第三讲《从质谱数据鉴定多肽和蛋白质》课件.ppt

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1、中科院自动化所Sample?PurificationDigestionMass MeasurerMany SpectraSerum AlbuminMyosinCytochrome CEscheria Coli.?IdentificationPeak m/z: 1019.08DFPIANGER 1019.09EPISVSSQQMLK 1347.56VLDALDSIK 974.13Carbonic anhydrase II SHHWGYGKHBGPZHWHKDFPIANGERQSPVNIDTKAVVQDPALKPLALVYGEATSRRMVNNGHSFNVEYDDSQDKAVLKDGPLTGTYR

2、LVQFHFHWGSSBBQGSEHTVDRKKYAAELHLVHWNTKYGDFGTAAQQPDGLAVVGVFLKVGDANPALQKVLDALDSIKTKGKSTDFPNFDPGSLLPNVLDYWTYPGSLTTPPLLESVTWIVLKEPISVSSQQMLKFRTLNFNAEGEPELLMLANWRPAQPLKNRQVRGFPK多匹配可以大大降低随机匹配的概率,从而增加结果的可信度Molecular weights used for calculations.ButtoncodeShortcodeNameAverage massof residueMonoisotopic mass

3、 of residueTwenty Naturally-Occurring Amino AcidsAlaAAlanine71.078871.03711CysCCysteine103.1448103.00919AspDAspartic Acid115.0886115.02694GluEGlutamic Acid129.1155129.04259PheFPhenylalanine147.1766147.06841GlyGGlycine57.052057.02146HisHHistidine137.1412137.05891IleIIsoleucine113.1595113.08406LysKLys

4、ine128.1742128.09496LeuLLeucine113.1595113.08406MetMMethionine131.1986131.04049AsnNAsparagine114.1039114.04293ProPProline97.116797.05276GlnQGlutamine128.1308128.05858ArgRArginine156.1876156.10111SerSSerine87.078287.03203ThrTThreonine101.1051101.04768ValVValine99.132699.06841TrpWTryptophan186.2133186.07931TyrYTyrosine163.1760163.06333dtytxyxC)()(),(10),(niiyixyxC质谱图De-novo Sequencing序列数据库一级质谱二级质谱质量纹数据库检索后筛选蛋白质未知多肽PSMs谢谢大家!

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