基础医学常用资源课件.ppt

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1、基础医学信息资源基础医学信息资源基础医学三大综述基础医学三大综述 生理学评论(生理学评论(Physiological Reviews)http:/physrev.physiology.org/Pharmacological Reviews药理学评论药理学评论http:/pharmrev.aspetjournals.org/临床微生物学评论(临床微生物学评论(Clinical Microbiology Reviews)http:/cmr.asm.org/微生物与分子生物学评论(微生物与分子生物学评论(Microbiology and Molecular Biology Reviews,MMBR)

2、http:/mmbr.asm.org/,http:/mmbr.asm.org/contents-by-date.0.shtml 生理学评论(生理学评论(Physiological Reviews)http:/physrev.physiology.org/美国生理学会主办美国生理学会主办 综述生理学和生物医学领域最近焦点问题综述生理学和生物医学领域最近焦点问题 2004年年JCR显示显示IF值为值为33.918,2005年年JCR显示显示IF值为值为28.721,居生理学期刊之首,居生理学期刊之首 于出版前约于出版前约3-4周预先公布将出版的计划目次表周预先公布将出版的计划目次表,出版出版12个

3、月后全文免费个月后全文免费 该杂志综述相当于记述某专题研究历史和最新进该杂志综述相当于记述某专题研究历史和最新进展的专著。均由世界著名生理学家撰写。展的专著。均由世界著名生理学家撰写。每篇约两万字,文中附相应的图表。参考文献数每篇约两万字,文中附相应的图表。参考文献数百篇,发表年份跨时约一个世纪。百篇,发表年份跨时约一个世纪。生理学评论(生理学评论(Physiological Reviews)http:/physrev.physiology.org/除生理学以外,还涉及综合自然科学、综合医学、除生理学以外,还涉及综合自然科学、综合医学、生命科学基础综合(包括解剖、组胚、生化、分生命科学基础综合

4、(包括解剖、组胚、生化、分子生物、细胞生物、生物学、动物学)、临床医子生物、细胞生物、生物学、动物学)、临床医学(包括呼吸病学、癌症、循环等)。学(包括呼吸病学、癌症、循环等)。在参考文献下方,提供引用该文的主要论文的题在参考文献下方,提供引用该文的主要论文的题录信息和全文链接。该杂志的综述论文被其它学录信息和全文链接。该杂志的综述论文被其它学科书刊引用极为广泛,往往也涉及综合自然科学、科书刊引用极为广泛,往往也涉及综合自然科学、综合医学及基础医学各学科。可以说,该刊的学综合医学及基础医学各学科。可以说,该刊的学术影响遍及基础医学各学科和临床医学许多相关术影响遍及基础医学各学科和临床医学许多相

5、关学科。学科。生理学评论(生理学评论(Physiological Reviews)http:/physrev.physiology.org/提供参考文献、引用该文文献列表与链接,提供参考文献、引用该文文献列表与链接,尤其后者只给出其中的精要,主要作用是尤其后者只给出其中的精要,主要作用是帮助读者快速追溯与该文密切相关的文献帮助读者快速追溯与该文密切相关的文献和密切相关的最新研究,起到为读者导读、和密切相关的最新研究,起到为读者导读、辅助读者精读的作用。辅助读者精读的作用。生理学评论(生理学评论(Physiological Reviews)http:/physrev.physiology.org

6、/提供文章的可视化引证图,直观地反映该文提供文章的可视化引证图,直观地反映该文引用其它杂志论文和被其它杂志论文引用的引用其它杂志论文和被其它杂志论文引用的情况,帮助读者了解该文和刊载该文的杂志情况,帮助读者了解该文和刊载该文的杂志与哪些论文和杂志存在着相互影响,进而了与哪些论文和杂志存在着相互影响,进而了解学科间交叉渗透的情况。可取与该文存在解学科间交叉渗透的情况。可取与该文存在引证关系的文献记录集中(以引证关系的文献记录集中(以HighWire为统为统计数据源)按被引频次降序排列的前计数据源)按被引频次降序排列的前10、15、20、25、30条引证记录查看可视图。图下提条引证记录查看可视图。

7、图下提供图中显示出来的引证记录的题录信息以及供图中显示出来的引证记录的题录信息以及摘要和全文链接,或者在图中直接点击文献摘要和全文链接,或者在图中直接点击文献记录也可查看这些信息。记录也可查看这些信息。生理学评论(生理学评论(Physiological Reviews)http:/physrev.physiology.org/Pharmacological Reviews药理学评论药理学评论http:/pharmrev.aspetjournals.org/美国药理学与实验治疗学会主办的综述杂志。美国药理学与实验治疗学会主办的综述杂志。季刊。登载对当前研究热点问题的综述文章。季刊。登载对当前研究

8、热点问题的综述文章。内容包括:生化与细胞药理学、药物代谢与内容包括:生化与细胞药理学、药物代谢与分布、肾脏药理学、神经药理学、行为药理分布、肾脏药理学、神经药理学、行为药理学、临床药理学和毒理学。学、临床药理学和毒理学。2004年年JCR显示显示IF值为值为22.837,列药理学与药学杂志之,列药理学与药学杂志之首首.2005年年IF值值15.689。每一篇综述都精辟而全面地阐述了药理学领每一篇综述都精辟而全面地阐述了药理学领域某专题研究的进展情况,相关于专题专著。域某专题研究的进展情况,相关于专题专著。微生物与分子生物学评论(微生物与分子生物学评论(Microbiology and Mole

9、cular Biology Reviews,MMBR)http:/mmbr.asm.org/,http:/mmbr.asm.org/contents-by-date.0.shtml 1937年创刊,其前身为年创刊,其前身为Microbiological Reviews。1992年,更为现名,同时分出一种临年,更为现名,同时分出一种临床综述刊床综述刊Clinical Microbiology Reviews。美。美国微生物学会主办。每年国微生物学会主办。每年4期。评论涉及微生物学、期。评论涉及微生物学、免疫学、分子与细胞生物学,为读者介绍有关细菌、免疫学、分子与细胞生物学,为读者介绍有关细菌、病

10、毒、寄生虫、真菌以及其它真核细胞生物研究的病毒、寄生虫、真菌以及其它真核细胞生物研究的最新发现。内容范畴有生理学与酶学、分子生物学、最新发现。内容范畴有生理学与酶学、分子生物学、遗传学、生态学、引发疾病的宿主遗传学、生态学、引发疾病的宿主-寄生虫关系、细寄生虫关系、细胞生物学、病毒学。胞生物学、病毒学。出版出版12个月后全文在线免费。个月后全文在线免费。临床微生物学评论临床微生物学评论(Clinical Microbiology Reviews)http:/cmr.asm.org/1988年创刊。美国微生物学会主办。年创刊。美国微生物学会主办。2004年年JCR显示显示IF值为值为10.671

11、,居,居141种刊种刊第第3位。位。2005年年IF值值10.443。文献出版。文献出版12个个月后全文在线免费。月后全文在线免费。主要学术机构及其信息资源主要学术机构及其信息资源 American Association of Anatomists(AAA)http:/www.anatomy.org/美国解剖学家协会成立于美国解剖学家协会成立于1888年,其成立宗年,其成立宗旨是旨是“推动解剖科学的发展推动解剖科学的发展”。目前已成为。目前已成为致力于解剖学形态与功能研究的生物医学研致力于解剖学形态与功能研究的生物医学研究与教育人员的专业学术组织。全世界究与教育人员的专业学术组织。全世界AA

12、A会员们既是为各医学院校医学生授课的首发会员们既是为各医学院校医学生授课的首发教育者,同时又投身成像学、细胞生物学、教育者,同时又投身成像学、细胞生物学、遗传学、分子发育学、内分泌学、组织学、遗传学、分子发育学、内分泌学、组织学、神经科学、法医学、电子显微镜、体质人类神经科学、法医学、电子显微镜、体质人类学、以及其它领域。学、以及其它领域。AAA杂志杂志 解剖学记录(解剖学记录(The Anatomical Record)http:/ 始创于始创于1906年,年,1908年从美国解剖学家协会最早的年从美国解剖学家协会最早的机关刊机关刊美国解剖学杂志美国解剖学杂志(1901年创刊)中分离年创刊)

13、中分离出来,独立刊行至今。自出来,独立刊行至今。自1996年该杂志分为两部分,年该杂志分为两部分,分别是:分别是:The Anatomical Record Part A:Discoveries in Molecular,Cellular,and Evolutionary Biology和和The Anatomical Record Part B:The New Anatomist。每年出。每年出版版18期。杂志提供有关生物结构及其功能意义研究期。杂志提供有关生物结构及其功能意义研究的论坛,杂志论文内容包括正规研究报告、综述、的论坛,杂志论文内容包括正规研究报告、综述、特殊通信等。特殊通信等。

14、AAA杂志杂志 发育动力学(发育动力学(Developmental Dynamics)http:/ 1901年创刊,创刊刊名为年创刊,创刊刊名为American Journal of Anatomy美国解剖学杂志美国解剖学杂志(1901-1991),),1992年改为现名。现每年出版年改为现名。现每年出版12期。期。该杂志的更名充分标示着解剖学研究方向和该杂志的更名充分标示着解剖学研究方向和方法的历史性转折。更名后,该刊内容为发方法的历史性转折。更名后,该刊内容为发育生物学家提供有关动物发育过程中形态出育生物学家提供有关动物发育过程中形态出现和控制形态形成机理方面的研究成果。现和控制形态形成机

15、理方面的研究成果。美国生理学会(美国生理学会(American Physiological Society,APS)http:/www.the-aps.org/美国生理学会是致力于生理科学教育、科美国生理学会是致力于生理科学教育、科研和信息发布的非营利性组织。成立于研和信息发布的非营利性组织。成立于1887年。总部设在马里兰州的年。总部设在马里兰州的Bethesda,地处美国实验生物学会联合会(地处美国实验生物学会联合会(the Federation of American Societies for Experimental Biology,FASEB)的园区的园区内,是内,是FASEB的的

16、18个成员学会之一。个成员学会之一。课堂练习:课堂练习:APS都主办哪些杂志(和杂志都主办哪些杂志(和杂志分辑)?列举出来。分辑)?列举出来。American Society for Pharmacology&Experimental Therapeuticshttp:/www.aspet.org/美国药理学和实验治疗学会成立于美国药理学和实验治疗学会成立于1908年,由年,由John J.Abel邀集了邀集了18位药理学家组建而成。网位药理学家组建而成。网站站“Training Program”栏目下提供有美国各大栏目下提供有美国各大学药理学系学药理学系/院院/部及研究所名录及链接,包括本部

17、及研究所名录及链接,包括本科、研究生、博士和博士后培训系部和研究所的科、研究生、博士和博士后培训系部和研究所的链接以及世界各地药理学研究生培训项目的名簿链接以及世界各地药理学研究生培训项目的名簿链接。此外还有丰富的教育资源和药理学相关资链接。此外还有丰富的教育资源和药理学相关资源链接。源链接。课堂练习:查该学会主要出版物有哪些?它们的课堂练习:查该学会主要出版物有哪些?它们的内容特征?内容特征?The American Society for Biochemistry and Molecular Biology(ASBMB)http:/www.asbmb.org/ASBMB/site.nsf

18、美国生物化学与分子生物学会始建于美国生物化学与分子生物学会始建于1906年,学会年,学会驻址在马里兰州的驻址在马里兰州的Bethesda,即,即FASEB园区内。园区内。现有会员现有会员11900人,属非营利性科教组织。其宗旨人,属非营利性科教组织。其宗旨是是“Promoting understanding of the molecular nature of life processes”。The American Society for Cell Biology(ASCB)http:/www.ascb.org/Research Collaboratory for Structural Bi

19、oinformatics(RCSB)http:/www.rcsb.org/index.html Biophysical Society http:/www.biophysics.org/National Human Genome Research Institute(NHGRI)http:/www.genome.gov/美国国立人类基因组研究所前身是国立人美国国立人类基因组研究所前身是国立人类基因组研究中心(类基因组研究中心(the National Center for Human Genome Research,NCHGR)。该中心创建于。该中心创建于 1989年,使命是年,使命是在国际人

20、类基因组计划(在国际人类基因组计划(the International Human Genome Project,HGP)中实施)中实施美国国立卫生研究院(美国国立卫生研究院(the National Institutes of Health,NIH)的任务。)的任务。美国美国Whitehead生物医学研究所基因组研生物医学研究所基因组研究中心(究中心(The Center for Genome Research at the Whitehead Institute for Biomedical Research)(http:/www.genome.wi.mit.edu)该中心该中心web服务

21、器提供以下信息:基因组服务器提供以下信息:基因组序列、基因组图谱、基因组中心的软件以序列、基因组图谱、基因组中心的软件以及该中心的研究人员。其中软件组中的及该中心的研究人员。其中软件组中的Primer3程序可自动设置程序可自动设置PCR最佳引物,从最佳引物,从中可获得设计最佳引物应满足的条件和原中可获得设计最佳引物应满足的条件和原则。则。American Society for Microbiology,ASM http:/www.asm.org/该学会主办该学会主办12种杂志(种杂志(Antimicrobial Agents and Chemotherapy、Applied and Envi

22、ronmental Microbiology、Clinical and Vaccine Immunology(2006)(前身为前身为Clinical and Diagnostic Laboratory Immunology)、Clinical Microbiology Reviews、Eukaryotic Cell、Infection and Immunity、Journal of Bacteriology、Journal of Clinical Microbiology、Journal of Virology、Microbiology and Molecular Biology Revie

23、ws、Molecular and Cellular Biology、Minireview Collection of all Journals),覆盖微生物学所有范畴),覆盖微生物学所有范畴从分子与细胞生物学到生物医学研究与技术。这从分子与细胞生物学到生物医学研究与技术。这12种杂志构种杂志构成了美国微生物学会的核心资源。所有成了美国微生物学会的核心资源。所有ASM的出版物都可的出版物都可以通过以通过http:/www.asmpress.org查阅。查阅。生物化学、分子生物学与遗传学大刊生物化学、分子生物学与遗传学大刊 生物化学杂志(生物化学杂志(Journal of Biological C

24、hemistry,JBC)http:/www.jbc.org Cell http:/ Nature Genetics自然遗传学自然遗传学http:/ Nature Publishing Group(http:/ of Biological Chemistry,JBC)http:/www.jbc.org 由美国生物化学与分子生物学会(由美国生物化学与分子生物学会(American Society for Biochemistry and Molecular Biology,ASBMB,http:/www.asbmb.org/ASBMB/site.nsf)主办。)主办。1905年创刊。周刊,每年原

25、始研年创刊。周刊,每年原始研究报告总印数达究报告总印数达55000多页。有印刷本和电子版两多页。有印刷本和电子版两种刊载载体。原始研究论文经同行评议确认对生物种刊载载体。原始研究论文经同行评议确认对生物化学、分子生物学领域有创新性重要贡献才能予以化学、分子生物学领域有创新性重要贡献才能予以发表。发表。可采用常规发表和快速发表两种形式。前者录用率可采用常规发表和快速发表两种形式。前者录用率约为约为15%,后者,后者5%。快速发表的研究成果要求特。快速发表的研究成果要求特别具有新颖性、创造性、重要性并特别吸引读者。别具有新颖性、创造性、重要性并特别吸引读者。稿件一旦获准录用,将在稿件一旦获准录用,

26、将在24小时内进入小时内进入“JBC Papers in Press”在网上公布。相应地,如果论文在网上公布。相应地,如果论文中涉及到新认定的生物大分子结构,那么新的结构中涉及到新认定的生物大分子结构,那么新的结构信息也必须同步录入信息也必须同步录入Protein Data Bank。生物化学杂志(生物化学杂志(Journal of Biological Chemistry,JBC)http:/www.jbc.org JBC论文按内容分编,主要类目有方法学、论文按内容分编,主要类目有方法学、测序与克隆、酶学、蛋白与蛋白相互作用、测序与克隆、酶学、蛋白与蛋白相互作用、转录、代谢调节与基因表达、翻

27、译后修饰、转录、代谢调节与基因表达、翻译后修饰、糖生物学(糖生物学(glycobiology)、蛋白突变分析、)、蛋白突变分析、转基因与敲除、功能性基因组蛋白质组分析、转基因与敲除、功能性基因组蛋白质组分析、生物信息学、用流式细胞计数研究细胞周期生物信息学、用流式细胞计数研究细胞周期与凋亡、与凋亡、RNAi。JBI还设有小综述栏目,发还设有小综述栏目,发表对当前热点问题的特邀小综述。表对当前热点问题的特邀小综述。2004年年JCR显示该刊显示该刊IF值为值为6.355,居上述,居上述388种期种期刊的第刊的第43位,位,2005年年IF值值5.854。文献出版。文献出版后一年全文免费。后一年全

28、文免费。Nature Genetics http:/ Nature Publishing Group(http:/ Genetics http:/ 杂志设有编者述评、通信杂志设有编者述评、通信(Correspondence)、书、书评、新闻与观点、综述、短篇通讯评、新闻与观点、综述、短篇通讯(Brief Communications)、原始论文、读者来信、原始论文、读者来信(Letters)等栏目。)等栏目。通信通信(Correspondence)原为原为Letters to the Editor,登载读者感兴趣的问题,可以是政策争论,也可以登载读者感兴趣的问题,可以是政策争论,也可以是由研究

29、论文引发的问题公告,该类文章的原始研是由研究论文引发的问题公告,该类文章的原始研究数据要求以摘要形式描述。究数据要求以摘要形式描述。短篇通讯短篇通讯(Brief Communications)报告高质量且具报告高质量且具有广泛兴趣的简洁研究成果。有广泛兴趣的简洁研究成果。读者来信(读者来信(Letters)发表重要的新的研究成果,但)发表重要的新的研究成果,但其重要性又较原始论文(其重要性又较原始论文(Articles)次之。)次之。2004年是年是24.695,均居,均居120种遗传学种遗传学(Genetics&Hereditary)期刊的首位。期刊的首位。2005年年IF值值25.797。

30、权威知识库权威知识库 The Visible Human Project http:/www.nlm.nih.gov/research/visible/visible_human.html 人类可视化计划是美国国立卫生研究院国立医学图人类可视化计划是美国国立卫生研究院国立医学图书馆书馆1986年长期计划的产物,它展现正常的人类男年长期计划的产物,它展现正常的人类男性与女性机体的全面的、解剖学上十分详尽的、三性与女性机体的全面的、解剖学上十分详尽的、三维结构。也包括具有代表性的男性和女性尸体的横维结构。也包括具有代表性的男性和女性尸体的横断面断面CT、MR和和cryosection成像。横断间隔

31、男性成像。横断间隔男性为一毫米,女性为三分之一毫米。人类可视化计划为一毫米,女性为三分之一毫米。人类可视化计划的长期目标是建构一个大型知识结构体系,在可视的长期目标是建构一个大型知识结构体系,在可视图像与知识符号(如机体部位名称)之间建立显而图像与知识符号(如机体部位名称)之间建立显而易见的连接。计划的承建者是科罗拉多大学卫生科易见的连接。计划的承建者是科罗拉多大学卫生科学中心的人类模拟中心学中心的人类模拟中心(http:/www.uchsc.edu/sm/chs/)和国立大气研究和国立大气研究中心中心(http:/www.ucar.edu/redirects/404.shtml)。权威知识库

32、权威知识库 虚拟器官库虚拟器官库Virtual Organ Library http:/www.anatomy.org/Education/virtual_organ_image_library/default.asp 由美国解剖学家协会由美国解剖学家协会(http:/www.anatomy.org/)提供,由其主)提供,由其主页将鼠标置于页将鼠标置于“Education&Teaching Tools”处即见处即见“Virtual Organ Image Library”,点击即进入该库页面。该网页提,点击即进入该库页面。该网页提供了丰富的解剖学图谱和成像资料的链接,供了丰富的解剖学图谱和成像

33、资料的链接,每一库都包含极为丰富的图像资料。每一库都包含极为丰富的图像资料。练习:该库有哪些类图像库?练习:该库有哪些类图像库?权威知识库权威知识库 PhysioNet-the research resource for complex physiologic signals http:/www.physionet.org/“综合生理学信号研究资源综合生理学信号研究资源”是一个由波士顿是一个由波士顿Beth Israel Deaconess医学中心医学中心/哈佛大学、哈佛大学、波士顿大学、麦吉尔大学和波士顿大学、麦吉尔大学和MIT的研究人员,的研究人员,在美国国立卫生研究院的国立研究资源中心在

34、美国国立卫生研究院的国立研究资源中心的赞助下,合作开发的项目。该项目旨在激的赞助下,合作开发的项目。该项目旨在激发综合生物医学和生理学信号领域的新研究。发综合生物医学和生理学信号领域的新研究。共有三个紧密联系的组成部分:共有三个紧密联系的组成部分:权威知识库权威知识库-PhysioNet(一)(一)PhysioNet PhysioNet是一个在线论坛,通过提供数据是一个在线论坛,通过提供数据合作分析以及新算法评估的设施来分发交换合作分析以及新算法评估的设施来分发交换生物医学信号记录及其分析的开放使用软件。生物医学信号记录及其分析的开放使用软件。除提供除提供PhysioBank数据和数据和Phy

35、sioToolkit软软件的免费电子获取入口外,件的免费电子获取入口外,PhysioNet还通还通过在线指南(过在线指南(PhysioNet Tutorial)提供用)提供用户服务与培训。户服务与培训。权威知识库权威知识库-PhysioBank(二)(二)PhysioBank PhysioBank是一个大型的逐渐扩增的生理学信号和相关数是一个大型的逐渐扩增的生理学信号和相关数据的数字化记录文档,目前包括多参数的心肺、神经和其他据的数字化记录文档,目前包括多参数的心肺、神经和其他生物医学信号,信号来自健康受试者和各种疾病的患者,涉生物医学信号,信号来自健康受试者和各种疾病的患者,涉及到的患者疾病

36、包括心脏猝死、充血性心衰、癫痫、步态不及到的患者疾病包括心脏猝死、充血性心衰、癫痫、步态不稳、睡眠呼吸暂停和衰老。这些数据库有三类,一类是完全稳、睡眠呼吸暂停和衰老。这些数据库有三类,一类是完全参考数据库(参考数据库(completed reference databases,Class 1),二类是支持已发表研究的原始数据的文档拷贝,由作),二类是支持已发表研究的原始数据的文档拷贝,由作者和期刊投交(者和期刊投交(archival copies of raw data that support published research,contributed by authors or jour

37、nals,Class 2),第三类是其它来源数据集,包括进行中的工作),第三类是其它来源数据集,包括进行中的工作(other contributed collections of data,including works in progress,Class 3)。作为对研究团体的服务,)。作为对研究团体的服务,第二类和第三类数据可通过第二类和第三类数据可通过PhysioNet获得。投交的数据一获得。投交的数据一经接受,都放在第二类和第三类,经同行评议和公众评论期经接受,都放在第二类和第三类,经同行评议和公众评论期后可能转入第一类。后可能转入第一类。练习:按数据特征例举介绍这些数据库。权威知识库

38、权威知识库 Goodman and Gilmans The Pharmacological Basis of Therapeutics(古德曼古德曼 吉尔曼治疗学的药理学基吉尔曼治疗学的药理学基础础)这是一本经典的药理学名著,被誉为这是一本经典的药理学名著,被誉为“药理学的蓝色圣经药理学的蓝色圣经”。各论按药物的药理学作用编排。网上可见各论按药物的药理学作用编排。网上可见http:/有售。目前尚未发现该书有网络有售。目前尚未发现该书有网络版。版。2006年将由年将由McGraw-Hill Professional公司出版第公司出版第11版,版,Laurence Brunton、John Laz

39、o和和Keith Parker主编。主编。该书是医学药理学名著,反映药物作用和药物该书是医学药理学名著,反映药物作用和药物-疾病相互作疾病相互作用所有重要的最新进展。用所有重要的最新进展。药理学领域最受关注的教科书;最全面的药理学信息资源,药理学领域最受关注的教科书;最全面的药理学信息资源,内容涵盖所有药物种类和所有器官系统,也包括临床疾病条内容涵盖所有药物种类和所有器官系统,也包括临床疾病条目;适时更新,反映最有重要价值的新进展;增设新章节目;适时更新,反映最有重要价值的新进展;增设新章节“药物转运药物转运”、“药物代谢药物代谢”、“药物基因组学药物基因组学”;各章末;各章末附以临床概述附以

40、临床概述主要药物原型临床应用相关的基本概念主要药物原型临床应用相关的基本概念.权威知识库权威知识库 CHEMINFO:Chemical Information Resources(Wiggins at Indiana)http:/www.indiana.edu/cheminfo/印第安娜大学化学信息资源有印第安娜大学化学信息资源有:Chemical Acronyms Database(CAD)化学物质缩写词库,共化学物质缩写词库,共11000多条款目链多条款目链至缩写词的全称;至缩写词的全称;Chemical Reference Sources Database(CRSD)化学参考材料库,其中

41、包括印本参考资化学参考材料库,其中包括印本参考资源、商业数据库和软件;源、商业数据库和软件;Faculty Publications of the Indiana University Department of Chemistry(FACPUB);Indiana University Molecular Structure Center(IUMSC)可溶性晶体结构数据库及使其可视的可溶性晶体结构数据库及使其可视的Java程序。程序。WHO-Guide to Good Prescribing http:/www.med.rug.nl/pharma/ggp.htm WHO良方实践手册良方实践手册

42、,有图解和纯文本两种版本。另有,有图解和纯文本两种版本。另有WHO基本药物标准目录基本药物标准目录2005年年14版,版,WHO模式处模式处方集方集2004年版。年版。权威知识库权威知识库 美国国立医学图书馆化学信息数据库(美国国立医学图书馆化学信息数据库(NLM Chemical Information SIS-specialized information services,http:/sis.nlm.nih.gov/chemical.html ChemIDplus 内含逾内含逾370,000种化学物质、种化学物质、synonyms、结构、结构、regulatory list inform

43、ation及到其它数据库的链接。该库有及到其它数据库的链接。该库有两种检索方式:一是两种检索方式:一是ChemIDplus Lite,以,以化学物质名称和登记号来检索;二是化学物质名称和登记号来检索;二是ChemIDplus Advanced,以登记号、化学,以登记号、化学物质名称、分子式、结构式、物理和毒理性物质名称、分子式、结构式、物理和毒理性质以及定位和分类数据来检索和显示。质以及定位和分类数据来检索和显示。权威知识库权威知识库 CenterWatch Clinical Trials Listing Service http:/ Listings 通过治疗部位(人体器官系统)检索通过治疗

44、部位(人体器官系统)检索临床试验项目;临床试验项目;Clinical Trial Results 临床试验结临床试验结果数据库;果数据库;Drugs in Clinical Trials 临床试验药物临床试验药物数据库;患者用药指南和相关临床研究信息。数据库;患者用药指南和相关临床研究信息。The Merck Index OnlineSM (Last Loaded on Web:September 13,2005,Last Update To Bluesheet:June 24,2003)http:/ 世界著名的世界著名的默克索引默克索引网络版。数据库的记录来网络版。数据库的记录来自大约自大约

45、800种国际化学、生物医学、临床医学杂志;种国际化学、生物医学、临床医学杂志;30多个国家注册的专利;图书;会议录;其它标准多个国家注册的专利;图书;会议录;其它标准参考著作。参考著作。权威知识库权威知识库 TOXNET http:/toxnet.nlm.nih.gov/该网站由美国国立医学图书馆特殊信息服务部该网站由美国国立医学图书馆特殊信息服务部(The Division of Specialized Information Services,SIS,http:/sis.nlm.nih.gov/)主持的)主持的毒理与环境卫生信息项目(毒理与环境卫生信息项目(Toxicology and E

46、nvironmental Health Information Program,TEHIP,http:/tox.nlm.nih.gov)创建,网站主要)创建,网站主要提供毒理学数据库、有害化学物质、环境卫生等方提供毒理学数据库、有害化学物质、环境卫生等方面的内容。面的内容。课堂练习:查看该网站主要资源有哪些?课堂练习:查看该网站主要资源有哪些?权威知识库权威知识库 Protein Data Bank,PDB http:/www.rcsb.org/pdb/PDB是世界上唯一一个国际性的处理实验测是世界上唯一一个国际性的处理实验测定的高分子三维结构数据的仓库。主要由定的高分子三维结构数据的仓库。主

47、要由Rutgers(新泽西州立大学)和圣地亚哥超(新泽西州立大学)和圣地亚哥超型计算机中心(加利福尼亚大学)维护。其型计算机中心(加利福尼亚大学)维护。其它参与数据处理的机构有驻址在英国的欧洲它参与数据处理的机构有驻址在英国的欧洲生物信息研究所大分子结构数据库组(生物信息研究所大分子结构数据库组(the European Bioinformatics Institute Macromolecular Structure Database group)和日本大阪大学的蛋白质研究所)和日本大阪大学的蛋白质研究所。权威知识库权威知识库 ExPASy Proteomics Server http:/u

48、s.expasy.org/蛋白质分析专家系统蛋白质分析专家系统ExPASy(Expert Protein Analysis System)是瑞士生物信息)是瑞士生物信息研究所(研究所(Swiss Institute of Bioinformatics,SIB)创建的蛋白质组学服务器,用于分析)创建的蛋白质组学服务器,用于分析蛋白质序列和结构以及蛋白质序列和结构以及2维聚丙烯酰胺凝胶电维聚丙烯酰胺凝胶电泳(泳(2-D PAGE)。)。该系统网站还提供一系列其它软件工具,如该系统网站还提供一系列其它软件工具,如蛋白质组学和序列分析工具、蛋白质组学和序列分析工具、2-D PAGE分析分析工具、质谱分

49、析工具等。工具、质谱分析工具等。权威知识库权威知识库 UniProt(Universal Protein Resource)http:/us.expasy.org/sprot/UniProt由由SIB和和EBI(European Bioinformatics Institute欧洲生物信息学研究所欧洲生物信息学研究所http:/www.ebi.ac.uk/)的的Swiss-Prot数据库组开发数据库组开发而成,包括两部分,即而成,包括两部分,即Swiss-Prot(蛋白质知识库)(蛋白质知识库)和和TrEMBL(对(对Swiss-Prot的计算机注释补充)。的计算机注释补充)。前者是蛋白质序列

50、注释数据库,库中描述蛋白质功前者是蛋白质序列注释数据库,库中描述蛋白质功能、其域结构、翻译后修饰我、变异等等。能、其域结构、翻译后修饰我、变异等等。后者是后者是Swiss-Prot的补集,包括所有尚未整合入的补集,包括所有尚未整合入Swiss-Pro的的EMBL核苷酸序列款目的翻译。核苷酸序列款目的翻译。权威知识库权威知识库 Database of Macromolecular Movements with Associated Tools for Flexibility and Geometric Analysis http:/molmovdb.mbb.yale.edu/molmovdb/数

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