1、编辑课件1Total DNA extraction from eukaryotic tissue组员:肖淑娟 刘娟娟 张小琴 主讲人:杨丽苹 2编辑课件3编辑课件4编辑课件5编辑课件6编辑课件n药品试剂:动物组织药品试剂:动物组织 生理盐水生理盐水 SDS 三羟三羟甲基氨基甲烷(甲基氨基甲烷(Tris或或三羟甲基甲氨基乙三羟甲基甲氨基乙磺酸磺酸)EDTA 饱和酚饱和酚 氯仿氯仿 异戊醇异戊醇 预冷无预冷无水乙醇水乙醇 75%乙醇乙醇 蛋白酶蛋白酶Kn仪器设备:高速离心机仪器设备:高速离心机 冰箱冰箱 水浴锅水浴锅 微量微量移液器移液器 手术剪刀手术剪刀 镊子镊子 吸水纸吸水纸 研钵研钵 离心管
2、离心管7编辑课件n取新鲜小鼠肌肉组织取新鲜小鼠肌肉组织3g,尽量剪碎,放入离心管中。,尽量剪碎,放入离心管中。n加入加入0.45mlTES混匀,再加入混匀,再加入50ulSDS,5.0ul蛋白蛋白酶酶K,充分混匀后,充分混匀后,60水浴保温水浴保温30-60min,不时颠,不时颠倒混匀。倒混匀。n放置到室温,加入饱和酚放置到室温,加入饱和酚500ul颠倒混匀颠倒混匀,3000r/m离离心心10min.吸取上清液到另一个离心管中。吸取上清液到另一个离心管中。n加入酚:氯仿加入酚:氯仿:异戊醇(异戊醇(25:24:1)500ul,颠倒混匀。颠倒混匀。3000r/m离心离心10min.吸取上清液到另
3、一个离心管中。吸取上清液到另一个离心管中。8编辑课件5.加入加入2.5倍体积的倍体积的-20预冷的无水乙醇沉淀预冷的无水乙醇沉淀 DNA,观察现象。观察现象。6.3000r/m离心离心10min,弃乙醇。弃乙醇。7.-20预冷的预冷的75%乙醇乙醇洗涤,洗涤,3000r/m离心离心5min,弃乙醇,弃乙醇,55干燥干燥DNA.9编辑课件DNA纯化纯化n将已提取的DNA粗品加入生理盐水中,再加入固体NaCl使沉淀最少,即DNA溶解度最大。n3000r/m离心5min,吸取上清液加入乙醇析出。n3000r/m离心5min,弃乙醇得到较纯净的DNA.10编辑课件注意事项注意事项n选择的实验材料要新鲜
4、,处理时间不易过长。n在加入细胞裂解缓冲液前,细胞必须均匀分散,以减少DNA团块形成,取上清液时注意不要吸起中间的蛋白质。n 提取的DNA不易溶解:不纯,含杂质较多;加溶解液太少或沉淀物太干燥,都将使溶解变得很困难。n 酚/氯仿/异戊醇抽提后,其上清液太黏不易吸取含高浓度的DNA,可加大抽提前 缓冲液的量或减 少所取组织的量。11编辑课件琼脂糖凝胶电泳检测琼脂糖凝胶电泳检测实验目的 通过实验掌握琼脂糖凝胶电泳 鉴定DNA的原理与方法 12编辑课件实验原理实验原理n琼脂糖凝胶电泳是分离、鉴定和纯化DNA片段最为常用的方法之一,这种方法简便易行。而且琼脂糖可以灌制成各种形状、大小和孔径,在不同的装
5、置中进行电泳,如果有必要,还能够从凝胶中回收DNA谱带。琼脂糖凝胶的分离范围较广,选择不同凝胶浓度和装置,从50个碱基对到几兆不同长度的DNA都可以实现分离。DNA在琼脂糖凝胶中的迁移率受多种因素影响。例如DNA分子的大小;琼脂糖的浓度;所加电压等等。DNA片段越长,泳动速度越慢,而且泳动速度与电场强度成正比。一个给定大小的线性DNA片段,在不同浓度的琼脂糖凝胶中迁移率不同,DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系。用低浓度的荧光染料如溴化乙啶染色后,凝胶中的DNA可以直接被检测出来。紫外灯下可以直接检测到20pg的双链DNA。13编辑课件实验材料实验材料 实验器材 水平板电泳槽;灌胶模具及
6、梳齿;电泳仪;55水浴;沸水浴;微量移液器 实验试剂(1)DNA样品;DNA标准分子量标记物;琼脂糖;1x电泳缓冲液TBE;6x样品缓冲液(2)溴化乙锭:水中加入溴化乙啶,搅拌数小时至溶解。将配好的10 mg/ml溴化乙啶溶液装在棕色瓶中,室温保存,使用时稀释至0.5g/ml。缓冲溶液配制表 缓冲溶液工作溶液 储存溶液(每升)TBE0.5x5x0.045mol/L Tris-硼酸54 g Tris 碱0.001mol/L EDTA27.5g 硼酸20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)6x样品缓冲液0.2%溴酚蓝储存温度450%(w/v)蔗糖水液14编辑课件实验操作实验操作 1.照厂
7、家说明准备好灌胶模具,置于水平面上(实验操作示意图如下)。2.配制1%琼脂糖凝胶。取250ml三角瓶,加入100ml TBE缓冲液,称取1克琼脂糖加入缓冲液中,沸水浴加热至完全溶解,然后在55水浴中保温。在灌胶模具中插入梳齿,将稍微冷却的凝胶倒入灌胶模具。凝胶厚度35mm,避免气泡产生。3.室温放置3045分钟,待凝胶完全凝固后,按照厂家说明将凝胶放入水平板电泳槽。4.在电泳槽中加入电泳缓冲液,电泳缓冲液没过胶面1mm,拔下梳齿形成样品池。5.取样品与6X样品缓冲液按照比例混合后,用微量移液器缓慢加入样品池中。6.盖上电泳槽并且通电,注意电源正负极,确保样品向阳极移动。恒压15V/cm(按照两极之间距离计算),至示踪染料溴酚蓝前沿距离凝胶前端1cm时,切断电源。7.从电泳槽中取出凝胶,将凝胶置于0.5ug/ml溴化乙啶水溶液中,室温下振摇染色3045分钟。8.回收染色液,自来水冲洗凝胶后,于紫外灯下观察。15编辑课件16编辑课件注意事项注意事项 1.溴化乙啶是一种强诱变剂,并有中度毒性,取用含有这一染料的溶液时务必戴手套。2.紫外线对人体,尤其是眼睛有危害性。为减少紫外线照射,必须确保紫外线光源受到遮蔽。思考影响琼脂糖凝胶DNA迁移率的因素有那些,分别有怎样的影响?