1、实习实习19 流行病学数据分析常用软件流行病学数据分析常用软件v目的:通过课题资料分析,了解流行病学数据分目的:通过课题资料分析,了解流行病学数据分析常用统计软件的基本特点,学会应用这些软件析常用统计软件的基本特点,学会应用这些软件对流行病学研究资料进行基本的统计分析。对流行病学研究资料进行基本的统计分析。v时间:时间:3学时学时一、常用分析软件简介一、常用分析软件简介v流行病学是运用描述性、分析性、实验性及数理统流行病学是运用描述性、分析性、实验性及数理统计等方法,从群体水平研究疾病和健康有关问题的计等方法,从群体水平研究疾病和健康有关问题的一门重要学科。一门重要学科。v一个完整的流行病学研
2、究包括研究设计、按设计实一个完整的流行病学研究包括研究设计、按设计实施研究内容、搜集资料、整理和分析资料等四个阶施研究内容、搜集资料、整理和分析资料等四个阶段,资料的分析和数据的处理阶段是流行病学研究段,资料的分析和数据的处理阶段是流行病学研究的重要的一个环节。的重要的一个环节。Company Logov这里主要介绍流行病学常用的国内外知名的几种统这里主要介绍流行病学常用的国内外知名的几种统计分析软件:计分析软件:vEpi-DatavSPSSvSASvPEMSCompany LogoEpi Data软件简介软件简介vEpi Data软件是专为流行病学调查而设计的数据软件是专为流行病学调查而设计
3、的数据录入与管理软件。录入与管理软件。v可在可在Windows系列操作系统下使用,它的突出特系列操作系统下使用,它的突出特点是:点是:v占用空间小占用空间小v简单易学简单易学v功能强大功能强大Company Logov主要特点:主要特点:v调查表设计便捷,可识别调查表设计便捷,可识别Word文档等形式的文本文档等形式的文本内容。内容。v与调查表一致的可视数据录入界面。与调查表一致的可视数据录入界面。v数据核查功能强大且简便。数据核查功能强大且简便。v数据转换功能强大。数据转换功能强大。Company LogovEpi Data数据库包含数据库包含3个核心文件:个核心文件:v调查表文件(调查表文
4、件(.qes),用来定义调查表的结构),用来定义调查表的结构v数据文件(数据文件(.rec),用于存放数据以及已经定义),用于存放数据以及已经定义好的编码好的编码v核查文件(核查文件(.chk),用来定义数据输入时进行逻),用来定义数据输入时进行逻辑控制的有效性规划辑控制的有效性规划Company LogoEpi Info软件简介软件简介vEpi Info 应用于处理流行病学调查数据、组织研应用于处理流行病学调查数据、组织研究设计、编写结果报告的软件,能够便捷地制作适究设计、编写结果报告的软件,能够便捷地制作适应于公共卫生和医学专业的各种调查表、定制数据应于公共卫生和医学专业的各种调查表、定制
5、数据输入文件、分析数据、疾病监测等。输入文件、分析数据、疾病监测等。v流行病学常用分析、表格、统计图、疾病分布地图流行病学常用分析、表格、统计图、疾病分布地图等只需使用一些简单的命令如等只需使用一些简单的命令如FREQ、TABLES、GRAPH和和MAP就可以完成。就可以完成。Company LogoSPSS统计软件简介统计软件简介vSPSS是世界上最早的统计分析软件,由美国斯是世界上最早的统计分析软件,由美国斯坦福大学的三位研究生于坦福大学的三位研究生于20世纪世纪60年代末研制年代末研制,同时成立了,同时成立了SPSvS公司,并于公司,并于1975年在芝加哥组建了年在芝加哥组建了SPSS总
6、部总部。1984年年SPSS总部首先推出了世界上第一个总部首先推出了世界上第一个统计分析软件微机版本统计分析软件微机版本SPSS/PC+,开创了,开创了SPSS微机系列产品的开发方向,极大地扩充了微机系列产品的开发方向,极大地扩充了它的应用范围,并使其能很快地应用于自然科学它的应用范围,并使其能很快地应用于自然科学、技术科学、社会科学的各个领域,世界上许多、技术科学、社会科学的各个领域,世界上许多有影响的报刊杂志纷纷就有影响的报刊杂志纷纷就SPSS的自动统计绘图的自动统计绘图、数据的深入分析、使用方便、功能齐全等方面、数据的深入分析、使用方便、功能齐全等方面给予了高度的评价与称赞。给予了高度的
7、评价与称赞。Company LogovSPSS是世界上最早采用图形菜单驱动界面的统是世界上最早采用图形菜单驱动界面的统计软件,它最突出的特点就是操作界面极为友好计软件,它最突出的特点就是操作界面极为友好,输出结果美观漂亮。它将几乎所有的功能都以,输出结果美观漂亮。它将几乎所有的功能都以统一、规范的界面展现出来,使用统一、规范的界面展现出来,使用Windows的的窗口方式展示各种管理和分析数据方法的功能,窗口方式展示各种管理和分析数据方法的功能,对话框展示出各种功能选择项。用户只要掌握一对话框展示出各种功能选择项。用户只要掌握一定的定的Windows操作技能,粗通统计分析原理,操作技能,粗通统计
8、分析原理,就可以使用该软件为特定的科研工作服务。就可以使用该软件为特定的科研工作服务。Company LogovSPSS采用类似采用类似EXCEL表格的方式输入与管理数表格的方式输入与管理数据,数据接口较为通用,能方便的从其他数据库据,数据接口较为通用,能方便的从其他数据库中读入数据。其统计过程包括了常用的、较为成中读入数据。其统计过程包括了常用的、较为成熟的统计过程,完全可以满足非统计专业人士的熟的统计过程,完全可以满足非统计专业人士的工作需要。输出结果十分美观,存储时则是专用工作需要。输出结果十分美观,存储时则是专用的的SPO格式,可以转存为格式,可以转存为HTML格式和文本格式格式和文本
9、格式。对于熟悉老版本编程运行方式的用户,。对于熟悉老版本编程运行方式的用户,SPSS还特别设计了语法生成窗口,用户只需在菜单中还特别设计了语法生成窗口,用户只需在菜单中选好各个选项,然后按选好各个选项,然后按“粘贴粘贴”按钮就可以自动按钮就可以自动生成标准的生成标准的SPSS程序。极大的方便了中、高级程序。极大的方便了中、高级用户。用户。Company LogovSPSS的特点:的特点:v1、操作简便操作简便v2、编程方便编程方便v3、功能强大功能强大v4、全面的数据接口全面的数据接口v5、灵活的功能模块组合灵活的功能模块组合v6、针对性强、针对性强Company Logov缺点:缺点:vSP
10、SS输出结果虽然漂亮,但不能为输出结果虽然漂亮,但不能为WORD等常等常用文字处理软件直接打开,只能采用拷贝、粘贴的用文字处理软件直接打开,只能采用拷贝、粘贴的方式加以交互。方式加以交互。v对于一些比较新的、不够成熟的统计分析方法在对于一些比较新的、不够成熟的统计分析方法在SPSS中难觅芳迹。中难觅芳迹。v对于大型流行病学数据调查可能影响其资料输入的对于大型流行病学数据调查可能影响其资料输入的速度。速度。Company LogoSAS软件软件vSAS 系统全称为系统全称为Statistics Analysis System,最早由北卡罗来纳大学的两位生物统计学研究生,最早由北卡罗来纳大学的两位
11、生物统计学研究生编制,并于编制,并于1976年成立了年成立了SAS软件研究所,正式软件研究所,正式推出了推出了SAS软件。软件。SAS是用于决策支持的大型集是用于决策支持的大型集成信息系统,但该软件系统最早的功能限于统计分成信息系统,但该软件系统最早的功能限于统计分析,至今,统计分析功能也仍是它的重要组成部分析,至今,统计分析功能也仍是它的重要组成部分和核心功能。和核心功能。Company LogovSAS 系统是一个组合软件系统,它由多个功能模系统是一个组合软件系统,它由多个功能模块组合而成,其基本部分是块组合而成,其基本部分是BASE SAS模块。模块。BASE SAS模块是模块是SAS系
12、统的核心,承担着主系统的核心,承担着主要的数据管理任务,并管理用户使用环境,进行要的数据管理任务,并管理用户使用环境,进行用户语言的处理,调用其他用户语言的处理,调用其他SAS模块和产品。也模块和产品。也就是说,就是说,SAS系统的运行,首先必须启动系统的运行,首先必须启动BASE SAS模块,它除了本身所具有数据管理、程序设模块,它除了本身所具有数据管理、程序设计及描述统计计算功能以外,还是计及描述统计计算功能以外,还是SAS系统的中系统的中央调度室。它除可单独存在外,也可与其他产品央调度室。它除可单独存在外,也可与其他产品或模块共同构成一个完整的系统。各模块的安装或模块共同构成一个完整的系
13、统。各模块的安装及更新都可通过其安装程序非常方便地进行。及更新都可通过其安装程序非常方便地进行。Company LogovSAS系统具有灵活的功能扩展接口和强大的功能系统具有灵活的功能扩展接口和强大的功能模块,在模块,在BASE SAS的基础上,还可以增加如下的基础上,还可以增加如下不同的模块而增加不同的功能:不同的模块而增加不同的功能:SAS/STAT(统计分析模块)、统计分析模块)、SAS/GRAPH(绘图模块)(绘图模块)、SAS/QC(质量控制模块)、(质量控制模块)、SAS/ETS(经(经济计量学和时间序列分析模块)、济计量学和时间序列分析模块)、SAS/OR(运(运筹学模块)、筹学
14、模块)、SAS/IML(交互式矩阵程序设计(交互式矩阵程序设计语言模块)、语言模块)、SAS/FSP(快速数据处理的交互(快速数据处理的交互式菜单系统模块)、式菜单系统模块)、SAS/AF(交互式全屏幕软(交互式全屏幕软件应用系统模块)等等。件应用系统模块)等等。Company LogovSAS 是由大型机系统发展而来,其核心操作方式是由大型机系统发展而来,其核心操作方式就是程序驱动,经过多年的发展,现在已成为一套就是程序驱动,经过多年的发展,现在已成为一套完整的计算机语言,其用户完整的计算机语言,其用户v界面也充分体现了这一特点:它采用界面也充分体现了这一特点:它采用MDI(多文(多文档界面
15、),用户在档界面),用户在PGM视窗中输入程序,分析结视窗中输入程序,分析结果以文本的形式在果以文本的形式在OUTPUT视窗中输出。使用程视窗中输出。使用程序方式,用户可以完成所有需要做的工作,包括统序方式,用户可以完成所有需要做的工作,包括统计分析、预测、建模和模拟抽样等。但是,这使得计分析、预测、建模和模拟抽样等。但是,这使得初学者在使用初学者在使用SAS时必须要学习时必须要学习SAS语言,入门语言,入门比较困难。比较困难。Company LogovSAS的的Windows版本根据不同的用户群开发了版本根据不同的用户群开发了几种图形操作界面,这些图形操作界面各有特点,几种图形操作界面,这些
16、图形操作界面各有特点,使用时非常方便。但是由于国内介绍他们的文献不使用时非常方便。但是由于国内介绍他们的文献不多,并且也不是多,并且也不是SAS推广的重点,因此还不为绝推广的重点,因此还不为绝大多数人所了解。大多数人所了解。Company Logov中国医学百科全书中国医学百科全书医学统计学统计软件包医学统计学统计软件包(PEMS,Package forEncyclopaedia of Medical Statistics)第一、二版以其面向基层、第一、二版以其面向基层、方法齐全、操作简便而深受广大用户的欢迎,十五方法齐全、操作简便而深受广大用户的欢迎,十五年来年来(1986年后年后),已推广
17、发行至全国许多医药卫,已推广发行至全国许多医药卫生和教学单位,拥有大量的用户。生和教学单位,拥有大量的用户。Company LogovPEMS的主要特点如下:的主要特点如下:v、方法齐全功能完善、方法齐全功能完善:在前两版的基础上,在前两版的基础上,参考了近年国内外医学统计学专著,精选了参考了近年国内外医学统计学专著,精选了118种种实用性较强的统计方法,新增添了较多新方法,如实用性较强的统计方法,新增添了较多新方法,如Meta分析、诊断性试验等内容,极为全面、系统分析、诊断性试验等内容,极为全面、系统。并对软件进行严格测试,结果可靠。数据编辑。并对软件进行严格测试,结果可靠。数据编辑是电子表
18、格的格式,内容清晰、直观。能直接读取是电子表格的格式,内容清晰、直观。能直接读取或保存为或保存为Excel、Access、FoxPro、txt(纯文纯文本本)数据文件。编制的数据文件。编制的“结果编辑软件结果编辑软件”,可对,可对分析结果直接编辑和打印。分析结果为分析结果直接编辑和打印。分析结果为Word文件文件格式。格式。Company Logov2、易学易用、易学易用 有助教学有助教学v 整个软件采用纯中文显示、建立数据和调用分整个软件采用纯中文显示、建立数据和调用分析切换自如,操作简便。很适合基层人员使用。析切换自如,操作简便。很适合基层人员使用。v PEMS 3.1在软件的设计与使用上
19、,与当今流在软件的设计与使用上,与当今流行软件行软件(如如Office 97/2000)的界面和操作方式的界面和操作方式相同;配备的手册,对每种统计方法都有分析示例相同;配备的手册,对每种统计方法都有分析示例,并在应用条件、结果解释等方面作了简要阐述,并在应用条件、结果解释等方面作了简要阐述,与当前多种医学统计学及计算机教材保持一致。有与当前多种医学统计学及计算机教材保持一致。有助于医学统计学的计算机辅助教学或自学。助于医学统计学的计算机辅助教学或自学。Company Logov3、完善的图形处理功能、完善的图形处理功能vPEMS3.1增加了图形处理功能。能绘制常用统增加了图形处理功能。能绘制常用统计图(线图、条图、散点图、箱图、饼图),还计图(线图、条图、散点图、箱图、饼图),还可作曲线拟合图、直线回归图、生存曲线图等。可作曲线拟合图、直线回归图、生存曲线图等。对图形的颜色、坐标、刻度、标题修改极为方便对图形的颜色、坐标、刻度、标题修改极为方便,作出的图形美观实用。,作出的图形美观实用。Company LogoCompany Logo