趋化因子CXCL14基因中rs2237062 位点多态性与HBV相关课件.ppt

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1、趋化因子趋化因子CXCL14基因中基因中rs2237062位点多态性与位点多态性与HBV相关相关HCC进展有关进展有关作者姓名:顾星,戚鹏,吉强,高春芳 作者单位:第二军医大学东方肝胆外科医院实验诊断科 原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是全球最常见的癌症之一,在亚洲地区的发病率尤其高。在我国,随着感染乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)和丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)的人数增多,HCC的发生率也呈逐年上升趋势。背景介绍背景介绍病原体因素宿主的免疫应答能力宿主的遗传因素环境因素 HCC发生发展的影响因素发

2、生发展的影响因素 越来越多的研究表明人群特异的癌症遗传性与DNA序列中的多态性差异有关。人类基因组中最常见的序列变异是单个碱基的稳定替换,即单个核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)。人体许多表型差异、对药物的敏感性或疾病的易感性等都可能与SNP相关,所以已有人将SNP称为第三代遗传标志。遗传因素能够改变遗传因素能够改变HCC的风险的风险 已有相关性研究热点已有相关性研究热点 代谢酶类基因 谷胱甘肽-S-转移酶GST,N-乙酰化转移酶NAT,细胞色素P450 DNA合成及修复相关基因 X线修复交叉补体因子 XRCC,亚甲基四氢叶酸还原酶 MTHFR

3、 细胞因子及受体基因 转化生长因子-1,各类白介素及其受体 其它基因 金属基质蛋白酶MMP,p53,甲胎蛋白AFP 等等 CXCL14是趋化因子CXC家族中的成员,最早从人乳腺和肾脏组织分离得到;CXCL14蛋白参与了体内许多生物学过程的调控过程,如炎症免疫反应、肿瘤相关的血管生成、宿主对肿瘤特异性免疫的激活以及肿瘤生长的自分泌调节等方面;属于肿瘤抑制基因,肿瘤中CXCL14蛋白的表达缺失与肿瘤的发生发展有关;趋化因子趋化因子CXCL14 CXCL14多态性在肝癌中的研究多态性在肝癌中的研究 CXCL14在肝癌细胞中表达量下调,并有报道其rs2237062位点与日本人丙型肝炎相关的HCC易感性

4、有关。鉴于我国HCC类型多为HBV相关的HCC,我们采用病例-对照方法寻找这些位点在中国人群中与HBV相关HCC的关系。样本及方法样本及方法建立全血基因组DNA样本库,提取了已经收集的361例HBV相关的HCC患者、202例单纯的HBV感染者及407例正常健康对照者的基因组DNA。采用连接酶检测反应(ligase detection reaction,LDR)技术对样本在上述三个位点的基因型进行高通量SNP检测。分析各SNP位点在不同疾病组与对照组两两之间的差异性,并且进一步根据样本病理资料中的TNM分级、Child-pugh分级、纤维化情况等进行分层分析。实验结果:样本基本信息实验结果:样本

5、基本信息GroupsHealthy controls(n=407)Non-HCC patients with HBV infection(n=202)HBV-related HCC patients(n=361)Demographic parametersGender(M/F)283/124140/62325/36Age(Y)(xSD)35.111.843.810.348.410.9Laboratory parameters median(range)T-Bil a(mol/L)14(5-43)13(3-45)17(6-125)ALB a(g/L)48(41-55)48(34-54)41(25

6、-52)ALT b(U/L)17(4-130)23(9-78)45(6-2623)AFP a(ng/ml)2.1(0.6-10.5)2.1(0.5-24.4)286.8(0.5-2100.0)PLT b(109/L)192(94-341)182(51-407)134(12-695)rs2237062位点等位基因和基因型分布情况位点等位基因和基因型分布情况GroupsHealthy controls(n=407)Non-HCC patients with HBV infection(n=202)HBV-related HCC(n=361)GenotypeC/C36(8.85%)13(6.44%)

7、35(9.70%)C/G178(43.73%)94(46.53%)146(40.44%)G/G193(47.42%)95(47.03%)180(49.86%)AlleleC250(30.71%)120(29.70%)216(29.92%)G564(69.29%)284(70.30%)506(70.08%)Hardy-Weinberg equilibriump=0.58p=0.10p=0.50rs2237062rs2237062位点与位点与HCCHCC进展的关联分析进展的关联分析GroupsTNM-(%)(n=179)TNM-(%)(n=170)P valueOdds Ratio(95%CI)G

8、enotype0.055C/C14(7.8%)18(10.6%)0.1441.76(0.82-3.75)C/G64(35.8%)78(45.9%)0.025*1.66(1.07-2.60)G/G101(56.4%)74(43.5%)RefAlleleC92(25.7%)114(33.5%)0.023*1.46(1.05-2.02)G266(74.3%)226(66.5%)RefAt-risk genotypeC/C+C/G78(43.6%)96(56.5%)0.016*1.68(1.10-2.57)GG101(56.4%)74(43.5%)Ref结论结论 在被测人群的各组中,CXCL14基因中

9、rs2237062位点C/G等位基因分布频率在HCC患者中不具有统计学意义的变化;该位点与HBV相关HCC患者肿瘤TNM分级有关,C等位基因在TNM分级后期者中显著增高,CC与CG基因型也显示为肿瘤进程发展的危险因子。其他其他HBVHBV相关相关HCCHCC的的SNPSNP研究位点研究位点 细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4(CTLA-4)外显子+49 位点AG(rs2231775)位点;促肾上腺皮质素释放激素受体2(CRHR2)中rs2267716位点;神经胶质细胞来源的神经营养因子家族受体1(GFRA1)中rs12762746位点。结结 论论 在被测中国男性人群中,CTLA-4基因中rs231

10、775与HBV相关的HCC易感性具有相关性,A等位基因能够影响其发病的风险。CRHR2基因中rs2267716位点与HBV相关的HCC易感性具有相关性,C等位基因能够增加其发病的风险;此外,检测到该位点在不同基因型的肝癌组织样本中的基因转录水平存在差异;GFRA1中rs12762746位点与HBV相关的HCC肿瘤患者肝功能情况有关;G/G基因型携带者罹患HCC后肝功能损伤更易严重。展望展望 原发性肝细胞癌的发生发展是由多基因参与的一种变异渐进积累转化的过程。已有众多报道指出了多种基因SNP与HCC易感性存在相关性,并且这种相关性在不同人群中存在差异,然而大多数涉及HCC进程的遗传因子还有待研究。与此同时,高通量检测SNP的新技术正在不断发展,它将对肿瘤遗传易感性研究提供强有力的支持。越来越多的报道解释了内含子的单核苷酸多态性与疾病易感性的相关性。尽管内含子中多态性影响疾病易感性的机制研究难度较大,但是如果能攻克这一难关,建立内含子中多态性功能研究的新平台,将为人类疾病诊断和防治提供更为广阔的空间,并提供更多的手段和方法。

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