1、临床微生物学概论(二)细菌的耐药机制及其临床意义细菌的耐药机制及其临床意义胡付品胡付品复旦大学附属华山医院抗生素研究所复旦大学附属华山医院抗生素研究所n抗菌药物对细菌的作用机制n细菌对抗菌药物的耐药机制n细菌耐药性的遗传学基础n主要细菌的耐药性变迁及其防治本课内容本课内容(一)抗菌药物的作用机制(一)抗菌药物的作用机制n阻碍细菌细胞壁合成阻碍细菌细胞壁合成:导致细菌在低渗透压环境下膨胀破裂死亡,使细菌不能生长繁殖。l内酰胺类、糖肽类n与细菌细胞膜相互作用与细菌细胞膜相互作用:增强细菌细胞膜的通透性、打开膜上的离子通道,破坏其屏障作用,让细菌内部的有用物质漏出菌体或电解质平衡失调而死。l多黏菌素
2、n与细菌核糖体或其反应底物(如与细菌核糖体或其反应底物(如tRNA、mRNA)相互所用)相互所用:抑制蛋白质的合成,使细菌无法合成存活所必需的结构蛋白和酶。l大环内酯类、氨基糖苷类n阻碍细菌阻碍细菌DNA的复制和转录的复制和转录:阻碍DNA复制将导致细菌细胞分裂繁殖受阻,阻碍DNA转录成mRNA则导致后续的mRNA翻译合成蛋白的过程受阻。l喹诺酮类n抑制细菌叶酸代谢等。l磺胺类DNA引导的RNA多聚酶链霉素庆大霉素、妥布霉素(氨基糖苷类)阿米卡星蛋白合成(tRNA)莫匹罗星DNARNA503050305030核糖体THFADHFAPABADNA旋转酶(解旋、螺旋)喹诺酮类利福平蛋白合成(50S
3、抑制剂)红霉素氯霉素克林霉素蛋白合成(30S抑制剂)细胞膜多粘菌素氯霉素乙酰转移酶细胞壁合成细胞壁合成环丝氨酸万古霉素、替考拉宁杆菌肽青霉素类头孢菌素类拉氧头孢碳青霉烯类叶酸代谢甲氧苄啶磺胺类药周质空间-内酰胺酶氨基糖苷类钝化酶四环素大观霉素细菌模式图细菌模式图-抗菌药物作用机制抗菌药物作用机制(二)细菌主要的耐药机制(二)细菌主要的耐药机制n灭活酶与钝化酶的产生n抗生素渗透屏障作用n靶位结构改变n细菌代谢状态或营养缺陷n细菌菌膜形成X外排外排灭活灭活渗透障碍渗透障碍靶位改变靶位改变细菌耐药的主要机制灭活酶产生灭活酶产生抗生素靶位点改变抗生素靶位点改变孔蛋白改变,细胞壁孔蛋白改变,细胞壁/膜通
4、透性改变膜通透性改变喹诺酮类药物耐药基因-内酰胺类药物耐药基因多种抗菌药物耐药主动外排主动外排抗菌药物抗菌药物D2孔孔蛋白缺失蛋白缺失 MexA-MexB-OprM碳青霉烯酶碳青霉烯酶Abs失活失活胞胞内内周周间间隙隙铜绿假单胞菌对碳青霉烯类的耐药机制抗生素渗透屏障作用与外排泵抗生素渗透屏障作用与外排泵靶位结构改变靶位结构改变药物药物细菌靶位细菌靶位万古霉素敏感肠球菌万古霉素耐药肠球菌细菌利用酶系统,把对氨基苯甲酸氨基苯甲酸合成叶酸,维持自身生长需要。磺胺类药物与氨基苯甲酸氨基苯甲酸化学结构相似,当磺胺类药物浓度较高时,可深入细菌体内竞争二氢叶酸合成酶,生成异常的核酸拟似物,使细菌不能生成菌体
5、所必需核酸而死亡。对磺胺类药物产生耐药性的细菌,可通过调整代谢环节,产生大量的对氨基苯甲酸(20-100倍),抵消磺胺药对酶的竞争,从而使药物失去抑菌作用。细菌代谢状态改变营养缺陷等竞争力极强竞争力极强 内酰胺环内酰胺环PenicillinaseCHCONHRCHNCCSCH3HCOOHCH3灭活酶与钝化酶的产生灭活酶与钝化酶的产生细菌菌膜形成细菌菌膜形成耐药机制耐药机制1.灭活酶和钝化酶的产生n-内酰胺酶n氨基糖苷类钝化酶n氯霉素酰基转移酶nMLS类抗生素钝化酶(Macrolide-Licosamide Streptogramin)-内酰胺酶的分类内酰胺酶的分类ESBL-内酰胺酶内酰胺酶(质
6、粒质粒)(染色体染色体)(质粒质粒)(染色体或质粒染色体或质粒)Amp CMLOXA丝氨酸酶丝氨酸酶金属酶金属酶A类酶类酶C类酶类酶D类酶类酶B类酶类酶Extended-spectrum-lactamasemetallo-lactamasen底物谱底物谱l青霉素酶:青霉素类l头孢菌素酶u广谱酶:包括上述抗菌药,第一和第二头孢菌素u超广谱酶:包括上述抗菌药、第三和第四代头孢菌素uAmpC酶:包括上述抗菌药、头霉素类l碳青霉烯酶:包括上述抗菌药、碳青霉烯类u丝氨酸碳青霉烯酶u金属碳青霉烯酶n遗传学基础遗传学基础l质粒酶、染色体酶n可诱导性可诱导性l体质酶(固有的)、诱导酶重要重要-内酰胺酶及其底物
7、谱内酰胺酶及其底物谱ESBLsESBLs的分类的分类目前已超过200种Data from Lahey Cliniclahey.org/Studies/我国已报道的我国已报道的TEM 型和型和SHV型型ESBLsSHV酶城市TEM酶城市SHV-2浙江TEM-1 河南SHV-5浙江、四川TEM-10安徽SHV-10四川、TEM-19四川SHV-12安徽、北京、广州、河南、上海、武汉、浙江、TEM-28四川TEM-29四川SHV-18上海TEM-105浙江SHV-28深圳、浙江TEM-116广州SHV-56安徽、北京、广州、湖南、昆明、上海、四川、浙江TEM-128浙江TEM-144福州SHV-59
8、安徽、广州、湖南、昆明、深圳SHV-71广州SHV-89广州CTX-M型型ESBL全球流行图全球流行图质粒介导的头孢菌素酶质粒介导的头孢菌素酶ACT-1,DHA-1,CMY (北京北京)DHA-1,CIT,ACT-1 (上海上海)DHA-1(浙江浙江)DHA-1,ACT-1(广州广州)我国已报道的我国已报道的KPC型碳青酶烯酶型碳青酶烯酶发现酶型菌种质粒株数地区作者发表的杂志和年份2019.9KPC-2肺炎克雷伯菌60kb1浙江张幸国中华检验医学杂志2019.7KPC-2弗劳地柠檬酸60kb1浙江张 嵘中华检验医学杂志2019.8KPC-2粘质沙雷菌60kb1浙江张 嵘中华微生物和免疫学杂志2
9、019.1KPC-2粘质沙雷菌/6山东常 霞医学检验与临床2019.4KPC-2肺炎克雷伯菌/5上海沈继录中华检验医学杂志KPC-2弗劳地柠檬酸/11KPC-2粘质沙雷菌/12019.5KPC-2肺炎克雷伯菌56kb12江苏蒯守刚临床检验医学2019.9KPC-2肺炎克雷伯菌60kb10浙江冯雅君浙江医学2019年KPC-2肠杆菌科细菌/30北京杨启文AAC2019年KPC-2肺炎克雷伯菌/109上海陈淑丹AAC2019年KPC-3大肠埃希菌/3上海蒋晓飞EJCMID已经发现的已经发现的KPC型碳青霉烯酶(型碳青霉烯酶(20种)种)Klebsiella pneumoniae carbapene
10、mase(KPC)KPC型型年份年份国家国家细菌细菌KPC型型年份年份国家国家细菌细菌KPC-12019美国美国肺炎克雷伯菌肺炎克雷伯菌KPC-3 2019美国美国阴沟肠杆菌阴沟肠杆菌KPC-22019美国美国肺炎克雷伯菌肺炎克雷伯菌KPC-42019苏格兰苏格兰肠杆菌属肠杆菌属KPC-22019美国美国肠炎沙门菌肠炎沙门菌KPC-52019波多黎各波多黎各肺炎克雷伯菌肺炎克雷伯菌 2019中国中国肺炎克雷伯菌肺炎克雷伯菌KPC-62019波多黎各波多黎各肺炎克雷伯菌肺炎克雷伯菌 2019法国法国肺炎克雷伯菌肺炎克雷伯菌KPC-72019美国美国肺炎克雷伯菌肺炎克雷伯菌 2019哥伦比亚哥伦比
11、亚肺炎克雷伯菌肺炎克雷伯菌KPC-82019波多黎各波多黎各肺炎克雷伯菌肺炎克雷伯菌 2019以色列以色列大肠埃希菌大肠埃希菌KPC-92009以色列以色列大肠埃希菌大肠埃希菌 2019哥伦比亚哥伦比亚铜绿假单胞菌铜绿假单胞菌KPC-102019波多黎各波多黎各鲍曼不动杆菌鲍曼不动杆菌 2019哥伦比亚哥伦比亚弗劳地柠檬酸杆菌弗劳地柠檬酸杆菌KPC-112019美国美国肺炎克雷伯菌肺炎克雷伯菌VIM-2VIM-3VIM-6VIM-7VIM-1VIM-4VIM-5VIM-9VIM-10VIM-8P.aeruginosaUSAP.aeruginosaAcinetobacter spp.Entero
12、bacteriaceaeEUROPEFAR EASTSOUTH AMERICAP.aeruginosaTAIWANP.aeruginosaEnterobacteriaceaeGREECE,ITALYSWEDEN,POLANDEnterobacteriaceaeP.aeruginosaTURKEYP.putidaSINGAPOREP.aeruginosaSOUTH AMERICAP.aeruginosaUKP.aeruginosaITALYVIM-11aAcquired Metallo-Lactamases:VIM-Type EnzymesVIM-11bP.aeruginosa Argentin
13、aVIM-13VIM-12EnterobacteriaceaeGreeceP.aeruginosa Spain目前为止发现目前为止发现41种种VIM型金属酶型金属酶OXA型碳青霉烯酶型碳青霉烯酶Paterson 2019;Higgins 2009 and 2019;Kim 2019苏格兰苏格兰(1985)西班牙西班牙(2019)法国法国(2019)阿根廷阿根廷(1994)63%88%OXA-143巴西(2019)OXA-182韩国(2019)89%93%OXA-235美国,墨西哥(2019)56%55%目前为止发现目前为止发现418种种OXA型碳青霉烯酶型碳青霉烯酶氨基糖苷钝化酶氨基糖苷钝化酶
14、n氨基糖苷钝化酶可对氨基糖苷分子的活性基团进行修饰而使之失去抗菌活性n不同的氨基糖苷钝化酶可钝化同一种氨基糖苷类;而同一种氨基糖苷钝化酶又可钝化不同的氨基糖苷类氨基糖苷类钝化酶氨基糖苷类钝化酶n乙酰转移酶(Aminoglycoside acetyltransferases,AAC)lAAC(2)AAC(6)AAC(3)n核苷转移酶(Aminoglycoside nucleotidyltransferases,ANT 或ADD lANT(4)ANT(3)ANT(2)lANT(6)n磷酸转移酶(Aminoglycoside photransferases,AHP)lAPH(3)APH(3”)APH
15、(5”)革兰阳性菌(双重功能酶)uAAC(6)+APH(2)耐药机制耐药机制抗生素渗透障碍抗生素渗透障碍:细胞壁障碍或细胞膜通透性的改变,抗生素无法进入细胞内达到作用靶位而发挥作用。n细胞壁:类脂双层,脂多糖(LPS),阻碍疏水性抗菌药物进入菌体。n细胞外膜孔蛋白(Outer membrane porin channels):OmpF,OmpA,OmpC孔蛋白丢失或减少,阻碍亲水性抗菌药物进入菌体。n细胞内膜细胞内膜多药外排泵多药外排泵(Active efflux):产生新的能量依赖性转运系统。MexA-MexB-OprM。碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的外膜孔蛋白碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的外膜
16、孔蛋白泳道1和6为敏感菌株耐药机制耐药机制靶位结构改变靶位结构改变(Alteration of target)n靶位酶:二氢叶酸合成酶n靶位生理功能:细菌形态和活力n靶位结构:氟喹酮类 DNA旋转酶 举例:MRSA:含mecA基因,编码PBP2a PBP:Penicillin Binding Protein Altered PBP;Abnormal binding of antibioticAlteration of PBP Target耐药机制耐药机制4.其他n细菌代谢状态的改变:细菌代谢状态的改变:对氨基苯甲酸产量(PABA)n营养缺陷、L型细菌(无细胞壁)、芽胞n细菌菌膜的形成l抗菌药物
17、不能透过整个菌膜l菌膜对抗菌药物的敏感性降低l菌膜内的细菌具有独特的生物学特征细菌的特殊状态细菌的特殊状态n芽胞(Spore)l某些细菌在一定环境条件下,在菌体内形成一个圆形或卵圆形小体。l是细菌的休眠方式。l多数芽胞形成是在营养缺乏时l抵抗力强,对热、干燥、消毒剂等有强大的抵抗力。l一般方法不易将其杀死,可耐100沸水煮沸数小时。l最可靠的方法是高压蒸汽灭菌。以芽胞是否被杀死作为判断灭菌效果的指标。u如炭疽芽胞杆菌u破伤风梭菌(三)细菌耐药性的遗传学基础(三)细菌耐药性的遗传学基础n染色体介导耐药n质粒介导的耐药耐药菌的出现及流行耐药菌的出现及流行选择性压力选择性压力n抗菌药物均具有选择耐药
18、细菌选择耐药细菌的能力,其广泛使用可导致选择性压力增加。耐药菌株的出现耐药菌株的出现新的耐药细菌新的耐药细菌突变突变XX敏感细菌耐药细菌耐药细菌耐药基因转移耐药基因转移1.1.染色体介导的耐药性染色体介导的耐药性n耐药基因位于染色体,随细菌分裂传至后代n发生频率低:10-510-9n通常只对1、2种类似药物耐药n产生或消失和药物存在无关n耐药菌生长分裂变慢,竞争力变弱n居次要地位2.2.质粒介导的耐药性质粒介导的耐药性n染色体外的DNAn耐药质粒:接合型和非接合型质粒n转移方式:l接合型:接合转移l非接合型:转化,转导等方式 n发生频率:10-210-8n临床意义:可造成耐药菌的爆发流行。n居
19、主要地位接合(接合(Conjugation)n方式:通过耐药菌性菌毛和敏感菌菌体直接沟通,由耐药菌将耐药质粒边复制边转移给敏感菌。n细菌:革兰阴性菌,特别是肠道细菌。n种间,属间,牲畜与人。接合(接合(Conjugation)F+ConjugationHfr ConjugationR-Plasmid Conjugation耐药基因的传播耐药基因的传播a.质粒的转移接合 b.噬菌体转导 c.游离DNA转化d.转座 三三.主要细菌的耐药性变迁及其防治主要细菌的耐药性变迁及其防治n细菌耐药性的现状和变迁n耐药性的防治0.70.70.71.42.96.66.79.621.722.232.643.357
20、.673.101020304050607080亚胺培南美罗培南头孢哌酮/舒巴坦头孢吡肟哌拉西林/他唑巴坦头孢他啶头孢噻肟阿米卡星哌拉西林头孢西丁环丙沙星庆大霉素复方磺胺甲噁唑头孢呋辛抗菌药物抗菌药物耐药率()耐药率()细菌与抗菌药物的斗争历程细菌与抗菌药物的斗争历程抗菌药物抗菌药物细菌细菌窄谱窄谱内酰胺酶内酰胺酶青霉素青霉素广谱广谱内酰胺酶内酰胺酶广谱头孢菌素广谱头孢菌素ESBL超广谱头孢菌素超广谱头孢菌素AmpC酶酶酶抑制剂复方合剂酶抑制剂复方合剂ESBL+AmpC酶酶碳青霉烯类药物碳青霉烯类药物碳青霉烯酶碳青霉烯酶病原菌的变迁n医院中革兰阳性菌增多n一些少见病原菌增多不动杆菌、嗜麦芽窄食单
21、胞菌、洋葱伯克霍尔德菌等n真菌增多念珠菌、曲霉、组织胞浆菌等n出现新的病原菌和耐药菌lCA-MRSA、肺孢菌、艰难梭菌(毒力增强)lCA-ESBL、CA-KPC革兰阳性菌的变迁主要表现为革兰阳性菌的变迁主要表现为n金葡菌(尤其是MRSA)耐药株感染的发生率增多n凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)感染增多n青霉素不敏感肺炎链球菌(PISP、PRSP)的出现和增多n万古霉素耐药肠球菌(VRE)的出现和增多n耐青霉素和耐头孢菌素类草绿色链球菌的出现和增多57细菌耐药性变迁革兰阳性菌n金葡菌 lMRSAlVISA、hVISA lVRSA lCA-MRSAn青霉素不敏感肺炎链球菌 lPISP lPRSPn耐万
22、古肠球菌 lVRE临床重要的耐药细菌甲氧西林耐药葡萄球菌甲氧西林耐药葡萄球菌nMRSA:甲氧西林耐药金葡菌lMethicillin resistant Staphylococcus aureusl含mecA 基因,编码PBP2anMSSA:甲氧西林敏感金葡菌lMethicillin susceptible Staphylococcus aureusl不含mecA 基因,没有PBP2anMRCNS:甲氧西林耐药凝固酶阴性葡萄球菌lMethicillin-resistant coagulase negative StaphylococcusnMSCNS:甲氧西林敏感凝固酶阴性葡萄球菌lMethic
23、illin-susceptible coagulase negative Staphylococcus甲氧西林耐药葡萄球菌甲氧西林耐药葡萄球菌nHA-MRSA:lhealthcare associated MRSA 医院感染获得性MRSAl耐药性强强、毒力弱弱nCA-MRSA:社区感染获得性MRSAlcommunity-Associated MRSAl耐药性弱弱、毒力强强60超级细菌(Superbugs)PDRMRSA、VRE、VISA、VRSA碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌碳青霉
24、烯耐药其它肠杆菌科细菌碳青霉烯耐药其它肠杆菌科细菌(是指对其有效治疗药物几乎均耐药的细菌)(是指对其有效治疗药物几乎均耐药的细菌)主要超级细菌菌种:主要超级细菌菌种:上海地区甲氧西林耐药葡萄球菌的检出率万古霉素不敏感金黄色葡萄球菌万古霉素不敏感金黄色葡萄球菌nVISA:万古霉素低度耐药MRSAlvancomycin-intermediate Staphylococcus aureus nhVISA:异质性万古霉素低度耐药MRSA lheterogeneous Vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus VISAnVRSA:万古霉素耐药MRSA l
25、Vancomycin-resistant Staphylococcus aureus 历年美国报道的历年美国报道的12例例VRSA病案病案州州年份年份年令年令标本来源标本来源诊断诊断基础疾病基础疾病1密西根201940足溃疡和导管尖足底软组织感染糖尿病,透析2PA201970足溃疡骨髓炎肥胖症3纽约201963肾引流管内尿液没有感染多发性硬化,肾结石4密西根201978脚趾伤坏疽糖尿病,维管束病5密西根201958脂膜切除术后外科部位伤口感染外科感染肥胖症6密西根201948跖溃疡骨髓炎心律失常,慢性溃疡7密西根201943三头肌创伤引起坏死的筋膜炎糖尿病,透析、慢性溃疡8密西根201948脚
26、趾伤骨髓炎糖尿病,肥胖症,慢性溃疡9密西根201954脚切除术后的外科部位的伤口感染骨髓炎糖尿病,肝性脑病10密西根200953足底伤口足底软组织感染糖尿病,肥胖症,狼疮,类风湿性关节炎11德克萨斯201964Wound drainage人工关节感染糖尿病,晚期肾疾病(肾功能衰竭),透析12德克萨斯201983阴道拭子阴道排出物慢性难治性尿路感染,慢性尿路感染,膀胱肠瘘 除3号病案外,所有11株VRSA均为伤口标本分离物,且11例VRSA感染患者均被诊断为外科疾患*具有复杂的基础疾病,提示自身免疫能力低下肺炎链球菌的耐药性肺炎链球菌的耐药性n青霉素敏感肺炎链球菌:PSSPlPenicillin
27、-susceptible S.pneumoniael青霉素MIC 0.06ug/ml n青霉素中介肺炎链球菌:PISPlPenicillin-intermediate S.pneumoniael青霉素MIC 0.125-1ug/ml n青霉素耐药肺炎链球菌:PRSPlPenicillin-resistant S.pneumoniae l青霉素MIC 2ug/ml n青霉素不敏感肺炎链球菌:PNSPlPenicillin-nonsusceptible S.pneumoniae包括PISP和PRSP肠球菌的耐药性肠球菌的耐药性nHLARE:高水平氨基糖苷类耐药肠球菌lhigh-level amin
28、oglycoside resistanel氨苄西林和氨基糖苷类的联合治疗无效nVRE:万古霉素耐药的肠球菌lvancomycin-resistant enterococcil基因型:vanA、vanB、vanC、vanD、vanE l对万古霉素具有不同的耐药程度革兰阴性菌的主要变迁n肠杆菌科细菌l产ESBLs,AmpC,碳青霉烯酶(KPC)等大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和奇异变形杆菌检出率增加n大肠埃希菌对氟喹诺酮类的耐药率上升快:50%n不动杆菌属、铜绿假单胞菌中的MDR、XDR和PDR菌株增多n流感嗜血杆菌:产生-内酰胺酶n嗜麦芽窄食单胞菌、黄杆菌固有耐药株对碳青霉烯类的耐药性l检出率增加几个
29、重要的名字解释nMDR:Multi-drug resistant 多重耐药 l对3种或以上化学结构不同的抗菌药物均耐药nXDR:Extensively-drug resistant 广泛耐药l对仅除黏菌素或替加环素外的其他药物全部耐药nPDR:Pan-drug resistant 全耐药l对所有抗菌药物均耐药主要肠杆菌科细菌对碳青霉烯类的耐药性主要肠杆菌科细菌对碳青霉烯类的耐药性年份年份大肠埃希菌大肠埃希菌肺炎克雷伯菌肺炎克雷伯菌肠杆菌属肠杆菌属株数IMP-RMER-R株数IMP-RMER-R株数IMP-RMER-R201938601.11.4207832.97988.53.520195385
30、1.40.827493.42.711058.72.2201963790.70.929962.42.912315.42.5201963841.30.933103.83.714165.22.8200978851.7145064.84.716844.93.4201990881.61.449959.19.019615.24.820191171711.263009.59.725194.24.52019176730.9184538.810.830313.53.72019167941.03.01212110.013.538164.36.4670株碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌对株碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌对抗菌
31、药物的耐药率抗菌药物的耐药率(CHINET 2019)抗菌药R%S%抗菌药R%S%厄他培南1000哌拉西林/他唑91.82.5亚胺培南76.414.6哌拉西林1000美罗培南78.414.5氨苄西林/舒巴96.60.7头孢吡肟83.29.5氨苄西林1000头孢他啶94.13.5阿米卡星52.644.8头孢噻肟1000庆大霉素76.719.4头孢哌酮/舒巴84.73.5环丙沙星79.413.3头孢呋辛1000复方磺胺72.124.3头孢唑啉1000米诺环素37.542.9肺炎克雷伯菌占64.2%;病房依次为:ICU(36.3%)、神经外科(10%)CRE被列为被列为“紧急威胁紧急威胁”临床重要耐
32、药细菌的检测临床重要耐药细菌的检测74耐甲氧西林葡萄球菌的检测耐甲氧西林葡萄球菌的检测n苯唑西林:1g/片l金葡菌 11-12mml凝固酶阴性葡萄球菌 17mmn4%NaCl-6g/ml苯唑西林盐平板l培养条件:35,24-48小时l结果:1个菌落生长,判定为甲氧西林耐药(MR)菌株n头孢西丁:30g/片l金葡菌 22mml凝固酶阴性葡萄球菌 24mmn分子生物学方法:PCR扩增mecA基因75耐甲氧西林葡萄球菌的检测耐甲氧西林葡萄球菌的检测n苯唑西林和头孢西丁检测n苯唑西林盐平板检测76临床意义临床意义细菌mecA基因基因抗菌药物抗菌药物MSSA(甲氧西林敏感金葡菌)除青霉素外除青霉素外大多
33、敏感大多敏感MRSA(甲氧西林耐药金葡菌)大多耐药(万古霉素除外)大多耐药(万古霉素除外)MRSA及及MRCNS感染:感染:选用万古霉素或替考拉宁。磷霉素、复方磺胺甲噁唑、利福平等可根据情况与糖肽类药联合使用77MSSA(1495株)与MRSA(1916株)的耐药率(%)(CHINET 2019)克林霉素诱导耐药性的检测(克林霉素诱导耐药性的检测(D-试验)试验)结果结果报告报告阴性阴性敏感:敏感:该菌不表现为体外诱导型克林霉素耐药。阳性阳性耐药:耐药:该菌表现为体外诱导型克林霉素耐药,用克林霉素治疗可能无效。79HLARE肠球菌的检测肠球菌的检测nHLAREn120 g/片庆大霉素 K-B法
34、药敏n抑菌圈直径 S10mm I=7-9mm(用稀释法确证)R=6mmn临床意义 HLARE菌株采用氨苄西林和氨基糖苷类抗生素的联合治疗无效 80耐万古霉素肠球菌检测耐万古霉素肠球菌检测n万古霉素纸片扩散法l含量:30 g/片l结果:透射光,抑菌圈内出现薄雾状或任何其他生长或抑菌圈14mm均表示耐药l抑菌圈15-16mm为中度敏感,MICl抑菌圈17mm判定为敏感n万古霉素耐药确证试验l含6 g/ml万古霉素的MH平板l1-10 l 0.5MacFarland Standard菌悬液l35,24小时,1个菌落生长即判定为耐药n 分子生物学方法:VanA、VanB、VanC 等基因81临床意义临
35、床意义特征VanAVanBVanCVanDVanEVanGVanLVanM万古64-5004-5002-3264-1281612-168256替考16-5000.5-20.5-24-640.50.50.50.75-256表达诱导诱导体质诱导诱导/诱导位置质粒/染色体质粒/染色体染色体染色体染色体染色体/质粒/染色体常见菌粪肠、屎肠粪肠和屎肠鹑鸡、铅黄屎肠粪肠粪肠粪肠屎肠82n万古霉素依赖粪肠球菌(Vancomycindependent Enterococcus faecalis,VDE)。n长期、大量使用包括万古霉素、替考拉宁、氨基糖肽类等抗生素,由于抗生素的压力,肠球菌必须依赖万古霉素才能生
36、长。83汪复:中国抗感染化疗杂志2019:5(1):13耐药肠球菌感染耐药肠球菌感染n耐万古霉素肠球菌属感染:l新开发品种如利奈唑胺、奎奴普丁/达福普汀等,但后者对粪肠球菌无作用。l根据药敏结果联合用药(磷霉素、利福平、氟喹诺酮类、米诺环素等)。磷霉素联合呋喃妥因可能对尿路感染有效 84耐青霉素肺炎链球菌的检测耐青霉素肺炎链球菌的检测n苯唑西林:1g/片n抑菌圈直径20mm为青霉素敏感株(MIC2g/ml)n抑菌圈直径19mm可能为青霉素耐药、中敏或敏感株,必须进行青霉素MIC测定。青霉素敏感、中敏和耐药肺炎链球菌在儿童中的检出率(上海地区 2019-2019)85临床意义临床意义PSSP青霉
37、素、阿莫西林等-内酰胺类高度敏感对红霉素、克林霉素、氯霉素耐药率较高PISP+PRSP青霉素耐药,部分菌株对头孢曲松等第三代头孢菌素耐药;但对万古霉素、和碳青霉烯类等均呈敏感;对红霉素、克林霉素、氯霉素耐药率更高86产超广谱产超广谱 内酰胺酶菌株内酰胺酶菌株的检测的检测nESBL:Extended-spectrum-lactamasesn筛选试验:ESBLl头孢泊肟:10g/片 22mml头孢他啶:30g/片 22mml头孢噻肟:30g/片 27mml头孢曲松:30g/片 25mml氨曲南:30g/片 27mmn任一以上药物进行筛选,出现上述结果疑为ESBL产生株。87头孢他定头孢他定/克拉维
38、酸克拉维酸 头孢噻肟头孢噻肟 头孢他定头孢他定 头孢噻肟头孢噻肟/克拉维酸克拉维酸 10 mm26 mm88临床意义临床意义nESBLs菌株主要为大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌,其他的肠杆菌科细菌和非法酵菌中亦可存在n可水解各种广谱-内酰胺类抗生素包括第三代的头孢他啶、头孢噻肟、头孢曲松以及头孢吡肟和氨曲南等含氧亚氨基侧链的头孢菌素n多数可被酶抑制剂如克拉维酸、舒巴坦、三唑巴坦所抑制n对亚胺培南、美罗培南等碳青霉烯类高度敏感,对头霉素类、头孢哌酮/舒巴坦、哌拉西林/三唑巴坦等酶抑制剂复方制剂多数仍呈敏感n对具非-内酰胺结构的抗菌药物如氨基糖苷类、氟喹酮类等的耐药率亦较非产酶株高产与非产产与非产ESB
39、Ls大肠埃希菌对抗菌药的耐药率(大肠埃希菌对抗菌药的耐药率(%)抗菌药物耐药率抗菌药物耐药率产产ESBL(8214株株)非产非产ESBL(6991株株)产产ESBL(8214株株)非产非产ESBL(6991株株)阿米卡星5.71.8头孢哌酮/舒巴坦8.33.4庆大霉素56.536.6头孢西丁19.711.7哌拉西林96.846.9亚胺培南0.81.0哌拉西林/他唑巴坦4.62.9美罗培南3.52.8头孢唑林99.437.9厄他培南1.31.4头孢呋辛98.627.0环丙沙星71.440.9头孢噻肟98.821.2复方磺胺甲噁唑66.047.2头孢他啶45.110.2磷霉素10.13.1头孢吡肟
40、34.66.4呋喃妥因6.04.590 AmpCESBL水解头孢西丁水解头孢西丁+-水解头孢曲松等三代头孢菌素水解头孢曲松等三代头孢菌素+酶抑制剂抑制(克拉维酸、他唑巴坦)酶抑制剂抑制(克拉维酸、他唑巴坦)-+邻氯西林抑制邻氯西林抑制+-AmpC酶和ESBL酶的特点AmpC酶的检测酶的检测9192临床意义临床意义n产AmpC酶菌株主要发生在肠杆菌属肠杆菌属、普罗威登菌属、摩根菌属、沙雷菌属和假单胞菌属细菌中n对头霉素类、第三代头孢菌素和酶抑制剂复方制剂耐药,并可同时对氟喹酮类和氨基糖苷类耐药n对第四代头孢菌素头孢吡肟和碳青霉烯类敏感n如为ESBLs+AmpC酶菌株第四代头孢菌素头孢吡肟亦耐药9
41、3碳青霉烯酶碳青霉烯酶分类代表酶常见细菌Class A KPC,SME,IMI,NMC,GES肠杆菌科细菌(铜绿假单胞菌中少见)Class B(metallo-b-lactamse)NDM-1,IMP,VIM,GIM,SPM铜绿假单胞菌肠杆菌科细菌不动杆菌属Class DOXA不动杆菌属94产产KPC型碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌的药物敏感性型碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌的药物敏感性抗菌药物抗菌药物解释解释抗菌药物抗菌药物解释解释阿米卡星R头孢吡肟R庆大霉素R头孢哌酮/舒巴坦R氨苄西林R头孢西丁R氨苄西林/舒巴坦R亚胺培南亚胺培南R哌拉西林R美罗培南美罗培南R哌拉西林/他唑巴坦R厄他培南厄他培南R头孢唑啉
42、R环丙沙星R头孢呋辛R复方磺胺甲噁唑R头孢噻肟R亚胺培南亚胺培南(Etest)32mg/ml头孢他啶R美罗培南美罗培南(Etest)32mg/ml16794株大肠埃希菌对抗菌药的耐药率(株大肠埃希菌对抗菌药的耐药率(%)耐药率较低,耐药率较低,10%12121株克雷伯菌属对抗菌药的耐药率(株克雷伯菌属对抗菌药的耐药率(%)耐药率较低,耐药率较低,20%8257株铜绿假单胞菌对抗菌药的耐药率(株铜绿假单胞菌对抗菌药的耐药率(%)耐药率较低,耐药率较低,20%10120株不动杆菌属株不动杆菌属(鲍曼不动鲍曼不动89.2%)细菌对抗菌药的耐细菌对抗菌药的耐药率(药率(%)2019年各医院临床分离的广
43、泛耐药株数年各医院临床分离的广泛耐药株数医院铜绿假单胞菌鲍曼不动杆菌XDR株数总株数()XDR株数总株数()华山医院25/6204.0107/51320.6瑞金医院10/3812.664/51612.4协和医院10/8191.2206/71428.8同济医院93/9589.7456/92249.5广州一附院3/5860.50/5340.0北京医院15/3823.969/25227.4儿科医院0/2770.05/3071.6儿童医院0/1230.0104/23544.3甘肃人民医院0/2150.082/20340.4新疆医大一附院1/7110.10/7180.0安徽医大一附院1/4010.20/
44、4250.0昆明医大一附院1/2380.429/3657.9浙江邵逸夫医院0/4170.00/4940.0中国医大一附院4/4120.083/59713.9天津医大总院0/9750.0116/11799.8四川大学华西医院0/7420.00/10500.0合计163/82572.01321/902414.62019109/72711.51380/782717.62019年各医院临床分离的广泛耐药株数年各医院临床分离的广泛耐药株数医院肺炎克雷伯菌肠杆菌科细菌*XDR株数总株数()XDR株数总株数()华山医院60/7008.6 64/18523.5 瑞金医院24/7043.4 25/24671.0
45、 协和医院2/8300.2 4/31430.1 同济医院3/9840.3 8/31350.3 广州一附院1/3800.3 2/14240.1 北京医院19/2348.1 20/8702.3 儿科医院5/5490.9 6/29740.2 儿童医院25/2789.0 35/11853.0 甘肃人民医院0/4280.0 1/17520.1 新疆医大一附院0/10230.0 0/31510.0 安徽医大一附院11/5382.0 15/20840.7 昆明医大一附院95/59615.9 113/20885.4 浙江邵逸夫医院5/5840.9 8/21340.4 中国医大一附院0/5550.0 1/167
46、30.1 天津医大总院0/13690.0/40380.0 四川大学华西医院0/13010.0/39270.0 合计250/110532.3 302/378970.8 2019373/87724.2 395/312771.3101109株碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的敏感性株碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的敏感性Shudan Chen et al.AAC,2019,p.2493102Carbapenemases:the Versatile-Lactamases103 3-氨基苯硼酸抑制试验(300g/片)检测KPC型碳青霉烯酶EDTA协同试验(292g/片)检测金属酶82株株CRE菌株的耐药机制及其菌
47、株的耐药机制及其MIC范围范围耐药机制耐药机制菌株菌株(株)(株)MIC范围范围(g/mL)*ETPMEMIMP碳青霉烯酶碳青霉烯酶+ESBLs+膜蛋白异常膜蛋白异常514-2561-2561-256碳青霉烯酶碳青霉烯酶+ESBLs1164-25664-25616-128ESBL表达表达+膜蛋白异常膜蛋白异常*81-1281-1280.25-64碳青霉烯酶碳青霉烯酶+ESBLs+AmpC+膜蛋白异常膜蛋白异常*64-1282-2568-256膜蛋白异常膜蛋白异常44-640.25-81-16碳青霉烯酶碳青霉烯酶+膜蛋白异常膜蛋白异常11286432ESBL表达表达1422注:膜蛋白异常指膜蛋白
48、缺失或下调表达。注:膜蛋白异常指膜蛋白缺失或下调表达。ETP:厄他培南;:厄他培南;MEM:美罗培南;:美罗培南;IMP:亚:亚胺培南。胺培南。Fupin HU,et al Journal of Medical Microbiology 2019,61:132产产KPC酶菌株的流行传播酶菌株的流行传播n美、英、法、以色列和巴西等相继报道产KPC-2或KPC-3酶肠杆菌科细菌引起的医院感染暴发流行。n2019年美国全国性的耐药监测结果表明,24%的肺炎克雷伯菌携带KPC-2或KPC-3型碳青霉烯酶基因。l其中88%的产KPC酶菌株具有相同的基因谱型。n2019-2019年MYSTIC监测结果显示
49、,产KPC-2酶菌株已从最初的单一种属细菌扩展至6种不同种属的肠杆菌科细菌。产产KPC酶菌株的流行传播酶菌株的流行传播nNeil Woodford报道2019年自一女性患者分离出一株产KPC-3酶的肺炎克雷伯菌n结果证实该菌与以色列医院分离的一株产碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌具有相同的PFGE指纹图谱。n病史调查结果发现,该患者之前曾在这家以色列医院进行治疗,病人在不同国家之间的流动促进了该类菌株流行传播区域的多样化。n英国学者Daniel发现一株铜绿假单胞菌所产的KPC-5酶,是从KPC-2型和KPC-4型碳青霉烯酶进化而来,提示产KPC酶菌株的种类正积极地扩散至其他种属的细菌。JAC,2019
50、,62:1261-1264.AAC.2009,53:557-562 利奈唑胺耐药菌株染色体利奈唑胺耐药菌株染色体DNA经经SmaI酶切后酶切后的的PFGE电泳图电泳图 n所有临床株的PFGE谱型完全一致,且与分离自杭州地区的cfr基因阳性对照株也相同 以色列及美国产KPC酶肺炎克雷伯菌的PFGE结果希腊产希腊产KPC-2酶肺炎克雷伯菌引起的暴发流行酶肺炎克雷伯菌引起的暴发流行ICU病房分离的病房分离的50株产酶菌株中,株产酶菌株中,82%的菌株为同一克隆菌株。的菌株为同一克隆菌株。同一克隆菌株CID 2019;50:3647325株产KPC-2型酶的弗劳地柠檬酸杆菌其中15株为同一谱型华山医院