1、蛋白质结构和功能23456789咪唑基吲哚环苯环1011咪唑基吲哚环苯环胍基12 13咪唑基胍基吲哚环14 15()1617随意卷曲(random coil)形成,等结构氢键-与螺旋纵轴平行(3个/相邻螺旋)关键部位aa残基改变 功能改变(分子病)二、蛋白质分子结构及其规律性构象轻微改变R-CH-COO-R-CH-COO-R-CH-COOH*三级结构可以是球、椭圆、棒、纤维状等H2N-CH-COOH+HN-CH-COOH*40-400氨基酸组成*新发现蛋白质鉴定:全部/部分一级结构定义:多肽链中氨基酸序列Hb 四级结构,4亚基(2,2)结构相似,功能相似(Lys,Trp,Phe,Met,Leu
2、,Ile,Val,Thr)营养必需氨基酸(8种)理化因素作用下,蛋白质空间结构破坏,(2)普遍存在于天然蛋白质中*人、猪、牛、羊胰岛素三级结构 生物活性181920211222324252627鉴别不同蛋白质最基本,最重要的标志结合 氨基酸+辅基(非蛋白)H2N C COOH应用:凯氏定氮法测蛋白质含量#脂肪族 芳香族-羧基谷氨酸-Glu羧化(凝血因子)DNA聚合酶和PCNA三级结构 生物活性(六)维系蛋白质空间构象的次级键-转角(-turn)-羧基谷氨酸-Glu羧化(凝血因子)H2N-CH-COOH+HN-CH-COOH一级结构 三级结构 生物活性 结构相似,功能相似应用:凯氏定氮法测蛋白质
3、含量收缩和运动:肌动球蛋白螺旋-稳定的蛋白质空间构象空间结构-次级键、二硫键(四)蛋白质的三级结构(tertiary structure)2 22829303132GluCysGly 33TRH NC34353637随意卷曲(random coil)理化因素作用下,蛋白质空间结构破坏,1、多价两性离子(N端,C端,R基团)侧链基团(R)位置-螺旋外非关键部位aa残基差异,不影响生物活性储存和营养:肌红蛋白,铁蛋白,随意卷曲(random coil)氨基酸-蛋白质的构件分子:收缩和运动:肌动球蛋白 结构相似,功能相似收缩和运动:肌动球蛋白外切酶 聚合酶(一)一级结构是空间结构的基础:HbS携氧能
4、力,缺氧 镰刀状,脆性,溶血 例:Hb 图2-18收缩和运动:肌动球蛋白L-氨基酸(amino acid,aa)383940咪唑基吲哚环苯环胍基41424344454647结合 氨基酸+辅基(非蛋白)一级结构-蛋白质基本结构 结构相似,功能相似(一)一级结构是空间结构的基础:图 2-4,2-5(p14)收缩和运动:肌动球蛋白 氨基酸-蛋白质的构件分子:整条多肽链(包括相距甚远的主链及其侧链)结构相似,功能相似直链-Asp Asn Glu Gln Lys螺旋、折叠、转角、-螺旋、随意卷曲 例:Hb 图2-18亲水侧 组成离子通道三、紫外吸收特征与定量分析 维系键-肽键、(二硫键)形成,等结构(二
5、)氨基酸理化性质杂环族(3种):His Pro Trp1、多价两性离子(N端,C端,R基团)鉴别不同蛋白质最基本,最重要的标志4849大多数球蛋白大多数球蛋白:含含9 9505152531111545556 57*C-N,C-C之间键能自由旋转(蛋白质并非都具四级结构)二、蛋白质分子结构及其规律性(三)蛋白质的超二级结构和结构域 (super secondary structure and domain)羧基和氨基均能在水溶液中电离(+/-)不同的R基团对螺旋,折叠形成时的影响:真核细胞DNA聚合酶H2N C COOH结合蛋白质(按辅基不同)R-CH-COO-R-CH-COO-R-CH-COO
6、H收缩和运动:肌动球蛋白(一)氨基酸的分类:(氨基、胍基、咪唑基)结合 氨基酸+辅基(非蛋白)一、大分子亲水胶体性质形成,等结构杂环族(3种):His Pro Trp中性氨基酸:1个COOH、1个-NH2收缩和运动:肌动球蛋白结合蛋白质(按辅基不同)581259601361外显子外显子内含子内含子362636465666713136869()707172 738 874757677*一级结构 空间结构 生理功能运输:Hb,载脂蛋白,运铁蛋白*人、猪、牛、羊胰岛素Lys,Arg,His*一级结构 空间结构 生理功能*等电点(isoelectric point,pI):肌红蛋白(球状,一条链,15
7、3aa,8段)三、紫外吸收特征与定量分析直链-Asp Asn Glu Gln Lys亚基(subunit):(2)普遍存在于天然蛋白质中螺旋-稳定的蛋白质空间构象直链-Asp Asn Glu Gln Lys关于一级和二级结构的关系:运输:Hb,载脂蛋白,运铁蛋白羧基和氨基均能在水溶液中电离(+/-)氢键-与螺旋纵轴平行(3个/相邻螺旋)直链-Asp Asn Glu Gln Lys羧基和氨基均能在水溶液中电离(+/-)78191979 808182232383 84858687888990图图2-202-2091202092931616949596979899100101102103104105106107108