癌肿瘤遗传学优质课件.pptx

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1、 如何揭示肿瘤发生的遗传机制呢?如何揭示肿瘤发生的遗传机制呢?遗传学家与临床肿瘤学家们从(群体、遗传学家与临床肿瘤学家们从(群体、细胞、生化、免疫)遗传学和分子遗传学细胞、生化、免疫)遗传学和分子遗传学不同角度探讨肿瘤与遗传的关系,就逐渐不同角度探讨肿瘤与遗传的关系,就逐渐形成了一门新学科形成了一门新学科癌分子遗传学。癌分子遗传学。简言之,简言之,就是应用遗传学的基本原理、就是应用遗传学的基本原理、方法研究肿瘤的发生、发展与遗传的关系方法研究肿瘤的发生、发展与遗传的关系及规律,揭示肿瘤发生机理。及规律,揭示肿瘤发生机理。2 2、癌与肿瘤的概念癌与肿瘤的概念 单细胞生物为了生长,必须对环境单细胞

2、生物为了生长,必须对环境的变化产生反应,细胞为了营养的来源的变化产生反应,细胞为了营养的来源和生长、分裂,与周围的细胞竞争,直和生长、分裂,与周围的细胞竞争,直至营养供应被耗尽。至营养供应被耗尽。进化创造了多细胞生物进化创造了多细胞生物多细胞多细胞机体机体,高等生物。,高等生物。良、恶性肿瘤的基本区别:良、恶性肿瘤的基本区别:肿瘤是由连续无休止生长,且分化差的细胞肿瘤是由连续无休止生长,且分化差的细胞组成,一般有良、恶性之分。组成,一般有良、恶性之分。1 1)良性肿瘤的特征(异形性与周围组织差异不良性肿瘤的特征(异形性与周围组织差异不显著)显著);2)2)细胞被周围正常组织所局限,常有一层纤维

3、结细胞被周围正常组织所局限,常有一层纤维结缔组织包围;缔组织包围;3 3)生长缓慢,呈膨胀性,对周围组织不具侵袭生长缓慢,呈膨胀性,对周围组织不具侵袭破坏性破坏性,不发生远处转移。不发生远处转移。Martin和Vogt证实哺乳动物Bcl-2基因家族与CED-9在结构和功能上相似,但分为促进和抑制亚群。继发性异常是癌变过程中细胞分裂、增殖过程紊乱的结果,是随机的,因而,染色体多种多样,这可以解释肿瘤染色体异常的多样性。接种重要的凋亡调控基因1)减少对生长因子的需求。哺乳动物Caspases与CED-3同源;c)形成继发性肿瘤。杂合性丢失(Lossofheterozygosity,LOH)组)逆转

4、录病毒。与细胞凋亡进程密切相关的线粒体;五、癌的多阶段演化细胞凋亡-与肿瘤例如:1日龄鸡产生B细胞淋巴瘤如Fas、TNFR等、紫外线照射和电离辐射、抗癌药物、生长因子缺乏、过度表达某些特定的癌基因和抑癌基因等。原发性异常是致癌因子作用于遗传物质的直接结果,表现为基因突变或染色体畸变是非随机的,有时甚至是高度特异性的。微细胞(含单个染色体)3kb,编码4649a的蛋白质。其中一些遗传性肿瘤按照经典的孟德尔方式传递,但在更多情况下人类遗传的只是对肿瘤的易感性,并非亲代把肿瘤直接传给子代,遗传的只是单个基因,它在肿瘤发生上起了重要作用,即易感基因。肿瘤细胞遗传学研究表明:几乎所有肿瘤 所有生物生存于

5、自然界中和环境有着所有生物生存于自然界中和环境有着千丝万缕的联系,密不可分,人们所处千丝万缕的联系,密不可分,人们所处的环境之中有:的环境之中有:一些学者提出应区别两类染色体畸变1)简述肿瘤染色体异常机制Intracellularsignaltransducers哺乳动物Bcl-2基因家族与CED-9在结构和功能上相似,但分为促进和抑制亚群。杂合性丢失(Lossofheterozygosity,LOH)-癌基因Sarcoma:源于间叶组织(肌肉、骨、软骨、多共同的异常表现,它们都来源于一个共同的如Fas、TNFR等、紫外线照射和电离辐射、抗癌药物、生长因子缺乏、过度表达某些特定的癌基因和抑癌基

6、因等。1)恶性肿瘤的特征(异形性与周围组织相差大、显著)三、癌的染色体异常Bcl-2基因家族:新发现的成员使Bcl-2基因家族越来越庞大。Burkitt淋巴瘤14q+。细胞进入G1/S期,端粒酶活性逐渐增高,而在S期活性最高,在G2期/M期端粒酶活性逐渐消失。患者沿躯干的外周神经有多发的神经纤维瘤,皮肤上可见多个浅棕色的牛奶咖啡斑,腋窝有广泛的雀斑,(少数)患者有恶变倾向性。例如:1日龄鸡产生B细胞淋巴瘤FISH-检测EGFR基因扩增生、发展的遗传易感性。DCC17chr其它chrMMR基因功能丧失需要两次突变事件。疾病 染色体异常 易患肿瘤12GGTGCT重要的特异性标记染色体如何解释同一种

7、肿瘤既有遗传型的又有散发型,而且发病年龄不同哪?例如:1日龄鸡产生B细胞淋巴瘤M人类MMR系统与肿瘤1)TSG的发现及其研究途径(TSG存在的证据)(ALV)另外,已知150多种特异的肿瘤染色体断裂点。A正常情况pRb激活失活如:肿瘤组织中DNA常有异常甲基化作用。恶性肿瘤的发生涉及二次以上的突变,在遗传型的恶性肿瘤中,遗传的是一次生殖细胞的突变,在此基础上再发生一次体细胞突变即可完成始动,从正常细胞转化为恶性细胞。Bloom综合征四射体、SCE比易患肿瘤、继发性异常的意义在于扩大原发性效应的作用。80年代末期开始成为肿瘤病因学、病理学研究热点,人们对细胞凋亡的认识逐渐深入,对细胞凋亡发生分子

8、机理的了解越来越透彻,然而也发现这一过程远非原来想象的那样简单,而是包含了复杂的调控机制。复制差错研究认为,点突变是癌发生的始动因素,即早期变化。癌家族(Cancerfamily)是指一个家系中恶性肿瘤的发病率高,发病年龄较早,肿瘤按常染色体显性方式遗传。3)生长缓慢,呈膨胀性,对周围组织不具侵袭破坏性,不发生远处转移。LOH性母细胞瘤。肿瘤遗传基础的证据最初来自于三方面:这种机会很少,需要漫长过程的积累,所以散发型肿瘤多为单侧发病,发病年龄晚。结构异常都和增变基因突变相关。突变型在另一条染色上(Xa)上述我们提到肿瘤或癌形成的前提是细胞突变:M面部血管扩张性畸变MutS激活RISC需要一个A

9、TP依赖的将小分子RNA解双链的过程。Apoptosis复制终止C过度增殖就形成癌(Cancer,恶性)其中端粒酶是最主要因素。ras基因及产物的调节机制如Fas、TNFR等、紫外线照射和电离辐射、抗癌药物、生长因子缺乏、过度表达某些特定的癌基因和抑癌基因等。这种转录后基因沉默机制(post-transcriptionalgenesilencing,PTGS)被称为RNA干扰(RNAi)。pRb蛋白pRb蛋白某些肿瘤是按孟德尔方式遗传的,亦即单基因的异常决定的,它们通常以常染色体显性遗传方式传递,常为双侧性,多发性,发病早于散发型,具有不同程度的恶变倾向。DNA病毒:感染细胞后病毒Gene组整

10、合到宿主细胞Gene组.C周期调控,RB、p53-细胞有丝分裂的荧光显微图像细胞有丝分裂的荧光显微图像有丝分裂有丝分裂1 1 有丝分裂有丝分裂2 2 细胞有丝分裂1)恶性肿瘤的特征(异形性与周围组织相差大、显著)磷酸钙-DNA复合物粘附到细胞膜并通过胞饮进入目的细胞的细胞质。长期以来,肿瘤表现遗传不稳定性:不同种族中某些肿瘤发病率有明显差。目前已知有多种癌基因扩增,如ras家族myc家族等。抑制细胞生长的染色体如Fas、TNFR等、紫外线照射和电离辐射、抗癌药物、生长因子缺乏、过度表达某些特定的癌基因和抑癌基因等。细胞内外的许多信号刺激可以诱导细胞发生凋亡,如相应配体结合死亡受体.促进凋亡的C

11、ED-3、CED-4MMR系统缺陷鸟类白细胞增生病毒3)原癌基因激活机制、双亲无病后代则不发病。又在人和小鼠中发现,nm23基因的表达与乳腺癌等肿瘤的转移密切相关。甘氨酸缬氨酸(三)siRNA的转染病毒细胞癌细胞3)生长缓慢,呈膨胀性,对周围组织不具侵袭破坏性,不发生远处转移。体异常,同一种肿瘤细胞的染色体常发生有许此外,还有:此外,还有:一些学者提出应区别两类染色体畸变一些学者提出应区别两类染色体畸变总之总之抑制细胞生长的染色体增变基因:在确保遗传信息的完整性上起一定作某些细胞形成克隆肿瘤(Tumor,良DCC17chr其它chr的确癌细胞大多数都有染色体异常。AGNAT视网膜母C瘤13+原

12、癌基因癌基因74例HNPCC家系中研究表明,复制差(RER)阳性率高达92%说明MMRGene发生突变。DNA修复酶第一DNA突变引起癌的发生;有多种基因及某些Gene产物参与Checkpoint,调节C增殖。抑癌基因失活这种家族集聚现象提示,遗传因素在肿瘤发生中的作用。精原细胞瘤,网络成分和激酶Apoptosis复制终止C过度增殖非特异:只见于某种肿瘤的少数肿瘤细胞dsRNA消化法的主要优点在于可以跳过检测和筛选有效siRNA序列的。1)某些肿瘤经常有某几条染色体参与畸变,这种现象称为肿瘤染色体的非随机性或集聚(集中于某些染色体)。BCRBCRABLABL嵌合基因所编码的酪氨酸激酶,对正常控

13、嵌合基因所编码的酪氨酸激酶,对正常控制无应答反应制无应答反应 与与KnodsonKnodson二次打击学说是一致的二次打击学说是一致的,Rb Rb GeneGene缺失或功能丧失,失去对肿瘤细胞的抑缺失或功能丧失,失去对肿瘤细胞的抑制作用,认为制作用,认为Rb Gene Rb Gene 为为TSGTSG。前三种情况(前三种情况(1 1、2 2和和3 3),肿瘤组织中正常等位基因),肿瘤组织中正常等位基因丢失(丢失(A A),这称为杂合性丢失。),这称为杂合性丢失。它的部分作用是调控一组细胞转录因子它的部分作用是调控一组细胞转录因子-E2F-E2F。细胞周期进入。细胞周期进入S S期前(期前(2

14、-4hr2-4hr)pRb pRb 磷酸化而失活,解除对磷酸化而失活,解除对E2FE2F的抑制使的抑制使细胞进入细胞进入S S期。期。A A、停止细胞复制损伤的、停止细胞复制损伤的DNADNA。B B、参于细胞周期、参于细胞周期G1/SG1/S阶段的阶段的CheckpointCheckpoint(细胞缺少(细胞缺少p53p53或含有其突变时,就不能停止或含有其突变时,就不能停止于于G1G1期),而损伤期),而损伤DNADNA的复制可导致遗传的变的复制可导致遗传的变化。化。C C、与细胞死亡有关,调节细胞凋亡。这是、与细胞死亡有关,调节细胞凋亡。这是高水平的细胞结构自然选择的防御。癌的发生高水平

15、的细胞结构自然选择的防御。癌的发生就是这一控制功能的丧失。证明缺乏就是这一控制功能的丧失。证明缺乏p53p53的细的细胞不能进行凋亡。胞不能进行凋亡。现已发现有现已发现有3030多种多种TSGTSG,近年发现的有,近年发现的有FHITFHIT、PTENPTEN(MMAC1MMAC1)等。)等。1293、增变基因、增变基因n增变基因:在确保遗传信息的完整性上起一定作增变基因:在确保遗传信息的完整性上起一定作用,其突变导致用,其突变导致DNADNA复制和修复障碍。复制和修复障碍。n长期以来,肿瘤表现遗传不稳定性:长期以来,肿瘤表现遗传不稳定性:数目异常数目异常 核型异常核型异常 结构异常结构异常

16、都和增变基因突变相关。都和增变基因突变相关。LOHLOH DNADNA MI MI 130增变基因增变基因 n19931993年年FishelFishel在在E.ColiE.Coli和和yeastyeast中发现中发现,并将并将MutHLSMutHLS基因称为基因称为mutater genemutater gene。这些基因编。这些基因编码一种错误改正系统码一种错误改正系统-检查检查DNADNA错配错配的碱基对。的碱基对。n增变基因突变会导致增变基因突变会导致10010001001000倍突变率的倍突变率的增加。故现在又称为增加。故现在又称为DNADNA错配修复基因。错配修复基因。nFishe

17、lFishel等克隆了人的这一同源基因,等克隆了人的这一同源基因,Muts,Muts,并定位于并定位于2P2P,并迅速鉴定了另三个这样基因。,并迅速鉴定了另三个这样基因。131结肠癌的结肠癌的mutator genemutator gene。E Ecoli coli 人人 染色体的位置染色体的位置%HNPCC%HNPCCMuts MSH2 2P15-P22 50-60%Mutl MLH1 3P21.3 30,40%Mutl PMS1 2p31-p33 5%Mutl PMS2 7p22 5%与与TSGTSG一样,这类基因突变是隐性的,亦需一样,这类基因突变是隐性的,亦需要两次打击机制。要两次打击

18、机制。132 错配修复基因(错配修复基因(m misism match atch r repair gene epair gene,MMRMMR)nDNA错配修复系统(MMR首先是在原核生物中发现)Mut SnMMR系统 Mut L 也称 Mut SLH 途径。MutHn该系统的修复机制主要依赖于Mut S、MutL、MutH,基因所编码的蛋白、酶分子来完成。nMutS其蛋白的作用是识别错配的碱基位点并与 之结合。n而后MutL 和MutH基因产物依次与MutS形成复合物 进行协同作用。133AGNATTCGTAMutSMutHAGNATTCGTAMutL134另外,该系统还需要其它酶和因子参

19、与另外,该系统还需要其它酶和因子参与 DNADNA聚合酶聚合酶IIIIII;如:如:DNADNA连接酶;连接酶;单链结合蛋白;单链结合蛋白;外切酶等,从而共同完成修复反应。外切酶等,从而共同完成修复反应。135人类人类MMR系统系统:n现已阐明,人类现已阐明,人类MMRMMR基因编码的错配修复蛋白可基因编码的错配修复蛋白可相互作用,形成一种多聚复合物,参与细胞错相互作用,形成一种多聚复合物,参与细胞错配修复反应。配修复反应。修复:修复修复:修复DNADNA复制过程中出现的碱复制过程中出现的碱 作用作用 基错配。基错配。消除:消除由于简单重复序列之间的消除:消除由于简单重复序列之间的 遗传重组出

20、现的不配对基碱序列。遗传重组出现的不配对基碱序列。136目的目的n从而有效地防止从而有效地防止DNADNA复制差错的产生。复制差错的产生。n人体细胞中人体细胞中DNA DNA 错配修复反应过程依赖错配修复反应过程依赖于几种人类于几种人类MMRMMR基因产物,因此,其中任基因产物,因此,其中任何一种基因发生突变导致其产物的功能何一种基因发生突变导致其产物的功能丧失,将造成丧失,将造成DNADNA错配,修复功能的异常、错配,修复功能的异常、缺陷、或丧失。缺陷、或丧失。137人类人类MMRMMR基因定位:基因定位:Gene location Exon ORF 产物产物 HMSH2 2p16 16 2

21、802bp 934 aa HMLH1 3p21.3 19 2268bp 756 aa HPMS1 2q31-q33?2795bp 932aa HPMS2 2p22?2586bp 862aa 138人类人类MMRMMR系统与肿瘤系统与肿瘤nDNA DNA 错配修复基因的完整性对确保错配修复基因的完整性对确保DNADNA复制的精确性极复制的精确性极为重要为重要。DNA MMRDNA MMR系统系统 GeneGene 突变突变 MMRMMR系统缺陷系统缺陷 修复功能下降修复功能下降 MI 肿瘤易感性增强肿瘤易感性增强139微卫星不稳定(微卫星不稳定(Microsatellite DNA Micros

22、atellite DNA instability,MI instability,MI)n微卫星不稳定(微卫星不稳定(Microsatellite DNA instability,MIMicrosatellite DNA instability,MI)是指是指T T组织和组织和N N组织相比,其组织相比,其DNADNA等位结构发生简单重等位结构发生简单重复序列的改变,这种改变表现在肿瘤组织与其对应的正复序列的改变,这种改变表现在肿瘤组织与其对应的正常组织常组织PCRPCR产物经电泳后,电泳带出现增加或减少、位置产物经电泳后,电泳带出现增加或减少、位置及带的密度变化。及带的密度变化。N T LOH

23、 MI 肿瘤的发生肿瘤的发生涉及多阶涉及多阶段、多基因段、多基因参与的复杂参与的复杂过程,以结过程,以结肠直肠癌为肠直肠癌为例说明其过例说明其过程:程:149六、端粒和端粒酶六、端粒和端粒酶 端粒(端粒(telomeretelomere):是真核细胞染色体末端:是真核细胞染色体末端的一种特殊结构,由端粒的一种特殊结构,由端粒DNADNA和蛋白质组成。和蛋白质组成。其端粒其端粒DNADNA是富含是富含G G的高度的高度 保守的重复核苷酸保守的重复核苷酸序列。对染色体具有保护作用。序列。对染色体具有保护作用。150 不同物种的端粒不同物种的端粒DNA DNA 序列并不一致,人和其它哺乳序列并不一致

24、,人和其它哺乳动物的端粒动物的端粒DNADNA序列由序列由5533方向的(方向的(TTAGGGTTAGGG)n n反复串联组成。在人类大约有反复串联组成。在人类大约有121215Kb15Kb,是非结,是非结构基因,不编码蛋白质。构基因,不编码蛋白质。端粒端粒DNADNA的的33末端较末端较55末端伸出末端伸出121216bp 16bp 的一段的一段弯曲呈帽状结构,保护染色体,防止断裂、重组或弯曲呈帽状结构,保护染色体,防止断裂、重组或降解,促进染色体与核膜粘着,以及减数分裂时同降解,促进染色体与核膜粘着,以及减数分裂时同源染色体配对。源染色体配对。端粒被认为是细胞有丝分裂的端粒被认为是细胞有丝

25、分裂的“生物钟生物钟”,随着细,随着细胞分裂的不断进行,端粒逐渐缩短。当其长度减小胞分裂的不断进行,端粒逐渐缩短。当其长度减小到一定临界值时,细胞趋向衰老、死亡。到一定临界值时,细胞趋向衰老、死亡。151端粒端粒DNA DNA 逐渐变短的主要原因逐渐变短的主要原因:1 1、细胞分裂过程中线形染色体的末端端粒、细胞分裂过程中线形染色体的末端端粒DNADNA不能完全被不能完全被DNADNA指导指导DNADNA多聚酶所复制;多聚酶所复制;2 2、末端的特异性和非特异性降解;、末端的特异性和非特异性降解;3 3、细胞异源端粒之间的不均匀重组。、细胞异源端粒之间的不均匀重组。152影响端粒长度的因素很多

26、,其中主要有:影响端粒长度的因素很多,其中主要有:端粒结合蛋白端粒结合蛋白 端粒帽蛋白端粒帽蛋白 端粒酶及端粒酶及 DNADNA复制酶等复制酶等 其中其中端粒酶端粒酶是最主要因素。是最主要因素。端粒酶(端粒酶(telomerasretelomerasre):):是一种逆转录酶,能延长端粒末端,由蛋白质是一种逆转录酶,能延长端粒末端,由蛋白质和和RNA RNA 组成,可以其组成,可以其RNARNA为模板指导为模板指导DNADNA合成,向端合成,向端粒末端添加(粒末端添加(TTAGGGTTAGGG)n n序列,使端粒延长,延长序列,使端粒延长,延长细胞的寿命甚至使其永生化。细胞的寿命甚至使其永生化

27、。153端粒合成机制端粒合成机制154155 细胞进入细胞进入G1/SG1/S期,端粒酶活性逐渐增高,而期,端粒酶活性逐渐增高,而在在S S期活性最高,在期活性最高,在G2G2期期/M/M期端粒酶活性逐渐期端粒酶活性逐渐消失。消失。利用利用TRAPTRAP(Telemeric Repeat Amplication Telemeric Repeat Amplication ProtocolProtocol)技术检测正常动物、植物细胞时技术检测正常动物、植物细胞时发现,除个别增生活跃的组织有微弱的端粒发现,除个别增生活跃的组织有微弱的端粒酶活性外,其他组织都没有端粒酶活性,但酶活性外,其他组织都没

28、有端粒酶活性,但在肿瘤细胞、永生型细胞及干细胞(如造血在肿瘤细胞、永生型细胞及干细胞(如造血干细胞)中,端粒酶可被激活,活性增强。干细胞)中,端粒酶可被激活,活性增强。156端粒酶与肿瘤端粒酶与肿瘤 在恶性肿瘤中,端粒酶活性明显增高,在恶性肿瘤中,端粒酶活性明显增高,以延长端粒,弥补因细胞分裂而造成的以延长端粒,弥补因细胞分裂而造成的端粒缩短,从而使细胞无限增殖恶化,端粒缩短,从而使细胞无限增殖恶化,甚至使癌细胞永生化。甚至使癌细胞永生化。157 UedaUeda报道(报道(19971997,Cancer Res.Cancer Res.),在恶性肿),在恶性肿瘤中瘤中91%91%端粒酶活性增强

29、。端粒酶活性增强。Zheng PZheng P。S S。19971997,报道,妇科肿瘤中端粒,报道,妇科肿瘤中端粒酶活性增强的占酶活性增强的占95%95%。上述情况表明,绝大多数肿瘤细胞中都呈端上述情况表明,绝大多数肿瘤细胞中都呈端粒酶阳性,而在正常组织中却无表达。揭示,粒酶阳性,而在正常组织中却无表达。揭示,端粒酶可能是一个广泛的肿瘤标致,可用于端粒酶可能是一个广泛的肿瘤标致,可用于肿瘤的诊断。肿瘤的诊断。Hiyama E Hiyama E (19971997,CancerResCancerRes),通过检),通过检测胰腺肿瘤得出:测胰腺肿瘤得出:95%95%胰腺癌中端粒酶活性增胰腺癌中端

30、粒酶活性增强,而在良性胰腺瘤中为强,而在良性胰腺瘤中为0%0%。158 哪么能否应用抑制端粒酶的手段来治疗肿瘤哪么能否应用抑制端粒酶的手段来治疗肿瘤呢?呢?这个问题正是目前人们关注的问题,也这个问题正是目前人们关注的问题,也是研究的热点。是研究的热点。研究者们建议利用端粒酶抑制剂进行肿瘤治研究者们建议利用端粒酶抑制剂进行肿瘤治疗。疗。7-deaza-d ATP7-deaza-d ATP(7-7-脱氮脱氮-2-2脱氧腺苷酸)和脱氧腺苷酸)和7-7-deaza-d GTPdeaza-d GTP(7-7-脱氮脱氮-2-2脱氧鸟苷酸)是潜在脱氧鸟苷酸)是潜在的端粒酶抑制剂,二者都可通过端粒酶的催的端粒

31、酶抑制剂,二者都可通过端粒酶的催化作用惨入到端粒化作用惨入到端粒DNADNA中,由于它们的掺入使中,由于它们的掺入使端粒过早地缩短,开僻了肿瘤治疗的新途径。端粒过早地缩短,开僻了肿瘤治疗的新途径。159 KanazawaKanazawa制备一种锤头核酸酶制备一种锤头核酸酶telorztelorz,作用,作用于人类端粒酶的于人类端粒酶的RNA RNA 成分,对已合成的端粒成分,对已合成的端粒酶酶RNARNA成分具有特异分解作用,对端粒酶有明成分具有特异分解作用,对端粒酶有明显的抑制作用。显的抑制作用。应用反义核酸治疗方法,人工合成反义应用反义核酸治疗方法,人工合成反义DNA/RNA DNA/RN

32、A 抑制端粒酶的作用。抑制端粒酶的作用。160核酶核酶161核酶162RNARNA干涉干涉 近年来的研究表明近年来的研究表明 将与将与mRNA对应的正义对应的正义RNA和反义和反义RNA组组成的双链成的双链RNA(dsRNA)导入细胞,可以使导入细胞,可以使mRNA发生特异性的降解,导致其相应的基发生特异性的降解,导致其相应的基因沉默。这种转录后基因沉默机制因沉默。这种转录后基因沉默机制(post-transcriptionalgenesilencing,PTGS)被被称为称为RNA干扰(干扰(RNAi)。)。163164GFP报告基因-RNAi165166167168169RNA干涉05/1

33、1/18cellwangxiaodong170RNAi的分子机制的分子机制 RNA干扰包括干扰包括起始阶段和效应阶段起始阶段和效应阶段(inititationandeffectorsteps)。在起始阶段在起始阶段加入的小分子加入的小分子RNA被切割为被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰核苷酸长的小分子干扰RNA片段片段(smallinterferingRNAs,siRNAs)。证据表明;一个称为。证据表明;一个称为Dicer的酶,的酶,是是RNaseIII家族中特异识别双链家族中特异识别双链RNA的一员,它能的一员,它能以一种以一种ATP依赖的方式逐步切割由外源导入或者由依赖的方式逐步切割

34、由外源导入或者由转基因,病毒感染等各种方式引入的双链转基因,病毒感染等各种方式引入的双链RNA,将,将RNA降解为降解为21-23bp的双链的双链RNAs(siRNAs),每个,每个片段的片段的3端都有端都有2个碱基突出。个碱基突出。171172 在在RNAi效应阶段效应阶段siRNA双链结合一个核酶复合双链结合一个核酶复合物从而形成所谓物从而形成所谓RNA诱导沉默复合物(诱导沉默复合物(RNA-inducedsilencingcomplex,RISC)。激活。激活RISC需要一个需要一个ATP依赖的将小分子依赖的将小分子RNA解双链的过程。解双链的过程。激活的激活的RISC通过碱基配对定位到

35、同源通过碱基配对定位到同源mRNA转录本转录本上,并在距离上,并在距离siRNA3端端12个碱基的位置切割个碱基的位置切割mRNA。尽管切割的确切机制尚不明了,但每个尽管切割的确切机制尚不明了,但每个RISC都都包含一个包含一个siRNA和一个不同于和一个不同于Dicer的的RNA酶酶(Ago2)173如何进行RNAi试验(一)siRNA的设计 在设计在设计RNAiRNAi实验时,可以先在以下网站进行目标序列实验时,可以先在以下网站进行目标序列的筛选:的筛选:174(二二)siRNA)siRNA的制备的制备 1.1.化学合成化学合成 公司都可以根据用户要求提供高质量的化学合成公司都可以根据用户

36、要求提供高质量的化学合成siRNAsiRNA。2.2.体外转录体外转录 以以DNA OligoDNA Oligo为模版,通过体外转录合成为模版,通过体外转录合成siRNAssiRNAs。3.3.用用RNase III RNase III 消化长片断双链消化长片断双链RNARNA制备制备siRNAsiRNA dsRNA dsRNA消化法的主要优点在于可以跳过检测和筛选有效消化法的主要优点在于可以跳过检测和筛选有效siRNAsiRNA序列的。序列的。4.siRNA4.siRNA表达载体表达载体 siRNAsiRNA表达载体的优点在于可以进行较长期研究表达载体的优点在于可以进行较长期研究带有带有抗生

37、素标记的载体可以在细胞中持续抑制靶基因的表达,持抗生素标记的载体可以在细胞中持续抑制靶基因的表达,持续数星期甚至更久。续数星期甚至更久。5.siRNA5.siRNA表达框架表达框架 siRNAsiRNA表达框架表达框架(siRNA expression cassettes(siRNA expression cassettes,SECs)SECs)是是一种由一种由PCRPCR得到的得到的siRNAsiRNA表达模版,包括一个表达模版,包括一个RNA pol IIIRNA pol III启启动子,一段发夹结构动子,一段发夹结构siRNAsiRNA,一个,一个RNA pol IIIRNA pol I

38、II终止位点,能终止位点,能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。175176177(三三)siRNA)siRNA的转染的转染1.磷酸钙共沉淀磷酸钙共沉淀将氯化钙,将氯化钙,RNA(或或DNA)和磷酸缓冲液混合,沉淀形成包含和磷酸缓冲液混合,沉淀形成包含DNA且极且极小的不溶的磷酸钙颗粒。磷酸钙小的不溶的磷酸钙颗粒。磷酸钙-DNA复合物粘附到细胞膜并通过胞饮复合物粘附到细胞膜并通过胞饮进入目的细胞的细胞质。进入目的细胞的细胞质。2.电穿孔法电穿孔法电穿孔通过将细胞暴露在短暂的高场强电脉冲中转导分子。将细胞悬浮电穿孔通过将细胞暴露在短暂的高场

39、强电脉冲中转导分子。将细胞悬浮液置于电场中会诱导沿细胞膜的电压差异,据认为这种电压差异会导致液置于电场中会诱导沿细胞膜的电压差异,据认为这种电压差异会导致细胞膜暂时穿孔。细胞膜暂时穿孔。3.DEAE-葡聚糖和葡聚糖和polybrene带正电的带正电的DEAE-葡聚糖或葡聚糖或polybrene多聚体复合物和带负电的多聚体复合物和带负电的DNA分子分子使得使得DNA可以结合在细胞表面。通过使用可以结合在细胞表面。通过使用DMSO或甘油获得的渗透休克或甘油获得的渗透休克将将DNA复合体导入。复合体导入。4.机械法机械法转染技术也包括使用机械的方法,比如显微注射和基因枪(转染技术也包括使用机械的方法

40、,比如显微注射和基因枪(biolisticparticle)将)将DNA,RNA或蛋白直接转入细胞质或细胞核。或蛋白直接转入细胞质或细胞核。5.阳离子脂质体试剂阳离子脂质体试剂形成形成DNA-阳离子脂质体复合物。被俘获的阳离子脂质体复合物。被俘获的DNA就会被导入培养的细胞。就会被导入培养的细胞。178RNAi的应用前景的应用前景 1.研究基因功能的新工具研究基因功能的新工具 2.研究信号传导通路的新途径研究信号传导通路的新途径 3.开展基因治疗的新策略开展基因治疗的新策略1791.研究基因功能的新工具研究基因功能的新工具 已有研究表明已有研究表明RNAi能够在哺乳动物中灭活能够在哺乳动物中灭

41、活或降低特异性基因的表达,制作多种表型,或降低特异性基因的表达,制作多种表型,而且抑制基因表达的时间可以随意控制在发而且抑制基因表达的时间可以随意控制在发育的任何阶段,产生类似基因敲除的效应。育的任何阶段,产生类似基因敲除的效应。RNAi将大大促进对这些新基因功能的研究。将大大促进对这些新基因功能的研究。与传统的基因敲除技术相比,这一技术具有与传统的基因敲除技术相比,这一技术具有投入少,周期短,操作简单等优势,近来投入少,周期短,操作简单等优势,近来RNAi成功用于构建转基因动物模型的报道日成功用于构建转基因动物模型的报道日益增多,标志着益增多,标志着RNAi将成为研究基因功能不将成为研究基因

42、功能不可或缺的工具。可或缺的工具。1802.研究信号传导通路的新途径研究信号传导通路的新途径 联合利用传统的缺失突变技术和联合利用传统的缺失突变技术和RNAi技术技术,可以很可以很容易地确定复杂的信号传导途径中不同基因的上下容易地确定复杂的信号传导途径中不同基因的上下游关系,游关系,Clemensy等应用等应用RNAi研究了果蝇细胞系研究了果蝇细胞系中胰岛素信息传导途径中胰岛素信息传导途径,取得了与已知胰岛素信息传取得了与已知胰岛素信息传导通路完全一致的结果导通路完全一致的结果.在此基础上分析了在此基础上分析了DSH3PX1与与DACK之间的关系之间的关系,证实了证实了DACK是位于是位于DS

43、H3PX1磷酸化的上游激酶磷酸化的上游激酶.RNAi技术较传统的转染实验简单、快速、重复性技术较传统的转染实验简单、快速、重复性好,克服了转好,克服了转染实验中重组蛋白特异性聚集和转染染实验中重组蛋白特异性聚集和转染效率不高的缺点,效率不高的缺点,因此认为因此认为RNAi技术将可能成为技术将可能成为研究细胞信号传导通路的新途径。研究细胞信号传导通路的新途径。1813.开展基因治疗的新策略开展基因治疗的新策略 RNAi具有抵抗病毒入侵,抑制转座子活动,防止自私基因具有抵抗病毒入侵,抑制转座子活动,防止自私基因序列过量增殖等作用,因此可以利用序列过量增殖等作用,因此可以利用RNAi现象产生抗病毒现

44、象产生抗病毒的植物和动物,并可利用不同病毒转录序列中高度同源区段的植物和动物,并可利用不同病毒转录序列中高度同源区段相应的相应的dsRNA抵抗多种病毒。抵抗多种病毒。肿瘤是多个基因相互作用的基因网络调控的结果,传统技肿瘤是多个基因相互作用的基因网络调控的结果,传统技术诱发的单一癌基因的阻断不可能完全抑制或逆转肿瘤的生术诱发的单一癌基因的阻断不可能完全抑制或逆转肿瘤的生长长,而而RNAi可以利用同一基因家族的多个基因具有一段同源可以利用同一基因家族的多个基因具有一段同源性很高的保守序列这一特性性很高的保守序列这一特性,设计针对这一区段序列的设计针对这一区段序列的dsRNA分子,只注射一种分子,只

45、注射一种dsRNA即可以产生多个基因同时即可以产生多个基因同时剔除的表现,也可以同时注射多种剔除的表现,也可以同时注射多种dsRNA而将多个序列不而将多个序列不相关的基因同时剔除。相关的基因同时剔除。182表观基因组学表观基因组学/遗传学遗传学 在不影响在不影响DNADNA序列的情况下对其修饰序列的情况下对其修饰,不仅不仅影响个体的发育而且可遗传影响个体的发育而且可遗传.如如:一卵双生在同一环境中生一卵双生在同一环境中生,成年后表现成年后表现出性格、健康等方面的差异出性格、健康等方面的差异-表观遗传。表观遗传。经典的遗产物质经典的遗产物质-核酸(核酸(DNADNA)储存和传递)储存和传递遗传信

46、息。遗传信息。表观遗传修饰也可记忆、遗传,向传统的表观遗传修饰也可记忆、遗传,向传统的遗传规律提出挑战。遗传规律提出挑战。183DNADNA甲基化甲基化-表观遗传表观遗传 DNADNA甲基化一般指构成甲基化一般指构成DNADNA的四个碱基之一的胞嘧啶发的四个碱基之一的胞嘧啶发生异常,从而导致基因活性发生变化,即基因被生异常,从而导致基因活性发生变化,即基因被“打打开开”或或“关闭关闭”。这种变化容易诱发癌症等疾病。绘。这种变化容易诱发癌症等疾病。绘制出的制出的DNADNA甲基化图谱将可能用于诊断疾病,甚至能甲基化图谱将可能用于诊断疾病,甚至能在基因突变前预测人患癌症的风险性。在基因突变前预测人

47、患癌症的风险性。而科学家认为,大约一半的人类疾病可归咎于基因,而科学家认为,大约一半的人类疾病可归咎于基因,而另外一半则与非遗传因素有密切联系,其中表遗传而另外一半则与非遗传因素有密切联系,其中表遗传因素又占据非遗传因素的一定比例。至于因素又占据非遗传因素的一定比例。至于DNADNA甲基化,甲基化,它只是表遗传因素中较重要的一种。它只是表遗传因素中较重要的一种。184DNA甲基化仅限于甲基化仅限于CpG双核苷酸双核苷酸(人(人DNA约约3%胞嘧啶甲基化),胞嘧啶甲基化),CpG在胞嘧啶甲基转移酶作用下,加在胞嘧啶甲基转移酶作用下,加-CH3到到胞嘧啶胞嘧啶5C原子上,形成原子上,形成5-甲基胞

48、嘧啶,甲基胞嘧啶,其化学上不稳定并易于脱氨基形成胸腺其化学上不稳定并易于脱氨基形成胸腺嘧啶嘧啶(T)。185186 5CpG3甲基转移酶甲基转移酶5CmpG3 3GpC53GpCm5 甲基化后复制甲基化后复制 5CmpG3DNA复制复制3GpC5 甲基化后脱氨基及复制甲基化后脱氨基及复制 5CmpG3去氨基去氨基5TpG3 3GpCm53GpCm5 5TpG3DNA复制复制 3ApCm5187 如:肿瘤组织中如:肿瘤组织中DNADNA常有异常甲基化作用。常有异常甲基化作用。甲基化甲基化激活癌基因。激活癌基因。另一方面,可使另一方面,可使TSG 5TSG 5端启动子调控区端启动子调控区CpGCp

49、G岛异常甲基化,而抑制岛异常甲基化,而抑制mRNAmRNA转录作用,导致转录作用,导致TSG TSG 失活。失活。188DNA序列分析189细胞凋亡细胞凋亡-与肿瘤与肿瘤 细胞凋亡在肿瘤和其它疾病中具有重要的意义。细胞凋亡在肿瘤和其它疾病中具有重要的意义。自自19721972年年 KerrKerr提出细胞凋亡这一概念后,目前提出细胞凋亡这一概念后,目前在很多生物学领域进行广泛的研究。在很多生物学领域进行广泛的研究。8080年代末期开始成为肿瘤病因学、病理学研究年代末期开始成为肿瘤病因学、病理学研究热点,人们对细胞凋亡的认识逐渐深入,对细胞凋热点,人们对细胞凋亡的认识逐渐深入,对细胞凋亡发生分子

50、机理的了解越来越透彻,然而也发现这亡发生分子机理的了解越来越透彻,然而也发现这一过程远非原来想象的那样简单,而是包含了复杂一过程远非原来想象的那样简单,而是包含了复杂的调控机制。的调控机制。190 尽管仍有许多问题甚至是关键的问题没有尽管仍有许多问题甚至是关键的问题没有搞清楚搞清楚,但近几年的研究在凋亡信号转导途径、但近几年的研究在凋亡信号转导途径、细胞凋亡的生化反应机制以及细胞凋亡的基细胞凋亡的生化反应机制以及细胞凋亡的基因调控等方面都取得了显著的进展。因调控等方面都取得了显著的进展。近几年来对细胞凋亡的最活跃领域包括:近几年来对细胞凋亡的最活跃领域包括:细胞凋亡进程中重要的执行者细胞凋亡进

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