胞沉渣等提取提取DNA、RNA测序、测序、SNP、甲基化、芯片分析、甲基化、芯

26、片分析不同类型的样本根据用途 和将来提取方式不同,保存条件也不同4.19吉栩讲解样本库服务内容样本库服务内容 服务内容提供各类临床样本的采集、处理、储存和技术指导提供与库存样本相关联的临床信息查询服务提供各类生物样本深低温动存技术咨询服务提供实验条件开放共享核酸、蛋白的提纯和检测组织样本病理切片制备、染色等数字病理扫描样本的质量检测和合作研究简言之,简言之,可以:可以:用样本!用样本!用数据!用数据!用服务!用服务!如何使用生物样本资源如何使用生物样本资源 前瞻性研究为长期研究计划、后续研究留取临床样本,研究未 病到发病的状态 回顾性研究调取库存特定疾病样本和信息,为课题研究提供资 源(疾病风

27、险、生物标志物等)根据临床需求设计研究计划,定制符合研究需求的样本相关标准化 流程 使用实验平台分析样本,结合信息平台进行数据的挖掘和处理在已建成的样本资源库的基础上,需要通过广泛宣传、信息在已建成的样本资源库的基础上,需要通过广泛宣传、信息化化 手段、辅助技术平台的支持加强样本资源的深度利用,鼓手段、辅助技术平台的支持加强样本资源的深度利用,鼓励样励样 本的使用。本的使用。机制上仍需加强管理层的支持和多科室协调。机制上仍需加强管理层的支持和多科室协调。来源于不同中心的样本信息数据存在结构差异,统一的信息来源于不同中心的样本信息数据存在结构差异,统一的信息化化 采集有难度,是样本信息库建设和信

28、息共享中的难题。采集有难度,是样本信息库建设和信息共享中的难题。存在问题存在问题构建覆盖全军现役及退伍军人的样本及信息资源库,为现代新构建覆盖全军现役及退伍军人的样本及信息资源库,为现代新型战争提供战略资源支持。型战争提供战略资源支持。构建相关的技术平台,充分挖掘战略资源的科研价值,开发组构建相关的技术平台,充分挖掘战略资源的科研价值,开发组 织工程、干细胞修复、基因治疗等新技术为战伤救治服务。织工程、干细胞修复、基因治疗等新技术为战伤救治服务。在资源平台和技术平台基础上,促进产出并实现临床转化。在资源平台和技术平台基础上,促进产出并实现临床转化。构建全军健康信息与战略资源库联盟构建全军健康信息与战略资源库联盟展望展望谢谢

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